This file was created by the TYPO3 extension publications --- Timezone: CEST Creation date: 2026-04-18 Creation time: 07:03:24 --- Number of references 770 article JA 2026 Jan 13 10.1192/j.eurpsy.2025.10119. 41527398; Eur Psychiatry 69 e10 1 PREPARED Miriam Glock Antranik Erdekian Mike Rueb F Uhl R Husemann Jutta Stoffers-Winterling Stephanie Lindner Oliver Tüscher Lars P Hölzel K. Lieb Kristina Adorjan Hauke F Wiegand article bergmann_kinder_2026 Die geplante Krankenhaus- und Notfallreform in Deutschland strebt unter anderem eine Umstrukturierung der Notfallversorgung hin zu integrierten Notfallzentren (INZ) und integrierten Notfallzentren für Kinder- und Jugendliche (KINZ) an. Derzeit besteht eine Lücke an aktuellen Daten über die Vorstellungsgründe und die Inanspruchnahme von Notaufnahmen durch Patienten unter 18 Jahren. Die vorliegende Studie bietet eine multizentrische Analyse der häufigsten Vorstellungsgründe von Kindern und Jugendlichen in deutschen Notaufnahmen an. 2026 apr 2193-6226 10.1007/s00063-025-01254-z Medizinische Klinik - Intensivmedizin und Notfallmedizin 121 193—200 3 https://doi.org/10.1007/s00063-025-01254-z Johanna Bergmann Alina Balandin Susanne Drynda Gunnar Elke Marcus Klein Ronny Otto Domagoj Schunk article dusing_orthopaund_2026 Notaufnahmen sind zentraler Bestandteil der Notfallversorgung in Deutschland. Der vom Gemeinsamen Bundesausschuss (G-BA) beschlossene Aufbau von Zentralen Notaufnahmen und die geforderten Qualifikationen des ärztlichen Personals verändern die deutschlandweite Notfallversorgung. Über die verschiedenen in der Notaufnahme versorgten Patientengruppen ist bisher allerdings nicht viel bekannt. 2026 feb 2731-703X 10.1007/s00113-026-01685-z Die Unfallchirurgie https://doi.org/10.1007/s00113-026-01685-z Helena Düsing Ronny Otto Michael Raschke Felix Walcher Susanne Drynda Christian Waydhas Simon Oeckenpöhler article Bienzeislere114590 Introduction Urgent and emergency care in Germany is delivered across multiple, loosely connected sectors. In the absence of coherent, time-resolved data on patient movements between emergency medical services (EMS), out-of-hours ambulatory care, emergency departments (EDs) and inpatient care, inefficiencies and coordination gaps remain difficult to quantify. A process-centric, trans-sectoral analysis is required to characterise real-world patient pathways and identify actionable levers for improvement. The study aims to reconstruct, model and analyse patient pathways for urgent health complaints across all relevant sectors of the healthcare system in a German model region.Methods and analysis We will employ a mixed-methods observational study design. Routine data from EMS, out-of-hours ambulatory care, EDs and subsequent inpatient care will be pseudonymised at source, linked via a trusted third party and analysed within a trusted research environment. Time-stamped event logs will support process mining for discovery, conformance and performance analysis alongside descriptive statistics with stratification by context, such as setting, time of day, urgency and patient cohorts. Anonymous cross-sectional surveys of patients and front-line professionals, complemented by quarterly snapshot surveys in out-of-hours ambulatory care and interviews, will provide convergent evidence on the motives, barriers and coordination of utilisation behaviour. Enrolment for surveys is anticipated from the fourth quarter of 2025; routine data capture covers 1 January\textendash31 December 2026; analyses and dissemination run until 31 December 2027.Ethics and dissemination The study received ethical approval from the Ethics Committee of the Medical Faculty at RWTH Aachen University (EK 25-351). Survey modules are conducted anonymously with voluntary participation and without collection of direct identifiers; routine care data are processed in pseudonymised form and analysed within a trusted research environment. Stakeholder interviews will be conducted with informed consent. Results will be disseminated through peer-reviewed publications, conference presentations and summary reports for participating institutions and stakeholders, complemented by plain-language materials to support patient-centred navigation.Trial registration number DRKS00035916. 2026 2044-6055 10.1136/bmjopen-2025-114590 BMJ Open 16 British Medical Journal Publishing Group and TRANSPARENT Research Group and Schumacher, Heike and Gehrke, Simone and Capellmann, Jennifer and Schneiders, Guido and Brücken, David and Mülly, Thorsten and Tosuncuk-Ari, Nermin 2 Jonas Bienzeisler Miriam Katharina Hertwig Hauke Heidemeyer Mohamed Alhaskir Raphael W Majeed Alexander Kombeiz Wiliam Hoy Simon Huening Franziska Goettgens Jenny Unterkofler Susanne Rademacher Despina Panagiotidis Viktoria Marewski Anja Sommer Wiebke Schirrmeister Felix Walcher Ronny Otto Saskia Ehrentreich Harry H Beyel Viki Peeva Christopher T Schwanen Marco Pegoraro Beate Zoch-Lesniak Johannes Pollmanns Ralf Wittmar Dominik Graf Stillfried Rainer Röhrig Stefan K Beckers Wil M P Aalst Jörg Christian Brokmann report JA 2026 in Konsultation beim AWMF S3-Leitlinie PREPARED https://register.awmf.org/de/leitlinien/detail/038-026 12.02.2026 Hauke F Wiegand Manfred Beutel article bartenschlager2022 nein 10.24251/HICSS.2022.449 Gehalten auf der Hawaii International Conference on System Sciences 2022 C. Bartenschlager R. Frey M. Freitag et al article JA Studies in Health Technology and Informatics, eBook Serie 302 Khalid O Yusuf Sabine Hanss Dagmar Krefting poster JA Bettina Lorenz-Depiereux SM Hopff Heike Valentin Margarete Scherer Sarah Berger G. Anton Beate Balzuweit T Bahmer T. Illig Arne Blumentritt Christian Schäfer Sabine Hanss Matthias Nauck Dagmar Krefting Stefan Schreiber Martin Witzenrath Jens Schaller Wolfgang Lieb Dana Stahl Janne Vehreschild Monika Kraus On Behalf Of The Napkon Study Group NUKLEUS Ethics Coordination poster JA M Kraus Christopher Hampf Thomas Bahls Wolfgang Hoffmann Martin Bialke Arne Blumentritt Frank-Michael Moser Stefan Lang Ellen Sargsyan Aileen Stehn article klein_inpress Science Adv In press C. Klein M. Borsche A. Balck et al article jukic M. Jukic A. Dunkel B. Haller et al article kahn2021b M. Kahn S. Zellmer A. Ebigbo et al inproceedings wulff2021c Conference on 66. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie e.V. (GMDS) 2021 https://www.egms.de/static/de/meetings/gmds2021/21gmds058.shtml A. Wulff P. Biermann T. Landesberger et al inproceedings wulff2021a MedInfo Conference 2021 https://imia-medinfo.org/medinfo21/ A. Wulff P. Biermann T. Landesberger et al article weber_profiles_2025 Schwere COVID-19-Erkrankungen gehen mit Störungen im Cholesterinstoffwechsel einher, wobei das Protein PCSK9 eine wichtige Rolle spielt und vor allem in der Leber gebildet wird. In dieser Studie wurden Lebergewebe aus Obduktionen von COVID-19-Patienten mit Proben aus der Zeit vor der Pandemie verglichen sowie Blutwerte schwerkranker Patientinnen und Patienten analysiert. Dabei zeigte sich, dass PCSK9 und sein Regulator SREBP-2 mit bestimmten Leberveränderungen zusammenhängen, jedoch unabhängig davon, ob eine SARS-CoV-2-Infektion vorlag. Zwischen COVID-19- und Nicht-COVID-Patienten fanden sich weder relevante Unterschiede in der Leberstruktur noch in den gemessenen Leberwerten im Blut. Die Ergebnisse sprechen dafür, dass SARS-CoV-2 die Leber nicht direkt schädigt, auch wenn größere Studien nötig sind, um dies sicher zu bestätigen. JA 2025 11 1471-2334 10.1186/s12879-025-12129-1 BMC Infectious Diseases 25 1573 https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12616961/ Florian Weber Vlad Pavel Martina Müller Peter Boor Lea Läber Saskia Stillfried Christa Buechler article von_stillfried_von_2025 Obwohl sich die Obduktionstechnik seit über 150 Jahren kaum verändert hat, ist ihr wissenschaftlicher Nutzen durch moderne Analyse-, Bildgebungs- und Computerverfahren stark gewachsen. In den klinischen Obduktionsablauf wurden sowohl native als auch kontrastverstärkte postmortale Bildgebungen integriert, unter anderem zur Untersuchung von Gefäßveränderungen bei chronischen Nierenerkrankungen. Zusätzlich wurde gezeigt, dass Biomaterialien aus Obduktionen wertvolle Grundlagen für die translationale Forschung liefern. Der Aufbau eines nationalen Autopsieregisters ermöglichte außerdem eine systematische Auswertung großer Datenmengen aus Obduktionen. Insgesamt zeigen die Ergebnisse, dass postmortale Daten und Gewebe für die Erforschung komplexer und multisystemischer Erkrankungen unverzichtbar sind und innovative Methoden in der Obduktionspathologie weiter gefördert werden sollten. JA 2025 11 de 2731-7188, 2731-7196 10.1007/s00292-025-01508-9 Die Pathologie https://link.springer.com/10.1007/s00292-025-01508-9 Saskia Von Stillfried article neidhardt_digital_2025 Gewebeproben aus Obduktionen gelten als Goldstandard, um Todesursachen festzustellen und Krankheiten besser zu verstehen. Bei hochinfektiösen Erregern können postmortale, minimalinvasive Gewebeentnahmen das Infektionsrisiko für Ärztinnen und Ärzte senken. In dieser Machbarkeitsstudie wird ein System vorgestellt, das mithilfe von Computertomographie und Virtual Reality die vollständig entfernte Planung und Steuerung robotischer Biopsien ermöglicht. Drei verschiedene Interaktionsmethoden zur Nadelplatzierung wurden durch Rechtsmedizininer*innen. Die Ergebnisse zeigen, dass die Methode präzise, gut bedienbar und eine vielversprechende, sichere Alternative zu herkömmlichen Verfahren ist. JA 2025 09 2377-3766 10.1109/LRA.2025.3608655 IEEE Robotics and Automation Letters 1—6 Biopsy, Cadaver, Computed tomography, Needles, Robots, Skin, Biomedical imaging, Path Planning, Planning, Robot Control, Robot kinematics, Servers, Soft Tissue, User Interface, Virtual Reality https://ieeexplore.ieee.org/document/11154977 Maximilian Neidhardt Ludwig Bosse Vidas Raudonis Kristina Allgoewer Axel Heinemann Benjamin Ondruschka Alexander Schlaefer article schroder_krematoriumsleichenschau_2025 Die zweite Leichenschau vor einer Feuerbestattung dient nicht nur der forensischen Fallklärung, sondern hat auch epidemiologische und gesundheitspolitische Relevanz. Die COVID-19-Pandemie stellte hierbei neue Anforderungen an die Durchführung und Bewertung. Die Studie untersucht die rechtsmedizinische Praxis der Leichenschau vor der Einäscherung im Kontext der COVID-19-Pandemie. Dabei wurde festgestellt, dass eine attestierte SARS-CoV-2-Infektion nie alleiniger Grund für eine Zurückstellung des Leichnams vor der Einäscherung war. Die Untersuchung legt nahe, dass die Durchführung von Schwangerschaftsabbrüchen nach medizinisch-sozialer Indikation nicht immer in allen Einzelheiten der aktuellen Rechtslage entspricht. Die Ergebnisse betonen die Bedeutung einer sorgfältigen und rechtskonformen Dokumentation in der forensischen Praxis. Die Studie trägt zur Weiterentwicklung der rechtsmedizinischen Standards in Zeiten globaler Gesundheitskrisen bei. JA 2025 09 de 1434-5196 10.1007/s00194-025-00787-z Rechtsmedizin SARS-CoV‑2, Death certificate, Leichenschau, Todesbescheinigung, Cremation, Feuerbestattung, Postmortem examination https://doi.org/10.1007/s00194-025-00787-z Ann Sophie Schröder Benjamin Ondruschka article Background: Mathematical models are valuable tools for guiding public health policy decisions to combat the spread of infectious diseases. Nevertheless, a lack of appropriate quality assessment tools and reporting guidelines hinders the comprehensibility, transparency, and credibility of infectious disease modelling studies and the ability to assess their quality. In a first step towards addressing the need for reporting guidelines and quality assessment tools specific to infectious disease modelling, this scoping review identified common themes in existing reporting and quality assessment guidance for infectious disease modelling studies and adjacent fields. Methods: We conducted temporally-unrestricted searches on Medline (via Ovid), Web of Science, medRxiv, and bioRxiv in January 2024 to find articles that provide guidance on writing or assessing modelling studies within infectious disease modelling and adjacent fields including but not limited to healthcare and, more specifically, health economics. Articles were double-screened for eligibility via title-and-abstract screening and full-text screening. Recommendations made by eligible articles were classified into 31 subdimensions which were categorised into seven overarching dimensions (1. applicability; 2. model structure; 3. parameterisation and calibration; 4. validity; 5. uncertainty; 6. interpretation; 7. reproducibility, clarity, and transparency). We followed the PRISMA extension for reporting scoping reviews. Results: Our final review included 53 articles. All dimensions except for interpretation were covered by most articles (81%-98%). However, we found substantial heterogeneity in the frequency with which subdimensions were addressed (11%-96%). Subdimensions pertaining to parameter uncertainty and transparency about parameter values were mentioned in most articles (91%-96%); conversely, discussions about auxiliary publication details and software implementation were covered less frequently (11%-23%). Conclusions: This review shows that many recommendations made by reporting guidelines and quality assessment tools have thematic similarities and address common topics that are also relevant to infectious disease modelling. These identified themes and recommendations can be used as a starting point to inform the development of standardised guidelines for infectious disease modelling. JA 2025 Dec 31 10.1186/s12879-025-12211-8 41476310 BMC Infect Dis 26 182 1 PREPARED ESVE NUM-SAR Madhav Chaturvedi Antonia Bartz C. M. Denkinger Carolina Klett-Tammen M Kretzschmar E. Kuhlmann B Lange Florian M. Marx R. Mikolajczyk Ina Monsef Hoa Thi Nguyen Janik Suer N Skoetz Veronika K Jaeger A Karch article Background Integrated genomic surveillance (IGS), i.e. the integrated analysis of pathogen whole genome sequencing and classical epidemiological data, can contribute substantially to the disease surveillance and infection prevention activities of local public health authorities (LPHAs). Aim Our aim was to characterise how LPHAs use IGS, and factors required or important for their implementation, in the context of the German public health system. Methods We employed a mixed-methods design combining a quantitative survey of 60 LPHAs in three German states with five qualitative case studies based on LPHAs in four German localities and one state-level public health authority. Results Approximately half of LPHAs reported adoption of IGS; applications included outbreak analysis (n = 25), targeting and evaluation of infection control measures (n = 25 and n = 18, respectively) and characterisation of pathogen transmission chains (n = 25). Factors identified as required or important for the implementation of IGS in LPHAs included fast sample-to-result turnaround times, organisational data interpretation capabilities and clearly defined surveillance sampling strategies. Based on the case studies in which the adoption of IGS was successful, we formulate recommendations for implementing IGS at the level of LPHAs, including establishment of dedicated IGS analysis teams within LPHAs, use of user-friendly digital solutions (e.g. browser-based dashboards) for data exchange and analysis, and implementation of IGS in collaboration with local academic institutions. Conclusion Our analysis paves the way for increasing the implementation of IGS by LPHAs in Germany and other countries with similarly structured public health systems. JA 2025 Juli 30 10.2807/1560-7917.ES.2025.30.28.2500508 Anna Bludau Richard Egelkamp Lutz Ehlkes Hajo Grundmann Alexander T. Dilthey C Hornberg Nicole Fischer Christian Drosten Sandra Reuter article Sobkowiak2025-vo In dieser Studie wurde ein Ausbruch von Vancomycin-resistentem Enterococcus faecium (VREfm) in einem Krankenhaus untersucht. Die Forschenden analysierten über 400 Bakterienproben mithilfe einer speziellen Genomsequenzierung, um herauszufinden, wie sich die Keime verbreitet haben. Sie entdeckten, dass alle zum Ausbruch gehörenden Bakterien ein nahezu identisches Resistenz-Plasmid (vanA-Plasmid) trugen, was half, echte Ausbruchsfälle von einzelnen, nicht zusammenhängenden Fällen zu unterscheiden. Die Übertragung fand vor allem über gemeinsam genutzte Patientenzimmer statt. Nachdem strengere Hygienemaßnahmen eingeführt worden waren, kam es zu keinen weiteren Ansteckungen mehr. Ja 2025 may 28 BMC Microbiology 25 337 1 A Sobkowiak N Scherff V Almsick F Schuler T J Brix A Mellmann V Schwierzeck article Kinast2025-fa In dieser Studie wurde untersucht, wie man Laborwerte aus einem internen Krankenhaus-System besser standardisieren kann, damit sie leichter zwischen verschiedenen IT-Systemen ausgetauscht und für Forschung genutzt werden können. Viele Labors arbeiten noch mit eigenen Codes, was die Weiterverwendung der Daten erschwert. Die Forschenden entwickelten daher einen automatisierten Prozess, der diese internen Codes ausliest und ihnen passende internationale LOINC-Codes zuordnet. Von fast 3.000 Laborparametern konnten so rund 27 % automatisch standardisiert werden. Das Verfahren zeigt, dass eine solche Automatisierung funktioniert, macht aber auch deutlich, dass Laborsoftware künftig direkt LOINC unterstützen sollte, um vollständige und gut nutzbare Daten zu ermöglichen. ja 2025 apr 24 en Stud Health Technol Inform 324

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234—239 LOINC; laboratory information system Benjamin Kinast Joshua Wiedekopf Hannes Ulrich Bj"orn Schreiweis article Grikscheit31122025 JA 2025 01 23 10.1080/22221751.2025.2459137 Emerging Microbes & Infections 14 Taylor & Francis 2459137 1 PMID: 39868965 Katharina Grikscheit Annemarie Berger Holger Rabenau Niko Kohmer Katharina S. Appel Margarete Scherer Robert Bals Sabine Blaschke Axel Hamprecht Sina M. Hopff Dagmar Krefting Patrick Meybohm Carolin Nürnberger Peter Heuschmann Caitlin Pley Susana M. Nunes Miranda Edgar Dahl Björn Jensen Thomas Illig Gabriele Anton Jörg Janne Vehreschild Sandra Ciesek article doi:10.1177/17562864251391095 Es wurde ein Multiple-Sklerose-Behandlungsentscheings-Score (MS-TDS) mit Daten aus der ProVal-MS-Studie validiert. Der MS-TDS sagt die Wahrscheinlichkeit des Auftretens mindestens einer neuen oder sich vergrößernden T2-Läsion innerhalb von 6-24 Monaten nach Ausbruch der Erkrankung voraus und unterstützt die Entscheidung zwischen der Einleitung einer Plattformbehandlung oder einen "abwartenden" Ansatz. Ein sekundäres Ziel war die Machbarkeit von datenschutzkonformen Verbundkonzepten bei der Zusammenarbeit von mehreren Datenintegrationszentren aufzuzeigen. ja 2025 nov 21 10.1177/17562864251391095 Therapeutic Advances in Neurological Disorders 18 17562864251391095 Stefan Buchka Alexander Hapfelmeier Jan S. Kirschke Verena Steuerwald Markus Naumann Iñaki Soto-Rey Sven Olaf Rohr Frank Kramer Lars Behrens Eva Oswald Tania Kümpfel Hanna Zimmermann Verena S. Hoffmann Marlien Hagedorn Fady Albashiti Markus Krumbholz Ulf Ziemann Oliver Kohlbacher Benjamin Sailer Viola Braunmüller Stephanie Biergans Marius Herr Ulrike Ernemann Eva Bürkle Benjamin Bender Andreas Daul Christer Ruff Jörg Römhild Benedikt Wiestler Dominik Sepp Helmut Spengler Peter Pallaoro Martin Boeker Florian Kohlmayer Vera Dehmelt Achim Berthele Mark Mühlau Paula Uibel Josephine Wauschkuhn Klaus Kuhn Makbule Senel Ioannis Vardakas Daniela Taranu Hans Armin Kestler Nico Sollmann Begüm Irmak Ön Sandra Bilger Ulrich Mansmann Antonios Bayas Joachim Havla Markus C. Kowarik Hayrettin Tumani Bernhard Hemmer and article Graefe2025-vf Die Publikation stellt ein neuartiges Framework namens RareLink vor. REDCap wird zwar häufig in der Forschung zu seltenen Erkrankungen genutzt, bietet jedoch nur geringe Interoperabilität mit internationalen Gesundheitsstandards. RareLink, ein Open-Source-Framework auf Basis eines ontologiebasierten Common Data Models, ermöglicht einen standardisierten Datenaustausch zwischen REDCap, internationalen Registern und Analysewerkzeugen. Es verknüpft Daten mit GA4GH-Phenopackets und HL7-FHIR-Profilen. Das Framework wurde international entwickelt und anhand eines simulierten Kabuki-Syndrom-Patient Kohort erfolgreich getestet. ja 2025 nov 18 npj Genomic Medicine 10 72 1 Adam S L Graefe Filip Rehburg Samer Alkarkoukly Daniel Danis Ana Gr"onke Miriam R H"ubner Alexander Bartschke Thomas Debertsh"auser Sophie A I Klopfenstein Julian Sass Julia Fleck Mirko Rehberg Jana Zsch"untzsch Elisabeth F Nyoungui Tatiana Kalashnikova Luis Murgu\'ıa-Favela Beata Derfalvi Nicola A M Wright Shahida Moosa Soichi Ogishima Oliver Semler Susanna Wiegand Peter K"uhnen Christopher J Mungall Melissa A Haendel Peter N Robinson Sylvia Thun Oya Beyan article Kocman2025-jq Diese Studie untersuchte die Qualität und Vollständigkeit von medizinischen Routinedaten aus drei verschiedenen digitalen Datenquellen eines Universitätsklinikums. Die Forschenden verglichen wichtige Informationen wie Diagnosen, Behandlungen und Laborwerte zwischen den Systemen. Insgesamt waren die Daten weitgehend konsistent, es traten jedoch Unterschiede auf – zum Beispiel durch verschiedene Codiersysteme, Filterungen oder fehleranfällige Übertragungsprozesse. Solche Abweichungen können die Auswertung in der Forschung beeinflussen. Die Studie zeigt, wie wichtig es ist, die Herkunft und Verarbeitung von Routinedaten genau zu verstehen, um verlässliche Ergebnisse in der klinischen Forschung zu erzielen. ja 2025 may 15 en Stud Health Technol Inform 327

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703—707 Clinical Data Repositories (CDRs); Data quality Assessment (DQA); Multicenter Research Collaboration; TriNetX 2 Sude E Kocman Helene K"oster Christian Gulden Lorenz A Kapsner Igor Engel Hans-Ulrich Prokosch Jonathan M Mang article De_Arruda_Botelho2025-sy In dieser Arbeit wurde eine Lösung entwickelt, um die Güte von KI-Modellen – gemessen über die AUC – auch dann sicher berechnen zu können, wenn verschiedene Einrichtungen ihre sensiblen Daten nicht miteinander teilen dürfen. Die Forschenden stellten zwei Methoden vor: eine, die die AUC völlig exakt und datenschutzkonform berechnet, und eine zweite, die schneller ist und trotzdem sehr genaue Ergebnisse liefert. Beide Verfahren nutzen moderne Verschlüsselungstechniken, damit weder die wahren Diagnosen noch die Modellvorhersagen offengelegt werden. In der Gesundheitsplattform PHT-meDIC konnten die Methoden erfolgreich getestet und ihre Praxistauglichkeit gezeigt werden. Der frei verfügbare Programmcode erleichtert es anderen, die Verfahren im Rahmen kooperativer, datenschutzfreundlicher KI-Lösungen zu übernehmen. ja 2025 nov 13 PLOS Digital Health 4 Public Library of Science e0000753 11 Marius Arruda Botelho Cem Ata Baykara Ali Burak "Unal Nico Pfeifer Mete Akg"un article JA 2025 Jan 8 10.1186/s12913-024-12194-3 39780115 BMC Health Serv Re 25 43 1 Janis Evers Natalie Altschuck Claudia Mehl Lilly Rüthrich L Harst Felix Walther Oliver Steidle Arnt Suckow R Hecker J Schmitt M Geraedts article Macedo2025-li Die Publikation beschreibt die Extraktion von Allergieinformationen aus Entlassbriefen des UKSH mittels verschiedener Large-Language-Modelle. Zusätzlich wurden die Allergieinformationen nach der Extraktion automatisiert SNOMED CT codiert und als FHIR Observations abgelegt. ja 2025 aug 08 en Stud. Health Technol. Inform. 329 1074—1078 Clinical Documentation; Data Integration; HL7 FHIR; Large Language Models; SNOMED CT 3 Mário Macedo Joshua Wiedekopf Tobias Hillmer Bj"orn Schreiweis Sylvia Saalfeld Hannes Ulrich article Bronsch2025-jm Die Publikation beschreibt die Integration der Broad Consent Informationen in das UKSH MeDIC mit der Erfassung im Primärsystem, der JSON-basierten Übermittlung an das MeDIC. Darüber hinaus werden die zentraler Speicherung in einer IHE Advanced Patient Privacy Consents (APPC) Komponente, sowie abfragbarer und auswertbarer Umsetzungen in openEHR und MII FHIR Kerndatensatz beschrieben. ja 2025 aug 08 en Stud. Health Technol. Inform. 329 1626—1627 Broad Consent; Data Integration; FHIR™; Health Information Exchange; openEHR Tobias Bronsch Michael Anywar Benjamin Kinast Hannes Ulrich Mário Macedo Jesse Kruse Paul Behrend Bj"orn Schreiweis article Schramm2025-qz Die Primary Ciliary Dyskinesia Rule (PICADAR) ist ein diagnostisches Prognoseinstrument, das derzeit von der European Respiratory Society (ERS) empfohlen wird, um die Wahrscheinlichkeit einer Diagnose der primären ziliären Dyskinesie (PCD) zu beurteilen. Trotz ihrer Empfehlung gemäß der aktuellen ERS-Diagnoseleitlinie für PCD ist die Leistungsfähigkeit der PICADAR noch nicht ausreichend untersucht. Die Studie zeigt, dass der PICADAR eine begrenzte Sensitivität, insbesondere bei Personen ohne Lateralitätsdefekte (61 %) oder ohne charakteristische ultrastrukturelle Defekte (59 %), hat. Daher sollte der PICADAR nicht als einziger Faktor für die Einleitung einer diagnostischen Abklärung herangezogen werden und mit Vorsicht als primärer Faktor für die Einschätzung der Wahrscheinlichkeit einer PCD verwendet werden. Es werden alternative Prognoseinstrumente benötigt, insbesondere für PCD-Patienten mit normaler Körperzusammensetzung und normaler Ultrastruktur. ja 2025 dec 08 en Front. Mol. Biosci. 12 Frontiers Media SA 1691758 1691758 PCD; PICADAR; ciliary ultrastructure; motile ciliopathy; predictive tool; score; situs inversus; test sensitivity Andre Schramm Johanna Raidt Sarah Riepenhausen Caroline Marie Torp Nygaard Retno Tenardi-Wenge Tavs Qvist Pernille Witt Michael Storck Heike Olbrich Kim Gjerum Nielsen Heymut Omran incollection Lohr2025-au Im Jahr 2024 startete das GeMTeX-Projekt die bislang größte Deidentifizierungsinitiative für deutschsprachige klinische Berichte und veröffentlichte im Rahmen einer Pilotstudie GraSCCoPHI, das erste de-identifizierte deutschsprachige Goldstandard-Korpus aus synthetischen Entlassungsberichten. Die Publikation beschreibt den De-Identifizierungs-Workflow, das Management der Annotationstools sowie der Erfahrungen in der Vorannotation, etwa beim Zusammenstellen und Schulen der Annotationsteams und bei der Weiterentwicklung der Richtlinien. Im ersten Jahr entstanden intern etwa 9.000 Dokumente mit ~20 Millionen Tokens, und die Autoren berichten über quantitative Befunde zur Menge identifizierbarer Informationen pro Dokument. Wichtige Erkenntnisse sind verschiedene ungeplante Schwierigkeiten beim Rollout an sechs Klinikstandorten und die Beobachtung, dass weniger als 20 % der Annotationen einen Großteil dieser Probleme verursachen (Pareto-Effekt). ja 2025 sep 03 Studies in Health Technology and Informatics IOS Press Studies in Health Technology and Informatics Christina Lohr Jakob Faller Andrea Riedel Hung Manh Nguyen Markus Wolfien Justin Hofenbitzer Luise Modersohn Jutta Romberg Fabian Prasser Jazia Omeirat Yutong Wen Oksana Galusch Udo Hahn Marvin Seiferling Christoph Dieterich Peter Kl"ugl Franz Matthies Janina Kind Martin Boeker Markus L"offler Frank Meineke article Hoffmann2025_PMID41151842 Interstitielle Lungenerkrankung (ILD) stellt die häufigste und schwere Organerscheinung dar, die bei Patienten beobachtet wird, die mit Bindegewebeerkrankungen (CTDs) diagnostiziert werden. Ziel dieser retrospektiven Querschnittsstudie war es, klinische Risikofaktoren wie Lungensymptome, Alter, Geschlecht, Labor- und Lungenfunktionstest (PFT)-Parameter zu identifizieren, die mit dem Ausmaß der ILD in Verbindung stehen, gemessen durch künstliche Intelligenz-basierte Quantifizierung der Lungenhochauflösung berechneten Tomographie (AIqpHRCT). Wir enthielten Patienten mit einer CTD-ILD-Diagnose; alle leiden unter PFT und HRCT, und auch Lungensymptome und Entzündungserscheinungen wurden dokumentiert. AIpqHRCT wurde verwendet, um Lungenvolumen zu quantifizieren und ILD-Funktionen einschließlich Bodenglas-Optik (GGO), Retikulationen, hochauflösendes Lungenvolumen (HAV), Emphysema und Gesamtumfang von ILD. Schließlich waren 76 CTD-ILD-Patienten für Regressionsanalysen geeignet, um den Einfluss von klinischen Parametern auf das ILD-Grad zu bewerten. Die Verringerung der Streufähigkeit der Lunge für Kohlenmonoxid (DLCO), Gesamtlungskapazität (TLC) und erhöhte Entzündungsparameter war maßgeblich mit dem Ausmaß von GGO, Retikulationen, HAV und Gesamterstreckung von ILD verbunden. Pulmonale Symptome, Alter und erzwungene Lebensfähigkeit wurden nicht mit dem Ausmaß der ILD, das von AIqpHRCT quantifiziert wurde, verbunden. Die Studie präsentierte, dass DLCO und TLC für die CTD-ILD Schwere prognostiziert wurden. Folglich schlagen unsere Ergebnisse die Leistung von PFT, einschließlich DLCO für alle Patienten mit CTD vor. Bei reduziertem DLCO und DC sind weitere Diagnosen, einschließlich HRCT, erforderlich. JA 2025 Oct 10.1136/rmdopen-2025-005963 RMD open Hoffmann T Teichgräber U Lassen-Schmidt B Renz D Brüheim LB Weise T Krämer M Böttcher J Güttler F Wolf G article Seletkov2025_PMID40715621 Die Identifizierung des Krankheitsrisikos und die Erkennung von Krankheiten, bevor klinische Symptome auftreten, sind für die Frühintervention und die Verbesserung der Patientenergebnisse unerlässlich. In diesem Zusammenhang bietet die Integration der medizinischen Bildgebung in einen klinischen Workflow einen einzigartigen Vorteil durch die Erfassung detaillierter struktureller und funktionaler Informationen. Im Gegensatz zu Nicht-Bilddaten, wie Lebensstil, soziodemografischen oder früheren medizinischen Bedingungen, die sich oft auf selbst gemeldete Informationen stützen, die anfällig sind, um Vorurteile und subjektive Wahrnehmungen zu erinnern, bietet die Abbildung objektivere und verlässliche Erkenntnisse. Obwohl die Verwendung der medizinischen Bildgebung in der künstlichen Intelligenz (KI)-getriebenen Risikobewertung wächst, bleibt ihr volles Potenzial untergenutzt. In dieser Arbeit zeigen wir, wie die Bildgebung in Routine-Screening-Workflows integriert werden kann, insbesondere indem wir die in der großen prospektiven Studie UK Biobank zur Verfügung stehenden Nacken-zu-Knie- Ganzkörper-Magnetresonanz-Bildgebung (MRI)-Daten nutzen. Unsere Analyse konzentriert sich auf die dreijährige Risikobewertung für ein breites Spektrum von Krankheiten, einschließlich Herz-Kreislauf-, Verdauungs-, Stoffwechsel-, Entzündungs-, degenerativen und onkologischen Bedingungen. Wir bewerten KI-basierte Pipelines für die Verarbeitung von Ganzkörper-MRT und zeigen, dass mit bildabgeleiteten Radiomics-Features die beste Prognoseleistung, Interpretationsfähigkeit und Integrationsfähigkeit mit Nichtbilddaten bietet. JA 2025 Jul 10.1038/s41746-025-01771-3 NPJ digital medicine Seletkov D Starck S Mueller TT Zhang Y Steinhelfer L Rueckert D Braren R article Thaploo2025_PMID41094037 Olfaktorische Dysfunktion (OD) als Symptom von COVID-19 hat aufgrund seiner hohen Prävalenz in der Forschung große Aufmerksamkeit erhalten. Während es in den meisten Individuen transient ist, hält post-COVID OD in einer bemerkenswerten Teilmenge von Patienten sogar Monate bis Jahre nach der akuten Infektion. Ein tieferes Verständnis der zugrunde liegenden Faktoren, die dieses Phänomen führen, ist unerlässlich. Es gibt immer mehr Beweise für eine Einbeziehung des zentralen Nervensystems in dieses Defizit. Ziel dieser Studie war es, die strukturelle Konnektivität und Integrität von Weißstoffpfaden in Gehirnregionen zu untersuchen, die mit der olfaktorischen Verarbeitung unter Verwendung von MRT mit Diffusions Tensor-Bildgebung (DTI) bei Patienten mit persistentem Post-COVID OD verbunden sind. Die Studie umfasste 61 Patienten, unterteilt in zwei Gruppen: 31 Teilnehmer mit post-COVID OD (PC-OlfDys) und 30 post-COVID normosmic controls (PC-N). Bei MRI-Analysen wurde ein interessenorientierter Ansatz (ROI) und voxelweise statistische Vergleiche zwischen den Gruppen mit dem Alter als Kovariat verwendet. Die fraktionierte Anisotropie (FA) im linken Amygdala war in den PC-OlfDys höher als in der PC-N-Gruppe, und die radiale Diffusivität (RD) im rechten Amygdala war in der PC-OlfDys-Gruppe höher als in PC-N. Die PC-OlfDys-Gruppe zeigte höhere Depressionen und Angstwerte, gemessen durch die achtstufige Patienten-Gesundheits-Fragenskala und den allgemeinen Angststörungs- 7 Fragebogen. Diese Studie zeigt, dass post-COVID OD mit signifikanten Veränderungen der Myelierung oder des axonalen Durchmessers von olfaktorbezogenen Gehirnregionen verbunden ist. Da die amygdala, Putamen und piriforme Cortex (alle in olfaktorischer Funktion und emotionalem Wohlbefinden) Assoziationen mit Depressionen und Angstpunkten zeigten, vermuten wir, dass post-COVID OD und Depression und Angst miteinander verwandt sind, obwohl die Richtung dieser Beziehung noch geklärt werden muss. JA 2025 Oct 10.1038/s41598-025-23015-w Scientific reports Thaploo D Schmill LP Behrend N Gerlach S Fogel C Lieb W Schreiber S Maetzler W Maetzler C Krawczak M Weinert N Bahmer T Raquib S Fiedler K Vehreschild JJ Jansen O Mignot C Aludin S Laudien M article Schulze-Weddige2025_PMID40805199 Intracerebrale Hämorrhage (ICH) im Zusammenhang mit primären und metastasierenden Hirntumoren stellt eine erhebliche Herausforderung in der Neuroonkologie aufgrund des erheblichen Risikos von Komplikationen [...]. JA 2025 Jul 10.3390/cancers17152502 Cancers Schulze-Weddige S Baumgärtner GL Orth T Scheel M Wasilewski D Wattjes MP Hanning U Kniep H Penzkofer T Nawabi J article Lindholz2025_PMID39754865 Die Gesichtserkennungstechnologie in der medizinischen Bildgebung, insbesondere bei Kopfscans, stellt aufgrund identifizierbarer Gesichtszüge Datenschutzrisiken dar. Diese Studie wertet den Einsatz von Gesichtserkennungssoftware bei der Identifizierung von Gesichtsmerkmalen aus Kopf-CT-Scans aus und erforscht mit TotalSegmentator eine defacing Pipeline, um die Wiedererkennungsrisiken zu reduzieren und die Datenintegrität für die Forschung zu bewahren. 1404 hochwertige Renderings aus dem UCLH EIT Stroke Datensatz, sowohl mit als auch ohne Rücksicht wurden analysiert. Die Leistungsfähigkeit der von TotalSegmentator erstellten Gesichtsmaske wurde mit einem hochmodernen CT-Vernichtungsalgorithmus verglichen. Gesichtserkennung wurde mit Deep Learning Modellen durchgeführt. Die Kosinusähnlichkeit zwischen Gesichtseinbettungen für intra- und interpatientische Bilder wurde verglichen. Eine Support Vector Maschine wurde auf Cosinus-ähnliche Werte trainiert, um die Abstoßleistung zu bewerten, was bestimmt, ob zwei Renderings von demselben Patienten kamen. Diese Analyse wurde auf defaced und non-defaced Bildern mit 5-facher Quervalidierung durchgeführt. Gesichter wurden in 76,5 % nicht abgegrenzten Bildern nachgewiesen. Intra-Patient-Bilder zeigten eine mediane Kosinus-ähnlichkeit von 0,65 (IQR: 0.47-0.80), verglichen mit 0,50 (IQR: 0.39-0.62) für inter-Patient-Bilder. Ein binärer Klassifikator wurde mäßig auf nicht abgetasteten Bildern durchgeführt, wobei ein ROC-AUC von 0,69 (SD = 0,01) und eine Genauigkeit von 0,65 (SD = 0,01) erreicht wurde, um zu unterscheiden, ob ein Scan derselben oder einer anderen Person gehörte. Nach dem Abklingen ging die Leistung deutlich zurück. Die Defacation mit dem TotalSegmentator verringerte den ROC-AUC auf 0,55 (SD = 0,02) und die Genauigkeit auf 0,56 (SD = 0,01), während der CTA-DEFACE-Algorithmus die Leistung auf eine ROC-AUC von 0,60 (SD = 0,02) und eine Genauigkeit von 0,59 (SD = 0,01) reduzierte. Diese Ergebnisse zeigen die Wirksamkeit der Abgrenzung von Algorithmen bei der Minderung von Re-Identifikationsrisiken, wobei der TotalSegmentator einen leicht überlegenen Datenschutz bietet. Gesichtserkennung Software kann Gesichtsmerkmale aus Teil- und Vollkopf-CT-Scan Renderings identifizieren. Die Verwendung des TotalSegmentators zur Deface-Bilder reduziert jedoch die Neuidentifikationsrisiken auf ein Nah-Chance-Level. Wir bieten Code an, um diese datenschutzrechtliche Pipeline zu implementieren. Durch die Nutzung des TotalSegmentator-Frameworks entfernt die vorgeschlagene Pipeline die Gesichtseigenschaften von CT-Bildern effizient und ist damit ideal für die Mehr-Site-Forschung und den Datenaustausch. Es ist ein nützliches Werkzeug für Radiographen und Radiologen, die medico-legale Anforderungen erfüllen müssen, die die Entfernung von Gesichtsmerkmalen erfordern. JA 2025 Jan 10.1016/j.radi.2024.12.018 Radiography (London, England : 1995) Lindholz M Ruppel R Schulze-Weddige S Baumgärtner GL Schobert I Schmidt R Auer TA Nawabi J Stepansky L Poggi L Hosch R Hamm CA Penzkofer T article hamdan_apoe4_2025 Das Protein Apolipoprotein E4 (APOE4) ist ein bekannter Risikofaktor für Alzheimer und könnte auch den Verlauf von COVID-19 beeinflussen. In dieser Studie wurden Gehirn- und Lungenproben von 38 Menschen untersucht, die an COVID-19 gestorben waren, um den Zusammenhang zwischen APOE4 und Entzündungsreaktionen im Gehirn zu klären. Dabei zeigte sich, dass APOE4-Träger, besonders aus der ersten Infektionswelle, häufiger vorkamen und eine stärkere Aktivierung von Mikroglia (Immunzellen des Gehirns) aufwiesen. Diese verstärkte Entzündung war vor allem im Kleinhirn zu sehen und betraf Männer stärker als Frauen. Zudem hing eine hohe Virusmenge in der Lunge mit einer stärkeren Entzündungsreaktion im Kleinhirn zusammen, weshalb das Kleinhirn bei der Erforschung von Infektionskrankheiten stärker berücksichtigt werden sollte. JA 2025 dec eng 1440-1789 10.1111/neup.70033 Neuropathology: Official Journal of the Japanese Society of Neuropathology 45 e70033 6 Aged, COVID-19, Humans, Male, Middle Aged, SARS-CoV-2, Brain, Aged, 80 and over, Female, Adult, microglia, neuroinflammation, COVID‐19, SARS‐CoV‐2, Microglia, APOE, Apolipoprotein E4, Homozygote, nucleocapsid Amar Hamdan Yassir El-Amri Fabian Heinrich Osama A. A. Mohamed Diego Sepulveda-Falla Markus Glatzel Jakob Matschke Susanne Krasemann article Louizi2025_PMID40657231 Eine Verbindung zwischen zerebralen Weißen Materie Hyperintensitäten und koronaren Arterienerkrankungen ist weit verbreitet. Beide Bedingungen sind bei älteren Menschen häufiger. Während weiße Materie Hyperintensitäten oft mit kleinen Gefäßerkrankungen verbunden sind, ist die Atherosklerose die Hauptursache für koronare Arterienerkrankungen. Wir bewerteten die Inszenierung von CT-Scans des Körpers und die Inszenierung von Hirn-MRIs von Patienten mit neu diagnostiziertem malignem Melanom (ohne Metastasis) zwischen 01/01/2015 und 06/30/2023. Die CT-Scans wurden mit einer veränderten visuellen Gesamtbewertung auf Koronararterieerkrankungen bewertet. Fazekas-Scores wurden verwendet, um die MRT für Veränderungen der weißen Materie zu bewerten. Weitere klinische Daten wurden aus digitalen Patientenaufzeichnungen gewonnen. Wir analysierten Daten von 120 Patienten (57 Weibchen, mittleres Alter 68 Jahre, Standardabweichung 14 Jahre) und fanden eine Korrelation zwischen koronarer Arterienerkrankung und beides Alter (r = 0,48, α = 0,04) und Fazekas-Score (periventricular r = 0.46, subkortical and deep white matter r = 0.55). Ein lineares Modell einschließlich Alter, koronare Arterienerkrankungen, Diabetes und arterielle Hypertonie diente als Prädiktor für die weiße Materieerkrankung und zeigte signifikante Korrelationen. Die Zugabe von (1) Atherosklerose sowie (2) Karotidstenose zum Modell führten zu (1) einer leichten Abnahme der Bedeutung und (2) zur Entformung einer potentiellen spurigen Korrelation mit Karotidstenose. Es gibt eine signifikante Korrelation zwischen Weißstoff-Hyperintensitäten und sowohl karotidierten Stenosen als auch koronaren Arterienerkrankungen. Diese Erkenntnis ist klinisch relevant: Bei Patienten mit weißer Materie sollten Hyperintensitäten und koronarer Arterienerkrankung die Karotidstenose ausgeschlossen werden. JA 2025 10.3389/fnimg.2025.1559481 Frontiers in neuroimaging Louizi C Khadhraoui E Lotz J Behme D Fuchs E Kowallick JT Müller SJ article Leberzammer.2025 AIMS Patients with cardiovascular disease (CVD) have an increased risk of developing severe respiratory infections, including COVID-19. However, the underlying molecular mechanisms are not completely understood. It has been previously shown that cardiovascular disease predisposes to an altered responsiveness to subsequent inflammatory triggers by an imprinted epigenetic memory in innate immune cells. Therefore, we hypothesized that patients with preexisting atherosclerotic cardiovascular disease (ASCVD) and COVID-19 display a dysregulated inflammatory response compared to patients without ASCVD due to epigenetically altered immune cells leading to increased disease severity. METHODS AND RESULTS Single-cell RNA sequencing revealed a dysregulated myeloid immune response with hyperinflammatory and immunosuppressive features in patients with ASCVD and moderate COVID-19. Assay for Transposase-Accessible Chromatin sequencing and in-vitro experiments with isolated monocytes infected with SARS-CoV-2 showed epigenetic priming of monocytes from patients with ASCVD towards increased expression of inflammatory mediators and type I interferon signalling. In a German nationwide cohort (NAPKON), using multiplex cytokine assays, enzyme-linked immunosorbent assays, and bulk-RNA-sequencing, we confirmed that patients with ASCVD display an exaggerated inflammatory response during moderate COVID-19. CONCLUSIONS This study demonstrates that patients with ASCVD show a dysregulated myeloid immune response in moderate COVID-19 disease. Mechanistically, epigenetic imprinting sensitizes myeloid cells of patients with ASCVD to an exaggerated type I interferon-associated immune response. TRANSLATIONAL PERSPECTIVE This study evaluates the underlying molecular mechanisms of worse outcomes of patients with atherosclerotic cardiovascular disease during respiratory infections, specifically COVID-19. Patients with atherosclerotic cardiovascular disease present with a dysregulated hyperinflammatory, type I interferon-driven immune response already during moderate COVID-19. This not only explains a major risk factor for severe COVID-19 but might also enable targeted therapies for this specific risk group. JA 2025 10.1093/cvr/cvaf268 Cardiovascular research Julian Leberzammer Wesley Tyler Abplanalp Katharina Grikscheit Emmanouil G. Solomonidis Simone-Franziska Glaser Bianca Schuhmacher Maximilian Merten Gligorije Jeremijev Annett Wilken-Schmitz Lara Korth David John Stefan Günther Carsten Kuenne Mario Looso Chanil Valasarajan Vladimir Benes Ferris Jung Vivianne Niehaus Gabriele Anton Christoph Stellbrink Christoph Römmele Siri Göpel Soni Savai Pullamsetti Janne Vehreschild Maria Vehreschild Sandra Ciesek David M. Leistner Andreas M. Zeiher Stefanie Dimmeler Sebastian Cremer article Lackner2025_PMID41313446 Computed Tomography (CT) Scans sind für die Bestrahlungsplanung unerlässlich und liefern wesentliche Daten für Dosisberechnungen. Diese Studie untersuchte retrospektive Bildgebungsdosen, Scanlängen und Protokollhaftung zur Unterstützung der Bildoptimierung und zur Verringerung der Patientenstrahlung. Aus dem institutionellen Bildarchivierungs- und Kommunikationssystem (PACS) wurden CT-Daten von Patienten, die in der Zeit 04/2021 bis 12/2024 einer externen Strahlentherapie und einer Brachytherapie unterzogen wurden, abgerufen. Imaging-Dosen (volumetrischer CT-Dosenindex [CTDIvol] und Dosislängenprodukt [DLP]) wurden aus Dosisberichten extrahiert. Die Automatisierte Organsegmentierung wurde verwendet, um die Einhaltung der Standard-Betriebsverfahren (SOPs) durch Schätzung anatomischer Scanlängenunterschiede zu beurteilen. Zusätzliche Qualitätssicherung überprüft das geprüfte Protokoll und die Abbildungskonsistenz. Messprotokolle zeigten den höchsten CTDIvol (73 ± 12 mGy), während Kopf- und Halsprotokolle höhere DLP-Werte (3212 ± 757 mGy·cm hatten. Das Lungen 4D-Protokoll zeigte eine höhere effektive Dosis (23 ± 9 mSv) im Vergleich zum Standard Lungenprotokoll. Anatomische Abtastlängenunterschiede wurden an der unteren Grenze im oberen Bauch (120 ± 75 mm) und Wirbelsäule (155 ± 159 mm) beobachtet, was die Möglichkeiten zur Verbesserung des Arbeitsablaufs anzeigt. Die Verbesserung von CT-Workflows für Strahlentherapiepatienten ist wichtig und machbar. Dose- und Scan-Längenanalysen legen nahe, dass die Revision institutioneller SOPs, die Optimierung der Röntgenröhrenmodulation und die Verfeinerung der Scan-Längengrenzen für dieses Ziel berücksichtigt werden sollten. JA 2025 Nov 10.1007/s00066-025-02494-w Strahlentherapie und Onkologie : Organ der Deutschen Rontgengesellschaft ... [et al] Lackner NA Brandt T Ott OJ Putz F Strnad V May MS Fietkau R Bert C Szkitsak J article Garajová2025_PMID41169122 Ein effektives Dosismanagement in der Computertomographie wird durch 2 zentrale operative Herausforderungen behindert: eine fehleranfällige manuelle Protokoll-Mapping und das hohe Volumen an nicht reaktionsfähigen Alarmen aus fester diagnostischen Referenzebene (DRLs). Diese "altere Müdigkeit" schafft ein Risiko, klinisch signifikante Dosisabweichungen zu überblicken. Diese Studie zielte darauf ab, einen neuartigen künstlichen Intelligenz (KI)-gestützten Rahmen zu entwickeln und auszuwerten, um die Scan-Klassifikation zu automatisieren und einen patientenspezifischen Kontext für die Dosisbeurteilung bereitzustellen. Diese retrospektive Studie analysierte 2955 CT-Bestrahlungsereignisse. Es wurde eine Verarbeitungspipeline entwickelt, die zunächst eine automatisierte Körpersegmentierung mit einem tiefen Lernmodell durchführt. Ein zufälliger Waldklassifikator wurde dann auf die resultierenden Organvolumina trainiert, um 15 verschiedene Scanbereiche zu identifizieren. Für 4 gemeinsame Untersuchungstypen wurden lineare Regressionsmodelle ermittelt, um den CT-Dosenindex (CTDIvol) basierend auf der mittleren Querschnittsfläche des Patienten zu prognostizieren. Die Fälle wurden als statistische Ausreißer identifiziert, wenn der absolute standardisierte Rest > 2 war. Die Anzahl dieser Ausreißer wurde mit der Anzahl der üblichen DRL-Überschreitungen verglichen. Der automatisierte Scanbereich Klassifikator erreichte eine hohe Genauigkeit mit einem makrodurchschnittenen F1-Score von 93,8% auf dem Hold-out-Testsatz. Die Regressionsmodelle zeigten eine klare lineare Korrelation zwischen Patientenanatomie und CTDIvol (r = 0,56 bis 0,79). Die patientenspezifischen Modelle identifizierten deutlich weniger Fälle zur Überprüfung (60 statistische Ausreißer) im Vergleich zum Standard DRL-basierten Verfahren (170 Überschreitungen). Die manuelle Analyse bestätigte, dass alle markierten Fälle klinisch gerechtfertigt waren. Unsere Ergebnisse bestätigen, dass ein AI-gestützter, patientenzentrierter Rahmen eine hochwirksame Strategie für das Dosismanagement ist. Durch die Verschiebung des Paradigmas von starren, bevölkerungsbasierten Schwellen auf eine dynamische, patientenspezifische Bewertung, bietet unser Ansatz eine effektivere Methode zur Identifizierung potenzieller Dosisabweichungen und reduziert die Belastung nicht reaktionsfähiger Alarme erheblich. Diese Arbeit zeigt einen Kurs auf einen neuen Standard der Strahlungsdosisüberwachung, das Feld in Richtung einer effizienteren und zuverlässigeren Form der personalisierten Dosisüberwachung voranzutreiben. JA 2025 Oct 10.1097/RLI.0000000000001247 Investigative radiology Garajová L Theis M Nowak S Kütting D Block W Luetkens JA article Schulze-Weddige2025_PMID40868387 Das differenzierte Wachstum der sekundären Lebermetastasen ist für die frühe Erkennung von Progression wichtig, bleibt aber aufgrund variabler Tumorwachstumsraten herausfordernd. Wir wollten eine genaue, konsequente und effiziente Längsüberwachung automatisieren. Wir entwickelten einen automatischen 3D-Segmentierungs- und Tracking-Algorithmus, um das differentielle Wachstum zu quantifizieren, getestet auf kontrastverstärkten MRI-Follow-ups von Patienten mit neuroendocrine Lebermetastasen (NELMs). Die Ausgabe wurde in ein Entscheidungshilfeinstrument integriert, um zwischen fortschreitender Krankheit, stabiler Krankheit und teilweiser/vollständiger Reaktion zu unterscheiden. Eine Anwenderstudie, die eine Expertengruppe von sieben Expertenradiologen umfasst, hat ihre Auswirkungen bewertet. Gruppenvergleiche nutzten den Friedman-Test mit Post-hoc-Analysen. Unser Algorithmus entdeckte 991 Metastasen bei 30 Patienten: 13% neu, 30% progressiv, 18% stabil und 18% regressiv; der Rest war entweder zu klein, um (15%) zu messen oder mit einer anderen Metastasierung in der Folgebewertung (6%) zusammengeführt. Die Diagnosegenauigkeit verbesserte sich mit zusätzlichen Informationen über die Lebertumorbelastung und das Differenzwachstum, wenn auch nicht signifikant (p = 0,72). Die Diagnosezeit wurde erhöht (>i>p < 0,001). Alle Radiologen fanden die Methode nützlich und drückten den Wunsch aus, sie in bestehende diagnostische Werkzeuge zu integrieren. Wir automatisierten Segmentierung und Quantifizierung einzelner NELMs und ermöglichen eine umfassende Längsanalyse des differentiellen Tumorwachstums mit dem Potenzial, die klinische Entscheidungsfindung zu verbessern. JA 2025 Aug 10.3390/bioengineering12080874 Bioengineering (Basel, Switzerland) Schulze-Weddige S Fehrenbach U Kolck J Ruppel R Baumgärtner GL Lindholz M Schobert IT Jann H Mogl M Geisel D Wiedenmann B Penzkofer T article Ziegler2025_PMID40233352 Real-world-Daten (RWD) aus Quellen wie administrativen Ansprüchen, elektronischen Gesundheitsaufzeichnungen und Krebsregistrierungen bieten Einblicke in Patientenpopulationen jenseits der eng regulierten Umgebung von randomisierten kontrollierten Studien. Um dies zu nutzen und die Krebsforschung voranzutreiben, haben 6 Universitätskliniken in Bayern eine gemeinsame Forschungs-IT-Infrastruktur aufgebaut. Diese Studie zielte darauf ab, das Design, die Implementierung und den Einsatz einer modularen Datentransformationspipeline zu skizzieren, die die onkologische RWD in ein Health Level 7 (HL7) Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR)-Format verwandelt und dann in ein tabellarisches Format in Vorbereitung auf eine föderierte Analyse (FA) in den 6 bayerischen Krebsforschungszentrum Universitätskliniken. Um RWD effektiv zu nutzen, haben wir eine Pipeline entwickelt, um den onkologischen Basisdatensatz (oBDS) in HL7 FHIR Format umzuwandeln und auf FA vorzubereiten. Die Pipeline behandelt vielfältige IT-Infrastrukturen und -Systeme, wobei die Daten für die Analyse dezentralisiert bleiben. Um die Funktionalität und Gültigkeit unserer Umsetzung zu bewerten, haben wir eine Kohorte festgelegt, um zwei spezifische medizinische Forschungsfragen zu behandeln. Wir haben unsere Ergebnisse ausgewertet, indem wir die Ergebnisse der FA mit Berichten aus dem Bayerischen Krebsregister und den Originaldaten aus lokalen Tumordokumentationssystemen vergleichen. Wir führten eine FA von 17,885 Krebsfällen ab 2021/2022 durch. Brustkrebs war die häufigste Diagnose an 3 Standorten, Prostatakrebs in den Top 2 an 4 Standorten, und malignes Melanom war besonders verbreitet. Geschlechtsspezifische Trends zeigten Larynx- und Esophaguskrebse waren bei Männern häufiger, während Brust- und Schilddrüsenkrebs bei Frauen häufiger war. Diskrepanzen zwischen dem Bayerischen Krebsregister und unseren Daten, wie höhere Rate von malignem Melanom (3400/63,771, 5,3% vs 1921/17,885, 10,7%) und niedrigere Darstellung von Dickdarmkrebs (8100/63,771, 12,7% vs 1187/17,885, 6,6%) wahrscheinlich aus Differenzen in den untersuchten Zeiträumen (2019 vs 2021/2022) und dem Umfang der Daten resultieren. Das Bayerische Krebsregister berichtet ungefähr 3 mal mehr Krebsfälle als allein die 6 Universitätskliniken. Die modulare Pipeline hat die onkologische RWD in 6 Krankenhäusern erfolgreich transformiert, und der föderierte Ansatz bewahrte die Privatsphäre und ermöglicht eine umfassende Analyse. Zukünftige Arbeiten werden die Unterstützung neuer oBDS-Versionen hinzufügen, Datenqualitätsprüfungen automatisieren und zusätzliche klinische Daten integrieren. Unsere Ergebnisse unterstreichen das Potenzial von federgeführten Gesundheitsdatennetzwerken und legen den Grundstein für die zukünftige Forschung, die hochwertige RWD nutzen kann, um wertvolle Kenntnisse auf dem Gebiet der Krebsforschung beizutragen. JA 2025 Apr 10.2196/65681 Journal of medical Internet research Ziegler J Erpenbeck MP Fuchs T Volkmer PC Schmidt G Eicher J Pallaoro P De Souza Falguera R Aubele F Hagedorn M Vansovich E Raffler J Ringshandl S Maurer JK Kühnel B Schenkirsch G Kampf M Kapsner LA Ghanbarian H Spengler H Soto-Rey I Albashiti F Hellwig D Ertl M Fette G Kraska D Boeker M Prokosch HU Gulden C article Moradi2025_PMID40213035 Die Strahlentherapie (RT) ist bei der Behandlung von Kopf- und Halskrebs (HNC) von wesentlicher Bedeutung, wobei die Magnetresonanztomographie (MRI)-geführte RT einen überlegenen Weichgewebekontrast und eine funktionelle Abbildung bietet. Die manuelle Tumorsegmentierung ist jedoch zeitaufwendig und komplex und bleibt daher eine Herausforderung. In dieser Studie stellen wir unsere Lösung als Team TUMOR der HNTS-MRG24 MICCAI Challenge vor, die sich auf die automatisierte Segmentierung von primären Bruttotumorvolumina (GTVp) und metastasierenden Lymphknoten Bruttotumorvolumen (GTVn) in Vor-RT- und Mid-RT-Bildern konzentriert. Wir nutzten den HNTS-MRG2024 Datensatz, der aus 150 MRI-Scans von Patienten besteht, die mit HNC diagnostiziert werden, einschließlich Original- und registrierte Pre-RT- und Mid-RT-T2-gewichtete Bilder mit entsprechenden Segmentierungsmasken für GTVp und GTVn. Wir beschäftigten zwei hochmoderne Modelle in Deep Learning, nnUNet und MedNeXt. Für Task 1 haben wir Modelle auf vor-RT registrierten und mittleren-RT-Bildern vortrainiert, gefolgt von Feinabstimmung auf originalen Vor-RT-Bildern. Für Task 2 haben wir registrierte Pre-RT-Bilder, registrierte Pre-RT-Segmentationsmasken und Mid-RT-Daten als Multi-Channel-Eingabe für das Training zusammengefasst. Unsere Lösung für Task 1 erreichte 1. Platz in der endgültigen Testphase mit einem aggregierten Dice Ähnlichity Coeffizient von 0.8254 und unserer Lösung für Task 2 auf Platz 8 mit einem Score von 0.7005. Die vorgeschlagene Lösung ist im Github Repository öffentlich verfügbar. JA 2025 10.1007/978-3-031-83274-1_10 Head and Neck Tumor Segmentation for MR-Guided Applications : First MICCAI Challenge, HNTS-MRG 2024, held in conjunction with MICCAI 2024, Marrakesh, Morocco, October 17, 2024, proceedings Moradi N Puladi B Kleesiek J Fatemizadeh E Luijten G Alves V Egger J article Lindholz2025_PMID40674943 Radiologie-Berichte können sich während des Workflows ändern, vor allem, wenn die Bewohner vorläufige Versionen erstellen, die die Ärzte abschließend behandeln. Wir untersuchten, wie große Sprachmodelle (LLMs) und Einbettungstechniken diese Veränderungen in textuellen, semantischen oder klinisch handlungsfähigen Typen kategorisieren können. Wir haben 400 adulte CT-Berichte ausgewertet, die von Bewohnern gegen abgeschlossene Versionen von Ärzten erstellt wurden. Änderungen wurden in einer fünf-Punkt-Skala von keiner Veränderung zu kritischen bewertet. Wir untersuchten Open-Source-LLMs neben traditionellen Metriken wie normalisierte Wortunterschiede, Levenshtein und Jaccard Ähnlichkeit und Texteinbettung Ähnlichkeit. Die Modellleistung wurde mit quadratisch gewichteten Cohen's kappa (κ), (balanced) Genauigkeit, F₁, Präzision und Rückruf bewertet. Die Inter-Rater-Verlässlichkeit bei den Evaluatoren war ausgezeichnet (κ = 0.990). Von den analysierten Berichten enthielten 1,3 % kritische Veränderungen. Die getesteten Verfahren zeigten signifikante Leistungsunterschiede (P < 0,001). Das Qwen3-235B-A22B-Modell mit einer Null-Schuss-Prompt, die am besten mit menschlichen Einschätzungen von Veränderungen in klinischen Berichten fluchtet und einen κ von 0,822 (SD 0.031) erreicht. Die beste konventionelle Metrik, Wortdifferenz, hatte einen κ von 0,732 (SD 0,048), die Differenz zwischen den beiden zeigte statistische Bedeutung bei unjustierten Post-hoc-Tests (P = 0,038), aber verlorene Bedeutung nach Einstellung für Mehrfachtests (P = 0,064). Einbettungsmodelle im Vergleich zu LLMs und klassischen Methoden, die in den meisten Fällen statistische Bedeutung zeigen. Große Sprachmodelle wie Qwen3-235B-A22B zeigten eine moderate bis starke Ausrichtung mit Expertenauswertungen der klinischen Bedeutung von Veränderungen in Radiologieberichten. LLMs vertiefte Einbettungsmethoden und traditionelle String- und Wortansätze, wobei in den meisten Fällen statistische Bedeutung zukommt. Dies zeigt ihr Potenzial als Werkzeuge zur Unterstützung der Peer Review. JA 2025 Oct 10.1016/j.ejrad.2025.112316 European journal of radiology Lindholz M Ruppel R Schulze-Weddige S Baumgärtner GL Schobert I Eminovic S Hamm CA Penzkofer T article Schmidt2025_PMID40282451 Background/Objectives: Ziel dieser Studie war es, den prognostischen Wert der etablierten Antwortbewertungstools für hepatozelluläres Karzinom (HCC) zu untersuchen, das mit einer hoch dosierten interstitiellen Brachytherapie (iBT) allein oder mit transarterialer Chemoembolisierung (cTACE) behandelt wird. Methoden: (Non-)Referenten wurden unter Verwendung von größenbasierten RECIST 1.1 und WHO-Kriterien, Enhance-basierten MRECIST- und EASL-Kriterien und dem LI-RADS-Behandlungsreaktionsalgorithm (LR-TRA)Kategorisiert. Die Ergebnisse waren das Gesamtüberleben (OS), das progressionsfreie Überleben (PFS) und die Zeit zur Progression (TTP). Die verwendeten Statistiken enthielten Fisher's genaue Test, ein t-Test, den Mann-Whitney-U Test und eine Kaplan-Meier-Analyse. Die Median OS, PFS und TTP waren bei Patienten nach iBT (26.3, 9.1 und 13.0 Monaten) höher als nach cTACE/iBT (23.3, 7.6 und 9.2 Monaten). Ergebnisse: Die Enhance-basierten Kriterien identifizierten mehr Beantworter und prognostizierten PFS und TTP besser im Vergleich zu den größenbasierten Kriterien. In zwei Monaten zeigten die cTACE/iBT-Ansprecher eine verbesserte PFS (mRECIST und EASL: 11.3 vs. 2.3 und 11.0 vs. 2.3, p < 0.01) und TTP (mRECIST und EASL: 11.9 vs. 2.4 Monate, p>/i> 0.01) durch die verbesserungsbasierten Kriterien. Eine EASL-Bewertung in fünf Monaten prognostizierte ein verbessertes Überleben sowohl nach cTACE/iBT (PFS: 11,9 vs. 5.1 Monate, p = 0,03; TTP: 12,4 vs. 5.0, p < 0.01) als auch nach iBT (11.1 vs. 5.1 Monate, p>/i> = 0,04; 13,0 vs. Das LR-TRA zeigte für cTACE/iBT-Ansprecher fünf Monate OS-Leistungen. Größenbasierte Kriterien waren nicht prognostisch. Ausschlüsse: Die Verlängerung der Nachverfolgung nach dem iBT oder nach dem iBT/cTACE kann die Schichtung und Prognose der Befragten verbessern. JA 2025 Apr 10.3390/cancers17081275 Cancers Schmidt R Rueger C Xu H He Y Yilmaz EY Heidemann L Sulejmani O Liu Y Noack L Hesse F Ruppel R Abosabie SA Hamm CA Penzkofer T Gebauer B Savic LJ article Eminovic2025_PMID40559098 Background/Objectives: Diese Studie vergleicht die Genauigkeit der Antworten von hochmodernen Großsprachenmodellen (LLMs) auf Patientenfragen vor der CT- und MRT-Bildgebung. Wir wollen das Potenzial von LLMs bei der Verbesserung der Workflow-Effizienz demonstrieren und gleichzeitig Risiken wie Fehlinformationen hervorheben. Methods>/b>: Es gab 57 CT-bezogene und 64 MRT-bezogene Patientenfragen an ChatGPT-4o, Claude 3.5 Sonnet, Google Gemini und Mistral Large 2. Jede Antwort wurde von zwei brettzertifizierten Radiologen bewertet und mit einer 5-Punkt-Skala für Genauigkeit/Korrektheit/Gewohnheit bewertet. Statistiken verglichen LLM-Leistungen in Fragekategorien. Results: ChatGPT-4o erreichte die höchsten durchschnittlichen Punkte für CT-bezogene Fragen und bindet mit Claude 3.5 Sonnet für MRT-bezogene Fragen, mit höheren Punkten über alle Modelle für MRT (ChatGPT-4o: CT [4.52 (± 0.46)], MRT: [4.79 (± 0.37)]; Google Gemini: CT [4.44] Mindestens eine Antwort pro LLM wurde als ungenau bewertet, wobei Google Gemini am häufigsten potenziell irreführend beantwortet (in 5,26% für CT und 2,34% für MRT). Mistral Large 2 wurde von ChatGPT-4o für alle CT-bezogenen Fragen (p>/i> < 0.001) und von ChatGPT-4o (p = 0.003), Google Gemini (p>/i> = 0.022) und Claude 3.5 Sonnet (p>/i> = 0.004) für alle CT Contrast Medieninformationsfragen überholt. Ausschlüsse : Obwohl alle LLMs insgesamt gut durchgeführt und großes Potenzial für die Patientenerziehung zeigte, zeigte jedes Modell gelegentlich potenziell irreführende Informationen, was das klinische Anwendungsrisiko hervorhebt. JA 2025 Jun 10.3390/jpm15060235 Journal of personalized medicine Eminovic S Levita B Leppig JA Nawabi J Penzkofer T article Graf2025_PMID39857998 Ziel dieser retrospektiven Studie war es, den Wert der kontrastverstärkten berechneten Tomographie (CE-CT) Bildmerkmale an der Basislinie und nach der neoadjuvanten Chemotherapie bei der Vorhersage histopathologischer Reaktionen bei Patienten mit Adenokarzinom der gastroesophagealen Verbindung (GEJ) zu bewerten. Insgesamt 105 Patienten mit einer Diagnose des Adenokarzinoms des GEJ wurden von CE-CT an der Basislinie untersucht und nach der Neoadjuvant Chemotherapie präoperativen. Alle Patienten unterzogen chirurgische Resektion. Histopathologische Parameter und Tumorregressionsstufen nach Becker et al. wurden bei 93 Patienten gesammelt. Mit ImageJ wurden Linienprofile der primären Tumorfläche in Basis- und präoperativen CE-CT generiert. Maximale Tumordichte und Tumor-zu-Wanddichte Delta wurden berechnet und mit der histopathologischen Tumorantwort korreliert. Darüber hinaus wurde die Tumorantwort nach Standard-RECIST-Messungen bei allen Patienten und durch Endoskopie bei 72 Patienten bewertet. Die Baseline und die Änderung der Basislinie auf präoperative CE-CT-Parameter zeigten keine signifikanten Unterschiede zwischen den Befragten (Becker-Grade 1a, 1b) und Nicht-Antragern (Becker-Grade 2, 3). Nach der Neoadjuvant-Therapie zeigten die Befragten und Nicht-Antrager signifikante Unterschiede in der maximalen Dichte und der Tumor-zu-Wanddichte Delta-Werte. Linienprofilmessungen zeigten eine ausgezeichnete Inter-Rater-Vereinbarung. Im Vergleich dazu zeigten weder RECIST noch Endoskopie signifikante Unterschiede zwischen diesen Gruppen. Nachbehandlung CE-CT kann histopathologische Therapiereaktion auf Neoadjuvantbehandlung im Adenokarzinom von GEJ-Patienten mit hoher Genauigkeit vorhersagen und so das Patientenmanagement verbessern. JA 2025 Jan 10.3390/cancers17020216 Cancers Graf M Ziegelmayer S Reischl S Teumer Y Gassert FT Marka AW Raffler P Bachmann J Makowski M Reim D Lohöfer F Burian E Braren R article allgoewer_nationale_2025 Obduktionen spielen eine zentrale Rolle in der Aufklärung von Todesursachen, der Qualitätssicherung in der Medizin und der biomedizinischen Forschung. Während der COVID-19-Pandemie rückte ihr wissenschaftlicher Wert erneut in den Fokus. In diesem Kontext entstand das Nationale Obduktionsnetzwerk (NATON) als interdisziplinäre Plattform für krankheitsbezogene postmortale Forschung. Das Obduktionsnetzwerk umfasst aktuell Institute von über 90 % der deutschen Universitätsklinika und vereint Rechtsmedizin, Pathologie und Neuropathologie in einem einzigartigen Verbund. 2780 vollständige Obduktionsdatensätze und Informationen zu mehr als 67.000 postmortalen Gewebeproben wurden zentral erfasst. Neue krankheitsspezifische Registermodule – etwa zu weiteren Infektionskrankheiten, Arzneimittelerkrankungen, Tumorerkrankungen, intensivmedizinischen Verläufen und plötzlichem Herztod – sollen das Spektrum der Forschung erweitern. Die Rechtsmedizin trägt mit hoher Obduktionsfrequenz und spezifischer Fachexpertise entscheidend zur Weiterentwicklung des Netzwerks bei. JA 2025 aug de 1434-5196 10.1007/s00194-025-00784-2 Rechtsmedizin COVID-19, Pandemics, Biomedical research, Registries, Academic medical centers, Multizentrische Forschung, Obduktionsregister, Postpandemie, Universitätsmedizin https://doi.org/10.1007/s00194-025-00784-2 Kristina Allgoewer Svenja Windeck Christiane Stark Anna Katharina Kuderna Saskia Stillfried Falko Fend Jessica Pablik Bruno Märkl Tina Schaller Helena Radbruch Peter Boor Benjamin Ondruschka article Schmitt.2025 With the Network of University Medicine (NUM) and the Medical Informatics Initiative (MII), the BMBF is funding two pioneering, structure-building research measures that are now being merged. The data integration centers (DIZ) of the MII are to be consolidated in the NUM. The aim is to establish a standardized research infrastructure within which the existing data from the clinical routine care of the 36 German university hospitals, from clinical cohorts and clinical-epidemiological studies can be used for various research questions upon request and via coordinated processes. The legal basis for this was the MII's \textquotedblInformed Broad Consent\textquotedbl, which had been agreed upon with ethics committees and data protection authorities and implemented in all NUM locations, with a so-called \textquotedblhealth insurance module\textquotedbl that allows the collection and linking of routine medical data from statutory health insurance funds (GKV) and private health insurers (PKV) as a category of care-related data (VeDa). Linking this routine data with data from hospital information systems offers particularly high potential, as no single data source provides a complete picture of medical care and the two data sources complement each other optimally. The aim now is to integrate this routine data into the NUM's secure, transparent and participatory research infrastructure in a strategic partnership with statutory health insurance funds and private health insurance companies. This promotes Germany in its role as a research location and makes a decisive contribution to improving the quality and safety of healthcare in Germany in an evidence-based manner. Das BMBF fördert mit dem Netzwerk Universitätsmedizin (NUM) und der Medizininformatik-Initiative (MII) zwei richtungsweisende strukturbildende Forschungsmaßnahmen, die nun zusammengeführt werden. Die Datenintegrationszentren (DIZ) der MII sollen im NUM verstetigt werden. Ziel ist der Aufbau einer einheitlichen Dateninfrastruktur, innerhalb der die vorhandenen Daten aus der klinischen Routineversorgung der 36 deutschen Universitätskliniken des NUM, aus klinischen Kohorten und klinisch-epidemiologischen Studien auf Antrag und über abgestimmte Prozesse für unterschiedliche Forschungsfragen genutzt werden können. Rechtsgrundlage bildet hierfür der mit Ethikkommissionen und Datenschutzbehörden abgestimmte und in allen NUM-Standorten implementierte „Broad Consent“ der Universitätsmedizin mit einem so genannten „Kassenmodul“, das die Erhebung und Verlinkung von medizinischen Routinedaten der gesetzlichen Krankenversicherung (GKV) und der privaten Krankenversicherungen (PKV) als eine Kategorie versorgungsnaher Daten (VeDa) erlaubt. Die Verknüpfung dieser Routinedaten mit Daten aus Klinikinformationssystemen bietet ein besonders hohes Potenzial, da keine Datenquelle allein ein vollständiges Bild der medizinischen Versorgung zeichnet und sich die beiden Datenquellen ideal komplementär ergänzen. Ziel ist es nun, in einer strategischen Partnerschaft mit gesetzlichen Krankenkassen und privaten Krankenversicherungen diese Routinedaten in die sichere, transparente und partizipative Forschungsinfrastruktur des NUM zu integrieren. Dies fördert den Forschungsstandort Deutschland und trägt entscheidend dazu bei, die Qualität und Sicherheit der Gesundheitsversorgung in Deutschland evidenzbasiert zu verbessern. JA 2025 10.1055/a-2438-0670 Gesundheitswesen (Bundesverband der Arzte des Offentlichen Gesundheitsdienstes (Germany)) 87 S279-S288 S 02 Jochen Schmitt Peter Ihle Olaf Schoffer Jens-Peter Reese Steffen Ortmann Enno Swart Sabine Hanß Falk Hoffmann Christoph Stallmann Monika Kraus Sebastian Claudius Semler Ralf Heyder Jörg Janne Vehreschild Peter Heuschmann Dagmar Krefting Martin Sedlmayr Wolfgang Hoffmann article Rempe2025_PMID40481871 Medizinische Bildgebungsdaten, die in der Forschung verwendet werden, umfassen häufig sensible geschützte Gesundheitsinformationen (PHI) und personenbezogene identifizierbare Informationen (PII), die strengen Rechtsrahmen wie die Datenschutz-Grundverordnung (DSGVO) oder das Health Insurance Portability and Accountability Act (HIPAA) unterliegen. Daher müssen diese Datentypen vor der Nutzung de-identifiziert werden, was für viele Forscher eine große Herausforderung darstellt. Angesichts der Vielzahl von medizinischen Bildgebungsdaten ist es notwendig, eine Vielzahl von Entschlüsselungstechniken einzusetzen. Um den Ent-Identifizierungsprozess für medizinische Bildgebungsdaten zu erleichtern, haben wir ein Open-Source-Tool entwickelt, mit dem Digital Imaging and Communications in Medicine (DICOM) Magnetresonanzbilder, Computertomographie-Bilder, ganze Dia-Bilder und Magnetresonanz-Twix-Rohdaten identifiziert werden können. Ferner ermöglicht die Implementierung eines neuronalen Netzes die Entfernung von Text innerhalb der Bilder. Das vorgeschlagene Tool erreicht vergleichbare Ergebnisse mit aktuellen hochmodernen Algorithmen zu reduzierter Rechenzeit (bis zu × 265). Das Tool schafft es auch, Bilddaten verschiedener Typen wie Neuroimaging Informatics Technology Initiative (NIfTI) oder Whole Slide Image (WSI-)DICOMS vollständig zu identifizieren. Das vorgeschlagene Tool automatisiert eine aufwendige Ent-Identifikations-Pipeline für mehrere Arten von Eingaben, wodurch die Notwendigkeit zusätzlicher Werkzeuge zur De-Identifizierung von Abbildungsdaten reduziert wird. Frage Wie können Forscher sensible medizinische Bildgebungsdaten effektiv entschlüsseln und dabei Rechtsrahmen zum Schutz von Patientengesundheitsinformationen einhalten? Ergebnisse Wir entwickelten ein Open-Source-Tool, das die De-Identifizierung verschiedener medizinischer Bildgebungsformate automatisiert und die Effizienz von De-Identifizierungsprozessen verbessert. Klinische Relevanz Dieses Tool befasst sich mit dem kritischen Bedarf an robusten und benutzerfreundlichen De-Identifikationslösungen in der medizinischen Bildgebung, wodurch der Datenaustausch in der Forschung und der Schutz der Patienten Privatsphäre erleichtert wird. JA 2025 Dec 10.1007/s00330-025-11695-x European radiology Rempe M Heine L Seibold C Hörst F Kleesiek J article Tan2025_PMID39758710 Das Deep Learning (DL) beschleunigte kontrollierte Aliasing in paralleler Bildgebung führt zu einer höheren Beschleunigung (CAIPIRINHA)-volumetrisch interpolierte Atemhalteprüfung (VIBE), die eine hohe räumliche Auflösung T1-gewichtete Bildgebung des oberen Bauches ermöglicht. Wir wollten untersuchen, ob DL-CAIPIRINHA-VIBE die Bildqualität, die Gefäßvermutung und die Lesionsnachweisbarkeit im Vergleich zu einem Standard CAIPIRINHA-VIBE in der Nierenbildgebung bei 3 Tesla verbessern kann. In dieser prospektiven Studie wurden 50 Patienten mit 23 soliden und 45 cystischen Nierenläsionen mit klinischen MR-Sequenzen, einschließlich Standard-CAIPIRINHA-VIBE und DL-CAIPIRINHA-VIBE-Sequenzen in der nephrographischen Phase bei 3 Tesla, MRT entwickelt. Zwei erfahrene Radiologen bewerteten unabhängig sowohl Sequenzen als auch multiplanare Rekonstruktionen (MPR) der sagittalen und koronalen Ebenen für Bildqualität mit einem Likert-Skala von 1 bis 5 (5 = Best). Quantitative Messungen einschließlich der Größe der größten Läsions- und Nierenläsionenkontrastverhältnisse wurden ausgewertet. DL-CAIPIRINHA-VIBE im Vergleich zu Standard CAIPIRINHA-VIBE zeigte deutlich verbesserte Gesamtbildqualität, höhere Noten für Nierenrandabgrenzung, Nierensünden, Gefäße, Nebennieren, reduzierte Bewegungsartefakte und reduzierte wahrgenommene Geräusche in nephrographischen Phasenbildern (alle p < 0,001). DL-CAIPIRINHA-VIBE mit MPR zeigte im Vergleich zu Standard CAIPIRINHA-VIBE ein überlegenes Missionsvertrauen und Diagnosevertrauen. DL-CAIPIRINHA-VIBE präsentierte jedoch ein synthetischeres Erscheinungsbild und unter anderem Artefakte (p < 0,023). Die mittlere Größe und Signalintensität von Nierenläsionen für DL-CAIPIRINHA-VIBE ergab keine signifikanten Unterschiede im Vergleich zu Standard CAIPIRINHA-VIBE (p > 0,9). DL-CAIPIRINHA-VIBE ist gut geeignet für die Nierenbildgebung in der nephrographischen Phase, bietet eine gute Bildqualität, verbesserte Abgrenzung anatomischer Strukturen und Nierenläsionen. JA 2025 Jun 10.1016/j.ejro.2024.100622 European journal of radiology open Tan Q Miao J Nitschke L Nickel MD Lerchbaumer MH Penzkofer T Hofbauer S Peters R Hamm B Geisel D Wagner M Walter-Rittel TC article becker_ubersehenen_2025 Ziel dieser Studie war es, zu ermitteln, ob alle meldepflichtigen COVID-19-Todesfälle mit positivem SARS-CoV-2-Nachweis und Hamburger Zuständigkeit im Zeitraum vom 01.03.2020 bis zum 31.12.2021 an die zuständige Landesbehörde und damit an das Robert Koch-Institut übermittelt worden sind. Zudem sollte überprüft werden, ob und welche Variablen einen Einfluss auf das Endergebnis der Übermittlung hatten. Meldepflichtige Hamburger COVID-19-Todesfälle wurden über die Todesbescheinigungen, die vorliegenden Daten der Gesundheitsämter und des Instituts für Rechtsmedizin in Hamburg identifiziert. E 2237 meldepflichtige COVID-19-Todesfälle mit positivem SARS-CoV-2-Nachweis wurden in die Studie eingeschlossen. 90,3 % (95 % KI: 88,9–91,4) der meldepflichtigen COVID-19-Todesfälle dieser Studie wurden korrekt an die zuständige Landebehörde übermittelt. Verschiedene medizinische, institutionelle und soziodemographische Variablen waren mit der Chance der Übermittlung assoziiert. Meldestandards und Prozesse sollten vereinheitlicht und digitalisiert werden, um für zukünftige Pandemien ein vollständiges Übermittlungsergebnis zu erreichen. JA 2025 aug de 1434-5196 10.1007/s00194-025-00788-y Rechtsmedizin SARS-CoV‑2, Mortalität, Mortality, Todesbescheinigung, Death certificates, Death case evaluation, Öffentliches Gesundheitswesen, Public health, Sterbefallevaluation https://doi.org/10.1007/s00194-025-00788-y I. Becker K. Püschel F. Stallbaum B. Ondruschka F. Heinrich article Wald2025_PMID39913077 Gadolinium-verstärkte "Sampling Perfection mit anwendungsoptimierten Kontrasten mit unterschiedlicher Flip-Winkel-Entwicklung" (SPACE)-Sequenz ermöglicht eine bessere Visualisierung von Hirnmetastasen (BMs) im Vergleich zu "magnetisierungsvorbereiteten schnellen Akquisitionsgradientenecho" (MPRAGE). Wir vermuten, dass diese bessere Vermutung zu einer qualitativ hochwertigen Annotation (HAQ) führt, die den tiefen Lernalgorithmus (DL) von BMs auf MPRAGE-Bildern verbessert. Es wurden retrospektive kontrastverstärkte (gadobutrol 0.1 mmol/kg) SPACE- und MPRAGE-Daten von 157 Patienten mit BM verwendet, die entweder auf MPRAGE notiert wurden, was zu einer normalen Annotationsqualität (NAQ) oder auf koregiertem SPACE führt, was zu HAQ führt. Mehrere DL-Methoden wurden mit NAQ oder HAQ unter Verwendung von SPACE- oder MRPAGE-Bildern entwickelt und auf ihrer Nachweisleistung mit positivem Vorhersagewert (PPV), Sensitivität und F1-Score und auf ihrer Abgrenzungsleistung mit volumetrischen Dice Ähnlichkeitskoeffizienten, PPV und Empfindlichkeit auf einem internen und vier zusätzlichen Testdatensätzen (660 Patienten) ausgewertet. Das SPACE-HAQ Modell erreichte 0,978 PPV, 0,882 Empfindlichkeit und 0,916 F1-Score. Die MPRAGE-HAQ erreichte 0,867, 0,839 und 0,840, die MPRAGE NAQ 0.964, 0.667 bzw. 0.798 (p ≥ 0.157). Die MPRAGE-HAQ F1-Score-Erkennung erhöhte sich gegenüber MPRAGE-NAQ auf allen zusätzlichen Testdatensätzen um 2,5-9,6 Punkte (p < 0,016) und die Empfindlichkeit verbesserte sich an drei Datensätzen um 4,6-8,5 Punkte (p < 0,001). Darüber hinaus verbesserte sich die volumetrische Instanzempfindlichkeit um 3,6-7,6 Punkte (p < 0,001). HAQ verbessert DL-Methoden ohne spezialisierte Bildgebung während der Anwendungszeit. HAQ allein erreicht etwa 40% der Leistungsverbesserungen, die mit SPACE-Bildern als Eingabe gesehen werden, was eine schnelle und genaue, vollautomatische Erkennung von kleinen (< 1 cm) BMs ermöglicht. Die mit der SPACE-Sequenz erstellte Ausbildung mit hochwertigen Annotationen verbessert die Erkennungs- und Delineationsempfindlichkeit von DL-Methoden zur Detektion von Hirnmetastasen (BMs) auf MPRAGE-Bildern. Dieses MRI Cross-Technique Transfer Lernen ist ein vielversprechender Weg, um die diagnostische Leistung zu erhöhen. Die Delineierung kleiner BMs auf SPACE MRI-Sequenz führt zu höheren Qualitätsannotationen als auf der MPRAGE-Sequenz aufgrund erhöhter Vermutung. Durch die Verwendung von Cross-Technique Boden Wahrheits-Annotationen während der Ausbildung verbesserte die Genauigkeit von DL-Modellen bei der Erkennung und Segmentierung von BMs. Cross-Technique-Annotation kann DL-Modelle verbessern, indem die Vorteile von spezialisierten, zeitintensiven MRT-Sequenzen integriert werden, während sie sich nicht auf sie verlassen. Eine weitere Validierung in prospektiven Studien ist erforderlich. JA 2025 Feb 10.1186/s41747-025-00554-5 European radiology experimental Wald T Hamm B Holzschuh JC El Shafie R Kovacs B Pflüger I B Ulrich C Baumgartner MA Vollmuth P Debus J Maier-Hein KH Welzel T article baum_establishing_2025 Abstract Gastrointestinal infections in Germany account for 24.5 million outpatient visits annually. To enhance outbreak detection and trend monitoring, we developed and validated a syndrome definition for syndromic surveillance of gastrointestinal infections in emergency departments. We selected presenting complaints (Canadian Emergency Department Information System) and diagnoses (ICD-10) to develop the syndrome definition. Validation involved cross-correlation analysis of syndromic and laboratory-based surveillance trends (norovirus-gastroenteritis, rotavirus-gastroenteritis, campylobacteriosis and salmonellosis notifications). We included emergency departments from the German AKTIN registry with continuous data transmission (01/2019–06/2023). Our novel syndrome definition combined complaints (diarrhoea, vomiting, nausea) and diagnoses (intestinal infectious diseases). Across 864,353 visits in 7 emergency departments, 2.1% (n = 18,158) were gastrointestinal infection cases. Of those, 57% (n = 10,424) were female; 23% were aged 0–19 years (n = 4108); and 23% 20–39 years (n = 4116). Trends were similar between surveillance systems. Cross-correlation was 0.73 (95%-confidence interval 0.61–0.85; p \textless 0.001) at lag − 1, indicating a 1-week relative reporting delay of laboratory-based surveillance. Coherent trends and significant cross-correlation validated our syndrome definition. This novel automated syndromic surveillance complements laboratory-based surveillance while offering improved timeliness and reduced workload. Therefore, it was implemented in Germany’s national routine surveillance of emergency departments. 2025 nov en 2045-2322 10.1038/s41598-025-13675-z Scientific Reports 15 38281 1 https://www.nature.com/articles/s41598-025-13675-z Jonathan Hans Josef Baum Achim Dörre Tamara Sonia Boender Katharina Heldt Hendrik Wilking Susanne Drynda Bernadett Erdmann Rupert Grashey Caroline Grupp Kirsten Habbinga Eckard Hamelmann Amrei Heining Heike Höger-Schmidt Clemens Kill Friedrich Reichert Joachim Riße Tobias Schilling AKTIN Research Group Markus Baacke Jaqueline Bauer Michael Bernhard Jonas Bienzeisler Sabine Blaschke Jörg Brokmann Volker Burst Hans-Jörg Busch Harald Dormann Christoph Duesberg Saskia Ehrentreich André Gries Thomas Händl Eric Handmann Felix Hans Frank Hanses Thomas Henke Matthias Klein Tobias Hofmann Marina Karg Jan Kleinekorth Alexander Kombeiz Bernhard Kumle Philipp Kümpers Christoph Lewejohann Alexander Dinse-Lambracht Benjamin Lucas Carsten Mach Raphael W. Majeed Jürgen Neubauer Ronny Otto Thomas Peschel Norbert Pfeufer Rainer Röhrig Wiebke Schirrmeister Domagoj Schunk Wolfgang Stahl Hartmut Stefani Lucas Triefenbach Bernd Uirich Felix Walcher Markus Wehler Hardy Wenderoth Sebastian Wolfrum Christian Wrede Markus Zimmermann Madlen Schranz article schranz_establishing_2025 Abstract Background Emergency department (ED) routine data offer a unique opportunity for syndromic surveillance of communicable and noncommunicable diseases (NCDs). In 2020, the Robert Koch Institute established a syndromic surveillance system using ED data from the AKTIN registry. The system provides daily insights into ED utilization for infectious diseases. Adding NCD indicators to the surveillance is of great public health importance, especially during acute events, where timely monitoring enables targeted public health responses and communication. Objective This study aimed to develop and validate syndrome definitions for the NCD indicators of acute coronary syndrome (ACS), myocardial infarction (MI), and stroke (STR). Methods First, syndrome definitions were developed with clinical experts combining ED diagnosis, chief complaints, diagnostic certainty, and discharge information. Then, using the multicenter retrospective routine ED data provided by the AKTIN registry, we conducted internal validation by linking ED cases fulfilling the syndrome definition with the hospital discharge diagnoses and calculating sensitivity, specificity, and accuracy. Lastly, external validation comprised the comparison of the ED cases fulfilling the syndrome definition with the federal German hospital diagnosis statistic. Ratios comparing the relative number of cases for all syndrome definitions were calculated and stratified by age and sex. Results We analyzed data from 9 EDs, totaling 704,797 attendances from January 1, 2019, to March 5, 2021. Syndrome definitions were based on ICD-10 (International Statistical Classification of Diseases and Related Health Problems 10th Revision-German Modification) diagnoses, chief complaints, and discharge information. We identified 4.3% of all cases as ACS, 0.6% as MI, and 3.2% as STR. Patients with ACS and MI were more likely to be male (58.3% and 64.7%), compared to the overall attendances (52.7%). For all syndrome definitions, the prevalence was higher in the older age groups (60‐79 years and \textgreater80 years), and the highest proportions of cases were assigned an urgency level (3=urgent or 2=very urgent). The internal validation showed accuracy and specificity levels above 96% for all syndrome definitions. The sensitivity was 85.3% for ACS, 56.6% for MI, and 80.5% for STR. The external validation showed high levels of correspondence between the ED data and the German hospital statistics, with most ratios ranging around 1, indicating congruence, particularly in older age groups. The highest differences were noted in younger age groups, with the highest ratios in women aged between 20 and 39 years (4.57 for MI and 4.17 for ACS). Conclusions We developed NCD indicators for ACS, MI, and STR that showed high levels of internal and external validity. The integration of these indicators into the syndromic surveillance system for EDs could enable daily monitoring of NCD patterns and trends to enhance timely public health surveillance in Germany. 2025 feb en 2369-2960 10.2196/66218 JMIR Public Health and Surveillance 11 e66218—e66218 https://publichealth.jmir.org/2025/1/e66218 Madlen Schranz Mirjam Rupprecht Annette Aigner Leo Benning Carmen Schlump Nesrine Charfeddine Michaela Diercke Linus Grabenhenrich Alexander Ullrich Hannelore Neuhauser Birga Maier AKTIN Research Group Felix Patricius Hans Sabine Blaschke article Woo2025_PMID41193908 Prostataspezifische Membran-Antigen (PSMA) Positronen-Emissionstomographie (PET) berechnete Tomographie (CT) und Ganzkörper-Magnetresonanz-Bildgebung (WB-MRI) sind der herkömmlichen CT- und Knochenscan-Bildgebung überlegen, um metastasierende Krankheit bei Patienten mit Prostatakrebs zu erkennen. Während diese höherakustischen Bildgebungsverfahren bereits das Potenzial zur Verbesserung der Patientenergebnisse gezeigt haben, ist ein gründliches Verständnis der Beziehung zwischen der Behandlungslandschaft und dem Krankheitsvolumen bei konventioneller Bildgebung sowie der prognostischen Bedeutung der prostataspezifischen Antigenantwort entscheidend, um festzustellen, wie sie effektiver eingebunden werden können. Prospektive klinische Studien sind erforderlich, um zu bewerten, ob PSMA-PET/CT und WB-MRI durch präzise Therapieanpassungen klinisch relevante Endpunkte für Patienten wirklich verbessern können. In diesem Beitrag erforschen wir die spezifischen Möglichkeiten von PSMA-PET/CT und WB-MRI als Biomarker in mehreren klinischen Bereichen, einschließlich Metastasis-Erkennung und -Stufe, Krankheitscharakterisierung und Aggressivitätsbewertungen, Biopsiezielauswahl, Auswirkungen auf die Behandlungsplanung, Bewertung der therapeutischen Reaktion und Theranostik. Wir unterstreichen die zentralen Forschungsfragen, die Aufmerksamkeit erfordern. KEY POINTS: Frage Können PSMA-PET/CT und WB-MRI, mit ihrer überlegenen Fähigkeit, Metastasen in Prostatakrebs zu erkennen, wirklich verbessern Patientenergebnisse? Das Finden von hochgenauer Bildgebung verbessert die Metastasenerkennung, Inszenierung, Bewertung von Krankheitsarmut und ermöglicht eine personalisierte Behandlungsplanung für fortgeschrittene Prostatakrebspatienten. Klinische Relevanz PSMA-PET/CT und WB-MRI haben das Potenzial, das Management von Männern mit fortgeschrittenem Prostatakrebs zu verändern, aber prospektive klinische Studien sind erforderlich, um die Vorteile für das Überleben oder die Lebensqualität zu bestätigen, bevor man die Routinenutzung empfiehlt. JA 2025 Nov 10.1007/s00330-025-12089-9 European radiology Woo S Russo L Withey SJ García-Figueiras R Schoots IG Petralia G Penzkofer T Pecoraro M Wu CJ Walz J Eiber M Fendler WP Gillessen S Perez-Lopez R Lecouvet FE Barwick TD Padhani AR article Künnemann2025_PMID40767951 KI-getriebene automatisierte Körperzusammensetzungsanalyse (BCA) kann quantitative prognostische Biomarker liefern, die von Routine-Instrumenten CTs abgeleitet werden. Diese zweizentige Studie wertet den prognostischen Wert dieser volumetrischen Marker für das Gesamtüberleben bei Lungenkrebspatienten aus. Lungenkrebs-Kohorten aus Krankenhaus A (n = 3345, mittleres Alter 65, 86% NSCLC, 40% M1, 40% weiblich) und B (n = 1364, mittleres Alter 66, 87% NSCLC, 37% M1, 38% weiblich) wurde automatisiert BCA von Bauch CTs ±60 Tage Primärdiagnose. Ein tiefes Lernnetzwerk segmentierte Muskel-, Knochen- und Fettgewebe (visceral = VAT, subkutan = SAT, intra-/intermuskulär = IMAT und total = TAT) um drei Marker abzuleiten: Sarcopenia Index (SI = Muskel/Bone), Myosteatotic Fat Index (MFI = IMAT/TAT) und Abdominal Fat Index (AFI = VAT/SAT). Kaplan-Meier Überlebensanalyse, Cox Proportional Gefahren Modellierung und maschinell lernbasierte Überlebensprognose wurden durchgeführt. Ein Überlebensmodell einschließlich klinischer Daten (BMI, ECOG, L3-SMI, -SATI, -VATI und -IMATI) wurde auf Hospital A-Daten installiert und auf Hospital B-Daten validiert. In nichtmetastatischem NSCLC prognostizierte High SI ein längeres Überleben in den Zentren für Männer (Hauptstadt A: 24.6 vs. 46,0 Monate; Krankenhaus B: 13,3 vs. 28,9 Monate; beide p < 0,001) und Frauen (Hauptstadt A: 37,9 vs. 53,6 Monate, p = 0,008; Krankenhaus B: 23,0 vs. 28,6 Monate, p = 0,018). Bei Männern in beiden Krankenhäusern (Krankenhaus A: 43,7 vs. 28,2 Monate; Krankenhaus B: 28,8 vs. 14,3 Monate; beides p ≤ 0,001) zeigte aber zentrumsabhängige Wirkungen bei Frauen (bedeutend nur im Krankenhaus A, p < 0,01). Bei der metastasierenden Krankheit blieb SI für Männer in beiden Zentren prognostiziert (p < 0,05), während MFI nur im Krankenhaus A (p ≤ 0,001) und AFI nur im Krankenhaus B (p = 0,042) signifikant war. Multivariate Cox Regression bestätigte, dass höhere SI Schutz war (A: HR 0.53, B: 0.59, p ≤ 0.001), während MFI mit kürzerem Überleben verbunden war (A: HR 1.31, B: 1.12, p < 0.01). Das auf den Daten des Krankenhauses A geschulte multivariate Überlebensmodell zeigte eine prognostische Differenzierung von Gruppen in interner (n = 209, p ≤ 0,001) und externer (Hospital B, n = 361, p = 0,044) Validierung, wobei SI-Eigenschaft (0.037) unter ECOG (0.082) und M-Status (0.078) steht, übertrifft alle anderen Merkmale, einschließlich herkömmlicher L3-Single-Slice-Messungen. CT-basierte volumetrische BCA bietet prognostische Biomarker bei Lungenkrebs mit unterschiedlicher Bedeutung durch Sex, Krankheitsstadium und Zentrum. SI war der stärkste prognostische Marker, übertrifft konventionelle L3-basierte Messungen, während fettbedingte Marker unterschiedliche Assoziationen zeigten. Unser Multivariate-Modell legt nahe, dass BCA-Marker, insbesondere SI, die Risikoschichtung bei Lungenkrebs, bis zur zentrischen und sexspezifischen Validierung verbessern können. Die Integration dieser Marker in klinische Workflows könnte eine personalisierte Betreuung und gezielte Eingriffe für risikoreiche Patienten ermöglichen. JA 2025 Aug 10.1002/jcsm.70021 Journal of cachexia, sarcopenia and muscle Künnemann MD Römer C Kemper M Heindel W Brix TJ Forsting M Haubold J Opitz M Schuler M Nensa F Borys K Hosch R article Buchka2025_PMID41281704 Der Verlauf der relapsing-remittierenden multiplen Sklerose (RRMS), häufig vor dem klinisch isolierten Syndrom (CIS), ist variabel und schwierig zu prognostizieren. Bei vielen verfügbaren Behandlungsoptionen gewinnen prognostische Algorithmen an Bedeutung bei der Unterrichtung von ersten Behandlungsentscheidungen. Bisher gibt es jedoch nur wenige extern validierte. Eine externe Validierung, die die Anwendung eines Modells auf unabhängige Daten beinhaltet, ist unerlässlich. Datenschutz-erhaltende föderierte Analysen einzelner Daten ermöglichen eine externe Validierung mithilfe von klinischen Datensätzen, die typischerweise schwer zugänglich sind. Mit Daten aus der ProVal-MS-Studie zur externen Validierung des Multiple Sklerose-Behandlungs-Entscheidungs-Scores (MS-TDS), einem prädiktiven Algorithmus für frühe RRMS und CIS. Die MS-TDS prognostiziert die Wahrscheinlichkeit des Auftretens von mindestens einer neuen oder erweiterten T2 Läsion innerhalb von 6-24 Monaten nach Beginn der Erkrankung und unterstützt die Wahl zwischen der Einleitung der Plattformbehandlung oder einem "Warte-and-see" Ansatz. Ein sekundäres Ziel ist es, die Durchführbarkeit von datenschutzorientierten Konzepten im Konsortium Data Integration for Future Medicine (DIFUTURE) zu demonstrieren. Prospektive, multizentrische, nicht-interventionelle Kohortenstudie (ProVal-MS) innerhalb von DIFUTURE. Die kalibrierte MS-TDS wurde mit dem Bereich unter der Empfänger-Betriebskennlinie (AUROC) und dem Brier-Score in beiden gepoolten und verteilten Einstellungen ausgewertet. Eine Entscheidungskurvenanalyse (DCA) wurde verwendet, um den Nettonutzen von Behandlungsentscheidungen zu bewerten, die von der MS-TDS im Vergleich zu den durch die Behandlung von Neurologen getroffenen getroffen wurden. Von den 271 Personen, die mit CIS oder frühen RRMS diagnostiziert wurden, erhielten 202 (78,2%) Plattformbehandlung, während 59 (21,8%) keine Behandlung erhielten. Das AUROC betrug 0,561 (95% CI: 0,492-0,630) in der gebündelten Analyse und 0,567 (95% CI: 0,496-0,634) in der verteilten Analyse. Die DCA hat einen Nettovorteil gezeigt, der mit dem Ergebnis von Entscheidungen von erfahrenen Neurologen in Einklang steht. Die externe Validierung der MS-TDS zeigte eine geringe, nicht signifikante Vorhersageleistung; sie kann jedoch als nützliche Ergänzung dienen, insbesondere für weniger erfahrene Neurologen. Die verteilte Validierung wurde sowohl durchführbar als auch konform zu den Datenschutzbestimmungen gefunden. JA 2025 10.1177/17562864251391095 Therapeutic advances in neurological disorders Buchka S Kirschke JS Steuerwald V Naumann M Soto-Rey I Rohr SO Kramer F Behrens L Oswald E Kümpfel T Zimmermann H Hoffmann VS Hagedorn M Albashiti F Krumbholz M Ziemann U Kohlbacher O Sailer B Braunmüller V Biergans S M Ernemann U Bürkle E Bender B Ruff C Römhild J Wiestler B Sepp D Spengler H Pallaoro P Boeker M Kohlmayer F Dehmelt V Mühlau M Uibel P Wauschkuhn J Kuhn K Senel M Vardakas I Taranu D Kestler HA Sollmann N Irmak B Bilger S Mansmann U Havla J Kowarik MC Tumani H Hemmer B article matschke_fatal_2025 Vaccination against severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2) has been crucial in managing the COVID-19 pandemic. In 2021, a rare syndrome characterized by thrombotic events and thrombocytopenia was identified in individuals who received the ChAdOx1 nCoV-19 or the Ad26.COV2.S vaccine, both of which use adenoviral vectors.[1] [2] [3] [4] [5] This syndrome, known as vaccine-induced immune thrombocytopenia and thrombosis (VITT), is linked to high levels of immunoglobulin G (IgG) antibodies targeting platelet factor 4 (PF4), a chemokine released from platelet α-granules.[6] Similar conditions associated with anti-PF4 antibodies include classic heparin-induced thrombocytopenia (HIT), autoimmune HIT (aHIT), and spontaneous HIT.[7] Additionally, prothrombotic, platelet-activating anti-PF4 antibodies not associated with heparin have been identified in a patient with monoclonal gammopathy.[8] These anti-PF4 disorders present with thrombosis and thrombocytopenia following exposure of PF4 to polyanions like DNA, heparin, or polyphosphate.[9] [10] Recently, anti-PF4 antibodies were detected in two individuals who developed a VITT-like syndrome after adenovirus infection, despite not receiving COVID-19 vaccination or heparin treatment.[11] In the meantime, further such cases, some of them with a preceding respiratory infection and positive testing for adenovirus, have been reported (see [Table 1]).[12] [13] [14] Here, we report the case of a 3-year-old boy who developed fatal cerebral venous sinus thrombosis (CVST) and thrombocytopenia several days after an adenovirus infection. Postmortem studies revealed the presence of anti-PF4 antibodies in his serum. This case further confirms the existence of adenovirus-triggered anti-PF4 antibodies, emphasizing the need to study anti-PF4 antibodies in patients with unexplained thrombosis and thrombocytopenia. JA 2025 jan en 0340-6245, 2567-689X 10.1055/a-2510-6235 Thrombosis and Haemostasis Letter to the Editor http://www.thieme-connect.de/DOI/DOI?10.1055/a-2510-6235 Publisher: Georg Thieme Verlag KG Jakob Matschke Tobias Huter Thomas Renné Marc Lütgehetmann Markus Glatzel Benjamin Ondruschka article wahjudi_fulminant_2025 Lack of immune stimulation ("immune debt") in the wake of the COVID-19 pandemic has led to a resurgence of many paediatric infectious diseases, recently including parvovirus B19 (PVB19). We observed three cases of fulminant PVB19 myocarditis in infants. All had experienced a short prodromal illness and succumbed to cardiogenic shock within 2-72 h after admission. The risk of fulminant myocarditis appears to be increased in infants. Further studies are needed to assess the incidence of fulminant myocarditis caused by PVB19, potentially linked to immune debt. JA 2025 feb eng 1435-4373 10.1007/s10096-025-05072-1 European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases: Official Publication of the European Society of Clinical Microbiology Myocarditis, “immune debt”, Fulminant, Parvovirus B19 virus Tatjana Wahjudi Alex Nitsch Jan-Peter Sperhake Peter H. Hoeger article ehrentreich_impact_2025 Annual discussions concerning emergency department (ED) utilization during New Year due to avoidable emergencies and potential “pyrotechnic bans” often highlight media reports of severe injuries. However, limited data exist on the ED burden and specific injury patterns. This study aimed to investigate firework-related ED cases in Germany around the turn of the year owing to the pyrotechnic ban during the COVID-19 pandemic. 2025 nov 1863-9941 10.1007/s00068-025-03002-6 European Journal of Trauma and Emergency Surgery 51 337 1 https://doi.org/10.1007/s00068-025-03002-6 Saskia Ehrentreich Nele Kamer Susanne Drynda Ronny Otto Felix Walcher Benjamin Lucas article Schluessel.2025 INTRODUCTION Severe respiratory infections pose a major challenge in clinical practice, especially in older adults. Body composition analysis could play a crucial role in risk assessment and therapeutic decision-making. This study investigates whether obesity or sarcopenia has a greater impact on mortality in patients with severe respiratory infections. The study focuses on the National Pandemic Cohort Network (NAPKON-SUEP) cohort, which includes patients over 60 years of age with confirmed severe COVID-19 pneumonia. An innovative approach was adopted, using pre-trained deep learning models for automated analysis of body composition based on routine thoracic CT scans. METHODS The study included 157 hospitalized patients (mean age 70 $\pm$ 8 years, 41% women, mortality rate 39%) from the NAPKON-SUEP cohort at 57 study sites. A pre-trained deep learning model was used to analyze body composition (muscle, bone, fat, and intramuscular fat volumes) from thoracic CT images of the NAPKON-SUEP cohort. Binary logistic regression was performed to investigate the association between obesity, sarcopenia, and mortality. RESULTS Non-survivors exhibited lower muscle volume (p = 0.043), higher intramuscular fat volume (p = 0.041), and a higher BMI (p = 0.031) compared to survivors. Among all body composition parameters, muscle volume adjusted to weight was the strongest predictor of mortality in the logistic regression model, even after adjusting for factors such as sex, age, diabetes, chronic lung disease and chronic kidney disease, (odds ratio = 0.516). In contrast, BMI did not show significant differences after adjustment for comorbidities. CONCLUSION This study identifies muscle volume derived from routine CT scans as a major predictor of survival in patients with severe respiratory infections. The results underscore the potential of AI supported CT-based body composition analysis for risk stratification and clinical decision making, not only for COVID-19 patients but also for all patients over 60 years of age with severe acute respiratory infections. The innovative application of pre-trained deep learning models opens up new possibilities for automated and standardized assessment in clinical practice. 2025 10.1007/s15010-025-02555-3 Infection 53 2111—2124 5 Sabine Schluessel Benedikt Mueller Olivia Tausendfreund Michaela Rippl Linda Deissler Sebastian Martini Ralf Schmidmaier Sophia Stoecklein Michael Ingrisch Sabine Blaschke Gunnar Brandhorst Peter Spieth Kristin Lehnert Peter Heuschmann Susana M. Nunes Miranda Michael Drey article Schluessel2025_PMID40377852 Schwere Atemwegsinfektionen stellen eine große Herausforderung in der klinischen Praxis dar, vor allem bei älteren Erwachsenen. Die Analyse der Körperzusammensetzung könnte eine entscheidende Rolle bei der Risikobewertung und der therapeutischen Entscheidungsfindung spielen. Diese Studie untersucht, ob Adipositas oder Sarkoopenie einen größeren Einfluss auf die Mortalität bei Patienten mit schweren Atemwegsinfektionen hat. Die Studie konzentriert sich auf die Kohorte National Pandemic Cohort Network (NAPKON-SUEP), die Patienten über 60 Jahre mit bestätigter schwerer COVID-19-Pneumonie umfasst. Ein innovativer Ansatz wurde angenommen, mit vortrainierten Tiefenlernmodellen zur automatisierten Analyse der Körperzusammensetzung auf Basis von Routine-Torakic-CT-Scans. Die Studie umfasste 157 Krankenhauspatienten (mittleres Alter 70 ± 8 Jahre, 41% Frauen, Mortalitätsrate 39%) aus der NAPKON-SUEP Kohorte an 57 Studienplätzen. Ein vortrainiertes Tiefenlernmodell wurde verwendet, um Körperzusammensetzung (Muskel, Knochen, Fett und intramuskuläre Fettvolumina) aus thorakalen CT-Bildern des NAPKON-SUEP Kohorts zu analysieren. Binäre logistische Regression wurde durchgeführt, um den Zusammenhang zwischen Fettleibigkeit, Sarkoopenie und Mortalität zu untersuchen. Nicht-Überlebende zeigten ein geringeres Muskelvolumen (p = 0,043), ein höheres intramuskuläres Fettvolumen (p = 0,041) und ein höheres BMI (p = 0,031) im Vergleich zu Überlebenden. Unter allen Körperzusammensetzungsparametern war das auf das Gewicht eingestellte Muskelvolumen der stärkste Mortalitätsvorhersage im logistischen Regressionsmodell, auch nach der Anpassung an Faktoren wie Geschlecht, Alter, Diabetes, chronische Lungenerkrankungen und chronische Nierenerkrankungen (Dosisverhältnis = 0,516). Im Gegensatz dazu zeigte BMI nach der Anpassung an Komorbiditäten keine signifikanten Unterschiede. Diese Studie identifiziert das Muskelvolumen, das von Routine-CT-Scans abgeleitet wird, als Hauptvorhersage des Überlebens bei Patienten mit schweren Atemwegsinfektionen. Die Ergebnisse unterstreichen das Potenzial von AI unterstützten CT-basierten Körperzusammensetzungsanalysen zur Risikoschichtung und klinischen Entscheidungsfindung, nicht nur für COVID-19 Patienten, sondern auch für alle Patienten über 60 Jahre mit schweren akuten Atemwegsinfektionen. Die innovative Anwendung vortrainierter Tiefenlernmodelle eröffnet neue Möglichkeiten zur automatisierten und standardisierten Bewertung in der klinischen Praxis. JA 2025 Oct 10.1007/s15010-025-02555-3 Infection Schluessel S Mueller B Tausendfreund O Rippl M Deissler L Martini S Schmidmaier R Stoecklein S Ingrisch M Blaschke S Brandhorst G Spieth P Lehnert K Heuschmann P SMN Drey M article allgoewer_impact_2025 All over the world, the COVID-19 pandemic has impacted mortality beyond deaths that can be directly attributed to the viral disease. This study investigates the effects of the pandemic on admissions of deceased to a large institute of legal medicine and metropolitan morgue in Germany. Employing statistical models, the general time trend was separated from the effect of the pandemic in terms of place of death, autopsy category, age and sex. In addition, the pandemic’s impact on one of the structurally most important public health determinants, poverty, on numbers of admissions in different place of death categories was analyzed. We find that the pandemic has caused a significant increase in admissions of those who died at residential addresses, which appears to be primarily driven by SARS-CoV-2 negative cases, and those who died in retirement and care facilities, with a significant overrepresentation of SARS-CoV-2 positive cases. A high degree of poverty in a neighborhood does not impact the likelihood to be admitted to the institute in those two categories before or during the pandemic. For dead bodies found in public spaces, however, a poverty variable causes a significant increase in the number of admissions during the pre-pandemic phase. Interestingly, this effect is reversed during the pandemic period. The number of admissions without an autopsy being ordered or requested increased significantly during the pandemic. Further, the COVID-19 pandemic caused a significant increase in admissions in the senile population. Our results indicate that the reluctance of treating physicians to conduct house calls to certify a death has persisted throughout the pandemic and has caused a surge of admissions of deceased to the institute of legal medicine without any criminological indications or subsequent rise in forensic autopsy orders. JA 2025 apr en 2045-2322 10.1038/s41598-025-97117-w Scientific Reports 15 15115 1 Diseases, Medical research, Health care https://www.nature.com/articles/s41598-025-97117-w Publisher: Nature Publishing Group Kristina Allgoewer Christiane Stark Antonia Fitzek Tobias Huter Axel Heinemann Benjamin Ondruschka article bienzeisler_implementation_2025 Continuous access to electronic health records will fuel the digital transformation of medicine. For data-sharing initiatives, the challenge lies in ensuring data access aligns with the interests of data holders. Federated data access authorization, where data remains controlled locally, may offer a solution to balance these interests. This paper reports on a digital health implementation of the federated data access authorization system used in the German National Emergency Department Data Registry. Using data from 2017 to 2024, we analyzed the system’s effectiveness in managing data access in a nationwide research network of 58 emergency departments. Facilitating access to more than 7.9 million records, 75% of data access queries were authorized within 15 days. The system also supports periodic queries, enabling recurring real-time access. Query volumes grew from 15 to over 23,000 by 2024, with completion rates of 86%. The system may thus serve as a blueprint for data-sharing initiatives worldwide. 2025 feb 2398-6352 10.1038/s41746-025-01481-w npj Digital Medicine 8 94 1 https://doi.org/10.1038/s41746-025-01481-w Jonas Bienzeisler Alexander Kombeiz Saskia Ehrentreich Ronny Otto Wiebke Schirrmeister Marco Pegoraro Dominik Brammen Behrus Puladi Rainer Röhrig Raphael W Majeed article JA 2025 May 10.1007/s00115-025-01812-y 40053131 Nervenarzt 96 257-265 3 PREPARED Antranik Erdekian Miriam Glock Sophia Huetter Mike Rueb Dirk Riedinger Jutta Stoffers-Winterling Stephanie Lindner Oliver Tüscher K. Lieb Kristina Adorjan Hauke F Wiegand article FRANK2025112185 In dieser Studie wurde untersucht, wie sich seelische Widerstandskraft (Resilienz) während einer stationären psychosomatischen Psychotherapie verändert. Die Ergebnisse zeigen, dass die Resilienz der 225 Patientinnen und Patienten vom Aufnahme- bis zum Entlassungszeitpunkt deutlich zunahm. Besonders stark profitierten Personen, die zu Beginn eine schlechtere Lebensqualität oder mehr belastende Kindheitserfahrungen hatten. Ein höheres Gefühl von innerer Stabilität und Verstehbarkeit des eigenen Lebens (Sense of Coherence) war insgesamt mit höherer Resilienz verbunden. Die Studie zeigt, dass psychosomatische Therapie die Widerstandskraft stärken kann und dass Resilienz ein wichtiges Therapieziel sein sollte. ja 2025 aug 0022-3999 https://doi.org/10.1016/j.jpsychores.2025.112185 Journal of Psychosomatic Research 195 112185 Trait resilience, Psychodynamic psychotherapy, Inpatient treatment, Childhood trauma, Sense of coherence, Health-related quality of life https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022399925001497 Gina Liviana Frank Patrick Linnemann Markus Ramm Gudrun Schneider Stefan Michael Kahnert Alice Janssen Rupert Conrad article Levita2025_PMID41082087 Diese Studie untersucht vier große Sprachmodelle (LLMs) in der Lage, häufige Patientenfragen vor der transarteriellen periartikulären Embolisierung (TAPE), der berechneten Tomographie (CT)-geführten High-Dosis-Rate (HDR) Brachytherapie und der Blutomycinelektrotherapie (BEST) zu beantworten. Ziel ist es, ihr Potenzial zur Verbesserung der klinischen Arbeitsabläufe und des Patientenverständnisses zu bewerten und gleichzeitig die damit verbundenen Risiken zu bewerten. Thirty-five TAPE, 34 CT-HDR Brachytherapie, und 36 BEST bezogene Fragen wurden an ChatGPT-4o, DeepSeek-V3, OpenBioLLM-8b und BioMistral-7b gestellt. Die LLM-generierten Reaktionen wurden unabhängig von zwei Board-zertifizierten Radiologen bewertet. Die Genauigkeit wurde auf einer 5-Punkt-Skala von Likert bewertet. Statistiken verglichen LLM-Leistungen in Fragekategorien für Patienten-Erziehungstauglichkeit. DeepSeek-V3 erreichte die höchsten Durchschnittswerte für BEST [4.49 (± 0.77)] und CT-HDR [4.24 (± 0.81)] und demonstrierte vergleichbare Performance mit ChatGPT-4o für TAPE-bezogene Fragen (DeepSeek-V3 [4.20 (± 0.77)] vs. ChatGPT-4o [4.17 (± 0.64)]; p = 1.000). Im Gegensatz dazu führten OpenBioLLM-8b (BEST 3.51 (± 1.15), CT-HDR 3.32 (± 1.13), TAPE 3.34 (± 1.16)) und BioMistral-7b (BEST 2.92 (± 1.35), CT-HDR 3.03 (± 1.06), TAPE 3.33 (± 1.28) deutlich schlechter aus als DeepSeek-V3 und ChatGPT-4o. Vorbereitung/Planung war die einzige Kategorie ohne statistisch signifikante Unterschiede in allen drei Verfahren. DeepSeek-V3 und ChatGPT-4o über TAPE, BEST und CT-HDR Brachytherapie-Fragen, die das Potenzial zur Verbesserung der Patientenausbildung in der interventionellen Radiologie angeben, wo komplexe aber minimalinvasive Verfahren oft in kurzen Konsultationen erklärt werden. Allerdings zeigten OpenBioLLM-8b und BioMistral-7b häufigere Ungenauigkeiten, was darauf hindeutete, dass LLMs noch keine umfassenden klinischen Konsultationen ersetzen kann. Patientenfeedback und klinische Workflow-Implementierung sollten diese Ergebnisse validieren. JA 2025 Oct 10.1186/s42155-025-00609-z CVIR endovascular Levita B Eminovic S Lüdemann WM Schnapauff D Schmidt R Nawabi J Penzkofer T article Kottlors2025_PMID39946168 Die neueste Weiterentwicklung der künstlichen Intelligenz (KI) ist ein generativer vortrainierter Transformator mit großen Sprachmodellen (LLMs). Sie wurden auf massive Textmengen geschult und ermöglichten menschliche und semantische Antworten auf textbasierte Eingaben und Anfragen. Das Potenzial solcher Werkzeuge für die medizinische Datenintegration und die klinische Entscheidungsfindung ist noch nicht klar. In dieser Studie untersuchen wir das Potenzial von LLMs in der berichtsbasierten medizinischen Entscheidungsfindung am Beispiel eines akuten ischämischen Schlaganfalls (AIS), wo klinische und bildbasierte Informationen einen unmittelbaren Bedarf an mechanischer Thrombektomie (MT) andeuten können. Ziel war es, die Durchführbarkeit der Integration von Radiologieberichtsdaten und anderen klinischen Informationen im Kontext der Therapieentscheidungsfindung mit LLMs zu klären. 100 Patienten mit AIS wurden rückwirkend aufgenommen, für die 50 % (50/100) für MT angegeben wurden, während die anderen 50 % (50/100) nicht waren. Der LLM wurde mit dem berechneten Tomographiebericht, Informationen über neurologische Symptome und das Alter der Patienten versorgt. Die Leistung des KI-Entscheidungsmodells wurde mit einem Expertenkonsens zur binären Bestimmung der MT-Indikation verglichen, für die Empfindlichkeit, Spezifität und Genauigkeit berechnet wurden. Das AI-Modell hatte eine Gesamtgenauigkeit von 88%, mit einer Spezifität von 96% und einer Empfindlichkeit von 80%. Der Bereich unter der Kurve für die berichtsbasierte MT-Entscheidung betrug 0,92. Die LLM erreichte vielversprechende Genauigkeit bei der Bestimmung der Förderfähigkeit von Patienten mit AIS für MT auf Basis von Radiologieberichten und klinischen Informationen. Unsere Ergebnisse unterstreichen das Potenzial von LLMs für die radiologische und medizinische Datenintegration. Diese Untersuchung sollte als Anreiz für weitere klinische Anwendungen von LLMs dienen, bei denen diese KI als verstärktes Unterstützungssystem für die menschliche Entscheidungsfindung verwendet werden sollte. JA 2025 Feb 10.2196/48328 Journal of medical Internet research Kottlors J Hahnfeldt R Görtz L Fervers P Bremm J Zopfs D Laukamp KR Onur OA Lennartz S Schönfeld M Maintz D Kabbasch C Persigehl T Schlamann M article Höppner2025_PMID39849019 Während der Omicron-Welle der COVID-19 Pandemie und der verfügbaren SARS-CoV-2 Impfstoffe stiegen die Seroprevalenzraten bei Kindern und Jugendlichen. Diese Studie untersuchte die Auswirkungen von sowohl SARS-CoV-2 Infektionen als auch Impfungen auf das Auftreten von akuten und verlängerten Symptomen bei realen Bedingungen während des Übergangs von der Pandemie in die endemische Phase. Den Teilnehmern einer pädiatrischen Bevölkerungsanalyse (CorKID-Studie) folgten mindestens zwei und fast vier Jahre lang eine Untersuchung der gesundheitlichen Statusmerkmale und Symptome, die auf das post-COVID-Syndrom (PCS) hindeuten. In einer Untergruppe (n = 259) wurde die SARS-CoV-2 Antikörperserologie weiter untersucht. 789 Teilnehmer der ursprünglichen CorKID-Studienkohorte (n = 2.121; 37,2%) wurden einbezogen. 67,9% meldeten mindestens eine SARS-CoV2-Infektion. 46,6% hatten eine oder mehrere SARS-CoV-2 Impfungen erhalten. In der überwiegenden Mehrheit serologisch getesteter Teilnehmer wurden nach Infektion und/oder Impfung wieder Antikörper SARS-CoV-2 Spike (98,9%) oder Nucleocapsid (93,3%) Antigen nachgewiesen. Mindestens 30% erfahrene eine nicht erkannte SARS-CoV-2 Infektion. Der allgemeine Gesundheitsstatus war zwischen Kindern vergleichbar, unabhängig von SARS-CoV-2 Infektionen und ähnlich der vor-pandemischen Bewertung. Eine Untergruppe junger Jugendlicher zeigte jedoch einen Rückgang der körperlichen Leistung im Vergleich zu vor-pandemischen Bedingungen. Nach der Infektion bestanden PCS-ähnliche Symptome in 7% der Befragten für mehr als drei Monate und bis zu vier Jahre. SARS-CoV-2 geimpften Teilnehmern (47%) berichteten 12% weniger akute flu-ähnliche Infektionen außer SARS-CoV-2. Fast alle Teilnehmer entwickelten in dieser Längsstudie SARS-CoV-2 Antikörper entweder durch Impfung oder Infektion während der Omicron-Welle. Etwa 7 % der Teilnehmer litten unter PCS-Symptomen, überwiegend Müdigkeit und Erschöpfung. Darüber hinaus meldeten die Teilnehmer, die Impfungen gegen SARS-CoV-2 erhielten, bei der Folge eine geringere Häufigkeit akuter Infektionen. JA 2025 Jan 10.1038/s41598-024-84140-6 Scientific reports Höppner J Maier C Lücke T Toepfner N Brinkmann F article Valentin2025 JA 2025 10.1186/s12874-025-02526-0 BMC Anesthesiology 25 148 1 Heike Valentin Henriette Rau Dana Stahl article Holzwarth2025_PMID39527343 Über spezifische Sicherheitsaspekte bei Kindern mit signifikanten Komorbiditäten, die den mRNA-Impfstoff BNT162b2 erhalten, ist wenig bekannt, da Zulassungsstudien diese Population nicht ansprechen. Diese Studie dient der Bewertung von Sicherheit und negativen Ereignissen in diesen Kindern im Vergleich zu gesunden Kindern. In dieser prospektiven, multizentrischen, branchenunabhängigen Kohortenstudie wurden Pflegekräfte, deren Kinder BNT162b2 erhielten, gebeten, an einem Online-Fragebogen teilzunehmen. Mögliche Nebenwirkungen wurden in zehn organbezogenen Kategorien bewertet. Die Häufigkeit der Symptome wurde in beiden Kohorten durch bivariate Analyse verglichen. Aus insgesamt 1.294 Antworten auf den Fragebogen wurden 793 Datensätze in die Analyse einbezogen (179 Kinder mit Komorbiditäten und 614 gesunde Kinder). Antworten wurden in einer Median von 17 Tagen nach der Impfung gegeben. Insgesamt war die Sicherheit von BNT162b2 in beiden Kohorten hoch. Psychologisch (OR: 3.56, [95% CI: 1.461 bis 8.629]), pulmonal (OR: 7.14, [95% CI: 2.039 bis 21.48]), gastrointestinal (OR: 2.35, [95% CI: 1.231 bis 4.665]), neurologische (OR: 1.74, [95% CI: 1.078 bis 2.796]) und dermatologische (OR: 2.28, Die höhere Rate der gemeldeten post-vaccination Symptome könnte entweder auf eine höhere Anfälligkeit für symptomatische Effekte nach Immunstimulation oder aufgrund eines trainierten Bewusstseins für gesundheitsbezogene Symptome zurückzuführen sein. Die Daten unterstreichen die Bedeutung, die Sicherheit der neuen mRNA COVID-19 Impfstoffe nicht nur bei gesunden Kindern, sondern auch bei Kindern mit Komorbiditäten zu bewerten. Für pharmazeutische Unternehmen sollte eine solche Bewertung zwingend vorgeschrieben werden. JA 2025 Apr 10.1007/s15010-024-02427-2 Infection Holzwarth S Saadat K Jorczyk M Dreßen S Kotsias-Konopelska S Maier C Schmitt J Paul K Pagel J Berner R Brinkmann F Toepfner N article JA 2025 Dec 10.1055/a-2365-9179 39009032 Gesundheitswesen S03 S334-S343 87 PREPARED ESVE PAKOP MUSE GenSurv NUM-SAR Simone Scheithauer J Hoffmann Caroline Lang Diana Fenz M. Berens A. Köster Ivonne Panchyrz L Harst Kristina Adorjan Christian Apfelbacher S Ciesek C. M. Denkinger Christian Drosten M Geraedts R Hecker Wolfgang Hoffmann A Karch T Koch Dagmar Krefting K. Lieb JJ Meerpohl EA Rehfuess N Skoetz Saša Sopka Thomas von Lengerke Hauke F Wiegand J Schmitt article Jaiswal2025_PMID40300640 AI entsteht als vielversprechendes Werkzeug zur Diagnose von COVID-19 basierend auf Brust-CT-Scans. Ziel dieser Studie war der Vergleich von KI-Modellen zur COVID-19-Diagnostik. Daher haben wir: (1) mit einem großen, klinisch relevanten CT-Datensatz drei verschiedene KI-Modelle zur Klassifikation von COVID-19 und Nicht-COVID-19-Pneumonie (nCP) trainiert, (2) die Modellleistung mit einem unabhängigen Testsatz bewertet und (3) die Modelle sowohl algorithmisch als auch experimentell verglichen. In dieser multizentrischen Multi-Vendor-Studie haben wir n=1591 Brust-CT-Scans von COVID-19 (n=762) und nCP (n=829) Patienten aus China und Deutschland gesammelt. In Deutschland wurden die Daten von drei RACOON-Standorten erhoben. Wir trainierten und validierten drei COVID-19 AI-Modelle mit unterschiedlichen Architekturen: COVNet basierend auf 2D-CNN, DeCoVnet basierend auf 3D-CNN und AD3D-MIL basierend auf 3D-CNN mit Aufmerksamkeitsmodul. 991 CT-Scans wurden zur Ausbildung der KI-Modelle mit 5-facher Quervalidierung verwendet. Für unabhängige Tests wurden 600 CT-Scans aus 6 verschiedenen Zentren verwendet. Die Leistung der Modelle wurde mit Genauigkeit (Acc), Empfindlichkeit (Se) und Spezifität (Sp) bewertet. Die durchschnittliche Validierungsgenauigkeit der COVNet-, DeCoVnet- und AD3D-MIL-Modelle über die 5 Falten betrug 80,9%, 82,0% bzw. 84,3%. Auf dem unabhängigen Testsatz mit n=600 CT-Scans lieferte COVNet Acc=76.6%, Se=67.8%, Sp=85.7%; DeCoVnet lieferte Acc=75.1%, Se=61.2%, Sp=89.7%; und AD3D-MIL erreichten Acc=73.9%, Se=57.7%, Sp=90.8%. Die Klassifikationsleistung der bewerteten KI-Modelle ist nicht von der Architektur selbst stark abhängig. Unsere Ergebnisse zeigen eine hohe Spezifität und moderate Empfindlichkeit. Die KI-Klassifikationsmodelle sollten nicht unbeaufsichtigt verwendet werden, sondern könnten Radiologen bei der COVID-19 und der NCP-Identifizierung unterstützen. · Diese Studie vergleicht KI-Ansätze zur Diagnose von COVID-19 in Brust-CT-Scans, die für die weitere Optimierung der Versorgung von Gesundheits- und Pandemievorbereitungen unerlässlich sind. · Unsere Experimente mit einem multicenter, multi-vendor, diversen Datensatz zeigen, dass die Trainingsdaten der Schlüsselfaktor für die Bestimmung der diagnostischen Leistung sind. · Die KI-Modelle sollten nicht unübertroffen, sondern als Werkzeug zur Unterstützung von Radiologen verwendet werden. · Jaiswal A, Fervers P, Meng F et al. Performance von KI-Ansätzen für COVID-19-Diagnose mit Chest CT-Scans: Die Auswirkungen von Architektur und Datensatz. Rofo 2025; DOI 10.1055/a-2577-3928. JA 2025 Apr 10.1055/a-2577-3928 RoFo : Fortschritte auf dem Gebiete der Rontgenstrahlen und der Nuklearmedizin Fervers P Meng F Zhang H Móré D Wailzer J Maintz D Kottlors J Shahzad R Persigehl T article Rothoeft2025_PMID40739412 Viele Untersuchungen wurden durchgeführt, vor allem auf Tuberkulose (TB), inwieweit zellulärer Immunschutz gemäß Interferon-γ-Freisetzungs-Assays (IGRA) altersabhängig ist. In einer früheren Studie zeigten wir, dass nach einer Omicron-Infektion Jugendliche mit einer hybriden Immunität eine höhere Wahrscheinlichkeit hatten, eine reaktive SARS-CoV-2-spezifische IGRA als Kinder zu haben. Daher haben wir in einer großen Gruppe von Minderjährigen und Erwachsenen untersucht, ob das Alter die zelluläre Immunität gemäß IGRA in TB und SARS-CoV-2 beeinflusst. Zelluläre Immunität wurde mit SARS-CoV-2 und Tb-spezifischen IGRA und humoraler Immunität gegen SARS-CoV-2 durch Messung von Antikörpern gegen Spike (S) und Nukleocapsidprotein analysiert. Die Analyse erfolgte je nach natürlicher (konvaleszenter, nicht geimpfter) oder hybrider Immunität (konvaleszent und geimpft). Insgesamt wurden 1401 Erwachsene und 392 Minderjährige einbezogen. Die von T-Zellen freigesetzte Menge an Interferon-γ sowie die Wahrscheinlichkeit eines positiven SARS-CoV-2 IGRA (OR 1.022) und eines positiven Tb IGRA (OR 1.047) waren altersabhängig. Die Empfindlichkeit von SARS-CoV-2 IGRA in der natürlichen Immunität war in Minderjährigen (0,45), vor allem in den weniger als 5 Jahren (0,299) im Vergleich zu Erwachsenen (0,66). Die interferon-γ Reaktion auf SARS-CoV-2 Infektionen und/oder Impfungen und Tb-Infektionen gemäß IGRA ist in Qualität und Menge abhängig vom Alter. Die Sensitivität kommerziell erhältlicher Tests bei jungen Kindern scheint suboptimal zu sein, ihre Verwendung als Diagnose- oder Forschungsinstrument in dieser Altersgruppe einzuschränken. JA 2025 Dec 10.1007/s15010-025-02613-w Infection Rothoeft T Hoffmann AT Maier C Denz R Kobbe R Behrens GMN Behrens P Berner R Denkinger CM Giesbrecht K Hojenski L Hovardovska O Iatseniuk O Kraus M Mitrov L Nauck M SN Scherer M Schmiedel Y Stahl D Timmesfeld N Toepfner N Vehreschild J Wohlgemuth WA Vehreschild MJGT Brinkmann F article Krueger2025_PMID40905704 Photon-counting-Detektor berechnete Tomographie (PCD CT) bietet eine höhere Dosiseffizienz als herkömmliche energieintegrierende Detektor CT (EID CT), was besonders für Kinder von Vorteil ist. Ein breiter Beweis fehlt, ob häufig erworbene pädiatrische Tiefdosis-Lungenbildgebung mit PCD CT weiter verbessert werden kann. Zum Vergleich der Strahlenexposition, quantitativer und qualitativer Bildqualität der pädiatrischen Tiefdosis Brust PCD CT gegen EID CT Untersuchungen. Unverstärkte, für klinische Indikationen erworbene, niederdosisarme PCD-CT- und EID-CT-Untersuchungen wurden rückwirkend verglichen. Kohorten wurden durch Wasseräquivalentdurchmesser (Dw) und Alter (n = 44 je; Medianalter 6,3 y PCD CT vs. 7,4 y EID CT) abgestimmt. Die Strahlenexposition wurde nach Volumen CT Dosisindex (CTDIvol), Dosislängenprodukt (DLP) und größenspezifische Dosisschätzung (SSDE) analysiert. Quantitative Bildqualitätsbeurteilung beinhaltete die Platzierung von interessierenden Bereichen (ROIs) in Lunge, Herz und Leber zur Extraktion von mittlerer Dämpfung, Rauschen, Signal-Rausch-Verhältnis (SNR), Kontrast-Rausch-Verhältnis (CNR) und Wertzahlen (FOMs). Qualitative Bildqualität wurde von 3 Lesern unter Verwendung von Likert-Skalen und zusätzlichen direkten Vergleichen blind bewertet. Gewicht, Höhe und Körpermasseindex (BMI) waren zwischen den 2 Kohorten (P>0.05) nicht signifikant verschieden. PCD-CT-Untersuchungen zeigten niedrigere mediane CTDIvol (0.27 vs. 0.39 mGy, P<0.0001), DLP (6.71 vs. 8.75 mGy*cm, P<0.0001), und SSDE (0.55 vs. 0.83 mGy, P<0.0001) im Vergleich zu EID CT. Qualitative Bewertung zeigte gleiche und insgesamt ausgezeichnete Ergebnisse für beide Kohorten. PCD CT ermöglicht die pädiatrische Tiefdosis-Brustbildgebung mit geringerer Strahlungsbelichtung bei ähnlicher Bildqualität im Vergleich zu EID CT. JA 2025 Sep 10.1097/RLI.0000000000001234 Investigative radiology Krueger MB Werncke T Eicke M Schwerk N Eckstein J Huisinga C Panknin C Shin HO Silchmüller FJ Schultze-Florey RE Hansen G Wacker F Hellms S Renz DM article Hartung.2025 OBJECTIVE Neuropsychiatric symptoms are among the most prevalent sequelae of COVID-19, particularly among hospitalized patients. Recent research has identified volumetric brain changes associated with COVID-19. However, it currently remains poorly understood how brain changes relate to post-COVID fatigue and cognitive deficits. We, therefore, aimed to assess structural brain changes after hospitalization for COVID-19 and their associations with cognitive performance and fatigue. METHODS We analyzed data from n = 57 patients previously hospitalized for COVID-19 (63% male, mean age 52 years) from the prospective, multicentric high-resolution platform of the German National Pandemic Cohort Network (NAPKON-HAP) and n = 57 matched healthy control participants (HC). We assessed cortical thickness and subcortical volumes in high-resolution T1-weighted MRI and their associations with cognitive performance (Montreal Cognitive Assessment) and fatigue (Fatigue Severity Scale). RESULTS Patients exhibited statistically significant reductions of cortical thickness in parahippocampal gyri and the temporal lobe (all p[FDR-corrected] \textless 0.05) as well as reduced hippocampal volumes compared to HC (left, Cohen's d [95% CI] = 0.50 [0.12-0.8]; right d = 0.43 [0.05-0.80]). Higher acute COVID-19 severity was associated with reduced cortical thickness, particularly in the olfactory system. Furthermore, reduced cortical thickness of the temporal poles and the anterior and posterior cingulate gyrus was associated with more severe post-acute fatigue. INTERPRETATION Our results identify long-lasting macrostructural brain changes after moderate to severe COVID-19 that correlate with acute disease severity and long-term fatigue. Early identification and targeted interventions for patients at risk of persistent brain changes are needed. TRIAL REGISTRATION NAPKON-HAP is registered at clinicaltrials.gov (NCT04747366). JA 2025 10.1002/acn3.70260 Annals of clinical and translational neurology Tim J. Hartung Florentin Steigerwald Amy Romanello Cathrin Kodde Matthias Endres Sandra Frank Peter Heuschmann Philipp Koehler Stephan Krohn Daniel Pape Jens Schaller Sophia Stöcklein Istvan Vadasz Janne Vehreschild Martin Witzenrath Thomas Zoller Carsten Finke article In acute crises such as the COVID-19 pandemic, scientific questions need to be addressed quickly in order to protect the health of the population and to maintain the function of the healthcare system. The prevailing urgency and the large number of issues to be addressed, combined with the limitation of time, personnel, or monetary resources make prioritization indispensable. In the COVID-19 Evidence Ecosystem (CEOsys) project initiated by the University Medicine Network (NUM), a procedure for the rapid prioritization of questions was used specifically for evidence syntheses and clinical guideline recommendations, which was further developed in the follow-up project PREparedness and Pandemic Response in Germany (PREPARED).The result is a concept paper on the prioritization of research questions and topics with a more generic orientation. The content of the concept is presented in this article. The core subjects are basic principles of successful prioritization as well as an explicit seven-step process with information on organizational framework conditions and the procedure. The concept offers possibilities for adaptation, as research prioritization is highly context-dependent.The application of such a systematic, transparent prioritization process contributes to comprehensible and informed decisions about which research questions are relevant and urgent, in which order they should be processed, and which issues are not critically urgent or have to be postponed. JA 2025 Jan 10.1007/s00103-024-03985-4 39636443 Bundesgesundheitsblatt Gesundheitsforschung Gesundheitsschutz 68 97-104 1 PREPARED A Ziegler Angela M Kunzler S Voigt-Radloff J Schmitt O. Moerer Simone Scheithauer H Heytens C. Apfelbacher JJ Meerpohl article De_Arruda_Botelho2025-hi Ensuring privacy in distributed machine learning while computing the Area Under the Curve (AUC) is a significant challenge because pooling sensitive test data is often not allowed. Although cryptographic methods can address some of these concerns, they may compromise either scalability or accuracy. In this paper, we present two privacy-preserving solutions for secure AUC computation across multiple institutions: (1) an exact global AUC method that handles ties in prediction scores and scales linearly with the number of samples, and (2) an approximation method that substantially reduces runtime while maintaining acceptable accuracy. Our protocols leverage a combination of homomorphic encryption (modified Paillier), symmetric and asymmetric cryptography, and randomized encoding to preserve the confidentiality of true labels and model predictions. We integrate these methods into the Personal Health Train (PHT)-meDIC platform, a distributed machine learning environment designed for healthcare, to demonstrate their correctness and feasibility. Results using both real-world and synthetic datasets confirm the accuracy of our approach: the exact method computes the true AUC without revealing private inputs, and the approximation provides a balanced trade-off between computational efficiency and precision. All relevant code and data is publicly available at https://github.com/PHT-meDIC/PP-AUC, facilitating straightforward adoption and further development within broader distributed learning ecosystems. 2025 nov en PLOS Digit. Health 4 Public Library of Science (PLoS) e0000753 11 Marius Arruda Botelho Cem Ata Baykara Ali Burak "Unal Nico Pfeifer Mete Akg"un article Bucher2025_PMID40418966 Koronare Berechnung, wie durch berechnete Tomographie (CT) definiert, kann mit einer Punktzahl (CAC-Score) quantifiziert werden. Es ist eine etablierte prognostische und prädiktive Abbildungsmarkierung des Herz-Kreislauf-Risikoprofils. Die prognostische Relevanz des CAC-Scores wurde bei akuten Erkrankungen, einschließlich der Coronavirus-Krankheit 2019 (COVID-19) in Vorstudien, nachgewiesen. Ziel der vorliegenden Studie war es, die prognostische Relevanz der CAC-Score bei Patienten mit Coronavirus-Krankheit 2019 zu beweisen. Die vorliegende Studie nutzte eine bundesweite radiologische Forschungsplattform, um eine multizentrische retrospektive Studie durchzuführen. Die Studie umfasste insgesamt 541 Patienten, davon 176 weiblich (32,5%). Das mittlere Alter der Patienten betrug 61,2 Jahre ± 15,6 Jahre. Die Coronavirus-Krankheit (SARS-COV-2) wurde bei allen Patienten durch PCR-Tests bestätigt. Die CAC-Score wurde mit der Weston-Score berechnet, die eine semiquantitative Methode ist. Das primäre Ergebnis der Studie war die 30-tägige Mortalität. Die Gesamtsterblichkeitsrate innerhalb der 30-Tage-Periode betrug 21,2%, 115 Patienten sterben. Die mittlere Weston-Score betrug 3,0 ± 3.6. 128 Patienten (23,7%) zeigten keinen Beweis für koronare Berechnungen, wie durch einen Weston-Score von 0 angedeutet. Bei der univariablen Regressionsanalyse wurde das Vorliegen von Kalkulationen mit dem Sterblichkeitsverhältnis von 1,68 (95 % Vertrauensintervall 1,08-2,59, p=0,01) assoziiert. Dieses Ergebnis blieb jedoch bei der multivariablen Analyse nicht statistisch signifikant (p=0,49). Die Weston-Score wurde bei der univariablen Analyse mit einem Quotenverhältnis (OR) von 1,10 (95% CI 1.04-1.14, p < 0,001) und in der multivariablen Analyse mit einem OR von 1,06 (95% CI 1.005-1.138, p = 0,036) assoziiert. Der bildgebende Marker CAC-Score wurde gezeigt, dass bei Patienten, die mit der Coronavirus-Krankheit 2019 diagnostiziert werden (COVID-19) signifikante prognostische Auswirkungen auf die 30-tägige Mortalität haben. Es obliegt dem Radiologen, die einzige Anwesenheit von koronaren Kalkulationen als ein relevanter prognostischer Faktor anzuerkennen. Die prognostische Relevanz der Berechnungen wurde in Fällen, in denen eine umfangreichere Kalkulation vorhanden war, größer. · Koronare Berechnungen, die von CT bewertet werden, sind prognostische Marker für 30-Tage COVID-19 Sterblichkeit. · Berechnungsmaß hat einen größeren prognostischen Wert als die bloße Anwesenheit von Kalkulationen.. · Die Studie unterstreicht die Notwendigkeit, koronare Berechnungen in klinische Risikopunkte zu integrieren.. · Bucher AM, Frodl E, Ehrengut C et al. Prognosewert der CT-definierten Koronarsklerose in COVID-19: Ergebnisse einer multizentrischen Studie basierend auf dem Weston-Score. Rofo 2025; DOI 10.1055/a-2583-0235. JA 2025 May 10.1055/a-2583-0235 RoFo : Fortschritte auf dem Gebiete der Rontgenstrahlen und der Nuklearmedizin Frodl E Ehrengut C Müller L Emrich T Kloeckner R Sieren M Sähn MJ Fink MA Móré D Melekh B Gottschling S Meinel F Schön H Kornemann N Renz DM Lubina N Wollny C May MS Siegler L Borggrefe J Meyer HJ article Gallée2025_PMID40567722 Erklärliche künstliche Intelligenz (xAI) wird immer wichtiger, da die Notwendigkeit des Verständnisses der Argumentation des Modells bei der Anwendung in Hochrisikobereichen wächst. Dies ist insbesondere im Bereich der Medizin von entscheidender Bedeutung, wenn Entscheidungsunterstützungssysteme zur Diagnose oder zur Bestimmung geeigneter Therapien eingesetzt werden. Hier ist es unerlässlich, intuitive und umfassende Erläuterungen zur Bewertung der Korrektheit des Systems bereitzustellen. Um diesem Bedarf gerecht zu werden, haben wir Proto-Caps entwickelt, ein eigens erklärbares Modell für die Bildklassifizierung. Es erklärt seine Entscheidungen durch die Bereitstellung von visuellen Prototypen, die bestimmten Erscheinungseigenschaften ähneln. Diese Eigenschaften werden vom Menschen vorgegeben, was sie einerseits verständlich macht und andererseits dazu führt, dass das Modell seine Entscheidung über die gleichen Merkmale wie der menschliche Experte trifft. Auf zwei öffentlichen Datensätzen zeigt diese Methode eine bessere Leistung im Vergleich zu bestehenden erklärenden Ansätzen, trotz der additiven Erklärbarkeitsmodalität durch die visuellen Prototypen. Neben den Leistungsbewertungen führten wir eine Analyse der Wahrhaftigkeit durch die Untersuchung der gemeinsamen Informationen zwischen der Zielvorhersage und deren Erklärungsausgabe durch. Dies wurde getan, um sicherzustellen, dass die Erklärung tatsächlich die Zielklassifikation begründet. Durch umfangreiche Hyperparameterstudien haben wir auch optimale Modelleinstellungen gefunden, was einen Ausgangspunkt für weitere Forschungen bietet. Unsere Arbeit betont die Perspektiven der Kombination von xAI-Ansätzen für eine größere Erklärbarkeit und zeigt, dass die Einbeziehung der Erklärbarkeit nicht unbedingt zu einem Verlust an Leistung führt. JA 2025 10.7717/peerj-cs.2908 PeerJ. Computer science Gallée L Lisson CS Ropinski T Beer M Götz M article JA 2025 May 10.1007/s00115-025-01822-w 40169414 Nervenarzt 96 272-277 3 PREPARED Hauke F Wiegand Kristina Adorjan Jutta Stoffers-Winterling Simone Scheithauer J Schmitt Oliver Tüscher Peter Falkai K. Lieb article Bujotzek2025_PMID39455061 Federated Learning (FL) ermöglicht kollaboratives Modelltraining, während Daten lokal gespeichert werden. Derzeit werden die meisten FL-Studien in der Radiologie durch zahlreiche Hürden durchgeführt, die ihre Übersetzung in die Praxis behindern. Die wenigen bestehenden realen FL-Initiativen kommunizieren selten konkrete Maßnahmen, die ergriffen werden, um diese Hürden zu überwinden. Um diese bedeutende Wissenslücke zu überbrücken, schlagen wir einen umfassenden Leitfaden für reale FL in der Radiologie vor. Bei der Umsetzung von real-world FL gibt es keine umfassenden Bewertungen, die FL mit weniger komplexen Alternativen in anspruchsvollen real-world-Einstellungen vergleichen, die wir durch umfangreiche Benchmarking ansprechen. Wir haben unsere eigene FL-Infrastruktur im deutschen Radiologischen Kooperativen Netzwerk (RACOON) entwickelt und ihre Funktionalität durch Ausbildung von FL-Modellen auf Lungenpathologie-Segmentationsaufgaben in sechs Universitätskliniken demonstriert. Während der Gründung unserer FL-Initiative und der Durchführung der umfangreichen Benchmark-Experimente wurden Einblicke gesammelt und in den Leitfaden eingeordnet. Der vorgeschlagene Leitfaden beschreibt wesentliche Schritte, identifizierte Hürden und implementierte Lösungen für erfolgreiche FL-Initiativen, die Echtzeit-Experimente durchführen. Unsere experimentellen Ergebnisse beweisen die praktische Relevanz unseres Leitfadens und zeigen, dass FL weniger komplexe Alternativen in allen Bewertungsszenarien übertrifft. Unsere Ergebnisse rechtfertigen die Bemühungen, die FL in reale Anwendungen zu übersetzen, indem wir eine vorteilhafte Leistung gegenüber alternativen Ansätzen zeigen. Darüber hinaus betonen sie die Bedeutung der strategischen Organisation, das robuste Management von verteilten Daten und Infrastruktur in realen Welteinstellungen. Mit dem vorgeschlagenen Leitfaden wollen wir zukünftige FL-Forscher bei der Umgehung von Fallfällen und der Beschleunigung der Übersetzung von FL in radiologische Anwendungen unterstützen. JA 2025 Jan 10.1093/jamia/ocae259 Journal of the American Medical Informatics Association : JAMIA Bujotzek MR Akünal Ü Denner S Neher P Zenk M Frodl E Kim M Krekiehn NR Nickel M Ruppel R Both M Döllinger F Opitz M Persigehl T Kleesiek J Penzkofer T Maier-Hein K Bucher A Braren R article Manzke2025_PMID39812663 Zur Untersuchung der Test-Retest-Wiederholbarkeit von radiomischen Features in myokardial native T1 und T2 Mapping. In dieser prospektiven Studie haben 50 gesunde Freiwillige (29 Frauen und 21 Männer, Durchschnittsalter 39,4 ± 13,7 Jahre) zwei identische Herz-Magnetresonanz-Bildgebung (MRI)-Untersuchungen bei 1,5 T durchgeführt. Das Protokoll beinhaltete die native T1 und T2 Kartierung sowohl in der Kurz- als auch in der Langachse. Für die T1 Kartierung haben wir Standard (1.9 × 1,9 mm) und hohe (1.4 × 1,4 mm) Raumauflösung untersucht. Nach manueller Segmentierung des linken ventrikulären Myokards wurden 100 radiomische Features aus sieben Merkmalsklassen extrahiert und analysiert. Die Prüf-Retest-Wiederholbarkeit von radiomischen Merkmalen wurde mit dem Intraklasse-Korrelationskoeffizienten (ICC) bewertet und als schlecht eingestuft (ICC < 0,50), gemäßigt (0,50-0.75), gut (0.75-0,90) und ausgezeichnet (> 0,90). Für T1-Karten, die in kurzer Ausrichtung bei Standardauflösung erworben wurden, war die Wiederholbarkeit für 6 Features, gut für 29 Features, moderiert für 19 Features und schlecht für 46 Features. Wir identifizierten 15 Merkmale von 6 Klassen, die eine gute bis ausgezeichnete Reproduzierbarkeit für T1 Mapping in allen Auflösungen und allen Orientierungen zeigten. Für kurze T2-Karten war die Wiederholbarkeit für 6 Funktionen, gut für 25 Funktionen, moderiert für 23 Funktionen und schlecht für 46 Funktionen. 12 Merkmale aus 5 Klassen wurden gefunden, um eine gute bis ausgezeichnete Wiederholbarkeit in T2 Kartierung unabhängig von der Schichtorientierung zu haben. Wir haben eine Untermenge von Merkmalen mit guter bis ausgezeichneter Wiederholbarkeit unabhängig von der Schichtorientierung und der räumlichen Auflösung identifiziert. Wir empfehlen, diese Funktionen für weitere Radiomik-Forschung in myocardial T1 und T2 Mapping zu nutzen. Frage Die Studie befasst sich mit dem Bedürfnis nach zuverlässigen radiomischen Merkmalen für die quantitative Analyse des Myokards, um die diagnostische Konsistenz im Herz-MRT zu gewährleisten. Ergebnisse Wir haben eine Teilmenge von radiomischen Merkmalen identifiziert, die eine gute bis ausgezeichnete Wiederholbarkeit in nativen T1 und T2 Kartierungen unabhängig von Schichtorientierung und Auflösung zeigen. Klinische RelevanzRadiomische Merkmale wurden als diagnostische und prognostische Biomarker in verschiedenen Herzerkrankungen vorgeschlagen. Durch die Identifizierung einer Teilmenge von besonders reproduzierbaren radiomischen Merkmalen dient unsere Studie dazu, die Auswahl von radiomischen Merkmalen in zukünftigen Forschungs- und klinischen Anwendungen zu informieren. JA 2025 Mar 10.1007/s00330-024-11337-8 European radiology Manzke M Laqua FC Böttcher B Weber MA Baessler B Meinel FG article petrov_rewired_2025 Hohes Alter ist der wichtigste Risikofaktor für einen schweren oder tödlichen COVID-19-Verlauf, die zugrunde liegenden biologischen Mechanismen sind jedoch noch nicht vollständig verstanden. In dieser Studie wurden Proben von 164 SARS-CoV-2-infizierten Personen im Alter von 1 bis 84 Jahren mit modernen molekularen Methoden untersucht. Dabei zeigte sich, dass sich mit zunehmendem Alter wichtige Abwehr-Signalwege des Immunsystems verändern, was zu einer Verschiebung hin zu stärker entzündlichen Reaktionen führt. Diese Veränderungen gehen mit einer erhöhten Freisetzung von Entzündungsstoffen und einer verzögerten Rückbildung der Immunantwort nach der Infektion einher. Zudem unterscheidet sich die Antikörperantwort zwischen Kindern und Erwachsenen, was erklärt, warum ältere Menschen häufiger überschießende Entzündungen und schwerere Krankheitsverläufe entwickeln. JA 2025 aug English 2666-3791 10.1016/j.xcrm.2025.102285 Cell Reports Medicine 6 8 COVID-19, SARS-CoV-2, T cells, B cells, monocytes, age, antibodies, children, immune response, signaling, STAT1, STAT3, type I IFN https://www.cell.com/cell-reports-medicine/abstract/S2666-3791(25)00358-1 Publisher: Elsevier Lev Petrov Sophia Brumhard Sebastian Wisniewski Philipp Georg David Hillus Anna Hiller Rosario Astaburuaga-García Nils Blüthgen Emanuel Wyler Katrin Vogt Hannah-Philine Dey Saskia von Stillfried Christina Iwert Roman D. Bülow Bruno Märkl Lukas Maas Christine Langner Tim Meyer Jennifer Loske Roland Eils Irina Lehmann Benjamin Ondruschka Markus Ralser Jakob Trimpert Peter Boor Sammy Bedoui Christian Meisel Marcus A. Mall Victor M. Corman Leif Erik Sander Jobst Röhmel Birgit Sawitzki article Trif2025_PMID41229738 Softwaregeführte semi-quantitative Analyse der Koronavirus-Krankheit 2019 (COVID-19) Lungenentzündung in Lungenrechnertomographie (CT)-Datensätzen zur Schwerebewertung. Darüber hinaus werden bildgebende Erkenntnisse mit der Notwendigkeit intensiver Pflegemedizin und klinischer Parameter korreliert. Diese einzentige retrospektive Studie analysierte 66 aufeinanderfolgende Patienten (31 Frauen, mittleres Alter 64.6±16.2 Jahre) mit Lungen-CT-Datensätzen von 12/2020 bis 05/2021 und bestätigte COVID-19-Pneumonie. Lungen-CT-Datensätze wurden mit einer semiquantitativen Software zur Segmentierung und Quantifizierung ausgewertet. Die Korrelation mit zugrunde liegenden Krankheiten, Laborparametern und weiterem Kurs wurde bewertet, einschließlich Intubation und Notwendigkeit einer intensiven Pflege. Das Gesamtvolumen der Lungen betrug 3,903,65±1,185.67 mL, das mittlere Volumen der Trübungen betrug 866,52±829,29 mL, was 23,54%±21.92% des gesamten Lungenvolumens widerspiegelt. Das Volumen der hohen Trübungen betrug 186.88±208.15 mL, was 0,06%±0,07% des gesamten Lungenvolumens widerspiegelt. Insgesamt starben 12 Patienten (18,2%), 10 Patienten (15,2%) erforderlich Intubation und in 27 Fällen (40,9%) intensive Pflege war notwendig. Bei Patienten, die das Volumen an Opazitäten und hohen Opazitäten starben, waren deutlich höher (P<0.05). Wesentliche Unterschiede mit einem Risiko für eine intensive Pflegemedizin waren umfangreiche pulmonale Opazitäten, ein Volumen hoher Opazitäten und ein Prozentsatz hoher Opazitäten (P< 0,001 je). Die COVID-19-Pneumonie kann mittels eines künstlichen Intelligenz (AI)-basierten Software-Ansatzes halbquantifiziert werden. Quantitative Methoden könnten genaue Informationen über das Volumen der Trübungen liefern und die Erkennung von Verbindungen zur Patiententherapie ermöglichen, einschließlich der Notwendigkeit einer intensiven Pflege. JA 2025 Oct 10.21037/jtd-2025-655 Journal of thoracic disease Trif N Kloth C Büttner SM Egenrieder N Wolf D Schmidt SA Vogele D Sollmann N Flack F Peters L Grüner B Jungwirth B Stenger S Stamminger T Beer M article Saldanha2025_PMID39915630 In den nächsten 5 Jahren werden neue Brustkrebs-Screening-Richtlinien, die Magnetresonanz-Bildgebung (MRI) für bestimmte Patienten empfehlen, das Volumen der zu analysierenden Bildgebungsdaten deutlich erhöhen. Während diese Zunahme Herausforderungen für Radiologen stellt, bietet künstliche Intelligenz (KI) potenzielle Lösungen, um diese Arbeitsbelastung zu bewältigen. Die Entwicklung von KI-Modellen wird jedoch oft durch manuelle Annotationsanforderungen und strenge Datenschutzbestimmungen zwischen Institutionen behindert. In dieser Studie stellen wir eine integrierte Pipeline vor, die die Notwendigkeit detaillierter Anmerkungen mit lokaler KI-Modellausbildung über Swarm-Learning (SL) schwächer beaufsichtigt, was den zentralen Datenaustausch umgeht. Wir nutzten drei Datensätze aus 1372 weiblichen bilateralen Brust-MRT-Prüfungen von Institutionen in drei Ländern: die Vereinigten Staaten (US), die Schweiz und das Vereinigte Königreich (UK) Modelle zu trainieren. Diese Modelle wurden dann auf zwei externen Datensätzen, bestehend aus 649 bilateralen Brust-MRT-Prüfungen aus Deutschland und Griechenland, validiert. Beim systematischen Benchmarking verschiedener schwach beaufsichtigter zweidimensionaler (2D) und dreidimensionaler (3D) Deep Learning (DL)-Methoden finden wir, dass das 3D-ResNet-101 überlegene Leistung zeigt. Durch die Implementierung eines realen SL-Setups in drei internationalen Zentren beobachten wir, dass diese kollaborativ geschulten Modelle die vor Ort geschulten übertreffen. Auch bei einem kleineren Datensatz zeigen wir die praktische Durchführbarkeit, SL international mit der Datenverarbeitung vor Ort einzusetzen, Herausforderungen wie Datenschutz und Annotationsvariabilität zu bewältigen. Die Kombination schwach beaufsichtigten Lernens mit SL verbessert die interinstitutionelle Zusammenarbeit, die Verbesserung des Nutzens verteilter Datensätze für medizinische KI-Ausbildung, ohne dass detaillierte Anmerkungen oder zentrale Datenfreigabe erforderlich sind. JA 2025 Feb 10.1038/s43856-024-00722-5 Communications medicine Saldanha OL Zhu J Müller-Franzes G Carrero ZI Payne NR Escudero Sánchez L Varoutas PC Kyathanahally S Laleh NG Pfeiffer K Ligero M Behner J Abdullah KA Apostolakos G Kolofousi C Kalogeropoulos M Rossi C Nowakowska S Perez-Lopez R Mann R Veldhuis W Camps J Schulz V Wenzel M Morozov S Kuhl C Gilbert FJ Truhn D Kather JN article Hoffmann2025_PMID40794200 Interstitial Lungenerkrankung (ILD) ist eine häufige und ernsthafte Organerscheinung bei Patienten mit Bindegewebeerkrankung (CTD), aber es ist unsicher, ob es einen Unterschied in der ILD zwischen symptomatischen und asymptomatischen Patienten gibt. Daher haben wir eine Studie durchgeführt, um Unterschiede im Ausmaß der ILD anhand von radiologischen Erkenntnissen zwischen symptomatischen/asymptomatischen Patienten mit einer künstlichen Intelligenz (AI)-basierten Quantifizierung der pulmonalen hochauflösenden berechneten Tomographie (AIpqHRCT) zu bewerten. In der Studie wurden mit AIqpHRCT 67 Querschnittsdatensätze und klinische Daten (einschließlich Lungenfunktionstest) von aufeinanderfolgenden Patienten (mittleres Alter: 57,1 ± 14,7 Jahre, Frau n = 45; 67,2 %) und ILD (alle ohne Immunsuppressive Therapie) analysiert. 25,4% (n = 17) der Patienten mit ILD bei der ersten Diagnose von CTD hatten keine Lungensymptome. In Bezug auf die grundlegenden Merkmale (Alter, Geschlecht, Krankheit) gab es keinen signifikanten Unterschied zwischen der symptomatischen und asymptomatischen Gruppe. Der Lungenfunktionstest (PFT) ergab folgende Mittelwerte (%vorhergesagt) in der symptomatischen und asymptomatischen Gruppe: Erzwungene Vitalkapazität (FVC) 69,4 ± 17,4 % gegenüber 86,1 ± 15,8 % (p = 0,001) und Streukapazität der Lunge für Kohlenmonoxid (DLCO) 49,7 ± 17,9 % gegenüber 60,0 ± 15,8 % (p = 0,043). AIqpHRCT-Daten zeigten einen signifikant höheren Anteil an hochgeschwächtem Volumen (HAV) (14,8 ± 11,0% gegenüber 8,9 ± 3,9%; p = 0,021) und Retikulationen (5.4 ± 8,7% gegenüber 1,4 ± 1,5%; p = 0,035) bei symptomatischen Patienten. Ein Viertel der Patienten mit ILD zum Zeitpunkt der ersten CTD-Diagnose hatte keine Lungensymptome, die DLCO zeigten, wurden in beiden Gruppen reduziert. Auch zeigte AIqpHRCT klinisch relevante ILD bei asymptomatischen Patienten. Diese Ergebnisse unterstreichen die Bedeutung eines frühzeitigen, risikogerechten Screenings für ILD auch bei asymptomatischen CTD-Patienten, da ILD mit einer erhöhten Mortalität verbunden ist. JA 2025 Aug 10.1007/s00296-025-05934-z Rheumatology international Hoffmann T Teichgräber U Brüheim LB Lassen-Schmidt B Renz D Weise T Krämer M Oelzner P Böttcher J Güttler F Wolf G article Herrmann2025-lc Deutsches Ärzteblatt: Einführung des Broad Consents an Universitätskliniken Die Studie evaluiert die Integration des sogenannten Broad Consent (BC) in den klinischen Alltag an vier Universitätsklinikstandorten (Dresden, Erlangen, Halle, Magdeburg). Kontext: Im Rahmen der Medizininformatik-Initiative (MII) wurden Voraussetzungen geschaffen, um Patientendaten für die Forschung nutzbar zu machen. Der Broad Consent: Er ermöglicht Patientinnen und Patienten, eine breite Einwilligung für die Nutzung ihrer Daten (Klinik, Krankenkasse, Biomaterialien) in zukünftigen, noch nicht definierten Forschungsprojekten zu geben. Ziel: Die retrospektive Analyse (03/2021 – 08/2024) soll Hürden und Erfolgsfaktoren aufzeigen, um die flächendeckende Einführung an weiteren Standorten zu erleichtern. ja 2025 jun en Dtsch. Arztebl. Int. 122 Deutscher Arzte-Verlag GmbH 338—339 12 Tim Herrmann Johannes Mallow Markus Plaumann R"udiger Lehmann Sebastian Baecke Jakob Berger Marko Rak Martin Franke Philipp Heinrich Daniel Tiller Anna Pirkl Johannes Bernarding Christian Bruns article Persigehl2025_PMID40771473 Der multidimensionale RACOON Viral Pneumonia Score (RVPS) wurde entwickelt, um die Hauptschwächen der etablierten eindimensionalen Brust-Computertomographie (CT)-Scores zu kompensieren. Sie zielte darauf ab, die Schwere der Lungenentzündung zu quantifizieren und die infektiöse Lungenerkrankung von der akuten Phase bis zur post-pneumonischen Sequenz qualitativ zu überwachen. Diese Forschung konzentriert sich auf die ursprüngliche Entwicklung und Bewertung der Anwendbarkeit und der Interreader Zuverlässigkeit des RVPS. Innerhalb des Radiological Cooperative Network (RACOON) wurde das Scoring-System nach mehreren Expertensitzungen entwickelt und in dieser Nachweisstudie mit 8,525 Beobachtungen getestet. In der Untermenge der Interreadervalidierung (7.800 Beobachtungen) applizierten acht blinde Radiologen die RVPS und bewerteten für jede Lungenkeule die folgenden CT-Ergebnisse einzeln: (I) reine Bodenglasundurchlässigkeiten (GGO), (II) GGO und interstitielle Verdickung, (III) Konsolidierungen, (IV) lineare Opazitäten und Retikulationen und (V) fibrotischartige Veränderungen. Das Ausmaß jeder Pathologie wurde auf einer Skala von 0-5 Punkten bewertet, und die Gesamtbeteiligung wurde berechnet. Die Variabilität der Interreader wurde mit Kendalls W bewertet. Die Gesamtinterreadersicherheit des RVPS war ausgezeichnet (Kendalls' W 0.95). CT-Ergebnisse im Zusammenhang mit akuter Lungenentzündung wurden mit guter Einigung erzielt (W 0.81-0.87). Bei der Trennung der Ergebnisse der Kategorie IV vs. Kategorie V (W 0.55-0.69) wurde eine geringe Unsicherheit eingeführt. Der Gesamtumfang der nachinfektiösen Ergebnisse wurde mit guter Einigung bewertet (W 0.79). Die Längsverteilung der Subscores erlaubte eine Differenzierung zwischen akuter Lungenentzündung und post-pneumonischer Sequenz. Diese Studie präsentiert das RVPS als umfassendes Werkzeug für eine zuverlässige Auswertung, Längsüberwachung und strukturierte Dokumentation des Ausmaßes sowie der Qualität der Brust-CT-Ergebnisse bei Infektions-Lungenerkrankungen. 2025 10.3389/fmed.2025.1578282 Frontiers in medicine Persigehl T Fervers P Bucher A Isfort P Maintz D Penzkofer T Sähn M Vogl T Kottlors J Doellinger F article Liebl.2025 BACKGROUND Early rehabilitation in acute hospitals aims to prevent immobilization-related complications and improve the functional capacity of patients with severe or critical illness. Early rehabilitation can be a useful concept to improve functioning in COVID-19 patients. However, literature concerning early in-hospital rehabilitation in COVID-19 patients is scarce. AIM To analyze the utilization of in-hospital interdisciplinary early rehabilitation (IER) in COVID-19 patients and characterize the sample of IER patients. DESIGN Prospective cohort study. SETTING Hospitalized COVID-19 patient cases. POPULATION This study used data from the National Pandemic Cohort Network (NAPKON) in Germany. METHODS IER utilization rates were retrieved. Demographic and clinical data from hospitalized COVID-19 patients who had received IER during the course of their treatment were evaluated. RESULTS Out of the 2,644 patients in the Cross-Sectoral Platform (German abbreviation: SUEP) cohort, 0.79% [95% CI: 0.51% to 1.22%] received IER during their stay in an acute care hospital. Among the subgroup of patients who had previously been treated in intensive care, 2.13% [95% CI: 1.16% to 3.63%] received IER. The most common comorbidities were cardiovascular diseases (66.7%) and neurological/psychiatric diseases (36.1%). The small sample size limited further analyses. CONCLUSION The low rate of early rehabilitation in acute hospitals for COVID-19 patients indicates an unmet need, particularly in severe cases. Structural changes in the health system are needed to close this gap. The WHO and the German Medical Council have recently acknowledged the necessity of early in-hospital rehabilitation and have issued a call for its implementation in acute hospitals. JA 2025 10.1371/journal.pone.0334941 PloS one 20 e0334941 10 Max E. Liebl Anett Reisshauer Dana Loudovici-Krug Philipp Baumbach Katharina S. Appel Sabine Blaschke Johanna Erber Ilka Grewe Marina Hagen Ekaterina Heim Sina M. Pütz Kristin Lehnert Patrick Meybohm Olga Miljukov Milena Milovanovic Susana M. Miranda Christoph Römmele Phil-Robin Tepasse Jörg J. Vehreschild Norman Weinert Martin Weigl Julia Wendel Christina Lemhöfer incollection rohrig_embedding_2025 Introduction: Medical services routinely transmit patient data using PDF, even as FHIR emerges as the standard for structured healthcare interoperability. This mismatch reflects a broader fragmentation in digital documentation, where pragmatic workflows often outpace technical ideals. Methods: We propose embedding FHIR bundles into PDF to enable structured data reuse without disrupting established processes. These hybrid documents can be processed via FHIR Binary endpoints, allowing downstream systems to extract, validate, and map the embedded data to interoperable resources. Results: A proof-of-concept using German emergency medical services records demonstrates that vital parameters and timestamps can be transmitted as PDF while preserving machine-readable structure. Conclusion: This approach respects existing transport mechanisms and accommodates heterogeneous IT landscapes. By bridging legacy formats with modern standards, the method offers a scalable migration path toward interoperability—ready to deploy wherever PDF are already in use. Thus, our approach provides a migration pathway for integrating routine data into interoperable research infrastructures, enabling structured reuse without altering clinical workflows. 2025 sep 978-1-64368-615-8 10.3233/SHTI251395 Studies in Health Technology and Informatics IOS Press Röhrig, Rainer and Ganslandt, Thomas and Jung, Klaus and Kock-Schoppenhauer, Ann-Kristin and König, Jochem and Sax, Ulrich and Sedlmayr, Martin and Spreckelsen, Cord and Zapf, Antonia https://ebooks.iospress.nl/doi/10.3233/SHTI251395 Jonas Bienzeisler Alexander Kombeiz Hauke Heidemeyer Miriam Hertwig Bernadett Erdmann Marco Pegoraro Saskia Ehrentreich Patrick A. Eder Jasmin Mosebach Asarnusch Rashid Raphael W. Majeed article JA 2024 11 04 10.3390/healthcare12212192 Healthcare 21 2192 21 pandemic preparedness; COVID-19; ambulatory care; hospitals; emergency medical services; nursing services; regional health planning; telemedicine; egepan S. Kugai Benjamin Aretz Yelda Krumpholtz Manuela Schmidt Daniela Süssle Linda Steyer Adrienne Henkel Katrin Bender Felix Girrbach Sebastian Stehr Katrin Balzer B. Weltermann article JA 2024 06 13 10.1038/s41598-024-63945-5 38871878 Sci Rep. 2024 Jun 13;14(1):13607 K Appel CH Lee Susana Nunes Miranda D Maier Jens-Peter Reese G. Anton T Bahmer Sabrina Ballhausen Beate Balzuweit C Bellinghausen Arne Blumentritt Markus Brechtel Irina Chaplinskaya-Sobol J Erber Karin Fiedler Ramsia Geisler R Heyder T. Illig M Kohls L Krist Roberto Lorbeer Olga Miljukov Lazar Mitrov Carolin Nürnberger C Pape Christina Pley Christian Schäfer Jens Schaller Mario Schattschneider Margarete Scherer N Schulze Dana Stahl Hans Christian Stubbe T Tamminga Johannes Josef Tebbe M Vehreschild Jörg J Vehreschild Silke Wiedmann J Kollek article JA 2024 06 10 10.2196/50049 J Med Internet Res. 2024 Jun 10;26:e50049 C Stellmach SM Hopff T Jaenisch Susana Nunes Miranda E Rinaldi NAPKON group ReCoDID Working Groups article JA 2024 05 20 Nat Commun. 2024 May 20; 15(1):4259. Y Devaux L Zhang AI Lumley K Karaduzovic-Hadziabdic V Mooser S Rousseau M Shoaib V Satagopam PK Srivastava C Emanueli F Martelli S Greco L Badimon T Padro M Lustrek M Scholz M Rosolowski Timo Brandenburger Jörg Janne Vehreschild Bettina Lorenz-Depiereux Marcus Dörr O Witzke M Jordan B Benczik P Ferdinandy G Sanchez S Kul AH Baker G Fagherazzi M Ollert R Wereski NL Mills H Firat article JA 2024 05 3 10.1007/s15010-024-02270-5 Infection. 2024 May 3 SM Hopff K Appel Olga Miljukov J. Schneider S Bercker Sabine Blaschke Isabel Bröhl Hiwa Dashti J Erber Anette Friedrichs Ramsia Geisler S Göpel M Hagen Frank Hanses B. Jensen A Krawczyk Bettina Lorenz-Depiereux Patrick Meybohm Milena Milovanovic Lazar Mitrov Carolin Nürnberger C. Römmele Christian Schäfer Christian Scheer Margarete Scherer J Schmidt Kristina Seibel Shimita Sikdar Johannes Josef Tebbe P R Tepasse Maria Vehreschild C Weismantel Jörg J Vehreschild R Bals N Büchner M Keul W Obst P Thelen article ja 2024 May 14 10.2196/45593 38743464 J Med Internet Res 26 Jonas Bienzeisler Guido Becker Bernadett Erdmann Alexander Kombeiz Raphael W. Majeed Rainer Röhrig Felix Greiner Ronny Otto Fabian Otto-Sobotka article Heming2024-vu In dieser Studie wurden die Immunzellen in Nervenwasser (Liquor) und Blut von über 8.000 Patientinnen und Patienten untersucht, um Muster zu erkennen, die bei verschiedenen neurologischen Erkrankungen auftreten. Die Forschenden fanden heraus, dass bestimmte Abwehrzellen im Liquor und Blut mit dem Alter zunehmen oder abnehmen und so etwas wie ein „Immun-Alter“ anzeigen können. Mithilfe von Computermodellen konnten vier große Krankheitsgruppen allein anhand der Zellprofile im Liquor und Blut unterschieden werden: gesunde Personen, Autoimmunerkrankungen, Hirnhaut- bzw. Gehirnentzündungen und neurodegenerative Erkrankungen. Diese Einteilung funktionierte auch in weiteren unabhängigen Patientengruppen. Zudem zeigte sich, dass die Methode helfen kann, Erkrankungen wie Multiple Sklerose oder Demenz besser einzuschätzen und die Diagnose zu verbessern. ja 2024 dec 12 en Ann Neurol 97

United States

779—790 4 Michael Heming Anna-Lena B"orsch Simone Melnik Noemi Gmahl Louisa M"uller-Miny Christine Dambietz Lukas Fisch Timm K"uhnel Tobias J Brix Alice Janssen Eva Schumann Catharina C Gross Julian Varghese Tim Hahn Heinz Wiendl Gerd Meyer Zu H"orste article Windeck2024-yg BACKGROUND: Autopsies have long been considered the gold standard for quality assurance in medicine, yet their significance in basic research has been relatively overlooked. The COVID-19 pandemic underscored the potential of autopsies in understanding pathophysiology, therapy, and disease management. In response, the German Registry for COVID-19 Autopsies (DeRegCOVID) was established in April 2020, followed by the DEFEAT PANDEMIcs consortium (2020-2021), which evolved into the National Autopsy Network (NATON). DEREGCOVID: DeRegCOVID collected and analyzed autopsy data from COVID-19 deceased in Germany over three years, serving as the largest national multicenter autopsy study. Results identified crucial factors in severe/fatal cases, such as pulmonary vascular thromboemboli and the intricate virus-immune interplay. DeRegCOVID served as a central hub for data analysis, research inquiries, and public communication, playing a vital role in informing policy changes and responding to health authorities. NATON: Initiated by the Network University Medicine (NUM), NATON emerged as a sustainable infrastructure for autopsy-based research. NATON aims to provide a data and method platform, fostering collaboration across pathology, neuropathology, and legal medicine. Its structure supports a swift feedback loop between research, patient care, and pandemic management. CONCLUSION: DeRegCOVID has significantly contributed to understanding COVID-19 pathophysiology, leading to the establishment of NATON. The National Autopsy Registry (NAREG), as its successor, embodies a modular and adaptable approach, aiming to enhance autopsy-based research collaboration nationally and, potentially, internationally. Ja 2024 de https://doi.org/10.1007/s00292-024-01307-8 Pathologie (Heidelb) Online ahead of print

Germany

Autopsy; COVID-19; Disease management; Germany; Registries; NATON; NATON 2.0 Svenja Windeck Saskia Stillfried Lucas Triefenbach Ulrike Nienaber Roman David Bülow Rainer Röhrig Benjamin Ondruschka Peter Boor NATON article Hoffmann2024_PMID37847297 Ein 69-jähriger männlicher Patient mit seropositiver erosiver rheumatoider Arthritis (RA) präsentierte sich in unserer Klinik durch progressive Dyspnea. Hochauflösende berechnete Tomographie (HRCT) und immunologische Bronchioalveolarlavage ergaben Bodenglas-Optik und eine durch interstitielle Lungenerkrankungen (ILD) in RA verursachte lymphozytische Alveolitis. In Anbetracht früherer Behandlungsformen wurde die krankheitsmodifizierende antirheumatische Behandlung (DMARD) auf die Facitinib umgestellt. Die Tofacitinib-Behandlung zeigte eine Verringerung der Bodenglas-Optik durch künstliche Intelligenz-basierte Quantifizierung der Lungen HRCT im Laufe von 6 Monaten, die mit einer Verbesserung der Dyspnea-Symptome verbunden war. Abschließend stellt Tofacitinib eine effektive entzündungshemmende therapeutische Option bei der Behandlung von RA-ILD dar. JA 2024 Aug 10.1007/s00393-023-01434-2 Zeitschrift fur Rheumatologie Hoffmann T Teichgräber U Lassen-Schmidt B Kroegel C Krämer M Förster M Renz D Oelzner P Böttcher J Franz M Wolf G Güttler F article Steinbeis.2024 BackgroundPatients with post-COVID-19 condition frequently suffer from chronic dyspnoea. The causes and mechanism for dyspnoea in these patients without evidence of structural lung disease are unclear. MethodsPatients treated for COVID-19 at Charité University Hospital in Berlin received pulmonary function testing including respiratory muscle strength tests and completed health-related quality-of-life questionnaires during follow-up. Patients with post-COVID-19 condition during outpatient follow-up with fatigue and exertional intolerance (PCF) were compared to patients with post-COVID-19 condition with evidence of chronic pulmonary sequelae (post-COVID-19 restriction (PCR)) as well as to patients without post-COVID-19 condition (NCF). ResultsA total of 170 patients presented for follow-up. 36 participants met criteria for PCF, 28 for PCR and 24 for NCF. PCF patients reported dyspnoea in 63.8%. % predicted value of respiratory muscle strength (median (IQR)) was reduced in PCF (55.8 (41.5—75.9)) compared to NCF and PCR (70.6 (66.3—88.9) and 76.8 (63.6—102.2), respectively; p=0.011). A pattern of reduced forced vital capacity (FVC), but normal total lung capacity (TLC), termed complex ventilatory dysfunction defined as TLC $-$ FVC \textgreater10% predicted was observed and occurred more frequently in PCF (88.9%) compared to NCF and PCR (29.1% and 25.0%, respectively; p\textless0.001). ConclusionDyspnoea in PCF is characterised by reduced respiratory muscle strength and complex ventilatory dysfunction indicating neuromuscular disturbance as a distinct phenotype among patients with post-COVID-19 condition. These observations could be a starting point for developing personalised rehabilitation concepts. Shareable abstract Patients with post-COVID-19 condition, fatigue and exertional malaise frequently suffer from dyspnoea. Dyspnoea in this patient group might be caused by a novel pattern of complex ventilatory dysfunction and neuromuscular disturbance. https://bit.ly/3WKhDrN JA 2024 10.1183/23120541.01027-2023 ERJ Open Research 10 5 https://publications.ersnet.org//content/erjor/10/5/01027-2023 Fridolin Steinbeis Claudia Kedor Hans-Jakob Meyer Charlotte Thibeault Mirja Mittermaier Philipp Knape Katharina Ahrens Gabriele Rotter Bettina Temmesfeld-Wollbrück Leif Erik Sander Florian Kurth Martin Witzenrath Carmen Scheibenbogen Thomas Zoller article Bialke.2024 INTRODUCTION In German and international research networks different approaches concerning patient consent are applied. So far it is time-consuming to find out to what extent data from these networks can be used for a specific research project. To make the contents of the consents queryable, we aimed for a permission-based approach (Opt-In) that can map both the permission and the withdrawal of consent contents as well as make it queryable beyond project boundaries. MATERIALS AND METHODS The current state of research was analysed in terms of approach and reusability. Selected process models for defining consent policies were abstracted in a next step. On this basis, a standardised semantic terminology for the description of consent policies was developed and initially agreed with experts. In a final step, the resulting code was evaluated with regards to different aspects of applicability. RESULTS A first and extendable version for a Semantic Consent Code (SCC) based on 3-axis (CLASS, ACTION, PURPOSE) was developed, consolidated und published. The added value achieved by the SCC was illustrated using the example of real consents from large national research associations (Medical Informatics Initiative and NUM NAPKON/NUKLEUS). The applicability of the SCC was successfully evaluated in terms of the manual semantic mapping of consents by briefly trained personnel and the automated interpretability of consent policies according to the SCC (and vice versa). In addition, a concept for the use of the SCC to simplify consent queries in heterogeneous research scenarios was presented. CONCLUSIONS The Semantic Consent Code has already successfully undergone initial evaluations. As the published 3-axis code SCC is an essential preliminary work to standardising initially diverse consent texts and contents and can iteratively be extended in multiple ways in terms of content and technical additions. It should be extended in cooperation with the potential user community. JA 2024 10.1016/j.ijmedinf.2024.105545 International journal of medical informatics 190 105545 Martin Bialke Christopher Hampf Arne Blumentritt Frank-Michael Moser Stefan Lang Aileen Stehn Ellen Sargsyan Wolfgang Hoffmann Monika Kraus article Vogele2024_PMID38248074 Sarcopenia gilt als negative prognostische Faktor bei Patienten mit malignen Tumoren. Unter anderem diagnostische Optionen kann die rechnetierte Tomographie (CT), die wiederholt an Tumorpatienten durchgeführt wird, von weiterem Nutzen sein. Die vorliegende Studie zielt darauf ab, einen Rahmen für die Einstufung der Auswirkungen von Sarkopenie auf die Prognose von Patienten zu schaffen, die mit Ösophagus- oder Magenkrebs diagnostiziert werden. Zusätzlich untersucht sie die Bedeutung von CT-Radiomics in diagnostischen und prognostischen Methoden. CT-Scans von 83 Patienten mit Ösophagus- oder Magenkrebs zum Zeitpunkt der Diagnose und während einer Nachlaufzeit von einem Jahr wurden rückwirkend ausgewertet. Insgesamt wurden 330 CT-Scans analysiert. Siebenzig drei dieser Patienten erhielten eine operative Tumorrektion nach der Neoadjuvant Chemotherapie, und 74% der Patienten waren männlich. Das Durchschnittsalter betrug 64 Jahre (31-83 Jahre). Drei Zeitpunkte (t) wurden als Grundlage für die statistische Analyse definiert, um den Krankheitsverlauf zu strukturieren: t1 = anfängliche Diagnose, t2 = folgende (neoadjuvante) Chemotherapie und t3 = Ende des ersten Jahres nach der Operation in der "chirurgischen" Gruppe oder Ende des ersten Jahres nach der Chemotherapie. Sarcopenia wurde mit dem Psoas-Muskelindex (PMI) bestimmt. Die weitere Analyse umfasste die Analyse ausgewählter radiomatischer Merkmale der Psoas-Dur, Quadratus lumborum und der erector spinae Muskeln auf der L3-Ebene. Der Krankheitsverlauf wurde nach den Reaktionsauswertungskriterien in festen Tumoren überwacht (RECIST 1.1). CT-Scans und Radiomics wurden verwendet, um die Wahrscheinlichkeit von Tumorfortschritt und ihre Korrelation zu Sarkoopenie zu beurteilen. Für maschinelles Lernen wurden die etablierten Algorithmen Entscheidungsbaum (DT), K-nächster Nachbar (KNN) und zufälliger Wald (RF) angewendet. Zur Bewertung der Leistung jedes Modells wurde eine 10-fache Kreuzvalidierung sowie eine Berechnung der Genauigkeit und Fläche unter der Kurve (AUC) verwendet. Während der Beobachtungszeit der Studie gab es einen signifikanten Rückgang der PMI. Dies zeigte sich am deutlichsten bei Patienten mit chirurgischer Therapie im Vergleich zwischen der Diagnose und nach der Neoadjuvant-Therapie und Chirurgie (jeweils p < 0,001). Die Tumorfortschritte (PD) wurden bei Patienten mit Sarkoopenie im Vergleich zu denen ohne Sarkoopenie zu einem beliebigen Zeitpunkt nicht deutlich beobachtet (p = 0,277 bis p = 0,465). Im Durchschnitt trat PD nach 271.69 ± 104.20 Tagen auf. Die Zeit von der anfänglichen Diagnose bis zur PD bei Patienten "mit Sarkoopenie" war zu keinem Zeitpunkt deutlich kürzer als bei Patienten "ohne Sarkoopenie" (p = 0,521 bis p = 0,817). Die CT-Radiomics des Skelettmuskels könnten sowohl Sarkaopenie als auch Tumorfortschritt vorhersagen, mit den besten Ergebnissen für den Psoas-Durmuskel mit dem RF-Algorithmus. Zur Erkennung von Sarkoopen betrug die Genauigkeit 0,90 ± 0,03 und AUC 0,96 ± 0.02. Für die Vorhersage von PD betrug die Genauigkeit 0,88 ± 0,04 und die AUC 0,93 ± 0,04. In der vorliegenden Studie korreliert die CT-Radiomics des Skelettmuskels zusammen mit dem maschinellen Lernen mit dem Vorhandensein von Sarkaopenie, und dies kann zusätzlich bei der Vorhersage des Krankheitsverlaufs helfen. Diese Funktionen können als vielversprechende Alternativen zu konventionellen Methoden eingestuft werden, mit großem Potenzial für weitere Forschung und zukünftige klinische Anwendung. Bei der Diagnose von Sarcopenia mit PMI konnte jedoch keine signifikante Korrelation zwischen Sarcopenia und PD beobachtet werden. JA 2024 Jan 10.3390/diagnostics14020198 Diagnostics (Basel, Switzerland) Vogele D Mueller T Wolf D Otto S Manoj S Goetz M Ettrich TJ Beer M article Hoffmann2024_PMID39249141 Die hochauflösende berechnete Tomographie (HRCT) ist wichtig für die Diagnose der interstitiellen Lungenerkrankung (ILD) bei entzündlichen rheumatischen Erkrankungen (IRD)-Patienten. Die visuelle ILD-Bewertung über HRCT hat jedoch oft eine hohe Interreader-Variabilität. Künstliche Intelligenz (KI)-basierte Techniken für quantitative Bildanalyse versprechen genauere Diagnose- und Prognoseinformationen. Diese Studie bewertete die Zuverlässigkeit der künstlichen Intelligenz-basierten Quantifizierung von pulmonären HRCT (AIqpHRCT) bei IRD-ILD-Patienten und überprüfte IRD-ILD-Quantifizierung mit AIqpHRCT im klinischen Umfeld. Die Reproduzierbarkeit von AIqpHRCT wurde für jedes typische HRCT-Muster (Bodenglas-Optik [GGO], unspezifische interstitielle Lungenentzündung [NSIP], übliche interstitielle Lungenentzündung [UIP], Granuloma) überprüft. Zusätzlich wurden 50 HRCT-Datensätze von 50 IRD-ILD-Patienten mit AIqpHRCT analysiert und mit klinischen Daten und Lungenfunktionsparametern korreliert. AIqpHRCT präsentierte eine 100%ige Vereinbarung (Koeffizient der Variation = 0,00%, Intraklasse-Korrelationskoeffizient = 1.000) über die Detektion des unterschiedlichen HRCT-Musters. Darüber hinaus zeigten AIqpHRCT-Daten eine Zunahme der ILD von 10,7 ± 28,3 % (vermittelt = 1,3 %) in GGO auf 18,9 ± 12,4 % (vermittelt = 18,0 %) im UIP-Muster. Das Ausmaß der Fibrose korrelierte mit FVC (ρ=-0.501), DC (ρ=-0.622) und DLCO (ρ=-0.693) (p < 0,001) negativ. GGO gemessen von AIqpHRCT auch signifikant negativ mit DLCO (ρ=-0.699), DC (ρ=-0.580) und FVC (ρ=-0.423) korreliert. Erstmals zeigt die Studie, dass AIpqHRCT eine hoch zuverlässige Methode zur Quantifizierung von Lungenparenchymalen Veränderungen in HRCT-Bildern von IRD-ILD-Patienten bietet. Ferner ergab die AIqpHRCT-Methode signifikante Zusammenhänge zwischen dem Ausmaß der ILD- und Lungenfunktionsparameter. Dies unterstreicht das Potenzial von AIpqHRCT, die Genauigkeit der ILD-Diagnostik und Prognose in klinischen Einstellungen zu verbessern, letztlich das Patientenmanagement und die Ergebnisse zu verbessern. JA 2024 Nov 10.1007/s00296-024-05715-0 Rheumatology international Hoffmann T Teichgräber U Lassen-Schmidt B Renz D Brüheim LB Krämer M Oelzner P Böttcher J Güttler F Wolf G article Harries2023-mm INTRODUCTION: Throughout the SARS-CoV-2 pandemic, Germany like other countries lacked adaptive population-based panels to monitor the spread of epidemic diseases. METHODS: To fill a gap of population-based estimates needed for winter 2022/23 weresampled in the German SARS-CoV-2 cohort study MuSPAD in mid-2022, including characterization of systemic cellular and humoral immune responses by interferon-$\gamma$-release assay (IGRA) and CLIA/IVN assay. We were able to confirm categorization of our study population into four groups with differing protection levels against severe COVID-19 course based on literature synthesis. Using these estimates we assessed potential health care burden for winter 2022/23 in different scenarios with varying assumptions on transmissibility, pathogenicity, new variants, and vaccine booster campaigns in ordinary differential equation models. RESULTS: We included 9921 participants from eight German regions. While 85% of individuals were located in one of the two highest protection categories, hospitalization estimates from scenario modelling were highly dependent on viral variant characteristics ranging from 30-300% compared to the 02/2021 peak. Our results were openly communicated and published to an epidemic panel network and a newly established modelling network. CONCLUSION: We demonstrate feasibility of a rapid epidemic panel to provide complex immune protection levels for inclusion in dynamic disease burden modelling scenarios. JA 2024 feb en 10.1016/j.ijid.2023.11.014 Int J Infect Dis 139 50-58 Humoral immunity; IGRA; Neutralizing Antibodies; ODE Model;SARS-CoV-2; SEIR; Scenarios; Seroepidemiological Studies; Simulation, PREPARED, COVIM, IMMUNEBRIDGE M Harries V K Jaeger I Rodiah M J Hassenstein J Ortmann M Dreier I Holt M Brinkmann A Dulovic D Gornyk O Hovardovska C Kuczewski M A Kurosinski M Schlotz N Schneiderhan-Marra M Strengert G Krause M Sester F Klein A Petersmann A Karch B Lange article Fervers2024_PMID39036542 Um die Machbarkeit des großen Sprachmodells (LLM) ChatGPT zur Klassifizierung von Leberläsionen nach dem Liver Imaging Reporting and Data System (LI-RADS) basierend auf MRI-Berichten zu untersuchen und die Klassifizierungsleistung auf strukturierten vs. unstrukturierten Berichten zu vergleichen. LI-RADS-klassifizierbare Leberläsionen wurden aus deutschen schriftlichen strukturierten und unstrukturierten MRT-Berichten mit Bericht über Größe, Lage und arterielle Phasenkontrastverbesserung als Mindestinklusionsanforderungen aufgenommen. Die Ergebnisse der Berichte wurden an ChatGPT (GPT-3.5) weiterverbreitet, die für jede klassifizierte Leberläsion zur Bestimmung von LI-RADS-Scores angewiesen wurde. Die Bodenwahrheit wurde durch zwei Radiologen im Konsens begründet. Die Vereinbarung zwischen Grundwahrheit und ChatGPT wurde mit Cohens Kappa bewertet. Test-Retest-Verlässlichkeit wurde bewertet, indem eine Teilmenge von n>/i> = 50 Läsionen fünfmal an ChatGPT, unter Verwendung des Intra-Klasse-Korrelationskoeffizienten (ICC). Es wurden 205 MRT von 150 Patienten aufgenommen. Die Genauigkeit von ChatGPT bei der Bestimmung von LI-RADS-Kategorien war schlecht (53% und 44% auf unstrukturierte und strukturierte Berichte). Die Übereinstimmung mit der Grundwahrheit war höher (k = 0,51 und k = 0,44), der mittlere absolute Fehler bei LI-RADS-Scores war niedriger (0,5 ± 0,5 vs. 0,6 ± 0,7, p < 0,05), und die Prüfretestsicherheit war höher (ICC = 0,81 vs. 0.50), in freier Textfassung im Vergleich zu strukturierten Berichten bzw. ChatGPT erreichte nur eine geringe Genauigkeit, wenn sie darum gebeten wurde, LI-RADS-Scores aus Leber-Imaging-Berichten zu bestimmen. Die überlegene Genauigkeit und Konsistenz in Freitextberichten könnte sich auf den Schulungsprozess von ChatGPT beziehen. Unsere Studie zeigt sowohl die Notwendigkeit der Optimierung von LLMs für strukturierte klinische Dateneingabe als auch das Potenzial von LLMs zur Erstellung von maschinenlesbaren Etiketten auf Basis großer freitextiger radiologischer Datenbanken. JA 2024 10.3389/fradi.2024.1390774 Frontiers in radiology Fervers P Hahnfeldt R Kottlors J Maintz D Pinto Dos Santos D Lennartz S Persigehl T article Gupta2024_PMID39653370 Künstliche Intelligenz (KI) ist bei der Lösung routinemäßiger Alltagsaufgaben üblich. Durch das exponentielle Wachstum im Datenvolumen und der Komplexität der medizinischen Bildgebung nimmt die Arbeitsbelastung der Radiologen stetig zu. KI wurde gezeigt, um die Effizienz in der medizinischen Bilderzeugung, -verarbeitung und -interpretation zu verbessern, und verschiedene solche KI-Modelle wurden in Forschungslaboren weltweit entwickelt. Doch nur wenige davon, wenn überhaupt, finden ihren Weg in den routinemäßigen klinischen Gebrauch, eine Diskrepanz, die die Trennung zwischen AI-Forschung und erfolgreicher AI-Übersetzung widerspiegelt. Ziel dieses Papiers ist es, einen Überblick über den Schnittpunkt von KI- und medizinischen Bildgebungslandschaften zu geben. Außerdem möchten wir die Leser über die Bedeutung der Verwendung von Standards in ihrem Radiologie-Workflow und die Herausforderungen im Zusammenhang mit der Bereitstellung von AI-Modellen im klinischen Workflow informieren. Der Schwerpunkt dieses Papiers liegt darin, den bestehenden Zustand des Radiologie-Workflows zu untersuchen und die Herausforderungen zu identifizieren, die die Implementierung von KI in Krankenhauseinstellungen behindern. Dieser Bericht spiegelt umfangreiche wöchentliche Diskussionen und praktische Problemlösungen wider, die über mehrere Jahre von Branchenexperten, bildgebenden Informatikern, Wissenschaftlern und Klinikern gesammelt wurden. Um ein tieferes Verständnis der Anforderungen für die Bereitstellung von KI-Modellen zu gewinnen, führen wir eine Taxonomie von KI-Verwendungsfällen ein, ergänzt durch reale Fälle der KI-Modellintegration in Krankenhäusern. Wir werden auch erklären, wie die Notwendigkeit der KI-Integration in Radiologie mit dem Medical Open Network for AI (MONAI) angesprochen werden kann. MONAI ist ein Open-Source-Konsortium zur Bereitstellung reproduzierbarer Deep Learning-Lösungen und Integrationstools für die Radiologiepraxis in Krankenhäusern. JA 2024 Dec 10.2196/55833 JMIR AI Gupta V Erdal B Ramirez C Floca R Genereaux B Bryson S Bridge C Kleesiek J Nensa F Braren R Younis K Penzkofer T Qin MM Bae G Lee H Cardoso MJ Ourselin S Kerfoot E Choudhury R White RD Cook T Bericat D Lungren M Haukioja R Shuaib H article Theis2024_PMID39699798 In jüngster Zeit wurde epikardiales Fettgewebe (EAT) mit CT als unabhängiger Mortalitätsvorhersager bei Patienten mit verschiedenen Herzerkrankungen identifiziert. Unser Ziel war es, eine tiefgreifende Lernpipeline für eine robuste automatische EAT-Bewertung in CT zu entwickeln. Kontrastverstärkte EKG-verstärkte Herz- und Thorako-Abdominalspirale CT-Bildgebung von 1502 Patienten, die einen transcatheter aortic Ventilersatz (TAVR) erlitten haben. Die Selektion auf Aortenventil (AV)-Ebene und EAT-Segmentierung erfolgte manuell als Bodenwahrheit. Für die Schichtextraktion wurden zwei Ansätze verglichen: Ein Regressionsmodell mit einem 2D-Konvolutional-Neuralnetzwerk (CNN) und einem 3D CNN unter Verwendung von Verstärkungslernen (RL). Die Leistungsauswertung basiert auf einer mittleren absoluten z-Abweichung auf der manuell ausgewählten AV-Ebene (Δz). Für die Gewebesegmentierung wurde ein 2D U-Net auf Einzel-Slice-Bilder auf AV-Ebene trainiert und mit Dice-Score im Vergleich zur Open-Source-Körper- und Organanalyse (BOA). Für die End-to-End-Auswertung wurden überlegene Methoden ausgewählt, bei denen der mittlere absolute Unterschied (MAD) von EAT-Bereich und Gewebedichte verglichen wurde. 95 % Vertrauensintervalle (CI) wurden für alle Metriken bewertet. Die Slice-Extraktion mit RL war etwas genauer (Δz: RL 1,8 mm (95% CI: [1.6, 2.0]), 2D CNN 2,0 mm (95% CI: [1.8, 2.3])). Für die EAT-Segmentierung auf AV-Ebene hat das 2D U-Net BOA deutlich übertroffen (Dice-Score: 2D U-Net 91.3% (95% CI: [90.7, 91.8]), BOA 85.6% (95% CI: [84.7, 86.5]). Die End-to-End-Bewertung ergab eine hohe Übereinstimmung zwischen automatischen und manuellen Messungen der EAT (MAD-Bereich: 1,1 cm² (95% CI: [1.0, 1.3]), MAD-Dichte: 2.2 Hounsfield Einheiten (95% CI: [2.0, 2.5]). Wir schlagen eine Methode zur robusten automatischen EAT-Bewertung in Spiral-CT-Scans vor, die eine opportunistische Auswertung in der klinischen Routine ermöglicht. Da entzündliche Veränderungen im epikardialen Fettgewebe (EAT) mit einem erhöhten Risiko von Herzerkrankungen verbunden sind, kann die automatisierte Auswertung als Grundlage für die Entwicklung automatisierter Herz-Kreislauf-Risikobewertungstools dienen, die für eine effiziente, groß angelegte Bewertung in opportunistischen Einstellungen unerlässlich sind. Tiefe Lernmethoden zur automatischen Beurteilung von epikardialen Fettgewebe (EAT) haben großes Potenzial. Ein 2-stufiger Ansatz mit Scheibenextraktion und Gewebesegmentierung ermöglicht eine robuste automatisierte Auswertung von EAT. End-to-End-Automatisierung ermöglicht umfangreiche Forschung über den Wert von EAT für die Ergebnisanalyse. JA 2024 Dec 10.1186/s13244-024-01875-6 Insights into imaging Theis M Garajová L Salam B Nowak S Block W Attenberger UI Kütting D Luetkens JA article Nowak2024_PMID37572195 Um den prognostischen Wert von CT-basierten Markern von Sarkaropenie und Myosteatose im Vergleich zur Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG)-Score für das Überleben von Patienten mit fortgeschrittenem Pankreaskarzinom zu bewerten, der mit hochintensivem fokussiertem Ultraschall (HIFU) behandelt wird. Für 142 retrospektive Patienten wurden der Skelettmuskelindex (SMI), die Skelettmuskel-Radiodensität (SMRD), die Fettmuskelfraktion (FMF) und die intermuskuläre Fettfraktion (IMFF) auf dem überlegenen mesenterischen Arterieniveau im vorinterventionalen CT bestimmt. Jeder Marker wurde auf Assoziationen mit Sex, Alter, Körpermasseindex (BMI) und ECOG getestet. Der prognostische Wert der Marker wurde in Kaplan-Meier-Analysen mit dem Log-Rank-Test und in uni- und multivariablen Cox-Proportionalgefahren (CPH)-Modellen untersucht. Folgende signifikante Assoziationen wurden beobachtet: männliche Patienten hatten höhere BMI und SMI. Patienten mit niedrigerem ECOG hatten niedrigeres BMI und SMI. Patienten mit BMI unter 21,8 kg/m² (median) zeigten auch weniger SMI und IMFF. Patienten, die jünger als 63,3 Jahre (median) wurden gefunden, haben höhere SMRD, niedriger FMF und niedriger IMFF. In der Kaplan-Meier-Analyse wurden signifikant geringere Überlebenszeiten bei Patienten mit höherem ECOG oder niedrigerem SMI beobachtet. Bei höheren ECOG, niedrigerem BMI und niedrigerem SMI bei unveränderlichen CPH-Analysen für 1-, 2- und 3-jähriges Überleben wurde ein erhöhtes Patientenrisiko beobachtet. Multivariable CPH-Analyse für 1-Jahres-Überleben ergab ein erhöhtes Patientenrisiko für höhere ECOG, niedrigere SMI, niedrigere IMFF und höhere FMF. Bei der multivariablen Analyse des 2- und 3-jährigen Überlebens blieben nur ECOG und FMF signifikant. CT-basierte Marker von Sarkoopenie und Myosteatose zeigen einen prognostischen Wert für die Beurteilung des Überlebens bei fortgeschrittenen Pankreaskrebspatienten, die eine HIFU-Therapie erfahren. Die Ergebnisse zeigen eine größere Rolle der Myosteatose für eine zusätzliche Risikobewertung über klinische Punkte hinaus, da nur FMF mit einem langfristigen Überleben in multivariablen CPH-Analysen entlang ECOG assoziiert wurde und auch ECOG in Gruppenanalysen unabhängig zeigte. • Diese Studie untersucht den prognostischen Wert von CT-basierten Markern von Sarkoopenie und Myosteatose für Patienten mit Pankreaskrebs, die mit hochintensitätsorientiertem Ultraschall behandelt werden. • Marker für Sarkoopenie und Myosteatose zeigten neben der klinischen Beurteilung des physikalischen Status durch die östliche Genossenschaft Onkologie Gruppe einen prognostischen Wert. Im Gegensatz zu Muskelgrößenmessungen zeigte die Myosteatose-Marker-Fettmuskelfraktion die Unabhängigkeit der klinischen Partitur. • Die Ergebnisse zeigen, dass Myosteatose eine größere Rolle für zusätzliche Patientenrisikobewertungen spielen könnte, die über klinische Beurteilungen des körperlichen Status hinausgehen. JA 2024 Jan 10.1007/s00330-023-09974-6 European radiology Nowak S Kloth C Theis M Marinova M Attenberger UI Luetkens JA article Li2024_PMID39166972 Zweck Um zu ermitteln, ob die ununterbrochene Domänenanpassung (UDA)-Methode mit generierten Bildern die Leistung eines überwachten Lernmodells (SL) für Prostatakrebs (PCa)-Erkennung mit multisite biparametric (bp) MRI-Datensätzen verbessert. Materialien und Methoden Diese retrospektive Studie umfasste Daten von 5150 Patienten (14 191 Proben), die in neun verschiedenen Bildgebungszentren gesammelt wurden. Ein neuartiges UDA-Verfahren mit einem einheitlichen Generativmodell wurde zur PCa-Detektion unter Verwendung von Multisite bpMRI-Datensätzen entwickelt. Diese Methode übersetzt diffusionsgewichtete Bildgebung (DWI) Akquisitionen, einschließlich scheinbarer Diffusionskoeffizient (ADC) und einzelne diffusionsgewichtete (DW)-Bilder, die mit verschiedenen b-Werten erfasst werden, um die Art der Bilder, die unter Verwendung von b-Werten, die von Prostate Imaging Reporting and Data System (PI-RADS)-Richtlinien empfohlen werden, anzupassen. Die generierten ADC- und DW-Bilder ersetzen die Originalbilder für die PCa-Erkennung. Zur Auswertung wurde ein unabhängiger Satz von 1692 Testfällen (2393 Proben) verwendet. Als primäre Metrik wurde die Fläche unter der Empfänger-Betriebskennlinie (AUC) verwendet und über Bootstrapping eine statistische Analyse durchgeführt. Ergebnisse Für alle Testfälle betrugen die AUC-Werte für die Basislinie SL und UDA-Methoden 0,73 bzw. 0,79 (P < .001), für PCa-Läsionen mit PI-RADS-Score von 3 oder mehr und 0,77 bzw. 0,80 (P>/i> < .001) für Läsionen mit PI-RADS-Scores von 4 oder mehr. In den 361 Testfällen unter der ungünstigsten Bildaufnahmeeinstellung betrugen die AUC-Werte für die Basislinie SL und UDA 0,49 und 0,76 (P < .001) für Läsionen mit PI-RADS-Scores von 3 oder mehr und 0,50 und 0,77 (P>/i> < .001) für Läsionen mit PI-RADS-Scores von 4 oder mehr. Fazit UDA mit generierten Bildern verbesserte die Leistung von SL-Methoden in der PCa-Leseerkennung über Multisite-Datensätze mit verschiedenen b-Werten, insbesondere für Bilder, die mit signifikanten Abweichungen vom PI-RADS-recommended DWI-Protokoll (z.B. mit einem extrem hohen b-Wert) erfasst wurden. Keywords: Prostate Cancer Detection, Multisite, Unsupervised Domain Adaptation, Diffusion-weighted Imaging, b Wert Supplementalmaterial ist für diesen Artikel verfügbar. © RSNA, 2024. JA 2024 Sep 10.1148/ryai.230521 Radiology. Artificial intelligence Li H Liu H H Grimm R Huisman H Winkel D Penzkofer T Shabunin I Choi MH Yang Q Szolar D Shea S Coakley F Harisinghani M Oguz I Comaniciu D Lou B article Appel2024-cd Abstract Purpose The objective examination of the Post-COVID syndrome (PCS) remains difficult due to heterogeneous definitions and clinical phenotypes. The aim of the study was to verify the functionality and correlates of a recently developed PCS score. Methods The PCS score was applied to the prospective, multi-center cross-sectoral cohort (in- and outpatients with SARS-CoV-2 infection) of the "National Pandemic Cohort Network (NAPKON, Germany)". Symptom assessment and patient-reported outcome measure questionnaires were analyzed at 3 and 12 months (3/12MFU) after diagnosis. Scores indicative of PCS severity were compared and correlated to demographic and clinical characteristics as well as quality of life (QoL, EQ-5D-5L). Results Six hundred three patients (mean 54.0 years, 60.6% male, 82.0% hospitalized) were included. Among those, 35.7% (215) had no and 64.3% (388) had mild, moderate, or severe PCS. PCS severity groups differed considering sex and pre-existing respiratory diseases. 3MFU PCS worsened with clinical severity of acute infection (p = .011), and number of comorbidities (p = .004). PCS severity was associated with poor QoL at the 3MFU and 12MFU (p Conclusion The PCS score correlated with patients' QoL and demonstrated to be instructive for clinical characterization and stratification across health care settings. Further studies should critically address the high prevalence, clinical relevance, and the role of comorbidities. Trail registration number The cohort is registered at www.clinicaltrials.gov under NCT04768998. JA 2024 apr en 10.1007/s15010-024-02226-9 Infection Springer Science and Business Media LLC Katharina S Appel Carolin Nürnberger Thomas Bahmer Christian Förster Maria Cristina Polidori Mirjam Kohls Tanja Kraus Nora Hettich-Damm Julia Petersen Sabine Blaschke Isabel Bröhl Jana Butzmann Hiwa Dashti Jürgen Deckert Michael Dreher Karin Fiedler Carsten Finke Ramsia Geisler Frank Hanses Sina M Hopff Björn-Erik O Jensen Margarethe Konik Kristin Lehnert Susana M Nunes Miranda Lazar Mitrov Olga Miljukov Jens-Peter Reese Gernot Rohde Margarete Scherer Kristin Tausche Johannes J Tebbe Jörg Janne Vehreschild Florian Voit Patricia Wagner Martin Weigl Christina Lemhöfer E Hamelmann H Heidenreich C Hornberg N S A Kulamadayil-Heidenreich P Maasjosthusmann A Muna M Ruwe C Stellbrink N Buechner Y Dashti C Tessmer B Laumerich I Silberbaur S Bader M Engelmann A Fuchs A Langer B Maerkl H Messmann A Muzalyova C Roemmele R Berner S Dressen T Koch D Lindemann K Seele P Spieth N Toepfner S V Bonin T Feldt V Keitel A Killer L Knopp T Luedde M Lutterbeck M Paluschinski J P V Pereira J Timm D Kraska A E Kremer M Leppkes J Mang M F Neurath H U Prokosch J Schmid M Vetter C Willam K Wolf C Arendt C Bellinghausen S Cremer A Groh A Gruenewaldt Y Khodamoradi S Klinsing M Vehreschild T Vogl A L F Engels D Jarczak M Kerinn S Kluge R Kobbe S Petereit C Schlesner T Zeller R Baber S Bercker N Krug S D Mueller H Wirtz G Boeckel J A Meier T Nowacki P R Tepasse R Vollenberg C Wilms E Dahl N Marx D Mueller-Wieland J Wipperfuerth C Brochhausen-Delius R Burkhardt M Feustel O Haag S Hansch M Malfertheiner T Niedermair P Schuster S Wallner W Barkey J Erber L Fricke J Lieb T Michler L Mueller C Spinner C Winter M Bitzer S Bunk S Göpel H Haeberle K Kienzle H Mahrhofer N Malek P Rosenberger C Struemper F Trauner S Frantz A Frey K Haas C Haertel J Herrmann N Isberner J Liese P Meybohm J Schmidt P Schulze F Brinkmann Y Brueggemann T Gambichler K Hellwig T Luecke A Reinacher-Schick W E Schmidt C Schuette E Steinmann C Torres Reyes A Hafke G Hermanns S Y Nussbeck M Santibanez-Santana S Zeh L Brochhagen S Dolff C Elsner A Krawczyk R J Madel M Otte O Witzke K Becker M Doerr N Piasta E Schaefer C Scheer A Arlt F Griesinger U Guenther A Hamprecht K Juergens A Kluge C Meinhardt K Meinhardt A Petersmann R Prenzel M Brechtel M Laugwitz C Lee G Sauer N Schulze K Seibel M Stecher M Hagen S Sikdar C Weismantel L Wolf K Günther J Haug F Haug C Fiessler P U Heuschmann L Schmidbauer S Jiru-Hillmann T Bahls H Valentin I Chaplinskaya S Hanß D Krefting C Pape M Rainers A Schoneberg N Weinert M Kraus B Lorenz-Depiereux R Lorbeer J Schaller J Fricke L Krist M Rönnefarth S Schmidt T Bahmer A Hermes M Krawczak W Lieb T Tamminga S Herold P Heuschmann R Heyder T Illig M Witzenrath Group article Weis2024-bw JA 2024 may en 10.1016/j.jad.2024.02.041 J. Affect. Disord. 352 Elsevier BV 296—305 Martin Weiß Julian Gutzeit Katharina S Appel Thomas Bahmer Manfred Beutel Jürgen Deckert Julia Fricke Sabine Hanß Nora Hettich-Damm Peter U Heuschmann Anna Horn Kamila Jauch-Chara Mirjam Kohls Lilian Krist Bettina Lorenz-Depiereux Christian Otte Daniel Pape Jens-Peter Reese Stefan Schreiber Stefan Störk Jörg Janne Vehreschild Grit Hein article Wei.2024 BACKGROUND Depression and fatigue are commonly observed sequelae following viral diseases such as COVID-19. Identifying symptom constellations that differentially classify post-COVID depression and fatigue may be helpful to individualize treatment strategies. Here, we investigated whether self-reported post-COVID depression and post-COVID fatigue are associated with the same or different symptom constellations. METHODS To address this question, we used data from COVIDOM, a population-based cohort study conducted as part of the NAPKON-POP platform. Data were collected in three different German regions (Kiel, Berlin, Würzburg). We analyzed data from \textgreater2000 individuals at least six months past a PCR-confirmed COVID-19 disease, using elastic net regression and cluster analysis. The regression model was developed in the Kiel data set, and externally validated using data sets from Berlin and Würzburg. RESULTS Our results revealed that post-COVID depression and fatigue are associated with overlapping symptom constellations consisting of difficulties with daily activities, perceived health-related quality of life, chronic exhaustion, unrestful sleep, and impaired concentration. Confirming the overlap in symptom constellations, a follow-up cluster analysis could categorize individuals as scoring high or low on depression and fatigue but could not differentiate between both dimensions. LIMITATIONS The data presented are cross-sectional, consisting primarily of self-reported questionnaire or medical records rather than biometric data. CONCLUSIONS In summary, our results suggest a strong link between post-COVID depression and fatigue, highlighting the need for integrative treatment approaches. JA 2024 10.1016/j.jad.2024.02.041 Journal of affective disorders 352 296—305 Martin Weiß Julian Gutzeit Katharina S. Appel Thomas Bahmer Manfred Beutel Jürgen Deckert Julia Fricke Sabine Hanß Nora Hettich-Damm Peter U. Heuschmann Anna Horn Kamila Jauch-Chara Mirjam Kohls Lilian Krist Bettina Lorenz-Depiereux Christian Otte Daniel Pape Jens-Peter Reese Stefan Schreiber Stefan Störk Jörg Janne Vehreschild Grit Hein article Manzke2024_PMID39143126 Um ein tiefes lernbasiertes Modell zu entwickeln, das in der Lage ist, das linke ventrikuläre (LV)-Myokard auf nativen T1-Karten von Herz-MRT in sowohl Long-Achs- als auch Short-Axis-Ausrichtung zu segmentieren. Modelle wurden auf nativen myocardial T1 Karten von 50 gesunden Freiwilligen und 75 Patienten mit manueller Segmentierung als Referenzstandard ausgebildet. Basierend auf einer U-Net-Architektur optimierten wir das Modelldesign systematisch mit zwei unterschiedlichen Trainingsmetriken (Sørensen-Dice Koeffizient = DSC und Intersection-over-Union = IOU), zwei unterschiedlichen Aktivierungsfunktionen (ReLU und LeakyReLU) und verschiedenen Trainingsepochs. Das Training mit DSC-Metrik und einer ReLU-Aktivierungsfunktion über 35 Epochen erreichten die höchste Gesamtleistung (mittlerer Fehler in T1 10,6 ± 17,9 ms, mittlere DSC 0,88 ± 0,07). Grenzen der Übereinstimmung zwischen Modellergebnissen und Bodenwahrheit waren von -35,5 bis + 36,1 ms. Dies war der Vereinbarung zwischen zwei Menschenraten überlegen (-34,7 bis + 59,1 ms). Die Segmentierung war genau für Long-Axis-Ansichten (mittlerer Fehler T1: 6,77 ± 8,3 ms, mittlerer DSC: 0,89 ± 0,03) wie bei Kurzachs-Bildern (mittlerer Fehler ΔT1: 11,6 ± 19,7 ms, mittlerer DSC: 0,88 ± 0,08). Vollautomatische Segmentierung und quantitative Analyse von nativen Myokard-T1-Karten ist sowohl in lang- und kurzachsigen Orientierungen mit sehr hoher Genauigkeit möglich. JA 2024 Aug 10.1038/s41598-024-69529-7 Scientific reports Manzke M Iseke S Böttcher B Weber MA Meinel FG article Nowak2024_PMID37934243 Zur Untersuchung des Potenzials und der Einschränkungen der Nutzung von transformatorbasierter Report-Annotation zur Vor-Ort-Entwicklung von bildbasierten diagnostischen Entscheidungsunterstützungssystemen (DDSS). Die Studie umfasste 88,353 Brust-Röntgen von 19,581 intensiven Pflegeeinheiten (ICU) Patienten. Zur Kennzeichnung von sechs typischen Befunden in 17,041 Bildern wurden die entsprechenden Freitextberichte der anwesenden Radiologen von medizinischen Forschungsassistenten ("Gold-Labels") bewertet. Für alle Berichte wurden automatisch generierte "Silber"-Etiketten von auf Gold-Etiketten ausgebildeten Transformatormodellen extrahiert. Zur Untersuchung des Vorteils solcher Silberetiketten wurden die bildbasierten Modelle mit drei Ansätzen geschult: nur mit Goldetiketten (M_G), zuerst mit Silberetiketten, dann mit Goldetiketten (M_S/G) und zusammen mit Silber- und Goldetiketten (M_S+G). Um den Einfluss des investierten Annotationsaufwands zu untersuchen, wurden die Experimente mit unterschiedlichen Zahlen (N) von goldannotierten Berichten zur Ausbildung des Transformators und bildbasierten Modellen wiederholt und auf 2099 goldannotierten Bildern getestet. Wesentliche Unterschiede im makrogemittelten Bereich unter der Empfänger-Betriebskennlinie (AUC) wurden durch nicht überschneidende 95 %-Konfidenzintervalle bewertet. Die Verwendung von silbernen Transformatoren-basierten Etiketten ergab deutlich höhere makrogemittelte AUC als ausschließlich mit Gold-Etiketten (N = 1000: M_G> 67.8 [66.0-69.6], M_S/G> 77.9 [76.2-79.6]; N = 14,580: M_{G>/sub> 74.5 [72.8-76.2]. Die Ausbildung mit Silber- und Goldetiketten war zusammen mit nur 500 Goldetiketten (MS+G 76.4 [74.7-78.0], MS/G 75.3 [73.5-77.0]) von Vorteil. Transformerbasierte Annotation hat Potenzial zur Entriegelung von Freitext-Berichtsdatenbanken für die Entwicklung von bildbasierten DDSS. Die Vor-Ort-Entwicklung von bildbasierten DDSS könnte jedoch von anspruchsvolleren Anmerkungspipelines profitieren, einschließlich weiterer Informationen als ein einziger radiologischer Bericht. Mit Hilfe von klinischen Datenbanken zur Vor-Ort-Entwicklung von künstlichen Intelligenz (KI)-basierten Diagnose-Entscheidungsunterstützungssystemen durch textbasierte Transformatoren könnte die Anwendung von KI in der klinischen Praxis durch Umgehung hochregulierter Datenaustausche mit Dritten gefördert werden. Die Datenmenge aus einer Datenbank, die zur Entwicklung von AI-gestützten diagnostischen Entscheidungssystemen verwendet werden kann, ist oft durch die Notwendigkeit einer zeitraubenden Identifizierung von Pathologien durch Radiologen begrenzt. • Die transformatorbasierte Strukturierung von Freitext-Radiologischen Berichten zeigt Potenzial, entsprechende Bilddatenbanken zur Vor-Ort-Entwicklung von bildbasierten Diagnose-Entscheidungsunterstützungssystemen zu entsperren. • Die Qualität der Bildnotationen, die ausschließlich auf den Inhalt eines einzigen Radiologieberichts erzeugt werden, kann jedoch durch potenzielle Ungenauigkeiten und Unvollkommenheiten dieses Berichts begrenzt werden.} JA 2024 May 10.1007/s00330-023-10373-0 European radiology Nowak S Schneider H Layer YC Theis M Biesner D Block W Wulff B Attenberger UI Sifa R article Bucher2024_PMID37702415 JA 2024 May 10.1002/jmri.28988 Journal of magnetic resonance imaging : JMRI Penzkofer T May MS article Tayebi2024_PMID38326501 Pretraining markierte Datensätze, wie ImageNet, sind zu einem technischen Standard in der fortgeschrittenen medizinischen Bildanalyse geworden. Das Erscheinen von selbstüberwachtem Lernen (SSL), das unmarkierte Daten nutzt, um robuste Features zu lernen, bietet jedoch die Möglichkeit, den intensiven Etikettierungsprozess zu umgehen. In dieser Studie untersuchten wir, ob SSL für die Vorschulung auf nicht-medizinischen Bildern auf Brust-Radiographen angewendet werden kann und wie es mit überwachten Vorschulungen auf nicht-medizinischen Bildern und auf medizinischen Bildern vergleicht. Wir nutzten einen Vision-Transformator und initialisierten seine Gewichte auf der Grundlage der folgenden: (i) SSL-Vorschulung auf nicht-medizinischen Bildern (DINOv2), (ii) überwachtes Lernen (SL) Vorschulung auf nicht-medizinischen Bildern (ImageNet-Datensatz) und (iii) SL-Vorschulung auf Brust-Radiographen aus der MIMIC-CXR-Datenbank, dem größten markierten öffentlichen Datensatz von Brustradiographen. Wir testeten unseren Ansatz auf über 800.000 Brust-Radiographen aus 6 großen globalen Datensätzen, die mehr als 20 unterschiedliche Abbildungsergebnisse diagnostizieren. Die Leistung wurde mit dem Bereich unter der Empfänger-Betriebskennlinie quantifiziert und mit Bootstrapping für statistische Bedeutung ausgewertet. Die SSL-Vorschulung auf nicht-medizinischen Bildern hat nicht nur ImageNet-basierte Vorschulung (p < 0,001 für alle Datensätze) übertroffen, sondern in bestimmten Fällen auch SL auf dem MIMIC-CXR-Datensatz überschritten. Unsere Erkenntnisse legen nahe, dass die Auswahl der richtigen Vorschulstrategie, insbesondere mit SSL, für die Verbesserung der Diagnosegenauigkeit von künstlicher Intelligenz in der medizinischen Bildgebung entscheidend sein kann. Indem wir das Versprechen von SSL in der Brustbildanalyse demonstrieren, unterstreichen wir einen transformativen Wandel hin zu effizienteren und präziseren AI-Modellen in der medizinischen Bildgebung. Selbstbetreutes Lernen unterstreicht einen Paradigmenwechsel zur Verbesserung der AI-getriebenen Genauigkeit und Effizienz in der medizinischen Bildgebung. Die breitere Anwendung des selbsterweiterten Lernens in der medizinischen Bildgebung erfordert eine tiefere Erkundung, insbesondere in Kontexten, in denen umfassende notierte Datensätze begrenzt sind. JA 2024 Feb 10.1186/s41747-023-00411-3 European radiology experimental Tayebi Arasteh S Misera L Kather JN Truhn D Nebelung S article Bucher2024_PMID39199765 Ziel dieser Studie war es, einen standardisierten strukturierten Workflow zu etablieren, um Erkenntnisse aus hochauflösenden, optimierten Rekonstruktionen von nachmortem berechneter Tomographie (pmCT) mit Autopsy-Ergebnissen zum Nachweis von Brüchen des Laryngohyoid-Komplexes in Strangulationsopfern zu vergleichen. Es wurden vierundvierzig Strangulationsfälle ausgewählt und PmCT-Scans des Laryngohyoidkomplexes erhalten. Sowohl pmCT-Scans als auch Autopsieberichte wurden mit einer strukturierten Vorlage analysiert und mit Cohens kappa-Koeffizienten (κ) und dem McNemar-Test verglichen. Die Studie hat auch die Prävalenz von Ossa-Sesamoidea und die Nicht-Fusion der großen und kleinen Hörner des Hyoid-Knochens zwischen beiden diagnostischen Methoden verglichen. Der Bruchnachweis zeigte eine sehr gute Korrelation zwischen Autopsie- und pmCT-Ergebnissen (κ = 0,905), wobei der McNemar-Test keinen statistisch signifikanten Unterschied zwischen den beiden Methoden zeigte. PmCT identifizierte 28 Sesamoidknochen, 45 Nicht-Fusionen der Haupthörner und 47 Nicht-Fusionen der Nebenhörner des Hyoidknochens im Vergleich zu vier, sechs bzw. null, die durch Autopsie identifiziert wurden (p < 0,0001). Autopsie- und pmCT-Ergebnisse korrelieren gut und können komplementär eingesetzt werden. PmCT ist der Autopsie überlegen, Dislokationen zu erkennen und anatomische Variationen im Laryngohyoid-Komplex zu erkennen, die zu Fehlinterpretationen bei der Autopsie führen können. Daher befürworten wir nicht, die Autopsie durch pmCT zu ersetzen, sondern schlagen einen strukturierten Workflow, einschließlich unserer standardisierten Berichtsvorlage, zur Auswertung von Läsionen im Laryngohyoid-Komplex vor. JA 2024 Aug 10.3390/bioengineering11080807 Bioengineering (Basel, Switzerland) Kettner M Kölzer S Dietz J Frodl E Pinto Dos Santos D Vogl TJ Verhoff MA Beeres M Lux C Heinbuch S article windeck_entwicklung_2024 Obduktionen gelten seit langem als der Goldstandard für die Qualitätssicherung in der Medizin. Die COVID-19-Pandemie hat ihr Potenzial für das Verständnis der Pathophysiologie, Therapie und Krankheitsbewältigung wieder in den Fokus gerückt. Im April 2020 wurde das Deutsche Register für COVID-19-Obduktionen (DeRegCOVID) eingerichtet, gefolgt vom Konsortium DEFEAT PANDEMIcs (2020–2021), das sich zum Nationalen Obduktionsnetzwerk (NATON) entwickelte. 2024 mar de 2731-7196 10.1007/s00292-024-01307-8 Die Pathologie Autopsie, Autopsy, COVID-19, Deutschland, Disease management, Germany, Krankheitsmanagement, Register, Registries https://doi.org/10.1007/s00292-024-01307-8 Svenja Windeck Saskia Stillfried Lucas Triefenbach Ulrike Nienaber Roman David Bülow Rainer Röhrig Benjamin Ondruschka Peter Boor NATON article Sayed2024_PMID39728912 Medizinische Bildsegmentierung ist ein wesentlicher Schritt sowohl in der klinischen als auch in der Forschung, und automatisierte Segmentierungsmodelle - wie TotalSegmentator- sind allgegenwärtig geworden. Allerdings bleiben robuste Verfahren zur Validierung der Genauigkeit dieser Modelle begrenzt, und oft ist eine manuelle Inspektion erforderlich, bevor die von diesen Modellen erzeugten Segmentierungsmasken verwendet werden können. Um diese Lücke zu lösen, haben wir ein neuartiges Validierungskonzept für Segmentierungsmodelle entwickelt, das die Datenvergrößerung zur Beurteilung der Modellkonsistenz nutzt. Wir produzierten Segmentierungsmasken für die Original- und Augmented-Scans, und wir berechneten die Ausrichtungsmetriken zwischen diesen Segmentierungsmasken. Unsere Ergebnisse zeigen eine starke Korrelation zwischen der Segmentierungsqualität des Originalscans und der durchschnittlichen Ausrichtung zwischen den Masken des Originals und erweiterten CT-Scans. Diese Ergebnisse wurden durch die Unterstützung von Metriken, einschließlich des Varianzkoeffizienten und der durchschnittlichen symmetrischen Oberflächendistanz, validiert, was darauf hindeutet, dass die Übereinstimmung mit augmented-scan-Segmentationsmasken ein gültiger Proxy für die Segmentierungsqualität ist. Insgesamt bietet unser Rahmen eine Pipeline zur Auswertung der Segmentierungsleistung, ohne sich auf manuell markierte Bodenwahrheitsdaten zu verlassen und eine Grundlage für zukünftige Fortschritte bei der automatisierten medizinischen Bildanalyse zu schaffen. JA 2024 Dec 10.3390/tomography10120150 Tomography (Ann Arbor, Mich.) Sayed M Saba-Sadiya S Wichtlhuber B Dietz J Neitzel M Keller L Roig G article Soll2024_PMID38383419 Anaplastischer Schilddrüsenkrebs (ATC) ist ein seltener und aggressiver Neoplasm. Wir haben noch keine wirksamen Behandlungsoptionen, so dass Überlebensraten sehr niedrig bleiben. Hier haben wir die Aktivität der Kombination von Lenvatinib und Pembrolizumab als systemische Erstlinientherapie in ATC bewertet. In einer retrospektiven Analyse untersuchten wir die Aktivität und Verträglichkeit von kombiniertem Lenvatinib (Startddosis 14 bis 24 mg täglich) und Pembrolizumab (200 mg alle drei Wochen) als Erstlinientherapie in einem institutionellen Kohort von ATC-Patienten. Fünf Patienten mit metastasierendem ATC erhielten Lenvatinib und Pembrolizumab als systemische Erstlinientherapie. Das mediane progressionsfreie Überleben betrug 4,7 (Bereich 0,8-5,9) Monate und das mediane Gesamtüberleben betrug 6,3 (Bereich 0,8-nicht erreicht) Monate. Bei der ersten Folge hatte ein Patient eine partielle Reaktion, drei Patienten hatten eine stabile Erkrankung, und ein Patient war aufgrund einer Störung der Bewertung durch eine mithelfende akute infektiöse Schilddrüse formal nicht auswertbar. Dieser Patient war dann für mehr als ein Jahr stabil und war noch bei der Datenabschaltung ohne Krankheitsfortschritt Therapie. Weitere Analysen ergaben eine unzureichende DNA-Mangel-Reparatur, hohe CD8⁺ Lymphozyten-Infiltration und geringe Makrophagen-Infiltration bei diesem Patienten. Von den anderen Patienten, zwei hatten progressive Krankheit nach negativen Drogenreaktionen und Therapie-Deskalation, und zwei starben nach der ersten Inszenierung. Für alle Patienten reichte der PD-L1 kombinierte positive Score von 12 bis 100 %. Die Kombination von Lenvatinib und Pembrolizumab war bei behandlungsnahen ATC-Patienten mit gelegentlicher lang anhaltender Reaktion wirksam und mäßig toleriert. Allerdings konnten wir die außergewöhnlichen Reaktionen für diese Kombinationstherapie, die zuvor bei vorbehandelten Patienten gemeldet wurde, nicht bestätigen. JA 2024 Feb 10.1186/s12902-024-01555-y BMC endocrine disorders Soll D Bischoff P Jensen M Karadeniz Z Mogl MT Horst D Penzkofer T Spranger J Keilholz U Mai K article Kaya2024_PMID39079602 Die Diagnose der Myokarditis beruht auf multimodalen Daten, einschließlich Herz-Kreislauf-Magnetresonanz (CMR), klinischen Symptomen und Blutwerten. Die korrekte Interpretation und Integration von CMR-Ergebnissen erfordert radiologisches Fachwissen und Wissen. Wir wollten die Leistung des Generativen vortrainierten Transformers 4 (GPT-4), eines großen Sprachmodells, für berichtsbasierte medizinische Entscheidungsfindung im Kontext der Herz-MRT für vermutete Myokarditis untersuchen. Diese retrospektive Studie umfasst CMR-Berichte von 396 Patienten mit vermuteter Myokarditis bzw. acht Zentren. CMR-Berichte und Patientendaten einschließlich Blutwerte, Alter und weitere klinische Informationen wurden GPT-4 und Radiologen mit 1 (Bewohner 1), 2 (Bewohner 2) und 4 Jahren (Bewohner 3) der Erfahrung in CMR und Kenntnisse der Lake Louise Criteria 2018 zur Verfügung gestellt. Der endgültige Eindruck des Berichts über die radiologische Beurteilung, ob Myokarditis vorliegt oder nicht, wurde nicht vorgelegt. Die Leistung des Generativen vortrainierten Transformators 4 (GPT-4) und der menschlichen Leser wurde mit einer Konsenslesung verglichen (zwei Board-zertifizierte Radiologen mit 8 und 10 Jahren Erfahrung in der CMR). Empfindlichkeit, Spezifität und Genauigkeit wurden berechnet. GPT-4 ergab eine Genauigkeit von 83 %, eine Empfindlichkeit von 90 % und eine Spezifität von 78 %, die dem Arzt mit 1 Jahr Erfahrung vergleichbar war (R1: 86 %, 90 %, 84 %, p = 0,14) und niedriger als die der erfahrenen Ärzte (R2: 89 %, 86 %, 91 %, p = 0,007 und R3: 91 %, 85 %, 96 %, p < 0,001). GPT-4 und menschliche Leser zeigten eine höhere Diagnoseleistung, wenn Ergebnisse aus T1- und T2-Mapping-Sequenzen Teil der Berichte waren, für Bewohner 1 und 3 mit statistischer Bedeutung (p = 0,004 bzw. p = 0,02). GPT-4 lieferte eine gute Genauigkeit für die Diagnose von Myokarditis auf Basis von CMR-Berichten in einem großen Datensatz aus mehreren Zentren und hält daher das Potenzial, als diagnostisches Entscheidungshilfewerkzeug in dieser Kapazität zu dienen, insbesondere für weniger erfahrene Ärzte. Weitere Studien sind erforderlich, um das volle Potenzial und die erzieherischen Aspekte der Integration großer Sprachmodelle in die medizinische Entscheidungsfindung zu erforschen. JA 2024 10.1016/j.jocmr.2024.101068 Journal of cardiovascular magnetic resonance : official journal of the Society for Cardiovascular Magnetic Resonance Kaya K Gietzen C Hahnfeldt R Zoubi M Emrich T Halfmann MC Sieren MM Elser Y Krumm P Brendel JM Nikolaou K Haag N Borggrefe J Krüchten RV Müller-Peltzer K Ehrengut C Denecke T Goertz L Gertz RJ Maintz D Persigehl T Lennartz S Luetkens JA Pennig L Kottlors J article zhou_glucocorticoids_2024 Acute kidney injury (AKI) is a frequent and challenging clinical condition associated with high morbidity and mortality and represents a common complication in critically ill patients with COVID-19. In AKI, renal tubular epithelial cells (TECs) are a primary site of damage, and recovery from AKI depends on TEC plasticity. However, the molecular mechanisms underlying adaptation and maladaptation of TECs in AKI remain largely unclear. Here, our study of an autopsy cohort of patients with COVID-19 provided evidence that injury of TECs by myoglobin, released as a consequence of rhabdomyolysis, is a major pathophysiological mechanism for AKI in severe COVID-19. Analyses of human kidney biopsies, mouse models of myoglobinuric and gentamicin-induced AKI, and mouse kidney tubuloids showed that TEC injury resulted in activation of the glucocorticoid receptor by endogenous glucocorticoids, which aggravated tubular damage. The detrimental effect of endogenous glucocorticoids on injured TECs was exacerbated by the administration of a widely clinically used synthetic glucocorticoid, dexamethasone, as indicated by experiments in mouse models of myoglobinuric- and folic acid-induced AKI, human and mouse kidney tubuloids, and human kidney slice cultures. Mechanistically, studies in mouse models of AKI, mouse tubuloids, and human kidney slice cultures demonstrated that glucocorticoid receptor signaling in injured TECs orchestrated a maladaptive transcriptional program to hinder DNA repair, amplify injury-induced DNA double-strand break formation, and dampen mTOR activity and mitochondrial bioenergetics. This study identifies glucocorticoid receptor activation as a mechanism of epithelial maladaptation, which is functionally important for AKI. 2024 oct eng 1946-6242 10.1126/scitranslmed.adk5005 Science Translational Medicine 16 eadk5005 767 Acute Kidney Injury, Animals, COVID-19, Dexamethasone, Disease Models, Animal, Epithelial Cells, Female, Glucocorticoids, Humans, Kidney Tubules, Male, Mice, Mice, Inbred C57BL, Myoglobin, Receptors, Glucocorticoid, SARS-CoV-2, Stress, Physiological Luping Zhou Marc Torres Pereiro Yanqun Li Marcus Derigs Carsten Kuenne Thomas Hielscher Wei Huang Bettina Kränzlin Gang Tian Kazuhiro Kobayashi Gia-Hue Natalie Lu Kevin Roedl Claudia Schmidt Stefan Günther Mario Looso Johannes Huber Yong Xu Thorsten Wiech Jan-Peter Sperhake Dominic Wichmann Hermann-Josef Gröne Thomas Worzfeld article Hoffmann2024_PMID39636479 2022 flohen über 1.000.000 Menschen aus der Ukraine nach Deutschland, vor allem Frauen und Kinder. Ziel dieser Studie war es, den Gesundheitsstatus und den soziodemographischen Hintergrund ukrainischer Flüchtlings Minderjährige in Deutschland zu bestimmen und diese mit deutschen Minderjährigen zu vergleichen. In dieser Studie wurden ukrainische Flüchtlinge aller Altersgruppen, die freiwillig über Flyer oder Flüchtlingsheime mit den Studienzentren in Kontakt kamen, mit Hilfe ausgebildeter Dolmetscher vom 09-12/2022 interviewt. Wir haben Daten von Minderjährigen und ihren Familien zum sozioökonomischen Status, zur allgemeinen Gesundheitswahrnehmung, zur aktuellen und vorbestehenden Infektions- und nicht ansteckenden Krankheiten und zum Impfungsstatus bewertet. Die Daten für die Minderjährigen wurden durch Interviews der Begleiter erhoben. Darüber hinaus wurden eine physikalische Untersuchung und serologische Untersuchung für Infektions- und Impfstoff-vermeidbare Krankheiten durchgeführt. Insgesamt wurden 392 Minderjährige und Begleiter (358) einbezogen. Die allgemeine und psychische Gesundheit der Minderjährigen wurde in 83% (316) bzw. 80% (304) als "mindestens gut" gemeldet. In 16 % (63) wurden Infektions- oder andere zugrunde liegende Krankheiten aufgenommen. Tuberkulose-Infektionen (7, 1,8%) und Hepatitis C (2, 0,5%) wurden durch die serologischen Tests gefunden. HIV konnte nur in einem vorbekannten Fall nachgewiesen werden. Selbst gemeldete Impfungen gegen Masern und Varicellen entsprachen beispielsweise nicht den serologischen Befunden (Schutz gegen Masern 304; 84%; Varicella 230; 64%). Begleitende Erwachsene bewerten häufig die allgemeine Gesundheit und das Wohlbefinden der ukrainischen Flüchtlings Minderjährigen als eher arm. Häufig stimmten selbst gemeldete Impfungen und vorbestehende Krankheiten nicht mit Serologieergebnissen überein; daher sollten ukrainische Flüchtlings Minderjährige ohne formale Impfungsbescheinigung alle empfohlenen Impfungen angeboten und zusätzlich zur Tuberkulose für Hepatitis B, C und HIV großzügig abgeschirmt werden. • Infektionskrankheiten (TB, Hepatitis B/C, HIV) sind häufiger unter ukrainischen Minderjährigen und Impfstoffhesitanz ist weit verbreiteter als in vielen Wirtsländern und erfordern eine angemessene medizinische Versorgung. • Verlagerung und Krieg verschlechtern die medizinische Versorgung und haben negative Auswirkungen auf die psychische Gesundheit. Obwohl die intrafamiliale Ausbreitung von Infektionskrankheiten selten war (in dieser Kohorte), wahrgenommene allgemeine Gesundheit der ukrainischen Minderjährigen ist ziemlich schlecht. • Halbstrukturierte Interviews - auch bei Dolmetschern - sind oft unzureichend, um gültige medizinische Informationen zu sammeln. JA 2024 Dec 10.1007/s00431-024-05847-2 European journal of pediatrics Hoffmann AT Kobbe R Denz R Maier C Toepfner N Timmesfeld N Giesbrecht K Hovardovska O Vehreschild JJ Scherer M SMN Mitrov L Skipiol KE Holzwarth S Kaur Y Hojenski L Vehreschild MJGT Brinkmann F article schwabenland_high_2024 The underlying pathogenesis of neurological sequelae in post-COVID-19 patients remains unclear. Here, we used multidimensional spatial immune phenotyping and machine learning methods on brains from initial COVID-19 survivors to identify the biological correlate associated with previous SARS-CoV-2 challenge. Compared to healthy controls, individuals with post-COVID-19 revealed a high percentage of TMEM119+P2RY12+CD68+Iba1+HLA-DR+CD11c+SCAMP2+ microglia assembled in prototypical cellular nodules. In contrast to acute SARS-CoV-2 cases, the frequency of CD8+ parenchymal T cells was reduced, suggesting an immune shift toward innate immune activation that may contribute to neurological alterations in post-COVID-19 patients. 2024 jul eng 1432-0533 10.1007/s00401-024-02770-6 Acta Neuropathologica 148 11 1 Adult, Aged, Brain, CD8-Positive T-Lymphocytes, COVID-19, Cicatrix, Female, Humans, Imaging mass cytometry, Immunity, Innate, Long-COVID, Machine Learning, Male, Microglia, Middle Aged, Neuro-long-COVID-19, PACS, PCC, Post-COVID condition, Post-acute COVID syndrome, SARS-CoV-2 Marius Schwabenland Dilara Hasavci Sibylle Frase Katharina Wolf Nikolaus Deigendesch Joerg M. Buescher Kirsten D. Mertz Benjamin Ondruschka Jakob Matschke Markus Glatzel Stephan Frank Robert Thimme Juergen Beck Jonas A. Hosp Thomas Blank Bertram Bengsch Marco Prinz article Infection prevention and control (IPC) professionals are key intermediaries between hospital managers and frontline staff. During the novel coronavirus disease pandemic, IPC professionals faced new challenges. Unfortunately, research on human resource management (HRM) to support IPC during and between pandemics is lacking. Therefore, this scoping review aimed to elucidate the existing knowledge on HRM measures in this context and thus contribute to the pandemic preparedness of healthcare facilities. It was conducted as part of the "PREparedness and PAndemic REsponse in Germany (PREPARED)" project within the Network University Medicine (NUM), using the Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses Extension for Scoping Reviews (PRISMA-ScR) checklist. PubMed was searched without time restriction until 2023 (filter: English, German). Two reviewers assessed titles/abstracts and full texts, respectively. A total of nine publications were included, eight of which were published in the USA. All publications reported survey data (quantitative: six). Measures targeting personnel development and the qualification of IPC personnel were reported in six studies, i.e., almost two-thirds of the studies, of which five focused on the tasks of IPC professionals. In contrast, management of personnel costs and remuneration systems were reported less frequently (three studies), and only regarding issues around retention, compensation and dismissal. In conclusion, research gaps include trials on implementation and effectiveness of HRM for IPC. Given the increasing shortage of IPC professionals, HRM measures during and between pandemics become more important for establishing pandemic preparedness. JA 2024 Jun 10.1016/j.jhin.2024.04.004 38679391 J Hosp Infect 148 145-154 Hospitals; Human resource management; Infection prevention and control professionals; Organizations; Pandemic preparedness R Ülgüt I Tomsic IF Chaberny Thomas von Lengerke article Hofmann.2024 In the early phase of the COVID-19 pandemic, many local collections of clinical data on patients infected with SARS-CoV-2 were initiated in Germany. As part of the National Pandemic Cohort Network (NAPKON) of the University Medicine Network, the \textquotedblIntegration Core\textquotedbl was established to design the legal, technical and organisational requirements for the integration of inventory data into ongoing prospective data collections and to test the feasibility of the newly developed solutions using use cases (UCs). Detailed study documents of the data collections were obtained. After structured document analysis, a review board evaluated the integrability of the data in NAPKON according to defined criteria. Of 30 university hospitals contacted, 20 responded to the request. Patient information and consent showed a heterogeneous picture with regard to the pseudonymised transfer of data to third parties and re-contact. The majority of the data collections (n=13) met the criteria for integration into NAPKON; four studies would require adjustments to the regulatory documents. Three cohorts were not suitable for inclusion in NAPKON. The legal framework for retrospective data integration and consent-free data use via research clauses (§27 BDSG) was elaborated by a legal opinion by TMF - Technology, Methods and Infrastructure for Networked Medical Research, Berlin. Two UCs selected by the NAPKON steering committee (CORKUM, LMU Munich; Pa-COVID-19, Charité- Universitätsmedizin Berlin) were used to demonstrate the feasibility of data integration in NAPKON by the end of 2021. Quality assurance and performance-based reimbursement of the cases were carried out according to the specifications. Based on the results, recommendations can be formulated for various contexts in order to create technical-operational prerequisites such as interoperability, interfaces and data models for data integration and to fulfil regulatory requirements on ethics, data protection, medical confidentiality and data access when integrating existing cohort data. The possible integration of data into research networks and their secondary use should be taken into account as early as the planning phase of a study - particularly with regard to informed consent - in order to maximise the benefits of the data collected. In der frühen Phase der COVID-19-Pandemie wurden in Deutschland viele lokale Sammlungen klinischer Daten mit SARS-CoV-2 infizierter Patient:innen initiiert. Im Rahmen des Nationalen Pandemie-Kohorten-Netzes (NAPKON) des Netzwerkes Universitätsmedizin wurde der „Integrationskern“ etabliert, um die rechtlichen, technischen und organisatorischen Voraussetzungen für eine Integration von Bestandsdaten in laufende prospektive Datensammlungen zu konzipieren und die Machbarkeit der entwickelten Lösungen mittels Use Cases (UCs) zu prüfen. Detaillierte Studienunterlagen der Datensammlungen wurden eingeholt. Nach strukturierter Dokumentenanalyse, bewertete ein Review Board, gemäß definierter Kriterien die Integrierbarkeit der Daten in NAPKON. Von 30 kontaktierten Universitätskliniken hatten 20 auf die Anfrage geantwortet. Die Patient:inneninformationen und Einwilligungen zeigten ein heterogenes Bild bezüglich der pseudonymen Weitergabe der Daten an Dritte und des Re-Kontakts. Ein Großteil der Datensammlungen (n=13) erfüllte die Kriterien für eine Integration in NAPKON, bei vier Studien wären Anpassungen der regulatorischen Dokumente erforderlich. Drei Kohorten waren nicht für einen Einschluss in NAPKON geeignet. Die rechtlichen Rahmenbedingungen einer retrospektiven Datenintegration und einer einwilligungsfreien Datennutzung über Forschungsklauseln (§27 BDSG) wurde durch ein Rechtsgutachten der TMF — Technologie- und Methodenplattform, für die vernetzte medizinische Forschung e. V., Berlin erarbeitet. Anhand zweier vom NAPKON-Lenkungsausschuss ausgewählter UCs(CORKUM, LMU München; Pa-COVID-19, Charité- Universitätsmedizin Berlin) wurde die Machbarkeit einer Datenintegration bis Ende 2021 in NAPKON gezeigt. Es erfolgte gemäß den Vorgaben die Qualitätssicherung und die aufwandsgenaue Abrechnung der übertragenen Fälle. Basierend auf den Ergebnissen können Empfehlungen für verschiedene Kontexte formuliert werden, um technisch-operative Voraussetzungen wie Interoperabilität, Schnittstellen und Datenmodelle für die Datenintegration zu schaffen sowie regulatorische Anforderungen an Ethik, Datenschutz, ärztliche Schweigepflichtsentbindung und den Datenzugang bei der Integration bestehender Kohortendaten zu erfüllen. Die mögliche Integration von Daten in Forschungsnetzwerke und deren Sekundärnutzung sollte bereits in der Planungsphase einer Studie — insbesondere beim Informed Consent — berücksichtigt werden, um den größtmöglichen Nutzen aus den erhobenen Daten zu ziehen. JA 2024 10.1055/a-2346-9680 Gesundheitswesen (Bundesverband der Arzte des Offentlichen Gesundheitsdienstes (Germany)) 86 647—654 10 Anna-Lena Hofmann Jörg Janne Vehreschild Martin Witzenrath Wolfgang Hoffmann Thomas Illig Stefan Schreiber Gabriele Anton Johannes Christian Hellmuth Maximilian Muenchhoff Clemens Scherer Christina Pley Charlotte Thibeault Florian Kurth Sarah Berger Michael Hummel Sina Marie Hopff Melanie Stecher Katharina Appel Dana Stahl Monika Kraus Bettina Lorenz-Depiereux Sabine Hanß Sebastian Kielmansegg Irene Schlünder Anna Niemeyer Peter Heuschmann Michael Krawczak Jens-Peter Reese article Orban2024-hr BACKGROUND: The COVID-19 pandemic has significantly impacted the mental health of children and families, i.e., due to measures like social distancing and remote schooling. While previous research has shown negative effects on mental health and health-related quality of life (HRQoL), most studies have focused on pre-post comparisons in the early pandemic stages. This systematic review aims to examine longitudinal studies to understand the long-term impacts of the pandemic on children and adolescents. METHODS: This systematic review adhered to the PRISMA guidelines and was preregistered in the international prospective register of systematic reviews (Record ID: CRD42022336930). We systematically searched PubMed/MEDLINE, Web of Science, PsycINFO, PSYNDEX, and the WHO-COVID-19 database and included studies published up to August 30, 2022. Based on pre-defined eligibility criteria, longitudinal and prospective studies that assessed the mental health or quality of life of children or adolescents (0-19 years) in the general population over a longer time span (at two or more measurement points) during the COVID-19 pandemic were included in the review. The methodological quality of the included studies was assessed using an adapted version of the Effective Public Health Practice Project (EPHPP) checklist. Narrative data synthesis was used to summarize the findings. RESULTS: A total of 5,099 results were obtained from literature searches, with 4,935 excluded during title/abstract screening. After reviewing 163 full-text articles, 24 publications were included in the review. Sample sizes ranged between n = 86 and n = 34,038. The length of the investigated time periods and the number of assessment points, as well as outcomes, varied. The majority of studies were of moderate methodological quality. Mental health outcomes were more frequently studied compared to measures of HRQoL. The findings from these studies mostly suggest that children and adolescents experienced heightened mental health problems, specifically internalizing symptoms like anxiety and depression. Further, there was a decline in their overall HRQoL over the course of the COVID-19 pandemic that did not necessarily subside when lockdowns ended. CONCLUSION: It is crucial to continue monitoring the mental health and well-being of children and adolescents following the pandemic to identify groups at risks and plan interventions. This should ideally be conducted by large systematic studies, using validated instruments, and encompassing representative samples to obtain reliable and comprehensive insights with the aim of improving youth mental health care. JA 2024 jan en https://doi.org/10.3389/fpubh.2023.1275917 Front Public Health 11

Switzerland

1275917 COVID-19; adolescents; children; mental health; prospective studies; quality of life; systematic review, coverCHILD Ester Orban Lydia Yao Li Martha Gilbert Ann-Kathrin Napp Anne Kaman Sabine Topf Maren Boecker Janine Devine Franziska Reiß Flora Wendel Caroline Jung-Sievers Vanessa Sophie Ernst Marco Franze Eva Möhler Eva Breitinger Stephan Bender Ulrike Ravens-Sieberer article Eckstein2024_PMID38117123 Das Post-COVID-Syndrom (PCS) kann die Lebensqualität der Patienten und ihrer Familien beeinträchtigen. Insbesondere ist der Grad der Herzbeeinträchtigung bei Kindern mit PCS unbekannt. Ziel dieser Studie war es, mögliche Herzentzündungssequenzen bei Kindern mit PCS im Vergleich zu gesunden Kontrollen zu identifizieren. Diese einzentige, prospektive, intraindividuelle, Beobachtungsstudie bewertet die Herzfunktion, globale und segmentbasierte Stämme und die Gewebecharakterisierung in 29 alters- und sexangepassten Kindern mit PCS und gesunden Kindern mit einer 3 T-Magnetresonanztomographie (MRI). Herz-MRT wurde über 36,4 ± 24,9 Wochen nach-COVID-Infektion durchgeführt. Die Studie Kohorte hat ein durchschnittliches Alter von 14,0 ± 2,8 Jahren, für die die meisten Menschen von Müdigkeit, Konzentrationsstörungen, Dyspnea, Schwindel und Muskelschmerzen erfahren. Kinder mit PSC im Gegensatz zur Kontrollgruppe zeigten eine erhöhte Herzfrequenz (83,7 ± 18,1 Schläge pro Minute vs 75,2 ± 11,2 Schläge pro Minute, P = 0,019), erhöhtes rechtsventrikuläres enddiastolic Volumen (95,2 ± 19,2 ml -2 vs 82,0 ± 21,5 ml -2, P = 0,018) und endsystolisches Volumen (40,3 ± 7,9 ml Basierend auf der aktualisierten Lake Louise Criteria, Myokardinentzündung ist in 20 (69%) Kindern mit PCS. Für globale Stämme wurde kein statistisch signifikanter Unterschied beobachtet. Cardiac MRI ergab geänderte rechtsventrikuläre Volumentrikten und erhöhte T1 und T2 Mapping-Werte bei Kindern mit PCS, suggestiv für eine diffuse myokardial Entzündung, die für die diagnostische Aufarbeitung von PCS bei Kindern nützlich sein kann. JA 2024 Jun 10.1097/RLI.0000000000001048 Investigative radiology Eckstein J Skeries V Pöhler G Babazade N Kaireit T Gutberlet M Kornemann N Hellms S Hansmann G Beerbaum P Hansen G Wacker F Vogel-Claussen J Wetzke M Renz DM article Rothoeft2024_PMID38499828 Im Gegensatz zu Erwachsenen ist der Immunschutz gegen SARS-CoV-2 bei Kindern und Jugendlichen mit natürlicher oder hybrider Immunität immer noch schlecht verstanden. Ziel dieser Studie war es, verschiedene Immunfächer in verschiedenen Altersgruppen zu analysieren und ob humorale Immunreaktionen mit einer zellulären Immunreaktion korrelieren. 72 Kinder und Jugendliche mit einer früheren SARS-CoV-2 Infektion wurden rekrutiert. 37 wurden mit einem RNA-Impfstoff (BNT162b2) geimpft. Nach einer Infektion durch Messung von Spikeprotein (S), Nucleocapsid (NCP) und Neutralisation von Antikörpern (nAB) wurde die humorale Immunität 3-26 Monate (vermittelt 10 Monate) analysiert. Zelluläre Immunität wurde mit einem SARS-CoV-2-spezifischen Interferon-γ-Release-Assay (IGRA) analysiert. Alle Kinder und Jugendlichen hatten S-Antikörper; Titer waren höher bei denen mit Hybrid-Immunität (14.900 BAU/ml vs. 2118 BAU/ml). NCP-Antikörper wurden in > 90% nachweisbar. Neutralisierende Antikörper (nAB) wurden häufiger (90%) mit höheren Titern (1914 RLU) bei Jugendlichen mit hybrider Immunität als bei Kindern mit natürlicher Immunität (62.5%, 476 RLU) nachgewiesen. Kinder mit natürlicher Immunität waren weniger wahrscheinlich reaktive IGRAs (43,8%) als Jugendliche mit hybrider Immunität (85%). Die von T-Zellen freigesetzte Menge an Interferon-γ war in der natürlichen und hybriden Immunität vergleichbar. Spike-Antikörper sind die zuverlässigsten Marker, um eine Immunreaktion gegen SARS-CoV-2 zu überwachen. Hohe Antikörpertiter von Spike-Antikörpern und nAB korrelierten mit zellulärer Immunität, ein Phänomen, das nur bei Jugendlichen mit hybrider Immunität gefunden wurde. Hybride Immunität ist mit deutlich höheren Antikörpertitern und einer höheren Wahrscheinlichkeit einer zellulären Immunantwort als einer natürlichen Immunität verbunden. JA 2024 Aug 10.1007/s15010-024-02225-w Infection Rothoeft T Maier C Lange B Denz R Timmesfeld N Toepfner N Vidal-Blanco E Pfaender S Lücke T Brinkmann F article LUCKE2024e24508 The severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) which is responsible for eliciting Coronavirus disease 2019 (COVID-19) still challenges healthcare services worldwide. While many patients only suffer from mild symptoms, patients with some pre-existing medical conditions are at a higher risk for a detrimental course of disease. However, the underlying mechanisms determining disease course are only partially understood. One key factor influencing disease severity is described to be immune-mediated. In this report, we describe a post-mortem analysis of 45 individuals who died from SARS-CoV-2 infection. We could show that although sociodemographic factors and premedical conditions such as obesity and diabetes mellitus reduced survival time in our cohort, they were not associated with changes in the expression of immune-related signature genes at the RNA level in the blood, the gut, or the liver between these different groups. Our data indicate that obesity and diabetes mellitus influence SARS-CoV-2-related mortality, without influencing the extrapulmonary gene expression of immunity-related signature genes at the RNA level. 2024 2405-8440 https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2024.e24508 Heliyon 10 e24508 2 https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2405844024005395 Jöran Lücke Marius Böttcher Mikolaj Nawrocki Nicholas Meins Josa Schnell Fabian Heinrich Franziska Bertram Morsal Sabihi Philipp Seeger Marie Pfaff Sara Notz Tom Blankenburg Tao Zhang Jan Kempski Matthias Reeh Stefan Wolter Oliver Mann Marc Lütgehetmann Thilo Hackert Jakob R. Izbicki Anna Duprée Samuel Huber Benjamin Ondruschka Anastasios D. Giannou article rong_persistence_2024 2024 nov English 1931-3128 10.1016/j.chom.2024.11.007 Cell Host & Microbe SARS-CoV-2, brain, long COVID, mRNA vaccine, meninges, neurodegeneration, neuroinflammation, skull, spike protein, tissue clearing https://www.cell.com/cell-host-microbe/abstract/S1931-3128(24)00438-4 Publisher: Elsevier Zhouyi Rong Hongcheng Mai Gregor Ebert Saketh Kapoor Victor G. Puelles Jan Czogalla Senbin Hu Jinpeng Su Danilo Prtvar Inderjeet Singh Julia Schädler Claire Delbridge Hanno Steinke Hannah Frenzel Katja Schmidt Christian Braun Gina Bruch Viktoria Ruf Kurt-Wolfram Sühs Mojtaba Nemati Franziska Hopfner Selin Ulukaya Denise Jeridi Daniele Mistretta Ozum Sehnaz Caliskan Jochen Martin Wettengel Fatma Cherif Zeynep Ilgin Kolabas Muge Molbay Izabela Horvath Shan Zhao Natalie Krahmer Ali Önder Yildirim Siegfried Ussar Jochen Herms Tobias B. Huber Sabina Tahirovic Susanne M. Schwarzmaier Nikolaus Plesnila Günter Höglinger Benjamin Ondruschka Ingo Bechmann Ulrike Protzer Markus Elsner Harsharan Singh Bhatia Farida Hellal Ali Erturk article schadler_pilot_2024 Funeral home and crematorium workers are an important occupational group in the corona crisis. The occupational setting led to concerns about an increased risk of infection with SARS-CoV-2. The seroprevalence in this occupational group is unclear. A questionnaire-based retrospective survey of funeral home and crematorium staff was conducted in December 2020. A second survey of funeral and crematorium staff was conducted 6 months later, in June 2021, to determine changes in pandemic management. Seroprevalence or vaccination status for SARS-CoV-2 was determined at these two time points. In December 2020, a seroprevalence of 2.3% (n = 1/44) was detected in funeral home and crematorium workers. In June 2021, one additional participant tested positive for the SARS-CoV-2 nucleocapsid. Of the participants, 48.5% (n = 16) were vaccinated at this time. The risk of SARS-CoV-2 infection for funeral home and crematorium workers is more similar to that of the general population in Hamburg, Germany. We found no evidence of an increased risk of infection at these two time points in our cohort. Further education on communicable diseases or appropriate protective measures in this occupational group for other infectious diseases would be useful in the future. 2024 en 1556-2891 10.1007/s12024-023-00661-y Forensic Science, Medicine and Pathology 20 500—507 COVID-19, Funeral and crematory workers, Occupational health and safety, SARS-CoV-2, Seroprevalence, Vaccination https://doi.org/10.1007/s12024-023-00661-y Julia Schädler Marc Lütgehetmann Ann Sophie Schröder Carolin Edler Klaus Püschel Benjamin Ondruschka Antonia Fitzek article gaertner_plasmacytoid_2024 Abstract Platelet homeostasis is essential for vascular integrity and immune defence 1,2 . Although the process of platelet formation by fragmenting megakaryocytes (MKs; thrombopoiesis) has been extensively studied, the cellular and molecular mechanisms required to constantly replenish the pool of MKs by their progenitor cells (megakaryopoiesis) remains unclear 3,4 . Here we use intravital imaging to track the cellular dynamics of megakaryopoiesis over days. We identify plasmacytoid dendritic cells (pDCs) as homeostatic sensors that monitor the bone marrow for apoptotic MKs and deliver IFNα to the MK niche triggering local on-demand proliferation and maturation of MK progenitors. This pDC-dependent feedback loop is crucial for MK and platelet homeostasis at steady state and under stress. pDCs are best known for their ability to function as vigilant detectors of viral infection 5 . We show that virus-induced activation of pDCs interferes with their function as homeostatic sensors of megakaryopoiesis. Consequently, activation of pDCs by SARS-CoV-2 leads to excessive megakaryopoiesis. Together, we identify a pDC-dependent homeostatic circuit that involves innate immune sensing and demand-adapted release of inflammatory mediators to maintain homeostasis of the megakaryocytic lineage. 2024 jul en 0028-0836, 1476-4687 10.1038/s41586-024-07671-y Nature 631 645—653 8021 https://www.nature.com/articles/s41586-024-07671-y Florian Gaertner Hellen Ishikawa-Ankerhold Susanne Stutte Wenwen Fu Jutta Weitz Anne Dueck Bhavishya Nelakuditi Valeria Fumagalli Dominic Van Den Heuvel Larissa Belz Gulnoza Sobirova Zhe Zhang Anna Titova Alejandro Martinez Navarro Kami Pekayvaz Michael Lorenz Louisa Von Baumgarten Jan Kranich Tobias Straub Bastian Popper Vanessa Zheden Walter Anton Kaufmann Chenglong Guo Guido Piontek Saskia Von Stillfried Peter Boor Marco Colonna Sebastian Clauß Christian Schulz Thomas Brocker Barbara Walzog Christoph Scheiermann Claus Nerlov Konstantin Stark Tobias Petzold Stefan Engelhardt Michael Sixt Robert Hauschild Martina Rudelius Robert A. J. Oostendorp Matteo Iannacone Matthias Heinig Steffen Massberg article Schlegtendal2024_PMID39707044 Mangel an Kontrollgruppe(n) und Selektionsbias waren die Hauptkritiken früherer Studien, die die Prävalenz des post-coronavirus-Krankheit 2019 (COVID-19)-Syndroms (PCS) untersuchten. Es gibt unzureichende Daten zu pädiatrischen PCS, insbesondere in der SARS-CoV-2 Omicron-Ära. Als solche untersuchte unsere Studie PCS-assoziierte Symptome in einer repräsentativen kontrollangepassten Kohorte. Im Rahmen des Projekts "Immunebridge" der Deutschen Netzwerkuniversitätsmedizin (NUM) wurden zwischen Juli und Oktober 2022 Kinder und Jugendliche rekrutiert. Kinder mit Polymerase-Kettenreaktion bestätigte SARS-CoV-2 Infektion in 2022 (COVID-19 Gruppe) wurden mit denen ohne Geschichte der SARS-CoV-2 Infektion und negativ für SARS-CoV-2 Antikörper verglichen. Zu den Abfragen gehören Impfungen, Lebensqualität (QoL) und psychische und körperliche Symptome, die in den letzten drei Monaten möglicherweise mit PCS verbunden sind. Aus den Antworten wurde ein zusätzlicher Verbundwerkstoff "physikalische Leistung" geschaffen. Die Anzahl der Kinder mit ≥ 1 PCS-Symptom(en) war zwischen den COVID-19 (n = 114 [62.1%]) und Kontrollgruppen (n = 66 [64.9%]) vergleichbar. Konzentrationsstörungen wurden häufiger in der COVID-19 Gruppe gemeldet (12,3 % gegenüber 1,5 %; p = 0,012) und "physische Leistung" wurde deutlich beeinträchtigt (p = 0,016) unabhängig von Alter, Geschlecht und SARS-CoV-2 Impfung. Die Häufigkeiten anderer Symptome waren in beiden Gruppen ähnlich. Die COVID-19 Gruppe bewertet ihre Fitness so schlechter, mit ansonsten gleichen QoL-Ratings in Bezug auf allgemeine und geistige Gesundheit. Fazit Kinder mit und ohne vorherige Infektionen waren in den meisten PCS-assoziierten Symptomen nicht unterschiedlich. Ausnahmen enthielten körperliche Leistungsfähigkeit und kognitive Probleme, die nach Omicron-Infektion stärker beeinträchtigt als in Kontrollen. • Vor allem durch zu wenige kontrollierte Studien ist das Wissen über die Prävalenz einzelner Symptome im pädiatrischen post-COVID-19-Syndrom (PCS) für die Omicron-Ära schlecht. • In einer repräsentativen kontrollangepassten Kohorte unterscheiden sich die meisten elterlich gemeldeten PCS-assoziierten Symptome und die Lebensqualität bei Kindern und Jugendlichen mit einer PCR-geprüften SARS-CoV-2 Infektion nicht von denen ohne Infektion. • Ausnahmen waren körperliche Leistungsfähigkeit und kognitive Probleme, die nach SARS-CoV-2-Omicron-Infektion offenbar stärker beeinträchtigt wurden als in den Kontrollpersonen. JA 2024 Dec 10.1007/s00431-024-05919-3 European journal of pediatrics Maier C Stein J Höpner J Drinka D Berner R Lücke T Toepfner N Brinkmann F article lahmer_postmortem_2024 Background: Economic restrictions and workforce cuts have continually challenged conventional autopsies. Recently, the COVID-19 pandemic has added tissue quality and safety requirements to the investigation of this disease, thereby launching efforts to upgrade autopsy strategies. Methods: In this proof-of-concept study, we performed bedside ultrasound-guided minimally invasive autopsy (US-MIA) in the ICU of critically ill COVID-19 patients using a structured protocol to obtain non-autolyzed tissue. Biopsies were assessed for their quality (vitality) and length of biopsy (mm) and for diagnosis. The efficiency of the procedure was monitored in five cases by recording the time of each step and safety issues by swabbing personal protective equipment and devices for viral contamination. Findings: Ultrasound examination and tissue procurement required a mean time period of 13 min and 54 min, respectively. A total of 318 multiorgan biopsies were obtained from five patients. Quality and vitality standards were fulfilled, which not only allowed for specific histopathological diagnosis but also the reliable detection of SARS-CoV-2 virions in unexpected organs using electronic microscopy and RNA-expressing techniques. Interpretation: Bedside multidisciplinary US-MIA allows for the fast and efficient acquisition of autolytic-free tissue and offers unappreciated potential to overcome the limitations of research in postmortem studies. JA 2024 jan en 2075-4418 10.3390/diagnostics14030294 Diagnostics 14 294 3 COVID-19, ICU, minimal invasive autopsy, postmortem diagnostic https://www.mdpi.com/2075-4418/14/3/294 Number: 3 Publisher: Multidisciplinary Digital Publishing Institute Tobias Lahmer Gregor Weirich Stefan Porubsky Sebastian Rasch Florian A. Kammerstetter Christian Schustetter Peter Schüffler Johanna Erber Miriam Dibos Claire Delbridge Peer Hendrik Kuhn Samuel Jeske Manuel Steinhardt Adam Chaker Markus Heim Uwe Heemann Roland M. Schmid Wilko Weichert Konrad Friedrich Stock Julia Slotta-Huspenina article Stake2024_PMID38893597 In dieser Studie haben wir versucht, die Fähigkeiten von Radiomik und maschinellem Lernen bei der Vorhersage von Seropositivität bei Patienten mit vermuteter Autoimmunenzenzenzephalitis (AE) aus MR-Bildern zu bewerten, die bei Symptombeginn erhalten wurden. Bei 83 Patienten, die zwischen 2011 und 2022 mit AE diagnostiziert wurden, wurde die manuelle bilaterale Segmentierung der Amygdala auf vorkontrastierten T2-Bildern mit 3D Slicer Open-Source-Software durchgeführt. Unsere Probe von 83 Patienten enthielt 43 seropositive und 40 seronegative AE-Fälle. Bilder wurden in unserem tertiären Pflegezentrum und in verschiedenen Sekundärpflegezentren in Nordrhein-Westfalen, Deutschland, erhalten. Die Probe wurde zufällig in Trainingsdaten und unabhängige Testdaten aufgeteilt. Insgesamt 107 radiomische Merkmale wurden aus bilateralen Interessengebieten (ROI) gewonnen. Automatisiertes maschinelles Lernen (AutoML) wurde verwendet, um die vielversprechendsten maschinellen Lernalgorithmen zu identifizieren. Die Feature-Auswahl wurde unter Verwendung einer rekursiven Merkmalsbehebung (RFE) durchgeführt und basiert auf der Bestimmung der wichtigsten Merkmale. Ausgewählte Funktionen wurden verwendet, um verschiedene maschinelle Lernalgorithmen auf 100 verschiedenen Datenpartitionen zu trainieren. Anschließend wurde die Leistung auf unabhängigen Testdaten ausgewertet. Unser Radiomics-Ansatz konnte die Anwesenheit von Autoantikörpern in den unabhängigen Testproben mit einem mittleren AUC von 0,90, einer mittleren Genauigkeit von 0,83, einer mittleren Empfindlichkeit von 0,84 und einer mittleren Spezifität von 0,82 vorhersagen, wobei Lasso Regressionsmodelle die vielversprechendsten Ergebnisse liefern. Diese Ergebnisse deuten darauf hin, dass das funktechnische Lernen ein vielversprechendes Werkzeug sein könnte, um die Anwesenheit von Autoantikörpern bei Verdacht auf AE-Patienten vorherzusagen. Angesichts der Auswirkungen der Seropositivität auf die endgültige Diagnose von vermuteten AE-Fällen kann dies die diagnostische Aufarbeitung noch beschleunigen, bevor Ergebnisse aus spezialisierten Labortests gewonnen werden können. Darüber hinaus zeigen unsere Ergebnisse in Verbindung mit den jüngsten Veröffentlichungen, dass die Charakterisierung von AE-Subtypen durch den Einsatz von Radiomikros in Zukunft möglich werden kann, was es den Ärzten ermöglicht, die Behandlung im Geiste der personalisierten Medizin auch vor Abschluss der Laborarbeit zu personalisieren. JA 2024 May 10.3390/diagnostics14111070 Diagnostics (Basel, Switzerland) Stake J Spiekers C Akkurt BH Heindel W Brix T Mannil M Musigmann M article Tayebi2024_PMID38486100 Künstliche Intelligenz (KI) Modelle werden zunehmend im medizinischen Bereich eingesetzt. Da medizinische Daten jedoch sehr empfindlich sind, sind besondere Vorsichtsmaßnahmen erforderlich, um ihren Schutz zu gewährleisten. Der Goldstandard für die Privatsphärenerhaltung ist die Einführung von Differential Privacy (DP) zur Modellbildung. Vorangegangene Arbeiten zeigen, dass DP negative Auswirkungen auf die Modellgenauigkeit und Fairness hat, die in der Medizin nicht akzeptabel sind und eine wesentliche Barriere für die weit verbreitete Verwendung von Datenschutz-Schutztechniken darstellen. In dieser Arbeit haben wir die Wirkung der datenschutzerhaltenden Ausbildung von KI-Modellen hinsichtlich Genauigkeit und Fairness im Vergleich zu nicht-privater Ausbildung bewertet. Wir verwendeten zwei Datensätze: (1) Ein großer Datensatz (N = 193,311) von hochqualitativen klinischen Brust-Radiographen und (2) ein Datensatz (N = 1625) von 3D-Abdominal-Computertomographie (CT)-Bildern, mit der Aufgabe, das Vorhandensein von Pankreas-Kanal-Adenokarzinom (PDAC) zu klassifizieren. Beide wurden rückwirkend gesammelt und manuell von erfahrenen Radiologen markiert. Wir verglichen dann nicht-private tief konvolutionale neuronale Netzwerke (CNNs) und datenschutz- (DP)-Modelle in Bezug auf die als Bereich unter der Empfänger-Betriebskennlinie (AUROC) gemessenen Privacy-utility-Trade-offs und Privacy-Fairness-Trade-offs, gemessen als Pearson's r oder Statistical Parity Difference. Wir finden, dass, während die schutzbedürftige Ausbildung weniger Genauigkeit liefert, es weitgehend nicht verstärkt Diskriminierung von Alter, Geschlecht oder Mitmorbidität. Wir finden jedoch einen Hinweis darauf, dass schwierige Diagnosen und Untergruppen stärkere Leistungseingriffe im privaten Training erleiden. Unsere Studie zeigt, dass - unter den herausfordernden realistischen Umständen eines realen klinischen Datensatzes - die schutzbedürftige Ausbildung diagnostischen Tiefenlernmodellen mit ausgezeichneter Diagnosegenauigkeit und Fairness möglich ist. JA 2024 Mar 10.1038/s43856-024-00462-6 Communications medicine Tayebi Arasteh S Kuhl C Makowski M Nebelung S Braren R Rueckert D Truhn D Kaissis G article Brinkmann.2024 BACKGROUND Vulnerability to infectious diseases in refugees is dependent on country of origin, flight routes, and conditions. Information on specific medical needs of different groups of refugees is lacking. We assessed the prevalence of infectious diseases, immunity to vaccine-preventable diseases, and chronic medical conditions in children, adolescents, and adult refugees from Ukraine who arrived in Germany in 2022. METHODS Using different media, we recruited Ukrainian refugees at 13 sites between 9-12/2022. An antigen test for acute respiratory syndrome coronavirus type 2 (SARS-CoV-2) infection, serologies for a range of vaccine-preventable diseases, as well as interferon gamma release assays (IGRAs) for tuberculosis (TB), and SARS-CoV-2 were performed. We assessed personal and family history of chronic medical conditions, infectious diseases, vaccination status, and conditions during migration. RESULTS Overall, 1793 refugees (1401 adults and 392 children/adolescents) were included. Most participants were females (n~=~1307; 72·3%) and from Eastern or Southern Ukraine. TB IGRA was positive in 13% (n~=~184) of the adults and in 2% (n~=~7) of the children. Serology-based immunological response was insufficient in approximately 21% (360/1793) of the participants for measles, 32% (572/1793) for diphtheria, and 74% (1289/1793) for hepatitis B. CONCLUSIONS We show evidence of low serological response to vaccine-preventable infections and increased LTBI prevalence in Ukrainian refugees. These findings should be integrated into guidelines for screening and treatment of infectious diseases in migrants and refugees in Germany and Europe. Furthermore, low immunity for vaccine-preventable diseases in Ukrainians independent of their refugee status, calls for tailor-made communication efforts. JA 2024 10.1016/j.jiph.2024.02.003 Journal of infection and public health 17 642—649 4 Folke Brinkmann Anette Friedrichs Georg MN Behrens Pia Behrens Reinhard Berner Amke Caliebe Claudia M. Denkinger Katharina Giesbrecht Alexander Gussew Anna Theresa Hoffmann Leonhard Hojenski Olga Hovardovska Alexandra Dopfer-Jablonka Achim J. Kaasch Robin Kobbe Monika Kraus Andreas Lindner Christoph Maier Lazar Mitrov Matthias Nauck Susana Nunes Miranda Margarete Scherer Yvonne Schmiedel Dana Stahl Nina Timmesfeld Nicole Toepfner Janne Vehreschild Walter A. Wohlgemuth Astrid Petersmann Maria J. G. T. Vehreschild article BRINKMANN2024 Background Vulnerability to infectious diseases in refugees is dependent on country of origin, flight routes, and conditions. Information on specific medical needs of different groups of refugees is lacking. We assessed the prevalence of infectious diseases, immunity to vaccine-preventable diseases, and chronic medical conditions in children, adolescents, and adult refugees from Ukraine who arrived in Germany in 2022. Methods Using different media, we recruited Ukrainian refugees at 13 sites between 9-12/2022. An antigen test for acute respiratory syndrome coronavirus type 2 (SARS-CoV-2) infection, serologies for a range of vaccine-preventable diseases, as well as interferon gamma release assays (IGRAs) for tuberculosis (TB), and SARS-CoV-2 were performed. We assessed personal and family history of chronic medical conditions, infectious diseases, vaccination status, and conditions during migration. Results Overall, 1,793 refugees (1,401 adults and 392 children/adolescents) were included. Most participants were females (n=1,307; 72·3%) and from Eastern or Southern Ukraine. TB IGRA was positive in 13% (n=184) of the adults and in 2% (n=7) of the children. Serology-based immunological response was insufficient in approximately 21% (360/1793) of the participants for measles, 32% (572/1793) for diphtheria, and 74% (1,289/1,793) for hepatitis B. Conclusions We show evidence of low serological response to vaccine-preventable infections and increased LTBI prevalence in Ukrainian refugees. These findings should be integrated into guidelines for screening and treatment of infectious diseases in migrants and refugees in Germany and Europe. Furthermore, low immunity for vaccine-preventable diseases in Ukrainians independent of their refugee status, calls for tailor-made communication efforts. JA 2024 1876-0341 https://doi.org/10.1016/j.jiph.2024.02.003 Journal of Infection and Public Health Online ahead of print https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1876034124000297 Folke Brinkmann Anette Friedrichs Georg MN Behrens Pia Behrens Reinhard Berner Amke Caliebe Claudia M. Denkinger Katharina Giesbrecht Alexander Gussew Anna Theresa Hoffmann Leonhard Hojenski Olga Hovardovska Alexandra Dopfer-Jablonka Achim J. Kaasch Robin Kobbe Monika Kraus Andreas Lindner Christoph Maier Lazar Mitrov Matthias Nauck Susana Nunes Miranda Margarete Scherer Yvonne Schmiedel Dana Stahl Nina Timmesfeld Nicole Toepfner Janne Vehreschild Walter A. Wohlgemuth Astrid Petersmann Maria J.G.T. Vehreschild article Penzkofer2024_PMID38902564 Industriefokusierte Software Tipps. JA 2024 Dec 10.1007/s00330-024-10867-5 European radiology Penzkofer T article Penzkofer2024_PMID38981893 Industriefokusierte Software Tipps // KI Tipps. JA 2024 Dec 10.1007/s00330-024-10909-y European radiology Penzkofer T article Radke2024-ty 2024 feb en https://doi.org/10.1038/s41593-024-01573-y Nat Neurosci. Online ahead of print NATON Josefine Radke Jenny Meinhardt Tom Aschman Robert Lorenz Chua Vadim Farztdinov Sören Lukassen Foo Wei Ten Ekaterina Friebel Naveed Ishaque Jonas Franz Valerie Helena Huhle Ronja Mothes Kristin Peters Carolina Thomas Shirin Schneeberger Elisa Schumann Leona Kawelke Julia Jünger Viktor Horst Simon Streit Regina Manitius Péter Körtvélyessy Stefan Vielhaber Dirk Reinhold Anja E Hauser Anja Osterloh Philipp Enghard Jana Ihlow Sefer Elezkurtaj David Horst Florian Kurth Marcel A Müller Nils C Gassen Julia Melchert Katharina Jechow Bernd Timmermann Camila Fernandez-Zapata Chotima Böttcher Werner Stenzel Elke Krüger Markus Landthaler Emanuel Wyler Victor Corman Christine Stadelmann Markus Ralser Roland Eils Frank L Heppner Michael Mülleder Christian Conrad Helena Radbruch article Canalini2024_PMID39594149 Objectives: Virtuelle Nichtkontrast (VNC)-Serie rekonstruiert aus kontrastverstärkten Herzinfarkten, die mit Photonenzähler CT (PCD-CT)-Systemen erworben wurden, haben das Potenzial, echte Nichtkontrast (TNC)-Serie zu ersetzen. Es ist jedoch ein quantitativer Vergleich der Bildeigenschaften von TNC- und VNC-Daten erforderlich, um zu bestimmen, inwieweit sie austauschbar sind. Diese Arbeit wertet die Bildähnlichkeit zwischen VNC und TNC-Rekonstruktionen quantitativ aus, indem die Stabilität von Multi-Klassen-Radiomics-Funktionen gemessen wird, die in intra-Patient-TNC- und VNC-Rekonstruktionen extrahiert werden. Methods: TNC und VNC Serie von 84 Patienten wurden rückwirkend gesammelt. Für jeden Patienten wurden das Myokard- und Epikardipos-Gewebe (EAT) in beiden VNC- und TNC-Rekonstruktionen halbautomatisch segmentiert und in jeder Maske 105 Radiomics-Features extrahiert. Intra-feature Korrelationspunkte wurden mit dem Intra-Klasse Korrelationskoeffizienten (ICC) berechnet. Stabile Merkmale wurden mit einem ICC über 0,75 definiert. Results: Im Myokard wurden 41 stabile Features identifiziert, und die drei mit dem höchsten ICC waren gglrlm GrayLevelVariance mit ICC3 von 0.98 [0.97, 0.99], ngtdm Strength mit ICC3 von 0.97 [0.95, 0.98], firstorder Variance mit ICC3 von 0.96 [0.94, 0.98]. Für das epikardiale Fett wurden 40 stabile Eigenschaften gefunden, und die drei höchsten Range sind Firstorder Median mit ICC3 von 0.96 [0.93, 0.97], firstorder RootMeanSquared mit ICC3 von 0.95 [0.92, 0.97], firstorder Mean mit ICC3 von 0.95 [0.92, 0.97]. Insgesamt 24 Merkmale (22,8%; 24/105) zeigten Stabilität in beiden anatomischen Strukturen. Ausschlüsse : Die signifikanten Unterschiede in der Korrelation von Radiomics-Features in VNC- und TNC-Volumen des Myokards und Epicardie-Fetts deuteten darauf hin, dass sich die beiden Rekonstruktionen mehr als ursprünglich angenommen unterscheiden können. Dies deutet darauf hin, dass sie nicht austauschbar sind, und solche Unterschiede könnten klinische Auswirkungen haben. Daher sollte bei der Auswahl von VNC als Ersatz für TNC in der Radiomikroforschung darauf geachtet werden, eine genaue und zuverlässige Analyse zu gewährleisten. Darüber hinaus können die beobachteten Variationen die klinischen Arbeitsabläufe beeinflussen, wo eine präzise Gewebecharakterisierung für die Diagnose- und Behandlungsplanung kritisch ist. JA 2024 Nov 10.3390/diagnostics14222483 Diagnostics (Basel, Switzerland) Canalini L Becker EG Risch F Bette S Hellbrueck S Becker J Rippel K Scheurig-Muenkler C Kroencke T Decker JA article Surov2024_PMID39354441 Eine genaue Vorhersage der kurzfristigen Sterblichkeit im akuten Lungenembolismus (APE) ist sehr wichtig. Ziel der vorliegenden Studie war es, die prognostische Rolle von Radiomikwerten des epikardialen Fettgewebes (EAT) in APE zu analysieren. Insgesamt wurden 508 Patienten in die Studie aufgenommen, 209 weiblich (42.1%), mittleres Alter, 64.7 ± 14.8 Jahre. 4,6% und 12,4% starben (7- bzw. 30-Tage-Sterblichkeit). Zur externen Validierung wurde eine Kohorte von 186 Patienten weiter analysiert. 20,2% bzw. 27,7% starben (7- bzw. 30-Tage-Sterblichkeit). CTPA wurde bei der Zulassung für jeden Patienten vor jeder vorherigen Behandlung auf Multi-Slice CT Scanner durchgeführt. Ein ausgebildeter Radiologe, der den Patientenergebnissen verblendet wurde, segmentierte die EAT auf einem dedizierten Arbeitsplatz mit ImageJ-Software. Die Extraktion von radiomischen Funktionen wurde mit der pyradiomics-Bibliothek angewendet. Nach Korrektur der Korrelation zwischen den Merkmalen und der Feature-Reinigung durch zufälligen Wald und Feature-Ranking, haben wir Feature-Signaturen mit 247 Merkmalen jedes Patienten implementiert. Insgesamt wurden 26 Merkmalskombinationen mit unterschiedlichen Merkmalsklassenkombinationen identifiziert. Patienten wurden zufällig einem Training und einer Validierungskohorte mit einem Verhältnis von 7:3 zugeordnet. Wir charakterisierten zwei Modelle (30-Tag und 7-Tage-Sterblichkeit). Die Modelle enthalten eine Kombination aus 13 Merkmalen von sieben verschiedenen Bildmerkmalklassen. Wir haben die charakterisierten Modelle auf eine Validierungskohorte (n = 169) montiert, um die Genauigkeit unserer Modelle zu testen. Wir beobachteten einen AUC von 0.776 (CI 0.671-0.881) und einen AUC von 0.724 (CI 0.628-0.820) zur Vorhersage von 30-tägiger Sterblichkeit bzw. 7-tägiger Sterblichkeit. Der Gesamtprozentsatz der korrekten Vorhersage betrug dabei 88% und 79% der Validierungskohorten. Schließlich betrug der AUC in einem unabhängigen externen Validierungskohort 0,721 (CI 0.633-0.808) bzw. 0.750 (CI 0.657-0.842). Radiomics-Parameter von EAT sind stark mit Mortalität bei Patienten mit APE verbunden. Nicht anwendbar. JA 2024 Oct 10.1186/s12931-024-02977-x Respiratory research Zimmermann S Hinnerichs M Meyer HJ Borggrefe J article Steeg2024_PMID39640939 Gesichtserkennungssoftware (FRS) wurde historisch als Mangel an der Fähigkeit empfunden, Personen aus medizinischen Querschnittsbildern zu identifizieren. Die Verwendung solcher Daten zu Identifizierungszwecken wurde aufgrund der erheblichen Rechenleistung und der speziellen technischen Expertise, die sie benötigen, als unlösbar angesehen. Die jüngsten Fortschritte in der auf künstlicher Intelligenz basierenden (AI-basierten) Software und Open-Source-Tools haben diese Anwendungen jedoch weit verbreitet und einfach zu bedienen und neue Datenschutzbedenken zu erhöhen. Dieses Konzept wurde als Querschnittsstudie konzipiert und umfasste Teilnehmer mit einer verifizierten Online-Präsenz. An diesen Teilnehmern wurden Standard-Magnetresonanztomographie (MRI)-Kopfscans durchgeführt, aus denen mittels freier und öffentlich verfügbarer Software dreidimensionale Rendering-Bilder (3DR) erstellt wurden. Diese Bilder wurden für Gesichtssuche durch kostenlose und öffentlich verfügbare FRS verwendet. Auf die 3DR-Bilder wurden unterschiedliche Kopforientierungen und Frisuren angewendet, um zu beurteilen, ob die FRS-Ergebnisse nicht-gesichtsmäßig beeinflusst wurden. Alle Ergebnisse wurden zwischen dem 10. Februar 2024 und dem 1. März 2024 erzielt. Gesichtssuche von 3DR-Bildern in einer Datenbank mit mehr als 800 Millionen Bildern aus dem World Wide Web (WWW) ergaben richtige Spiele für 50% der Teilnehmer in weniger als 10 min. Die benutzerfreundliche Software benötigt minimale Rechenkenntnisse oder Ressourcen, so dass dieser Prozess weit zugänglich ist. Modifizierende Elemente wie Frisuren oder die Orientierung des 3DR, um tatsächliche Fotografien der Teilnehmer besser ähneln, verbesserte FRS-Spiele. Aktuelle bestehende FRS können Personen aus MRI-Kopf-Scans schnell und genau identifizieren. Dies stellt ein erhebliches Datenschutzrisiko für Teilnehmer an eingeschriebenen klinischen Studien dar und unterstreicht den dringenden Bedarf an verbesserten Datenschutzmaßnahmen und erhöhter Sensitivität, um die Vertraulichkeit der Teilnehmer zu gewährleisten. Für diese Studie gab es keine Finanzierungsquelle. JA 2024 Dec 10.1016/j.eclinm.2024.102930 EClinicalMedicine Steeg K Bohrer E Schäfer SB Vu VD Scherberich J Krombach GA article misailovski_refining_2024 Purpose Until now, the Hospitalization Rate (HR) served as an indicator (among others) for the COVID-19 associated healthcare burden. To ensure that the HR accomplishes its full potential, hospitalizations caused by COVID-19 (primary cases) and hospitalizations of patients with incidental positive SARS-CoV-2 test results (incidental cases) must be differentiated. The aim of this study was to synthesize the existing evidence on differentiation criteria between hospitalizations of primary cases and incidental cases. Methods An online survey of the members of the German Network University Medicine (NUM) was conducted. Additionally, senior clinicians with expertise in COVID-19 care were invited for qualitative, semi-structured interviews. Furthermore, a rapid literature review was undertaken on publications between 03/2020 and 12/2022. Results In the online survey (n=30, response rate 56%), pneumonia and acute upper respiratory tract infections were the most indicative diagnoses for a primary case. In contrast, malignant neoplasms and acute myocardial infarctions were most likely to be associated with incidental cases. According to the experts (n=6), the diagnosis, ward, and type of admission (emergency or elective), low oxygen saturation, need for supplemental oxygen, and initiation of COVID-19 therapy point to a primary case. The literature review found that respiratory syndromes and symptoms, oxygen support, and elevated levels of inflammatory markers were associated with primary cases. Conclusion There are parameters for the differentiation of primary from incidental cases to improve the objective of the HR. Ultimately, an updated HR has the potential to serve as a more accurate indicator of the COVID-19 associated healthcare burden. 2024 sep 2590-0889 10.1016/j.infpip.2024.100371 Infection Prevention in Practice 6 100371 3 COVID-19, Hospitalization rate, Incidental SARS-CoV-2 https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2590088924000350 M. Misailovski D. Koller S. Blaschke M. Berens A. M. Köster R. Strobl R. Berner P. Boor M. Eisenmann S. Stillfried D. Krefting M. Krone J. Liese P. Meybohm G. Ulrich- Merzenich S. Zenker S. Scheithauer E. Grill article Zhang.2024 BA.2.86, a recently identified descendant of the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) Omicron BA.2 sublineage, contains $\sim$35 mutations in the spike (S)~protein and spreads in multiple countries. Here, we investigated whether the virus exhibits altered biological traits, focusing on S protein-driven viral entry. Employing pseudotyped particles, we show that BA.2.86, unlike other Omicron sublineages, enters Calu-3 lung cells with high efficiency and in a serine- but not cysteine-protease-dependent manner. Robust lung cell infection was confirmed with authentic BA.2.86, but the virus exhibited low specific infectivity. Further, BA.2.86 was highly resistant against all therapeutic antibodies tested, efficiently evading neutralization by antibodies induced by non-adapted vaccines. In contrast, BA.2.86 and the currently circulating EG.5.1 sublineage were appreciably neutralized by antibodies induced by the XBB.1.5-adapted vaccine. Collectively, BA.2.86 has regained a trait characteristic of early SARS-CoV-2 lineages, robust lung cell entry, and evades neutralizing antibodies. However, BA.2.86 exhibits low specific infectivity, which might limit transmissibility. JA 2024 10.1016/j.cell.2023.12.025 Cell Lu Zhang Amy Kempf Inga Nehlmeier Anne Cossmann Anja Richter Najat Bdeir Luise Graichen Anna-Sophie Moldenhauer Alexandra Dopfer-Jablonka Metodi V. Stankov Etienne Simon-Loriere Sebastian R. Schulz Hans-Martin Jäck Luka Cičin-Šain Georg M. N. Behrens Christian Drosten Markus Hoffmann Stefan Pöhlmann article mohme_sars-cov-2-associated_2024 In COVID-19 patients, neurological symptoms and complications are increasingly recognised, but their underlying causes remain poorly understood. This study found that SARS-CoV-2-associated T cells we... JA 2024 jan en 2050-0068 10.1002/cti2.1487 Clinical & Translational Immunology 13 e1487 2 https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/cti2.1487 Publisher: John Wiley & Sons, Ltd Malte Mohme Christoph Schultheiß Andras Piffko Antonia Fitzek Lisa Paschold Benjamin Thiele Klaus Püschel Markus Glatzel Manfred Westphal Katrin Lamszus Jakob Matschke Mascha Binder article Gehrmann2024_PMID39257886 Das Cancer of Unknown Primary (CUP)-Syndrom zeichnet sich durch identifizierbare Metastasen aus, während der primäre Tumor verborgen bleibt. In den letzten Jahren wurden verschiedene datengesteuerte Ansätze vorgeschlagen, um den Standort des primären Tumors (LOP) bei CUP-Patienten vorherzusagen, die eine verbesserte Diagnose und ein Ergebnis versprechen. Diese LOP-Prädiktionsansätze verwenden hochdimensionale Eingabedaten wie Bilder oder genetische Daten. Die Verwendung solcher Daten ist jedoch herausfordernd, ressourcenintensiv und damit eine mögliche Translationsbarriere. Anstatt hochdimensionale Daten zu verwenden, analysierten wir die LOP-Prädiktionsleistung niedrigdimensionaler Daten aus der Routinemedizin. Mit unseren Erkenntnissen zeigen wir, dass solche niedrigdimensionalen klinischen Informationen als Eingabedaten für baumbasierte LOP-Prädiktionsmodelle genügen. Das beste Modell erreichte eine mittlere Genauigkeit von 94% und eine mittlere Matthews Korrelationskoeffizient (MCC) Punktzahl von 0,92 in 10-facher geschachtelter Kreuzvalidierung (NCV) bei der Unterscheidung von vier Krebsarten. Bei der Betrachtung von acht Krebsarten erreichte dieses Modell eine mittlere Genauigkeit von 85% und eine mittlere MCC-Score von 0,81. Dies ist vergleichbar mit der Leistung, die durch Ansätze mit hochdimensionalen Eingangsdaten erreicht wird. Darüber hinaus scheint das Verteilungsmuster von Metastasen wichtige Informationen bei der Vorhersage der LOP zu sein. JA 2024 August 10.3389/fmed.2024.1396459 Frontiers in medicine Gehrmann J Soenarto DJ Hidayat K Beyer M Quakulinski L Alkarkoukly S Berressem S Butler M Lennartz S Persigehl T Zander T Beyan O article Thiam2024_PMID38459104 Die erfolgreiche Integration von neuronalen Netzwerken in eine klinische Umgebung ist trotz großer Erfolge, die durch künstliche Intelligenz in anderen Bereichen erzielt werden, noch unüblich. Dies ist vor allem auf die schwarze Box-Charakteristik der optimierten Modelle und die unbestimmte Verallgemeinerungsfähigkeit der geschulten Architekturen zurückzuführen. Die aktuelle Arbeit befasst sich mit beiden Problemen im Bereich der Radiologie, indem sie sich auf die Entwicklung einer effektiven und interpretierbaren Kardiomegalie-Detektionsarchitektur basierend auf Segmentierungsmodellen konzentriert. Die Architektur besteht aus zwei unterschiedlichen neuronalen Netzwerken, die die Segmentierung sowohl von kardialen als auch von thorakalen Gebieten eines Radiographen durchführen. Die jeweiligen Segmentierungsausgänge werden anschließend zur Schätzung des Kardiothorakalverhältnisses verwendet und das entsprechende Röntgenbild wird als Kardiomegalie basierend auf einer vorgegebenen Schwelle eingestuft. Durch die Knappheit von pixel-level-markierten Brust-Radiographen werden beide Segmentierungsmodelle halbüberwacht optimiert. Dies führt zu einer erheblichen Reduzierung der Kosten für die manuelle Anmerkung. Die resultierenden Segmentierungsausgänge verbessern die Interpretationsfähigkeit der endgültigen Klassifizierungsergebnisse der Architektur deutlich. Die Verallgemeinerungsfähigkeit der Architektur wird in einer Kreuzdomäneneinstellung beurteilt. Die Bewertung zeigt die Wirksamkeit der semi-supervisierten Optimierung der Segmentierungsmodelle und die Robustheit der anschließenden Klassifizierungsarchitektur. JA 2024 Mar 10.1038/s41598-024-56079-1 Scientific reports Thiam P Kloth C Blaich D Beer M Kestler HA article Erley2024_PMID38819515 Zur Bestimmung des Einflusses der arteriellen Hypertonie (AHT), des Geschlechts und der Wechselwirkung zwischen links- und rechtsventrikulärer (LV, RV) Morphologie, Funktion und Gewebeeigenschaften. Die Hamburg City Health Study (HCHS) ist eine bevölkerungsbasierte, prospektive, monozentrische Studie. 1972 Individuen ohne eine Geschichte von Herzerkrankungen / Interventionen wurden 3 T Herz-MR-Bildgebung (CMR). Allgemeine lineare Modelle wurden durchgeführt, einschließlich AHT, Sex (und die Interaktion wenn signifikant), Alter, Körpermasse Index, Geburtsort, Diabetes mellitus, Rauchen, Hyperlipoproteinämie, Atrialfibrillation, und Medikamente. Von 1972 Fächern litten 68% unter AHT. 42% mit AHT und 49% Kontrollen waren weiblich. Frauen zeigten insgesamt eine höhere Ejektionsfraktion (EF) (LV: Regressionskoeffizient +2,4% [95% Vertrauensintervall: 1,7; 3,1]), geringere Volumina und LV-Masse (-19,8% [-21.3; -18,5]) und verlängerte native Septum T1 (+22.1 ms [18,3; 25,9])/T2-Relaxationszeiten (+1.1 ms [0,9; 1,31)]) (alle männlichen p Themen mit AHT zeigten eine höhere EF (LV: +1,2% [0.3; 2.0], p = 0,009) und LV-Masse (+6,6% [4,3; 9,0], p < 0,001) als Kontrollen. Die Interaktion zwischen Sex und AHT beeinflusste das Mapping. Nach Ausschluss von Segmenten mit LGE zeigten Männchen (-0.7 ms [-1.0; -0.3 |) und Weibchen mit AHT (-1.1 ms [-1.6; -0.6]) kürzere T2 Relaxationszeiten als die sex-respektiven Kontrollen (p < 0,001), die Wirkung war jedoch bei Frauen stärker. In den HCHS zeigten weibliche und männliche Subjekte mit AHT ebenfalls eine höhere EF- und LV-Masse als Kontrollen, unabhängig von Sex. Unterschiede in den Gewebeeigenschaften zwischen Subjekten mit AHT und Kontrollen schienen jedoch sexspezifisch zu sein. Die Wechselwirkung zwischen Sex und Herzrisikofaktoren ist ein unterschätzter Faktor, der beim Vergleich von Gewebeeigenschaften zwischen hypertensiven Subjekten und Kontrollen und bei der Festlegung von Cutoff-Werten für normale und pathologische Relaxationszeiten berücksichtigt werden sollte. Es gibt sexabhängige Unterschiede in der arteriellen Hypertonie, aber es ist unklar, ob kardiale MR-Parameter sexspezifisch sind. Unterschiede bei Herz-MR-Parametern zwischen hypertensiven Subjekten und gesunden Kontrollen schienen sex-spezifisch für Gewebeeigenschaften zu sein. Sex muss beim Vergleich von Gewebeeigenschaften bei Patienten mit arterieller Hypertonie mit gesunden Kontrollen berücksichtigt werden. JA 2024 Nov 10.1007/s00330-024-10797-2 European radiology Erley J Jahnke CM Schüttler S Molwitz I Chen H Meyer M Muellerleile K Cavus E Lund GK Blankenberg S Adam G Tahir E article Shahzadi2024_PMID38859660 Akute Lungenembolie (APE) ist eine potentiell lebensbedrohliche Erkrankung, die die Bedeutung einer genauen Risikoschichtung und Überlebensprognose betont. Die Erforschung von bildgebenden Biomarkern, die das Überleben des Patienten widerspiegeln können, bietet das Potenzial, die Schichtung von APE-Patienten weiter zu verbessern und eine personalisierte Behandlung und frühzeitige Intervention zu ermöglichen. Daher entwickeln wir in dieser Studie rechnerische Tomographie-Pulmonal-Angiographie (CTPA) radiomische Signaturen für die Prognose von 7- und 30-Tage-All-Cause Mortalität bei Patienten mit APE. Diagnostische CTPA-Bilder von 829 Patienten mit APE wurden gesammelt. Zweihundert vierunddreißig Merkmale aus jedem Skelettmuskel (SM), intramuskuläres Fettgewebe (IMAT) und beide Gewebe kombiniert (SM + IMAT) wurden auf der Höhe des Brustwirbels 12 berechnet. Radiomische Signaturen wurden mit 10 mal wiederholter dreifacher Kreuzvalidierung auf den Trainingsdaten für SM, IMAT und SM + IMAT zur Vorhersage von 7- und 30-tägiger Mortalität abgeleitet. Die Leistung der radiomischen Signaturen wurde dann auf ausgehaltenen Testdaten bewertet und mit dem vereinfachten Pulmon-Embolismus-Senverity-Index (sPESI)-Score, einem etablierten Biomarker zur Risikoschichtung in APE, verglichen. Prädiktive Genauigkeit wurde durch den Bereich unter der Empfänger-Betriebskennlinie (AUC) mit einem 95 %-Konfidenzintervall (CI), Empfindlichkeit und Spezifität beurteilt. Die radiomischen Signaturen auf Basis von IMAT und einer Kombination von SM und IMAT (SM + IMAT) erzielten eine moderate Performance für die Vorhersage von 30-tägiger Mortalität auf Testdaten (IMAT: AUC = 0.68, 95% CI [0.57-0.78], Sensitivität = 0.57, Spezifität = 0.73; SM + IMAT: AUC = 0.70, 95% CI [0.60-0.79], Empfindlichkeit = 0.74, Spezifität = 0.74, Spezifität Radiomische Signaturen, die für die Vorhersage der 7-Tage-Gesamtsterblichkeit entwickelt wurden, zeigten eine insgesamt niedrige Leistung. Die klinische Signatur, d.h. sPESI, erreichte im Vergleich zu den radiomischen Signaturen für die Prädiktion von sowohl 7- als auch 30-tägiger Mortalität auf den Testdaten eine etwas bessere Leistung (7 Tage: AUC = 0,73, 95% CI [0.67-0.79], Sensitivität = 0.92, Spezifität = 0.16; 30 Tage: AUC = 0.74, 95% CI [0.66-06). Wir entwickelten und testeten radiomische Signaturen zur Vorhersage von 7- und 30-Tage-All-Cause-Sterblichkeit in APE mit einem multizentrischen retrospektiven Datensatz. Die gegenwärtige Multizentre-Arbeit zeigt, dass aus SM und IMAT gewonnene Radiomik-Parameter bei Patienten mit APE 30-Tage-All-Cause-Sterblichkeit vorhersagen können. JA 2024 Aug 10.1002/jcsm.13488 Journal of cachexia, sarcopenia and muscle Shahzadi I Frohwein LJ Schramm D Meyer HJ Hinnerichs M Moenninghoff C Niehoff JH Kroeger JR Borggrefe J article Steuwe2024_PMID38534481 CT-Protokolle, die COVID-19 diagnostizieren, variieren hinsichtlich der zugehörigen Strahlungsbelichtung und der gewünschten Bildqualität (IQ). Diese Studie zielt darauf ab, CT-Protokolle von Krankenhäusern, die am RACOON (Radiological Cooperative Network)-Projekt teilnehmen, zu bewerten und CT-Protokolle zu konsolidieren, um Empfehlungen und Strategien für künftige Pandemie bereitzustellen. In dieser retrospektiven Studie wurden CT-Erwerbe von COVID-19-Patienten, die zwischen März 2020 und Oktober 2020 (RACOON Phase 1) gescannt wurden, aufgenommen und alle nicht kontrastreichen Protokolle ausgewertet. Zu diesem Zweck wurden CT-Protokollparameter, IQ-Ratings, Strahlenexposition (CTDI_{>sub>/sub>) und zentrale Patientendurchmesser abgetastet. Schließlich wurden die Daten aus 14 Standorten und 534 CT Akquisitionen analysiert. IQ wurde für 81 % der bewerteten Untersuchungen gut bewertet. Bewegungs-, Strahlenhärtende Artefakte oder Bildgeräusche waren Gründe für einen suboptimalen IQ. Das Rohrpotenzial reichte zwischen 80 und 140 kVp, mit der Mehrheit zwischen 100 und 120 kVp>/sub>. CTDIvol betrug 3.7 ± 3.4 mGy. Die meisten im Lieferumfang enthaltenen Gesundheitseinrichtungen hatten kein spezifisches nicht kontrastreiches CT-Protokoll. Darüber hinaus variierten CT-Protokolle für die Brustbildgebung in ihren Einstellungen und Strahlungsexposition. In Zukunft werden Empfehlungen zu den erforderlichen IQ- und Protokollparametern für die Mehrzahl der CT-Scanner erforderlich sein, um vergleichbare IQ- sowie Strahlenexposition für verschiedene Standorte, aber identische Diagnosefragen zu ermöglichen.} JA 2024 Feb 10.3390/bioengineering11030207 Bioengineering (Basel, Switzerland) Kamp B Afat S Aludin S Bas EG Berger J Bohrer E Büttner SM Ehrengut C Gerwing M Grosu S Güttler F Jiraskova P Kloth C Kottlors J Kuennemann MD Liska C Lubina N Manzke M Meinel FG Meyer HJ Persigehl T Schmill LP Steinhardt M Antoch G Valentin B article JA 2024 Poster, ESHG 2024 Berlin Bettina Lorenz-Depiereux T Bahmer S Ciesek Michael Mülleder Stefanie Mücke Bärbel Fösel V Kopfnagel Christoph Dolch Matthias Nauck Soni Pullamsetti Mario Looso Markus Ralser Christian Schäfer Mario Schattschneider Stefan Schreiber Janne Vehreschild Christian Gieger Martin Witzenrath U Völker G. Anton T. Illig article JA 2024 Präsentation, State of the art speaker T12 – Bioinformatics and –omics and Big data, EBW 2024 Wien Bettina Lorenz-Depiereux T Bahmer S Ciesek Michael Mülleder Stefanie Mücke Bärbel Fösel V Kopfnagel Christoph Dolch S Kunze Matthias Nauck Soni Pullamsetti Markus Ralser Christian Schäfer Mario Schattschneider Stefan Schreiber Jörg Janne Vehreschild Martin Witzenrath U Völker T. Illig G. Anton On Behalf Of The Napkon Study Group NUKLEUS Study Group Mario Looso Christian Gieger article JA 2024 Präsentation, State of the art speaker T12 – Bioinformatics and –omics and Big data, EBW 2024 Wien Bettina Lorenz-Depiereux Thomas Bahmer Sandra Ciesek Michael Mülleder Stefanie Mücke Bärbel Fösel V Kopfnagel Christoph Dolch S Kunze Matthias Nauck Soni Pullamsetti Mario Looso Markus Ralser Christian Schäfer Mario Schattschneider S Schreiber Jörg Janne Vehreschild Christian Gieger Martin Witzenrath U Völker T. Illig G. Anton On Behalf Of The Napkon Study Group article meinhardt_neurobiology_2024 Worldwide, over 694 million people have been infected with SARS-CoV-2, with an estimated 55–60% of those infected developing COVID-19. Since the beginning of the pandemic in December 2019, different variants of concern have appeared and continue to occur. With the emergence of different variants, an increasing rate of vaccination and previous infections, the acute neurological symptomatology of COVID-19 changed. Moreover, 10–45% of individuals with a history of SARS-CoV-2 infection experience symptoms even 3 months after disease onset, a condition that has been defined as ‘post-COVID-19’ by the World Health Organization and that occurs independently of the virus variant. The pathomechanisms of COVID-19-related neurological complaints have become clearer during the past 3 years. To date, there is no overt — that is, truly convincing — evidence for SARS-CoV-2 particles in the brain. In this Review, we put special emphasis on discussing the  methodological difficulties of viral detection in CNS tissue and discuss immune-based (systemic and central) effects contributing to COVID-19-related CNS affection. We sequentially review the reported changes to CNS cells in COVID-19, starting with the blood–brain barrier and blood–cerebrospinal fluid barrier — as systemic factors from the periphery appear to primarily influence barriers and conduits — before we describe changes in brain parenchymal cells, including microglia, astrocytes, neurons and oligodendrocytes as well as cerebral lymphocytes. These findings are critical to understanding CNS affection in acute COVID-19 and post-COVID-19 in order to translate these findings into treatment options, which are still very limited. JA 2024 jan en 1471-0048 10.1038/s41583-023-00769-8 Nature Reviews Neuroscience 25 30—42 1 Immunology, Neuroscience https://www.nature.com/articles/s41583-023-00769-8 Publisher: Nature Publishing Group Jenny Meinhardt Simon Streit Carsten Dittmayer Regina v Manitius Helena Radbruch Frank L. Heppner article Kottlors2024_PMID38479409 Aufgrund der steigenden Anzahl an COVID-19-Infektionen seit Frühjahr 2020 hat sich der Patient-Pflege-Workflow in Deutschland verändert. Zur Minimierung der Gesichtsbelichtung und zur Verringerung des Infektionsrisikos wurden nicht zeitkritische elektive medizinische Verfahren verschoben. Da Ultraschalluntersuchungen nicht zeitkritische Wahlprüfungen umfassen und oft durch andere bildgebende Modalitäten ersetzt werden können, die keinen direkten Patientenkontakt erfordern, ist die Anzahl der Untersuchungen deutlich zurückgegangen. Ziel dieser Studie ist es, die Basiszahl der Ultraschalluntersuchungen in den Jahren vor, während und in der frühen post-pandemischen Periode der COVID-19 Pandemie (seit Januar 2015 bis September 2023) zu quantifizieren und die Anzahl der Untersuchungen an verschiedenen deutschen Universitätskliniken zu messen. Die Anzahl der Untersuchungen wurde anhand einer webbasierten Datenbank an allen teilnehmenden Kliniken zu den angegebenen Zeitpunkten bewertet. N = 288 562 Sonographische Untersuchungen von vier Standorten wurden in die vorliegende Untersuchung einbezogen. Von Januar 2020 bis Juni 2020 wurde eine deutlich niedrigere Anzahl von Untersuchungen von n = 591.21 vs. 698.43 (p = 0,01) pro Monat und inkl. Zentrum durchgeführt. Auch ohne die anfängliche Pandemie bis Juni 2020 wurden deutlich weniger Ultraschalluntersuchungen im Vergleich zu den Vor-Paridem-Jahren 648.1 vs. 698.4 (p < 0,05), pro Monat und inklusive Zentrum durchgeführt, wobei hier Unterschiede zwischen den einzelnen Zentren beobachtet wurden. In der späten Phase der Pandemie (n = 681.96) und in der post-pandemischen Phase (wie durch die WHO-Kriterien vom Mai 2023 definiert; n = 739.95) kehrte die Anzahl der sonographischen Untersuchungen auf die vor-pandemische Ebene zurück. Der Rückgang der durch die COVID-19 Pandemie verursachten sonographischen Untersuchungen war zunächst weitgehend absichtlich und kann quantitativ dargestellt werden. Nach einem anfänglichen abrupten Rückgang der sonographischen Untersuchungen konnte die Vor-Parademie für eine lange Zeit nicht erreicht werden, was auf eine Umstrukturierung der Patientenversorgung und Nachbehandlung zurückzuführen sein könnte. In der post-pandemischen Phase wurde die Vor-pandemik wieder erreicht. Die Gründe für eine längere Reduzierung der Ultraschalluntersuchungen werden in diesem Artikel diskutiert. · Während der Pandemie wurden deutlich weniger Ultraschalluntersuchungen in den eingeschlossenen Zentren durchgeführt.. · Die Anzahl der Untersuchungen konnte für eine lange Zeit nicht auf die Vor-Parade-Ebene erreicht werden, was auf eine Umstrukturierung der Patientenversorgung und Nachbehandlung zurückzuführen sein könnte. · Die Identifizierung der Ursachen für die sonographische Prüfungsreduktion ist entscheidend für die pandemische Bereitschaft, die Qualität und Kontinuität der Gesundheitsversorgung für alle Patienten zu gewährleisten. · Der lang anhaltende Rückgang der sonographischen Untersuchungen während der Pandemie stellt keinen dauerhaften Trend dar, wie sich die Rückkehr zu vor-pandemischen Ebenen bemerkbar macht. · Kottlors J, Fervers P, Froelich M et al. Die weltweite COVID-19 Pandemie verursachte einen Rückgang der sonographischen Untersuchungen - ist das ein anhaltender Trend?. Fürtschr Röntgenstr 2024; 196: 1246 - 1252. JA 2024 Dec 10.1055/a-2263-1632 RoFo : Fortschritte auf dem Gebiete der Rontgenstrahlen und der Nuklearmedizin Kottlors J Fervers P Froelich MF Grunz JP Booz C Maintz D Heneweer C Persigehl T Große Hokamp N article Peng2024_PMID38354027 Multisite klinische Studien verwenden zunehmend Echtzeit-Daten, um reale Beweise zu gewinnen. Aufgrund der Heterogenität von Quelldaten ist es jedoch schwierig, solche Daten in einheitlicher Weise über Kliniken zu analysieren. Daher ist die Implementierung von Extract-Transform-Load (ETL) oder Extract-Load-Transform (ELT) Prozessen zur Harmonisierung lokaler Gesundheitsdaten erforderlich, um die Datenqualität für die Forschung zu gewährleisten. Die Entwicklung solcher Prozesse ist jedoch zeitaufwendig und unbrauchbar. Eine vielversprechende Möglichkeit, dies zu erleichtern, ist die Verallgemeinerung von ETL/ELT-Prozessen. In dieser Arbeit untersuchen wir bestehende Möglichkeiten zur Entwicklung von generischen ETL/ELT-Prozessen. Insbesondere konzentrieren wir uns auf Ansätze mit geringer Entwicklungskomplexität, indem wir beschreibende Metadaten und strukturelle Metadaten verwenden. Nach den Richtlinien PRISMA (Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses) haben wir eine Literaturrezension durchgeführt. Wir haben 4 Publikationsdatenbanken (d.h. PubMed, IEEE Explore, Web of Science und Biomed Center) verwendet, um relevante Publikationen von 2012 bis 2022 zu suchen. Der PRISMA-Flow wurde dann mittels eines R-basierten Tools (Evidence Synthesis Hackathon) visualisiert. Alle relevanten Inhalte der Publikationen wurden zur weiteren Analyse und Visualisierung in ein Tabellenblatt extrahiert. In Bezug auf die PRISMA-Leitlinien haben wir 33 Publikationen in dieser Literaturrezension aufgenommen. Alle Publikationen wurden in 7 verschiedene Fokusgruppen (d.h. Medizin, Datenlager, Big Data, Industrie, Geoinformatik, Archäologie und Militär) eingeteilt. Basierend auf den extrahierten Daten waren die ontologischen und regelbasierten Ansätze die 2 am häufigsten verwendeten Ansätze in verschiedenen thematischen Kategorien. In den Anwendungsfällen wurden verschiedene Ansätze und Werkzeuge gewählt, um unterschiedliche Zwecke zu erreichen. Unsere Literaturrecherche zeigt, dass die Verwendung von metadata-getriebenen (MDD) Ansätzen zur Entwicklung eines ETL/ELT-Prozesses in verschiedenen thematischen Kategorien unterschiedliche Zwecke erfüllen kann. Die Ergebnisse zeigen, dass es vielversprechend ist, einen ETL/ELT-Prozess zu implementieren, indem MDD-Ansatz angewendet wird, um die Datentransformation von Fast Healthcare Interoperability Resources zu Observational Medical Outcomes Partnership Common Data Model zu automatisieren. Die Bestimmung eines geeigneten MDD-Ansatzes und eines geeigneten Werkzeugs zur Umsetzung eines solchen ETL/ELT-Prozesses bleibt jedoch eine Herausforderung. Dies liegt an der mangelnden umfassenden Einsicht in die Charakterisierungen der in dieser Studie vorgestellten MDD-Ansätze. Unser nächster Schritt ist es daher, die in dieser Studie vorgestellten MDD-Ansätze zu bewerten und die am besten geeigneten MDD-Ansätze zu ermitteln und in den ETL/ELT-Prozess zu integrieren. Dies könnte die Fähigkeit der Verwendung von MDD-Ansätzen zur Verallgemeinerung des ETL-Prozesses zur Harmonisierung medizinischer Daten überprüfen. JA 2024 Feb 10.2196/52967 JMIR medical informatics Peng Y Bathelt F Gebler R Gött R Henke E Kadioglu D Lorenz S Sedlmayr M article Starck2024_PMID39562746 Zuverlässige Referenzdaten in der medizinischen Bildgebung sind weitgehend nicht verfügbar. Die Entwicklung von Werkzeugen, die den Vergleich einzelner Patientendaten mit Referenzdaten ermöglichen, hat ein hohes Potenzial, die Diagnoseabbildung zu verbessern. Bevölkerungsatlasen sind ein häufig verwendetes Werkzeug in der medizinischen Bildgebung, um dies zu erleichtern. Bei der Arbeit mit hoch heterogenen Datensätzen, wie Ganzkörperbildern, die signifikante anatomische Variationen aufweisen, wird der Aufbau solcher Atlas besonders schwierig. In dieser Arbeit schlagen wir eine Pipeline zur Erzeugung eines standardisierten Ganzkörperatlas für eine hoch heterogene Bevölkerung vor, indem wir die Bevölkerung in anatomisch sinnvolle Untergruppen unterteilen. Mit Magnetresonanzbildern aus dem UK Biobank-Datensatz schaffen wir sechs Ganzkörperatlasen, die einen gesunden Bevölkerungsdurchschnitt darstellen. Wir beunruhigen sie auch, und so erhalten wir eine realistische Darstellung der Bevölkerung. Neben den anatomischen Atlasen erzeugen wir probabilistische Atlasen, die die Verteilungen von Bauchfett (visceral und subkutan) und fünf Bauchorgane über die Bevölkerung (Liber, Milz, Pankreas, linke und rechte Nieren) erfassen. Unsere Pipeline erzeugt effektiv hochwertige, realistische Ganzkörperatlasen mit klinischer Anwendbarkeit. Die probabilistischen Atlasen zeigen Unterschiede in der Fettverteilung zwischen Probanden mit medizinischen Bedingungen wie Diabetes und Herz-Kreislauf-Erkrankungen und gesunden Probanden im Atlasraum. Mit dieser Arbeit stellen wir die konstruierten anatomischen und Label Atlas öffentlich zur Verfügung, mit der Erwartung, dass sie die medizinische Forschung mit Ganzkörper-MR-Bildern unterstützen werden. JA 2024 Nov 10.1038/s43856-024-00670-0 Communications medicine Starck S Sideri-Lampretsa V Ritter JJM Zimmer VA Braren R Mueller TT Rueckert D article Bucher2024_PMID38926263 Die standardisierte Berichterstattung der multiparametrischen Prostata MRI (mpMRI) ist weit verbreitet und folgt internationalen Standards (Pi-RADS). Allerdings sind quantitative Messungen von mpMRI nicht weit vergleichbar. Obwohl T2 Mapping-Sequenzen wiederholbare quantitative Bildmessungen liefern und zuverlässige bildgebende Biomarker aus mpMRI extrahieren können, sind sie oft zeitaufwendig. Wir untersuchten daher den Wert quantitativer Messungen auf einer hoch beschleunigten T2-Mapping-Sequenz, um eine Schwelle zu schaffen, um Gutign von malignen Läsionen zu unterscheiden. Dazu haben wir eine neuartige, hoch beschleunigte T2-Mapping-Forschungssequenz ausgewertet, die eine hochauflösende Bildaufnahme mit kurzen Akquisitionszeiten in der klinischen Praxis ermöglicht. In dieser retrospektiven Einzelzentrumsstudie umfassten wir 54 Patienten mit klinisch angedeutetem MRT des Prostata- und Biopsie bestätigten Karzinoms (n = 37) oder Ausschluss von Karzinom (n = 17). Alle Patienten hatten einen Standard der Pflegebiopsie der Prostata erhalten, deren Ergebnisse verwendet wurden, um die Anwesenheit von malignen Läsionen zu bestätigen oder auszuschließen. Wir nutzten die linearen Mischeffekte Modell-fit von REML, um die Differenz zwischen Mittelwerten von Krebsgewebe und gesundem Gewebe zu bestimmen. Wir fanden eine gute Differenzierung zwischen malignen Läsionen und normal auftretendem Gewebe in der peripheren Zone basierend auf dem mittleren T2-Wert. Insbesondere betrug der mittlere T2-Wert für Gewebe ohne maligne Läsionen (151,7 ms [95% CI: 146,9-156,5 ms] im Vergleich zu 80,9 ms für maligne Läsionen [95% CI: 67.9-79,1 ms]; p < 0,001). Auf der Grundlage dieser Bewertung wird eine Grenze von 109,2 ms vorgeschlagen. Zwar wurde eine signifikante Korrelation zwischen T2 -Werten der Peripheriezone und PI-RADS-Scores beobachtet (p = 0,0194). Es wurde jedoch keine Korrelation zwischen dem Gleason Score und der T2 Relaxationszeit gefunden. Mit REML fanden wir einen Unterschied von -82,7 ms bei Mittelwerten zwischen Krebsgewebe und gesundem Gewebe. Wir haben einen Cut-off-Wert von 109,2 ms ermittelt, um genau zwischen malignen und nicht malignen Prostataregionen zu unterscheiden. Die Hinzufügung von T2 Mapping-Sequenzen zur Routineabbildung könnte eine automatisierte Läsionserkennung und eine kontrastfreie multiparametrische MRT der Prostata ermöglichen. JA 2024 Dec 10.1007/s10278-024-01150-6 Journal of imaging informatics in medicine Egger J Dietz J Strecker R Hilbert T Frodl E Wenzel M Penzkofer T Hamm B Chun FK Vogl T Kleesiek J Beeres M book Donker.2024 JA 2024 10.1101/2024.01.08.24300976 Tjibbe Donker Alexis Papathanassopoulos Hiren Ghosh Raisa Kociurzynski Marius Felder Hajo Grundmann Sandra Reuter incollection stoicu-tivadar_designing_2024 The AKTIN Emergency Department Registry, a German health data network, faces operational challenges due to rapid growth. Manual data request processes have become inefficient, hindering timely research and straining personnel. To address these challenges, we undertook a user-centered analysis utilizing Design Thinking principles to identify pain points and functional requirements in current data request creation and management processes. Future work will prioritize iterative implementation of the created concepts with continuous user engagement and rigorous software validation. 2024 nov 978-1-64368-554-0 10.3233/SHTI241065 Studies in Health Technology and Informatics IOS Press Stoicu-Tivadar, Lăcrămioara and Benis, Arriel and Deserno, Thomas M. and Bolboacă, Sorana D. and Saranto, Kaija and Crişan-Vida, Mihaela and Gallos, Parisis and Chirila, Oana S. and Weber, Patrick and Mihalaş, George and Tamburis, Oscar https://ebooks.iospress.nl/doi/10.3233/SHTI241065 Alexander Kombeiz Jonas Bienzeisler Raphael W. Majeed Rainer Röhrig AKTIN Research Group article JA 2023 12 10.4193/Rhin22.176 S Winkelmann A Korth B Voss MA Nasr N Behrend A Pudszuhn VM Hofmann C Maetzler A Hermes Christoph Borzikowsky T Bahmer W. Lieb Stefan Schreiber Stefan Störk FA Montellano Martin Witzenrath T. Keil Michael Krawczak Martin Laudien On Behalf Of The Napkon Study Group C Schendzielorz article JA 2023 10 25 10.1007/s15010-023-02043-6 NAPKON 2.0 K Appel Ramsia Geisler D Maier Olga Miljukov SM Hopff Jörg Janne Vehreschild article JA 2023 10 17 10.1186/s12910-023-00959-0 NAPKON 2.0 K Tilch SM Hopff K Appel M Kraus Bettina Lorenz-Depiereux Lisa Pilgram G. Anton Sarah Berger Ramsia Geisler K Haas T. Illig Dagmar Krefting Roberto Lorbeer Lazar Mitrov M. Muenchhoff Matthias Nauck Christina Pley Jens-Peter Reese Siegbert Rieg Margarete Scherer Melanie Stecher C Stellbrink Heike Valentin Christof Winter Martin Witzenrath Jörg Janne Vehreschild article JA 2023 09

eingereicht bei GMDS Jahrestagung Heilbronn (Sept 23)

Dana Stahl Arne Blumentritt Ekatherina Heim Heike Valentin Thomas Bahls Martin Bialke Monika Kraus Wolfgang Hoffmann Henriette Rau Lizon Fiedler-Lacombe article JA 2023 09 eingereicht bei GMDS Jahrestagung Heilbronn Khalid O Yusuf Irina Chaplinskaya-Sobol Anne Schoneberg Sabine Hanss Heike Valentin Bettina Lorenz-Depiereux Stefan Hansch Karin Fiedler Margarete Scherer Shimita Sikdar Olga Miljukov Jens-Peter Reese Patricia Wagner Isabel Bröhl Ramsia Geisler Jörg Janne Vehreschild Sabine Blaschke C Bellinghausen Milena Milovanovic Dagmar Krefting article JA 2023 09 10.3233/SHTI230707 NAPKON 2.0 2022-05-17_Khalid_DataQuality Khalid O Yusuf Irina Chaplinskaya-Sobol Anne Schoneberg Sabine Hanss Heike Valentin Bettina Lorenz-Depiereux Stefan Hansch Karin Fiedler Margarete Scherer Shimita Sikdar Olga Miljukov Jens-Peter Reese Patricia Wagner Isabel Bröhl Ramsia Geisler Jörg Janne Vehreschild Sabine Blaschke C Bellinghausen Milena Milovanovic Dagmar Krefting article JA 2023 07 11 10.1007/s15010-023-02057-0 F Steinbeis C. Thibeault S Steinbrecher Ira An Haack Dietrich August Beate Balzuweit C Bellinghausen Sarah Berger Irina Chaplinskaya-Sobol Oliver Cornely P Doeblin Matthias Endres Claudia Fink Carsten Finke Stephan Frank Sabine Hanss Tim J Hartung Johannes C. Hellmuth Susanne Herold Peter Heuschmann Jan Heyckendorf R Heyder S Hippenstiel Wolfgang Hoffmann Sebastian Ulrich Kelle P Knape Philipp Koehler Luzie Kretzler David Manuel Leistner Jasmin Lienau Roberto Lorbeer Bettina Lorenz-Depiereux Constanze Dorothea Lüttke Knut Mai U Merle L. Meyer-Arndt Olga Miljukov M. Muenchhoff M Müller-Plathe Julia Neuhann Hannelore Neuhauser Alexandra Nieters Christian Otte Daniel Pape Rafaela Maria Pinto Christina Pley A Pudszuhn Philipp Reuken Siegbert Rieg Petra Ritter Gritt Rohde Maria Rönnefarth Michael Ruzicka Jens Schaller Anne Schmidt Sein Schmidt Verena Schwachmeyer Georg Schwanitz Werner Seeger Dana Stahl Nicole Stobäus Hans Christian Stubbe Norbert Suttorp Bettina Temmesfeld S Thun Paul Triller Frederik Trinkmann Istvan Vadasz Heike Valentin Maria J.G.T. Vehreschild C Kalle Marie Lilienfeld-Toal Julia Weber Tobias Welte Christian Wildberg Robert Wizimirski Saskia Zvork Leif E Sander J Vehreschild T Zoller Florian Kurth Martin Witzenrath article JA 2023 05 25 10.1007/s15010-023-02043-6 Yanyan Shi Ralf Strobl C. Apfelbacher T Bahmer Ramsia Geisler Peter Heuschmann Anna Horn H. Hoven T. Keil Michael Krawczak L Krist Christina Lemhöfer W. Lieb Bettina Lorenz-Depiereux R. Mikolajczyk FA Montellano Jens-Peter Reese S Schreiber N Skoetz Stefan Störk Jörg Janne Vehreschild Martin Witzenrath E Grill On Behalf Of The Napkon Study Group article JA 2023 05 18 10.3233/SHTI230071 Dagmar Krefting G. Anton Irina Chaplinskaya-Sobol Sabine Hanss Wolfgang Hoffmann SM Hopff M Kraus Roberto Lorbeer Bettina Lorenz-Depiereux T. Illig Christian Schäfer Jens Schaller Dana Stahl Heike Valentin Peter Heuschmann J Vehreschild article JA 2023 05

NAPKON.vention, 03.-04.05.2023 in Frankfurt

Christoph Dolch I Bernemann Bärbel Fösel Sara Haag Norman Klopp V Kopfnagel A Kühn-Steven S Kunze Bettina Lorenz-Depiereux Stefanie Mücke Ina Ruhl Maximilian Schieck G. Anton T. Illig Manuela Scheuner article JA 2023 05

NAPKON.vention, 03.-04.05.2023 in Frankfurt

Stefanie Mücke S Kunze V Kopfnagel Bärbel Fösel I Bernemann Patrick Christ Christoph Dolch Norman Klopp Bettina Lorenz-Depiereux T. Illig G. Anton Nadine Lindemann article JA 2023 05

NAPKON.vention. 03.-04.05.2023 in Frankfurt

G. Anton T Bahmer S Ciesek Christoph Dolch Bärbel Fösel Peter Heuschmann V Kopfnagel S Kunze Bettina Lorenz-Depiereux Stefanie Mücke Matthias Nauck Soni Pullamsetti Markus Ralser JP Reese Christian Schäfer Mario Schattschneider Stefan Schreiber Janne Vehreschild Martin Witzenrath T. Illig poster JA 2023 05 Bettina Lorenz-Depiereux Margarete Scherer Heike Valentin Sarah Berger Melanie Stecher A Hermes M Müller Beate Balzuweit Dana Stahl Christian Schäfer Sabine Hanss Jens Schaller M Kraus Ekatherina Heim article JA 2023 04 10.1002/eji.202250210 Mikhail Lebedin Clara Vázquez García Lisa Spatt Christoph Ratswohl C. Thibeault Lennard Ostendorf Friedemann Paul Leif E Sander Florian Kurth Kathrin Rosa article Rogasch2023_PMID36820890 Bei Patienten mit nichtkleinem Zell-Lungenkrebs (NSCLC) ist die Genauigkeit der [¹⁸F]FDG-PET/CT für prätherapeutische Lymphknoten (LN)-Stufung durch falsche positive Ergebnisse begrenzt. Unser Ziel war es, das maschinelle Lernen mit routinemäßig erhältlichen Variablen zu bewerten, um die Genauigkeit bei der Standard-Bildbeurteilung zu verbessern. Monozentrische retrospektive Analyse von vortherapeutischen [¹⁸F]FDG-PET/CT bei 491 aufeinanderfolgenden Patienten mit NSCLC mit einem analogen PET/CT-Scanner (Training + Testkohort, n = 385) oder Digitalscanner (Validierung, n = 106). Vierzig klinische Variablen, Tumoreigenschaften und Bildvariablen (z.B. primärer Tumor und LN SUVmax und Größe) wurden gesammelt. Verschiedene Kombinationen von maschinellen Lernmethoden zur Merkmalsauswahl und Klassifizierung von N0/1 gegen N2/3-Krankheit wurden verglichen. Die zehnfache geschachtelte Kreuzvalidierung diente dazu, den mittleren Bereich unter der ROC-Kurve der zehn Testfalten ("test AUC") und AUC im Validierungskohort abzuleiten. Referenzstandard war die letzte N-Phase aus interdisziplinärem Konsens (historische Ergebnisse für N2/3 LNs in 96%). N2/3-Krankheit war bei 190 Patienten vorhanden (39%; Training + Test, 37%; Validierung, 46%; p = 0,09). Als letztes Modell wurde ein Gradienten-Boost-Klassifikator (GBM) mit 10 Features ausgewählt, basierend auf Test AUC von 0.91 (95% Vertrauensintervall, 0.87-0.94). Validierung AUC betrug 0.94 (0.89-0.98). Bei einer Zielempfindlichkeit von ca. 90 %, Test/Validierungsgenauigkeit der GBM betrug 0,78/0,87. Dies war deutlich höher als die Genauigkeit auf der Grundlage von "mediastinalen LN-Aufnahme > mediastinum" (0.7/0.75; je p < 0,05) oder kombinierten PET/CT-Kriterien (PET positive und/oder LN kurze Achsen Durchmesser > 10 mm; 0,68/0.75; je p < 0,001). Die Harmonisierung der PET-Bilder zwischen den beiden Scannern beeinflusste SUVmax und die visuelle Beurteilung der LNs, verringerte aber nicht den AUC des GBM. Ein maschinelles Lernmodell basierend auf routinemäßig verfügbaren Variablen aus [¹⁸F]FDG-PET/CT verbesserte Genauigkeit in der mediastinalen LN-Stufe im Vergleich zu etablierten visuellen Bewertungskriterien. Eine Web-Anwendung, die dieses Modell implementiert, wurde zur Verfügung gestellt. JA 2023 Jun 10.1007/s00259-023-06145-z European journal of nuclear medicine and molecular imaging Rogasch JMM Michaels L Baumgärtner GL Frost N Rückert JC Neudecker J Ochsenreither S Gerhold M Schmidt B Schneider P Amthauer H Furth C Penzkofer T article Appel2023-tr BACKGROUND: Numerous prognostic scores have been published to support risk stratification for patients with Coronavirus disease 2019 (COVID-19). METHODS: We performed a systematic review to identify the scores for confirmed or clinically assumed COVID-19 cases. An in-depth assessment and risk of bias (ROB) analysis (Prediction model Risk Of Bias ASsessment Tool (PROBAST)) was conducted for scores fulfilling predefined criteria ((I) area under the curve (AUC) $\geq$ 0.75; (II) a separate validation cohort present; (III) training data from a multicenter setting ($\geq$ 2 centers); (IV) point-scale scoring system). RESULTS: Out of 1,522 studies extracted from MEDLINE/Web of Science (20/02/2023), we identified 242 scores for COVID-19 outcome prognosis (mortality 109, severity 116, hospitalization 14, long-term sequelae 3). Most scores were developed using retrospective (75.2%) or single-center (57.1%) cohorts. Predictor analysis revealed the primary use of laboratory data and sociodemographic information in mortality and severity scores. Forty-nine scores were included in the in-depth analysis. The results indicated heterogeneous quality and predictor selection, with only five scores featuring low ROB. Among those, based on the number and heterogeneity of validation studies, only the 4C Mortality Score can be recommended for clinical application so far. CONCLUSION: The application and translation of most existing COVID scores appear unreliable. Guided development and predictor selection would have improved the generalizability of the scores and may enhance pandemic preparedness in the future. JA 2023 oct en 10.1093/cid/ciad618 37879096 Clin. Infect. Dis. Oxford University Press (OUP) COVID-19; Pandemic preparedness; Prediction models; Predictors; Scores Katharina S Appel Ramsia Geisler Daniel Maier Olga Miljukov Sina M Hopff Jörg J Vehreschild article Krämer2023_PMID37087928 Während der Coronavirus-Krankheit 2019 (COVID-19) Pandemie stehen Krankenhäuser immer noch vor der Herausforderung der rechtzeitigen Identifizierung von infizierten Personen vor der stationären Zulassung. Ein künstlicher Intelligenzansatz auf Basis eines etablierten klinischen Netzwerks kann die prospektive Pandemievorbereitung verbessern. Überwachtes maschinelles Lernen wurde verwendet, um Diagnosemodelle zu konstruieren, um COVID-19 vorherzusagen. Eine gepoolte Datenbank wurde rückwirkend aus 4437 Teilnehmerdaten generiert, die zwischen Januar 2017 und Oktober 2020 in 12 deutschen Zentren gesammelt wurden, die zum radiologischen Kooperationsnetzwerk des Konsortiums COVID-19 (RACOON) gehören. Insgesamt 692 (15,6 %) Teilnehmer waren COVID-19 positiv, bezogen auf den Reverse Transkriptions-Polymerase-Kettenreaktionstest. Die diagnostischen Modelle enthalten Brust-CT-Funktionen (Modell R), klinische Untersuchung und Labortest-Funktionen (Modell CL), oder alle drei Merkmalskategorien (Modell RCL). Performance-Ergebnisse beinhalteten Genauigkeit, Empfindlichkeit, Spezifität, negative und positive Vorhersagewerte und Bereich unter der Empfänger-Betriebskurve (AUC). Die Leistung von Prädiktionsmodellen verbesserte sich deutlich, indem Brust-CT-Funktionen zur klinischen Auswertung und Labortest-Funktionen hinzugefügt wurden. Ohne (Modell CL) und unter Einbeziehung der Brust CT (Modell RCL) betrug die Empfindlichkeit 0,82 und 0,89 (p < 0,0001), die Spezifität 0,84 und 0,89 (p < 0,0001), der negative Prädiktivwert 0,96 und 0,97 (p < 0,0001), die AUC 0,92 bzw. 0,95 (p < 0,0001), der Anteil falscher negativer Klassifikationen betrug 2,6 % bzw. 1,7 % (p < 0,0001), Die Ergänzung der Brust CT-Funktionen zu maschinellen lernbasierten Vorhersagemodellen verbessert die Wirksamkeit bei der Entscheidung am COVID-19 vor der stationären Zulassung zu regulären Stationen. JA 2023 Jun 10.1016/j.ejrad.2023.110827 European journal of radiology Krämer M Ingwersen M Teichgräber U Güttler F article Silber2023_PMID38098830 Kinder und Jugendliche, die für psychische Gesundheitsstörungen, wie Essstörungen (ED) gefährdet sind, wurden besonders von der COVID-19 Pandemie betroffen, doch sind die Beweise für die am stärksten betroffenen und damit in Deutschland kranken Kinder knapp. Diese Querschnittsstudie untersuchte anonymisierte Routinekrankenhausdaten (demographische Informationen, Diagnosen, Behandlungsmodalitäten) von Patienten, die (n = 2,849) an die Abteilung für Kinder- und Jugendpsychiatrie, Psychosomatik und Psychotherapie (DCAPPP) eines Deutschen Universitätsklinikums zwischen 01/2016 und 02/2022 zugelassen wurden. Absolute und relative Zahl von Patienten mit oder ohne ED vor (01/2016-02/2020) und während der COVID-19 Pandemie (03/2020-02/2022) wurden verglichen. Die Auswirkungen von Schulabschlüssen im Rahmen von Sozialabsperrmaßnahmen für die COVID-19-Abschwächung auf die stationäre Aufnahmequote wurde untersucht, wie sie als potenzieller Risikofaktor für psychische Gesundheitsprobleme in der Jugend diskutiert wurde. Während der COVID-19 Pandemie stieg die ED-Inpatient-Eintrittsrate von 10,5 auf 16,7%, vor allem von Anorexia Nervosa (AN). Im Gegensatz zu früheren Berichten fanden wir keine Veränderung der somatischen und psychischen Störung Komorbidität, Alter oder Sexratio für krankhafte Jugendliche mit ED. Allerdings beobachteten wir eine verkürzte Länge des Krankenhausaufenthalts (LOS) für krankhafte Jugendliche mit und ohne ED. Darüber hinaus präsentierten nicht-ED-Zulassungen eine erhöhte Anzahl von psychischen Störungen Komorbiditäten. Im Gegensatz zu unserer Hypothese waren die Schulabschlüsse nicht mit dem beobachteten Anstieg der ED verbunden. Zusammenfassend wurde die COVID-19 Pandemie mit einer erhöhten Ambulanz für Jugendliche, die an AN leiden, und von Jugendlichen, die von mehreren psychischen Störungen betroffen sind, verbunden. Daher gehen wir davon aus, dass die stationäre Zulassung für Personen mit einer höheren Krankheitslast während der COVID-19 Pandemie priorisiert wurde. Unsere Ergebnisse weisen darauf hin, dass bei Umweltkrisen eine angemessene stationäre psychische Gesundheitsbehandlungsfähigkeit und eine weitere Stärkung der Psychiatrie von Kindern und Jugendlichen in Deutschland erforderlich ist. JA 2023 10.3389/fpubh.2023.1281363 Frontiers in public health Silber AS Platte S Arora S Kadioglu D Schmidt M Storf H Freitag CM article Meng2023_PMID36525088 Differenzierung zwischen COVID-19 und gemeindebenötigter Lungenentzündung (CAP) in der berechneten Tomographie (CT) ist eine Aufgabe, die von menschlichen Radiologen und künstlicher Intelligenz (KI) durchgeführt werden kann. Die vorliegende Studie zielt darauf ab, (1) einen AI-Algorithmus zur Differenzierung von COVID-19 von CAP zu entwickeln und (2) seine Leistung zu bewerten. (3) Nutzen Sie das AI-Ergebnis als Hilfe für die radiologische Diagnose und die Auswirkungen auf relevante Parameter wie Genauigkeit der Diagnose, Diagnosezeit und Vertrauen. Wir enthielten n = 1591 Multicenter, Multivendor-Brust-CT-Scans und teilten sie in AI-Trainings- und Validierungsdatensätze, um einen AI-Algorithmus (n = 991 CT-Scans; n = 462 COVID-19 und n = 529 CAP) aus drei Zentren in China zu entwickeln. Ein unabhängiger chinesischer und deutscher Testdatensatz von n = 600 CT-Scans aus sechs Zentren (COVID-19 / CAP; n = 300) wurde verwendet, um die Leistung von acht blinden Radiologen und dem AI-Algorithmus zu testen. Ein Subtest-Datensatz (180 CT-Scans; n = 90) wurde verwendet, um die Leistung der Radiologen ohne und mit AI-Hilfe zu bewerten, um Änderungen der Diagnosegenauigkeit, der Berichtszeit und des Diagnosevertrauens zu quantifizieren. Die diagnostische Genauigkeit des AI-Algorithmus im chinesisch-deutschen Testdatensatz betrug 76,5%. Ohne KI-Hilfe betrug die Diagnosegenauigkeit der acht Radiologen 79,1% und stieg mit KI-Hilfe auf 81,5% und ging mit deutlich kürzeren Entscheidungszeiten und höheren Vertrauenswerten zusammen. Diese große multizentrische Studie zeigt, dass AI-Hilfe in CT-basierte Differenzierung von COVID-19 und CAP die radiologische Leistung mit höherer Genauigkeit und Spezifität, schnellere Diagnosezeit und verbessertes Diagnosevertrauen erhöht. • KI kann Radiologen dabei helfen, eine höhere Diagnosegenauigkeit zu erreichen, schnellere Entscheidungen zu treffen und das Diagnosevertrauen zu verbessern. • Die China-deutsche Multicenter-Studie zeigt die Vorteile einer Mensch-Maschine-Interaktion mit AI in der klinischen Radiologie zur diagnostischen Differenzierung zwischen COVID-19 und CAP in CT-Scans. JA 2023 Jun 10.1007/s00330-022-09335-9 European radiology Meng F Kottlors J Shahzad R Liu H Fervers P Jin Y Rinneburger M Le D Weisthoff M Liu W Ni M Sun Y An L Huai X Móré D Kaltenborn I Bucher A Maintz D Zhang L Thiele F Li M Perkuhn M Zhang H Persigehl T article Salzberger2023-xd The SARS-CoV-2 pandemic has highlighted the importance of viable infection surveillance and the relevant infrastructure. From a German perspective, an integral part of this infrastructure, genomic pathogen sequencing, was at best fragmentary and stretched to its limits due to the lack or inefficient use of equipment, human resources, data management and coordination. The experience in other countries has shown that the rate of sequenced positive samples and linkage of genomic and epidemiological data (person, place, time) represent important factors for a successful application of genomic pathogen surveillance. Planning, establishing and consistently supporting adequate structures for genomic pathogen surveillance will be crucial to identify and combat future pandemics as well as other challenges in infectious diseases such as multi-drug resistant bacteria and healthcare-associated infections. Therefore, the authors propose a multifaceted and coordinated process for the definition of procedural, legal and technical standards for comprehensive genomic pathogen surveillance in Germany, covering the areas of genomic sequencing, data collection and data linkage, as well as target pathogens. A comparative analysis of the structures established in Germany and in other countries is applied. This proposal aims to better tackle epi- and pandemics to come and take action from the "lessons learned" from the SARS-CoV-2 pandemic. JA 2023 aug en Infection 51 Springer Science and Business Media LLC 805—811 4 Epidemiology; Genomics; Pandemic; SARS-CoV-2; Surveillance, GenSurv, MolTrax Bernd Salzberger Alexander Mellmann Anna Bludau Sandra Ciesek Victor Corman Alexander Dilthey Tjibbe Donker Tim Eckmanns Richard Egelkamp Sören G Gatermann Hajo Grundmann Georg Häcker Martin Kaase Berit Lange Martin Mielke Mathias W Pletz Torsten Semmler Andrea Thürmer Lothar H Wieler Thorsten Wolff Andreas F Widmer Simone Scheithauer article Steinbeis2023-hb BACKGROUND: The severe acute respiratory syndrome corona virus 2 (SARS-CoV-2) pandemic causes a high burden of acute and long-term morbidity and mortality worldwide despite global efforts in containment, prophylaxis, and therapy. With unprecedented speed, the global scientific community has generated pivotal insights into the pathogen and the host response evoked by the infection. However, deeper characterization of the pathophysiology and pathology remains a high priority to reduce morbidity and mortality of coronavirus disease 2019 (COVID-19). METHODS: NAPKON-HAP is a multi-centered prospective observational study with a long-term follow-up phase of up to 36 months post-SARS-CoV-2 infection. It constitutes a central platform for harmonized data and biospecimen for interdisciplinary characterization of acute SARS-CoV-2 infection and long-term outcomes of diverging disease severities of hospitalized patients. RESULTS: Primary outcome measures include clinical scores and quality of life assessment captured during hospitalization and at outpatient follow-up visits to assess acute and chronic morbidity. Secondary measures include results of biomolecular and immunological investigations and assessment of organ-specific involvement during and post-COVID-19 infection. NAPKON-HAP constitutes a national platform to provide accessibility and usability of the comprehensive data and biospecimen collection to global research. CONCLUSION: NAPKON-HAP establishes a platform with standardized high-resolution data and biospecimen collection of hospitalized COVID-19 patients of different disease severities in Germany. With this study, we will add significant scientific insights and provide high-quality data to aid researchers to investigate COVID-19 pathophysiology, pathology, and chronic morbidity. JA 2023 jul en 10.1007/s15010-023-02057-0 37434025 Infection 52 93-104 1 COVID-19; Coronavirus; Deep phenotyping; Infectious disease; SARS-CoV-2 Fridolin Steinbeis Charlotte Thibeault Sarah Steinbrecher Ira An Haack Dietrich August Beate Balzuweit Carla Bellinghausen Sarah Berger Irina Chaplinskaya-Sobol Oliver Cornely Patrick Doeblin Matthias Endres Claudia Fink Carsten Finke Sandra Frank Sabine Hanß Tim Hartung Johannes Christian Hellmuth Susanne Herold Peter Heuschmann Jan Heyckendorf Ralf Heyder Stefan Hippenstiel Wolfgang Hoffmann Sebastian Ulrich Kelle Philipp Knape Philipp Koehler Lucie Kretzler David Manuel Leistner Jasmin Lienau Roberto Lorbeer Bettina Lorenz-Depiereux Constanze Dorothea Lüttke Knut Mai Uta Merle Lil Antonia Meyer-Arndt Olga Miljukov Maximilian Muenchhoff Moritz Müller-Plathe Julia Neuhann Hannelore Neuhauser Alexandra Nieters Christian Otte Daniel Pape Rafaela Maria Pinto Christina Pley Annett Pudszuhn Philipp Reuken Siegberg Rieg Petra Ritter Gernot Rohde Maria Rönnefarth Michael Ruzicka Jens Schaller Anne Schmidt Sein Schmidt Verena Schwachmeyer Georg Schwanitz Werner Seeger Dana Stahl Nicole Stobäus Hans Christian Stubbe Norbert Suttorp Bettina Temmesfeld Sylvia Thun Paul Triller Frederik Trinkmann Istvan Vadasz Heike Valentin Maria Vehreschild Christof Kalle Marie Lilienfeld-Toal Joachim Weber Tobias Welte Christian Wildberg Robert Wizimirski Saskia Zvork Leif Erik Sander Janne Vehreschild Thomas Zoller Florian Kurth Martin Witzenrath article Hellwig2023-fc Positron emission tomography (PET) is vital for diagnosing diseases and monitoring treatments. Conventional image reconstruction (IR) techniques like filtered backprojection and iterative algorithms are powerful but face limitations. PET IR can be seen as an image-to-image translation. Artificial intelligence (AI) and deep learning (DL) using multilayer neural networks enable a new approach to this computer vision task. This review aims to provide mutual understanding for nuclear medicine professionals and AI researchers. We outline fundamentals of PET imaging as well as state-of-the-art in AI-based PET IR with its typical algorithms and DL architectures. Advances improve resolution and contrast recovery, reduce noise, and remove artifacts via inferred attenuation and scatter correction, sinogram inpainting, denoising, and super-resolution refinement. Kernel-priors support list-mode reconstruction, motion correction, and parametric imaging. Hybrid approaches combine AI with conventional IR. Challenges of AI-assisted PET IR include availability of training data, cross-scanner compatibility, and the risk of hallucinated lesions. The need for rigorous evaluations, including quantitative phantom validation and visual comparison of diagnostic accuracy against conventional IR, is highlighted along with regulatory issues. First approved AI-based applications are clinically available, and its impact is foreseeable. Emerging trends, such as the integration of multimodal imaging and the use of data from previous imaging visits, highlight future potentials. Continued collaborative research promises significant improvements in image quality, quantitative accuracy, and diagnostic performance, ultimately leading to the integration of AI-based IR into routine PET imaging protocols. JA 2023 en 10.1055/a-2198-0358 Nuklearmedizin 62 Georg Thieme Verlag KG

Stuttgart

334—342 6 PET image reconstruction Artificial intelligence Deep learning Medical imaging Quantitative accuracy NUM-DIZ http://dx.doi.org/10.1055/a-2198-0358 Dirk Hellwig Nils Constantin Hellwig Steven Boehner Timo Fuchs Regina Fischer Daniel Schmidt article JA 2023 11. Nationales Biobanken Symposium 2023, Tagungsband 51-52 ISBN 978-3-8382-1841-0 V Kopfnagel I Bernemann Gabriele Anton T. Illig Stefanie Mücke Christoph Dolch Norman Klopp Dirk Drobek Markus Kersting article Jacobs2023_PMID37685411 Datengetriebenes maschinelles Lernen in der medizinischen Forschung und Diagnostik benötigt von klinischen Experten kuratierte großformatige Datensätze. Die Generierung großer Datensätze kann im Hinblick auf den Ressourcenverbrauch und den Zeitaufwand herausfordern, während die Verallgemeinerlichkeit und Validierung der entwickelten Modelle deutlich von der Vielfalt der Datenquellen profitieren. Schulungsalgorithmen zu kleineren dezentralen Datensätzen durch föderiertes Lernen können den Aufwand reduzieren, erfordern aber die Implementierung einer spezifischen und ambitionierten Infrastruktur, um Daten, Algorithmen und Rechenzeit zu teilen. Darüber hinaus bietet es die Möglichkeit, die Daten lokal zu pflegen und zu halten. Somit können Datensicherheitsprobleme vermieden werden, da Patientendaten nicht geteilt werden dürfen. Machine Learning Modelle werden auf lokalen Daten durch das Teilen des Modells und durch ein etabliertes Netzwerk trainiert. Neben kommerziellen Anwendungen gibt es auch zahlreiche akademische und maßgeschneiderte Implementierungen von Netzwerkinfrastrukturen. Die Konfiguration dieser Netzwerke unterscheidet sich in erster Linie, hält sich aber an einen Standardrahmen aus Grundkomponenten. In dieser technischen Anmerkung schlagen wir grundlegende Infrastrukturanforderungen für die Datenverwaltung, Datenwissenschafts-Workflows und lokale Knoten-Setup vor und berichten über die Vorteile und erfahrene Fallstricke bei der Umsetzung der lokalen Infrastruktur mit der deutschen Radiologischen kooperativen Netzwerkinitiative als Anwendungsbeispiel. Wir zeigen, wie die Infrastruktur auf einigen Basiskomponenten aufgebaut werden kann, um die Bedürfnisse eines föderierten Lernnetzwerks zu reflektieren und wie sie sowohl unter Berücksichtigung lokaler als auch globaler Netzwerkanforderungen umgesetzt werden können. Nach der Analyse des Bereitstellungsprozesses in verschiedenen Einstellungen und Szenarien empfehlen wir, den lokalen Knoten in eine bestehende klinische IT-Infrastruktur zu integrieren. Dieser Ansatz bietet Vorteile in Bezug auf Wartungs- und Bereitstellungsaufwand im Vergleich zur externen Integration in einer separaten Umgebung (z.B. der Radiologieabteilung). Diese vorgeschlagene Grundarbeit kann als beispielhafte Entwicklungsleitlinie für zukünftige Anwendungen von föderierten Lernnetzwerken in klinischen und wissenschaftlichen Umgebungen betrachtet werden. JA 2023 Aug 10.3390/healthcare11172377 Healthcare (Basel, Switzerland) Jacobs PP Ehrengut C Penzkofer T Lukas M Kleesiek J Denecke T article Ebel2023_PMID40567385 Geschlechtsunterschiede in der Größe bestimmter Gehirnstrukturen wurden umfassend untersucht, aber sorgfältige und reproduzierbare statistische Hypothesentests, um sie zu identifizieren, produzierte insgesamt kleine Effektgrößen und Unterschiede in Gehirnen von Männern und Frauen. Andererseits haben multivariate statistische oder maschinelle Lernmethoden, die MR-Bilder des gesamten Gehirns analysieren, respektable Akzente für die Aufgabe, Gehirne von Männern von Gehirnen von Frauen zu unterscheiden. Allerdings fehlten die meisten existierenden Studien eine sorgfältige Kontrolle für Hirnvolumenunterschiede zwischen den Geschlechtern und, wenn getan, ihre Genauigkeit oft auf 70% oder darunter. Dies stellt Fragen über die Relevanz der erreichten Genauigkeiten ohne sorgfältige Kontrolle des Gesamtvolumens. Wir untersuchten, wie genau der Sex aus den Eigenschaften des menschlichen Gehirns klassifiziert werden kann, wenn er sich auf das gesamte Gehirnvolumen anpasst. Wir haben getestet, wie robuste Machine Learning Klassifikatoren bei der Vorhersage von Cross-Cohort sind, d.h. wenn sie auf einer anderen Kohorte verwendet werden, als sie ausgebildet wurden. Darüber hinaus haben wir untersucht, wie ihre Genauigkeit von der Größe des Trainingssatzes abhängt und versuchte, Hirnregionen zu identifizieren, die für eine erfolgreiche Klassifizierung relevant sind. MRT-Daten wurden von zwei Bevölkerungsdatensätzen von 3298 meist älteren Erwachsenen aus der Studie of Health in Pomerania (SHIP) und 399 meist jüngeren Erwachsenen aus dem Human Connectome Project (HCP) verwendet. Wir haben zwei multivariate Methoden, logistische Regression und ein 3D-konvolutionales neuronales Netzwerk bewertet. Wir zeigen, dass männliche und weibliche Gehirne desselben intracranialen Volumens mit >92% Genauigkeit mit logistischer Regression auf einem Datensatz von 1166 angepasst Einzelpersonen unterschieden werden können. Das gleiche Modell erreichte auch 85% Genauigkeit auf einer anderen Kohorte ohne Rückgriff. Die Genauigkeit für beide Methoden erhöhte sich mit der Trainingskohortengröße bis zu und über 3000 Personen, was darauf hindeutet, dass Klassifikatoren, die auf kleinere Kohorten ausgebildet sind, einen Genauigkeitsnachteil haben. Wir fanden keine einzige hervorragende Gehirnregion, die für eine erfolgreiche Klassifikation erforderlich ist, aber wichtige Eigenschaften erscheinen ziemlich verteilt über das Gehirn. JA 2023 Sep 10.1016/j.ynirp.2023.100181 Neuroimage. Reports Ebel M Domin M Neumann N Schmidt CO Lotze M Stanke M article Meyer2023_PMID37290317 Thorakale Lymphadenopathie kann Prognosen bei Patienten mit Koronavirus-Krankheit 2019 (COVID-19) vorhersagen, wenngleich die gemeldeten Daten unschlüssig sind. Ziel der vorliegenden Analyse war es, die betroffenen Lymphknotenstationen und die kumulative Lymphknotengröße, die sich aus der berechneten Tomographie (CT) ergibt, zur Vorhersage von 30-tägiger Mortalität bei Patienten mit COVID-19 zu analysieren. Die klinische Datenbank wurde für Patienten mit COVID-19 zwischen 2020 und 2022 rückwirkend untersucht. Insgesamt wurden 177 Patienten (63 weiblich, 35,6%) in die Analyse aufgenommen. Thoracal Lymphadenopathie wurde durch einen kurzen Achsdurchmesser über 10 mm definiert. Die kumulative Lymphknotengröße der größten Lymphknoten wurde berechnet und die Menge der betroffenen Lymphknotenstationen quantifiziert. Insgesamt starben 53 Patienten (29,9%) innerhalb der 30-tägigen Beobachtungszeit. Bei der ICU wurden 108 Patienten (61,0%) zugelassen und 91 Patienten mussten intubiert werden (51.4%). Insgesamt gab es 130 Patienten mit Lymphadenopathie (73,4%). Die mittlere Anzahl der betroffenen Lymphknotenwerte lag bei Nicht-Überlebenden höher als bei Überlebenden (also 4,0 vs 2,2, p < 0,001). Die kumulative Größe war auch bei Nichtüberlebenden höher als bei Überlebenden (Mittel 55,9 mm gegenüber 44.1 mm, p = 0,006). Die Anwesenheit von Lymphadenopathie wurde mit 30-tägiger Mortalität in einer multivariablen Analyse verbunden, OR = 2,99 (95% CI 1,20 - 7,43), p = 0.02. Eine Thorax-Lymphadenopathie mit kumulativer Größe und von CT-Bildern abgeleiteten Betroffenen ist bei Patienten mit COVID-19 mit 30-tägiger Mortalität verbunden. JA 2023 Aug 10.1016/j.jiph.2023.05.031 Journal of infection and public health Meyer HJ Melekh B article gagiannis_clinical_2023 JA 2023 jun 1073-449X 10.1164/rccm.202302-0285LE American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine COVID-19, SARS-CoV-2, PASC, lung pathology, longCOVID, postCOVID, lung fibrosis https://www.atsjournals.org/doi/abs/10.1164/rccm.202302-0285LE Publisher: American Thoracic Society - AJRCCM Daniel Gagiannis Carsten Hackenbroch Wilhelm Bloch Fabian Zech Frank Kirchhoff Sonja Djudjaj Saskia Stillfried Roman Bülow Peter Boor Konrad Steinestel article Tayebi2023_PMID37055456 Aufgrund der rasanten Fortschritte in den letzten Jahren wird die medizinische Bildanalyse weitgehend von Deep Learning (DL) dominiert. Der Aufbau von leistungsstarken und robusten DL-Modellen erfordert jedoch Schulungen mit großen Multi-Party-Datensätzen. Während mehrere Stakeholder öffentlich verfügbare Datensätze bereitgestellt haben, sind die Art und Weise, wie diese Daten markiert werden, sehr unterschiedlich. Eine Einrichtung könnte beispielsweise einen Datensatz von Brust-Funkgraphen mit Etiketten für das Vorhandensein von Lungenentzündung bereitstellen, während eine andere Einrichtung einen Schwerpunkt auf der Bestimmung des Vorhandenseins von Metastasen in der Lunge haben könnte. Die Ausbildung eines einzigen KI-Modells mit all diesen Daten ist mit dem herkömmlichen föderierten Lernen (FL) nicht machbar. Dies ruft uns dazu auf, eine Erweiterung des weitverbreiteten FL-Prozesses vorzuschlagen, nämlich flexibles föderiertes Lernen (FFL) zur kollaborativen Ausbildung solcher Daten. Mit 695.000 Brust-Radiographen von fünf Institutionen von überall auf der Welt mit unterschiedlichen Etiketten- wir zeigen, dass mit heterogen markierten Datensätzen, FFL-basiertes Training führt zu einer signifikanten Leistungssteigerung im Vergleich zu herkömmlichen FL-Training, wo nur die gleichmäßig markierten Bilder verwendet werden. Wir glauben, dass unser vorgeschlagener Algorithmus den Prozess beschleunigen könnte, kollaborative Trainingsmethoden aus der Forschungs- und Simulationsphase in die realen Anwendungen im Gesundheitswesen zu bringen. JA 2023 Apr 10.1038/s41598-023-33303-y Scientific reports Tayebi Arasteh S Isfort P Saehn M Mueller-Franzes G Khader F Kather JN Kuhl C Nebelung S Truhn D article JA 2023 11. Nationales Biobanken Symposium 2023, Tagungsband 61-62 ISBN 978-3-8382-1841-0 I Bernemann Sara Haag Bärbel Fösel Christoph Dolch Norman Klopp V Kopfnagel A Kühn-Steven S Kunze Stefanie Mücke Ina Ruhl Maximilian Schieck T. Illig G. Anton article brautigam_comprehensive_2023 AIMS: COVID-19 has had enormous consequences on global health-care and has resulted in millions of fatalities. The exact mechanism and site of SARS-CoV-2 entry into the body remains insufficiently understood. Recently, novel virus receptors were identified, and alveolar macrophages were suggested as a potential viral entry cell type and vector for intra-alveolar virus transmission. Here, we investigated the protein expression of 10 well-known and novel virus entry molecules along potential entry sites in humans using immunohistochemistry. METHODS AND RESULTS: Samples of different anatomical sites from up to 93 patients were incorporated into tissue microarrays. Protein expression of ACE2, TMPRSS2, furin, CD147, C-type lectin receptors (CD169, CD209, CD299), neuropilin-1, ASGR1 and KREMEN1 were analysed. In lung tissues, at least one of the three receptors ACE2, ASGR1 or KREMEN1 was expressed in the majority of cases. Moreover, all the investigated molecules were found to be expressed in alveolar macrophages, and co-localisation with SARS-CoV-2 N-protein was demonstrated using dual immunohistochemistry in lung tissue from a COVID-19 autopsy. While CD169 and CD209 showed consistent protein expression in sinonasal, conjunctival and bronchiolar tissues, neuropilin-1 and ASGR1 were mostly absent, suggesting a minor relevance of these two molecules at these specific sites. CONCLUSION: Our results extend recent discoveries indicating a role for these molecules in virus entry at different anatomical sites. Moreover, they support the notion of alveolar macrophages being a potential entry cell for SARS-CoV-2. JA 2023 may eng 1365-2559 10.1111/his.14871 Histopathology 82 846—859 6 SARS-CoV-2, COVID-19, Humans, Angiotensin-Converting Enzyme 2, Asialoglycoprotein Receptor, lectin, macrophage, Macrophages, Alveolar, Neuropilin-1, receptor, Virus Internalization Konstantin Bräutigam Stefan Reinhard Martin Wartenberg Stefan Forster Karen Greif Massimo Granai Hans Bösmüller Karin Klingel Christian M. Schürch article schadler_concordance_2023 In pandemics or to further study highly contagious infectious diseases, new strategies are needed for the collection of post-mortem tissue samples to identify the pathogen as well as its morphological impact. In this study, an ultrasound-guided minimally invasive tissue sampling (MITS) protocol was developed and validated for post-mortem use. The histological and microbiological qualities of post-mortem specimens were evaluated and compared between MITS and conventional autopsy (CA) in a series of COVID-19 deaths. Thirty-six ultrasound-guided MITS were performed. In five cases more, specimens for histological and virological examination were also obtained and compared during the subsequently performed CA. Summary statistics and qualitative interpretations (positive, negative) were calculated for each organ tissue sample from MITS and CA, and target genes were determined for both human cell count (beta-globin) and virus (SARS-CoV-2 specific E gene). There are no significant differences between MITS and CA with respect to the detectability of viral load in individual organs, which is why MITS can be of utmost importance and an useful alternative, especially during outbreaks of infectious diseases. JA 2023 oct en 1437-1596 10.1007/s00414-023-03088-w International Journal of Legal Medicine COVID-19, Conventional autopsy, Minimally invasive tissue sampling, Post-mortem ultrasound, RT-qPCR, SARS-CoV-2 specific E-gene https://doi.org/10.1007/s00414-023-03088-w Julia Schädler Akhator Terence Azeke Benjamin Ondruschka Stefan Steurer Marc Lütgehetmann Antonia Fitzek Dustin Möbius article Yusuf2023-ia Background As a national effort to better understand the current pandemic, three cohorts collect sociodemographic and clinical data from coronavirus disease 2019 (COVID-19) patients from different target populations within the German National Pandemic Cohort Network (NAPKON). Furthermore, the German Corona Consensus Dataset (GECCO) was introduced as a harmonized basic information model for COVID-19 patients in clinical routine. To compare the cohort data with other GECCO-based studies, data items are mapped to GECCO. As mapping from one information model to another is complex, an additional consistency evaluation of the mapped items is recommended to detect possible mapping issues or source data inconsistencies.Objectives The goal of this work is to assure high consistency of research data mapped to the GECCO data model. In particular, it aims at identifying contradictions within interdependent GECCO data items of the German national COVID-19 cohorts to allow investigation of possible reasons for identified contradictions. We furthermore aim at enabling other researchers to easily perform data quality evaluation on GECCO-based datasets and adapt to similar data models.Methods All suitable data items from each of the three NAPKON cohorts are mapped to the GECCO items. A consistency assessment tool (dqGecco) is implemented, following the design of an existing quality assessment framework, retaining their-defined consistency taxonomies, including logical and empirical contradictions. Results of the assessment are verified independently on the primary data source.Results Our consistency assessment tool helped in correcting the mapping procedure and reveals remaining contradictory value combinations within COVID-19 symptoms, vital signs, and COVID-19 severity. Consistency rates differ between the different indicators and cohorts ranging from 95.84% up to 100%.Conclusion An efficient and portable tool capable of discovering inconsistencies in the COVID-19 domain has been developed and applied to three different cohorts. As the GECCO dataset is employed in different platforms and studies, the tool can be directly applied there or adapted to similar information models. JA 2023 jan 10.1055/a-2006-1086 Methods Inf Med 62 Georg Thieme Verlag KG e47—e56 S 01 data quality; COVID-19; consistency; metadata Khalid O. Yusuf Anne Schoneberg Sabine Hanß Martin Wiesenfeldt Melanie Stecher Lazar Mitrov Sina Marie Hopff Sarah Steinbrecher Florian Kurth Thomas Bahmer Stefan Schreiber Daniel Pape Anna-Lena Hofmann Mirjam Kohls Stefan Störk Hans Christian Stubbe Johannes J. Tebbe Johannes C. Hellmuth Johanna Erber Lilian Krist Siegbert Rieg Lisa Pilgram Jörg J. Vehreschild Jens-Peter Reese Dagmar Krefting article JA 2023 01 10.1055/a-2006-1086 Khalid O Yusuf Olga Miljukov Anne Schoneberg Sabine Hanß Martin Wiesenfeldt Melanie Stecher Lazar Mitrov SM Hopff S Steinbrecher Florian Kurth T Bahmer S Schreiber Daniel Pape Anna-Lena Hofmann M Kohls Stefan Störk Hans Christian Stubbe Johannes Josef Tebbe Johannes Hellmuth J Erber L Krist Siegbert Rieg Lisa Pilgram Jörg Janne Vehreschild JP Reese Dagmar Krefting article Meiler2023_PMID37382073 Ziel dieser Studie war es, zu bewerten, ob CT-Ergebnisse bei Patienten mit Lungen Post Covid-Syndrom Residua nach akuter Lungenentzündung darstellen oder ob SARS-CoV 2 eine wahre ILD induziert. Konsekutive Patienten mit Status post akute Covid-19 Lungenentzündung und anhaltende Lungensymptome wurden eingeschrieben. Inklusionskriterien waren die Verfügbarkeit von mindestens einer in der akuten Phase durchgeführten Brust CT und mindestens einer Brust CT mindestens 80 Tage nach Symptombeginn. Sowohl in der akuten als auch in der chronischen Phase wurden CTs 14 CT-Features sowie Verteilung und Ausmaß der Trübungen unabhängig voneinander durch zwei Brustradiologen bestimmt. Die Evolution jeder einzelnen CT-Lession im Laufe der Zeit wurde für jeden Patienten intraindividuell registriert. Darüber hinaus wurden Lungen-Anomalien automatisch mit einem vortrainierten nnU-Net-Modell und Volumen sowie Dichte von parenchymalen Läsionen über den gesamten Krankheitsverlauf aufgetragen, einschließlich aller verfügbaren CTs. 29 Patienten (median age 59 Jahre, IQR 8, 22 Männer) wurden eingeschrieben. Die Nachlaufzeit betrug 80-242 Tage (Mittel 134). 152/157 (97 %) Läsionen in der chronischen Phase CTs stellten Residua der Lungenpathologie in der akuten Phase dar. Die subjektive und objektive Auswertung serieller CTs ergab, dass CT-Anomalien standortstabil waren und die Ausdehnung und Dichte kontinuierlich abnimmt. Die Ergebnisse unserer Studie unterstützen die Hypothese, dass CT-Anomalien in der chronischen Phase nach Covid-19-Pneumonie Residua in Bezug auf eine verlängerte Heilung von akuter Infektion darstellen. Wir fanden keine Beweise für eine Post Covid ILD. JA 2023 Jun 10.36141/svdld.v40i2.13983 Sarcoidosis, vasculitis, and diffuse lung diseases : official journal of WASOG Meiler S Poschenrieder F Strotzer Q Scharf G Rennert J Stroszczynski C Pfeifer M Hamer O article stanelle-bertram_cyp19a1_2023 Male sex represents one of the major risk factors for severe COVID-19 outcome. However, underlying mechanisms that mediate sex-dependent disease outcome are as yet unknown. Here, we identify the CYP19A1 gene encoding for the testosterone-to-estradiol metabolizing enzyme CYP19A1 (also known as aromatase) as a host factor that contributes to worsened disease outcome in SARS-CoV-2-infected males. We analyzed exome sequencing data obtained from a human COVID-19 cohort (n = 2,866) using a machine-learning approach and identify a CYP19A1-activity-increasing mutation to be associated with the development of severe disease in men but not women. We further analyzed human autopsy-derived lungs (n = 86) and detect increased pulmonary CYP19A1 expression at the time point of death in men compared with women. In the golden hamster model, we show that SARS-CoV-2 infection causes increased CYP19A1 expression in the lung that is associated with dysregulated plasma sex hormone levels and reduced long-term pulmonary function in males but not females. Treatment of SARS-CoV-2-infected hamsters with a clinically approved CYP19A1 inhibitor (letrozole) improves impaired lung function and supports recovery of imbalanced sex hormones specifically in males. Our study identifies CYP19A1 as a contributor to sex-specific SARS-CoV-2 disease outcome in males. Furthermore, inhibition of CYP19A1 by the clinically approved drug letrozole may furnish a new therapeutic strategy for individualized patient management and treatment. JA 2023 aug en 2666-3791 10.1016/j.xcrm.2023.101152 Cell Reports Medicine 101152 COVID-19, CYP19A1, estradiol, letrozole, lung health, male sex, testosterone https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2666379123003051 Stephanie Stanelle-Bertram Sebastian Beck Nancy Kouassi Mounogou Berfin Schaumburg Fabian Stoll Zoé Schmal Tian Bai Martin Zickler Georg Beythien Kathrin Becker Madeleine Roi Fabian Heinrich Claudia Schulz Martina Sauter Susanne Krasemann Philine Lange Axel Heinemann Debby Riel Lonneke Leijten Lisa Bauer Thierry P. P. Bosch Boaz Lopuhaä Tobias Busche Daniel Wibberg Dirk Schaudien Torsten Goldmann Anna Lüttjohann Jenny Ruschinski Hanna Jania Zacharias Müller Vinicius Reis Vanessa Krupp-Buzimkic Martin Wolff Chiara Fallerini Margherita Baldassarri Simone Furini Katrina Norwood Christopher Käufer Nina Schützenmeister Maren Köckritz-Blickwede Maria Schroeder Dominik Jarczak Axel Nierhaus Tobias Welte Stefan Kluge Alice C. McHardy Frank Sommer Jörn Kalinowski Susanne Krauss-Etschmann Franziska Richter Jan Thüsen Wolfgang Baumgärtner Karin Klingel Benjamin Ondruschka Alessandra Renieri Gülsah Gabriel article JA 2023 11. Nationales Biobanken Symposium 2023, Tagungsband 53-54 ISBN 978-3-8382-1841-0 Stefanie Mücke S Kunze V Kopfnagel Bärbel Fösel I Bernemann Christoph Dolch Norman Klopp D Lindemann Bettina Lorenz-Depiereux T. Illig G. Anton Patrick Christ article JA 2023 Poster NAPKON Vention 2023, Frankfurt Carolin Nürnberger Katharina S. Appel Maria Cristina Polidori Nora Hettich T Bahmer Christian Förster Christina Lemhöfer On Behalf Of The Napkon Study Group article Theis2023_PMID37844428 Um die Überlebensprognose bei Patienten zu untersuchen, die einen transcatheteren aortischen Ventilersatz (TAVR) unter Verwendung von Deep Learning (DL)-Methoden durchführen, die direkt auf präinterventionelle CT-Bilder angewendet werden und die Leistung mit Überlebensmodellen basierend auf Skalarmarkern der Körperzusammensetzung vergleichen. Diese retrospektive Einzelzentrumsstudie umfasste 760 Patienten, die TAVR (im Alter von 81 ± 6 Jahren; 389 weiblich). Als Grundlinie wurde ein Cox-Proportional-Risikomodell (CPHM) ausgebildet, um das Überleben auf Geschlecht, Alter und die CT-Körperzusammensetzung Marker Fettmuskelfraktion (FMF), Skelettmuskel-Radiodensität (SMRD) und Skelettmuskelfläche (SMA) aus der Paraspinalmuskelsegmentierung einer einzelnen Schicht auf L3/L4-Ebene vorherzusagen. Der konvolutionale neuronale Netz-Encoder des DL-Modells zur Überlebensprognose wurde in einer Autoencoder-Einstellung mit und ohne Fokus auf paraspinalen Muskeln vortrainiert. Schließlich wurde eine Kombination aus DL und CPHM ausgewertet. Die Leistung wurde durch C-Index und Bereich unter der Empfänger-Betriebskurve (AUC) für das 1-jährige und 2-jährige Überleben bewertet. Alle Methoden wurden mit fünffacher Quervalidierung trainiert und an 152 Aushalteprüffällen ausgewertet. Die CNN für direkte bildbasierte Überlebensprognose, vortrainiert in einem fokussierten Autoencoder-Szenario, übertraf die Basislinie CPHM (CPHM: C-index = 0.608, 1Y-AUC = 0.606, 2Y-AUC = 0.594 vs. DL: C-index = 0.645, 1Y-AUC = 0.687, 2Y-AUC = 0.692). Die Kombination von DL und CPHM führte zu einer weiteren Verbesserung (C-Index = 0,668, 1Y-AUC = 0,713, 2Y-AUC = 0,696). Direkte DL-basierte Überlebensprognose zeigt Potenzial zur Verbesserung der Bildmerkmalsextraktion im Vergleich zu segmentationsbasierten Skalarmarkern der Körperzusammensetzung zur Risikobewertung bei TAVR-Patienten. JA 2023 Nov 10.1016/j.ejrad.2023.111150 European journal of radiology Theis M Block W Luetkens JA Attenberger UI Nowak S article https://doi.org/10.1002/eji.202250210 Abstract Diverse autoantibodies were suggested to contribute to severe outcomes of COVID-19, but their functional implications are largely unclear. ACE2, the SARS-CoV-2 receptor and a key regulator of blood pressure, was described to be one of many targets of autoantibodies in COVID-19. ACE2 in its soluble form (sACE2) is highly elevated in the blood of critically ill patients, raising the question of whether sACE2:spike complexes induce ACE2 reactivity. Screening 247 COVID-19 patients, we observed elevated sACE2 and anti-ACE2 IgG that were poorly correlated. Interestingly, levels of IgGs recognizing ACE2, IFNα2, and CD26 strongly correlated in severe COVID-19, with 15% of sera showing polyreactivity versus 4.1% exhibiting target-directed autoimmunity. Promiscuous autoantibodies failed to impair the activity of ACE2 and IFNα2, while only specific anti-IFNα2 IgG compromised cytokine function. Our study suggests that the detection of autoantibodies in COVID-19 is often attributed to a promiscuous reactivity, potentially misinterpreted as target-specific autoimmunity with functional impact. JA 2023 10.1002/eji.202250210 36856018 European Journal of Immunology 53 2250210 5 Autoantibodies, Autoimmunity, Autoreactivity, COVID-19, SARS-CoV-2 https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/eji.202250210 Mikhail Lebedin Clara Vázquez García Lisa Spatt Christoph Ratswohl Charlotte Thibeault Lennard Ostendorf Friedemann Paul Leif Erik Sander Florian Kurth Kathrin Rosa article kolabas_distinct_2023 JA 2023 aug en 00928674 10.1016/j.cell.2023.07.009 Cell S0092867423007420 https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0092867423007420 Zeynep Ilgin Kolabas Louis B. Kuemmerle Robert Perneczky Benjamin Förstera Selin Ulukaya Saketh Kapoor Laura M. Bartos Maren Büttner Ozum Sehnaz Caliskan Zhouyi Rong Hongcheng Mai Luciano Höher Denise Jeridi Muge Molbay Igor Khalin Ioannis K. Deligiannis Moritz Negwer Kenny Roberts Alba Simats Olga Carofiglio Mihail I. Todorov Izabela Horvath Furkan Ozturk Selina Hummel Gloria Biechele Artem Zatcepin Marcus Unterrainer Johannes Gnörich Jay Roodselaar Joshua Shrouder Pardis Khosravani Benjamin Tast Lisa Richter Laura Díaz-Marugán Doris Kaltenecker Laurin Lux Ying Chen Shan Zhao Boris-Stephan Rauchmann Michael Sterr Ines Kunze Karen Stanic Vanessa W.Y. Kan Simon Besson-Girard Sabrina Katzdobler Carla Palleis Julia Schädler Johannes C. Paetzold Sabine Liebscher Anja E. Hauser Ozgun Gokce Heiko Lickert Hanno Steinke Corinne Benakis Christian Braun Celia P. Martinez-Jimenez Katharina Buerger Günter Höglinger Johannes Levin Christian Haass Anna Kopczak Martin Dichgans Joachim Havla Tania Kümpfel Martin Kerschensteiner Martina Schifferer Mikael Simons Arthur Liesz Natalie Krahmer Omer A. Bayraktar Nicolai Franzmeier Nikolaus Plesnila Suheda Erener Victor G. Puelles Claire Delbridge Harsharan Singh Bhatia Farida Hellal Markus Elsner Ingo Bechmann Benjamin Ondruschka Matthias Brendel Fabian J. Theis Ali Erturk article mothes_distinct_2023 Abstract Prolonged lung pathology has been associated with COVID-19, yet the cellular and molecular mechanisms behind this chronic inflammatory disease are poorly understood. In this study, we combine advanced imaging and spatial transcriptomics to shed light on the local immune response in severe COVID-19. We show that activated adventitial niches are crucial microenvironments contributing to the orchestration of prolonged lung immunopathology. Up-regulation of the chemokines CCL21 and CCL18 associates to endothelial-to-mesenchymal transition and tissue fibrosis within these niches. CCL21 over-expression additionally links to the local accumulation of T cells expressing the cognate receptor CCR7. These T cells are imprinted with an exhausted phenotype and form lymphoid aggregates that can organize in ectopic lymphoid structures. Our work proposes immune-stromal interaction mechanisms promoting a self-sustained and non-resolving local immune response that extends beyond active viral infection and perpetuates tissue remodeling. JA 2023 feb en 2041-1723 10.1038/s41467-023-36333-2 Nature Communications 14 791 1 https://www.nature.com/articles/s41467-023-36333-2 Ronja Mothes Anna Pascual-Reguant Ralf Koehler Juliane Liebeskind Alina Liebheit Sandy Bauherr Lars Philipsen Carsten Dittmayer Michael Laue Regina Von Manitius Sefer Elezkurtaj Pawel Durek Frederik Heinrich Gitta A. Heinz Gabriela M. Guerra Benedikt Obermayer Jenny Meinhardt Jana Ihlow Josefine Radke Frank L. Heppner Philipp Enghard Helena Stockmann Tom Aschman Julia Schneider Victor M. Corman Leif E. Sander Mir-Farzin Mashreghi Thomas Conrad Andreas C. Hocke Raluca A. Niesner Helena Radbruch Anja E. Hauser article Tayebi2023_PMID38114729 Die Entwicklung robuster künstlicher Intelligenz (KI)-Modelle, die sich gut auf ungesehene Datensätze verallgemeinern, ist anspruchsvoll und erfordert in der Regel große und variable Datensätze, vorzugsweise von mehreren Institutionen. Im föderierten Lernen (FL) wird ein Modell kollaborativ an zahlreichen Standorten geschult, die lokale Datensätze halten, ohne sie auszutauschen. Bisher wurden die Auswirkungen der Trainingsstrategie, d.h. lokale Versus-kollaborative, auf die diagnostische On-Domain- und Off-Domain-Performance von KI-Modellen, die Brustradiographen interpretieren, nicht bewertet. Daher haben wir mit 610.000 Brust-Radiographen von fünf Institutionen auf der ganzen Welt diagnostische Leistung in Abhängigkeit von der Trainingsstrategie (d.h. lokale vs. kollaborative), Netzwerkarchitektur (d.h. convolutional vs. transformator-based), Single versus cross-institutional performance (d.h. on-domain vs. off-domain), Abbildungsfindung (i.etel, cardiomegaly, Große Datensätze zeigten nicht nur minimale Leistungszuwächse mit FL, sondern zeigten teilweise sogar Abnahmen. Im Gegensatz dazu zeigten kleinere Datensätze deutliche Verbesserungen. So wurde die On-Domain-Performance hauptsächlich von der Trainingsdatengröße angetrieben. Die Off-Domain-Performance lehnte sich jedoch mehr auf die Trainingsvielfalt ab. Als sie kollaborativ über verschiedene externe Institutionen geschult wurden, übertrafen AI-Modelle regelmäßig Modelle, die lokal für Off-Domain-Aufgaben geschult wurden und das Potenzial von FL für die Nutzung der Datenvielfalt betonten. Fazit: FL kann diagnostische Privatsphäre, Reproduzierbarkeit und Off-Domain-Verlässlichkeit von AI-Modellen stärken und potenziell Gesundheitsergebnisse optimieren. JA 2023 Dec 10.1038/s41598-023-49956-8 Scientific reports Tayebi Arasteh S Kuhl C Saehn MJ Isfort P Truhn D Nebelung S article Fuchs2023-es Nuclear imaging techniques such as positron emission tomography (PET) and single photon emission computed tomography (SPECT) in combination with computed tomography (CT) are established imaging modalities in clinical practice, particularly for oncological problems. Due to a multitude of manufacturers, different measurement protocols, local demographic or clinical workflow variations as well as various available reconstruction and analysis software, very heterogeneous datasets are generated. This review article examines the current state of interoperability and harmonisation of image data and related clinical data in the field of nuclear medicine. Various approaches and standards to improve data compatibility and integration are discussed. These include, for example, structured clinical history, standardisation of image acquisition and reconstruction as well as standardised preparation of image data for evaluation. Approaches to improve data acquisition, storage and analysis will be presented. Furthermore, approaches are presented to prepare the datasets in such a way that they become usable for projects applying artificial intelligence (AI) (machine learning, deep learning, etc.). This review article concludes with an outlook on future developments and trends related to AI in nuclear medicine, including a brief research of commercial solutions. JA 2023 en 10.1055/a-2187-5701 Nuklearmedizin 62 Georg Thieme Verlag KG

Stuttgart

389-398 6 Interoperability Harmonisation Image Data Clinical Data nuclear medicine NUM-DIZ http://dx.doi.org/10.1055/a-2187-5701 Timo Fuchs Lena Kaiser Dominik Müller Laszlo Papp Regina Fischer Johannes Tran-Gia article JA 2023 Poster KIT Kongress 2023, Leipzig K Tilch Sina Marie Hopff article Lange2023-fv PURPOSE: Despite the need to generate valid and reliable estimates of protection levels against SARS-CoV-2 infection and severe course of COVID-19 for the German population in summer 2022, there was a lack of systematically collected population-based data allowing for the assessment of the protection level in real time. METHODS: In the IMMUNEBRIDGE project, we harmonised data and biosamples for nine population-/hospital-based studies (total number of participants n = 33,637) to provide estimates for protection levels against SARS-CoV-2 infection and severe COVID-19 between June and November 2022. Based on evidence synthesis, we formed a combined endpoint of protection levels based on the number of self-reported infections/vaccinations in combination with nucleocapsid/spike antibody responses ("confirmed exposures"). Four confirmed exposures represented the highest protection level, and no exposure represented the lowest. RESULTS: Most participants were seropositive against the spike antigen; 37% of the participants $\geq$ 79 years had less than four confirmed exposures (highest level of protection) and 5% less than three. In the subgroup of participants with comorbidities, 46-56% had less than four confirmed exposures. We found major heterogeneity across federal states, with 4-28% of participants having less than three confirmed exposures. CONCLUSION: Using serological analyses, literature synthesis and infection dynamics during the survey period, we observed moderate to high levels of protection against severe COVID-19, whereas the protection against SARS-CoV-2 infection was low across all age groups. We found relevant protection gaps in the oldest age group and amongst individuals with comorbidities, indicating a need for additional protective measures in these groups. Ja 2023 aug en https://doi.org/10.1007/s15010-023-02071-2 Infection Humoral immunity; Neutralizing antibodies; SARS-CoV-2; Seroepidemiological studies Berit Lange Veronika K Jaeger Manuela Harries Viktoria R"ucker Hendrik Streeck Sabine Blaschke Astrid Petersmann Nicole Toepfner Matthias Nauck Max J Hassenstein Maren Dreier Isabell Holt Axel Budde Antonia Bartz Julia Ortmann Marc-André Kurosinski Reinhard Berner Max Borsche Gunnar Brandhorst Melanie Brinkmann Kathrin Budde Marek Deckena Geraldine Engels Marc Fenzlaff Christoph Härtel Olga Hovardovska Alexander Katalinic Katja Kehl Mirjam Kohls Stefan Krüger Wolfgang Lieb Kristin M Meyer-Schlinkmann Tobias Pischon Daniel Rosenkranz Nicole R"ubsamen Jan Rupp Christian Schäfer Mario Schattschneider Anne Schlegtendal Simon Schlinkert Lena Schmidbauer Kai Schulze-Wundling Stefan Störk Carsten Tiemann Henry V"olzke Theresa Winter Christine Klein Johannes Liese Folke Brinkmann Patrick F Ottensmeyer Jens-Peter Reese Peter Heuschmann André Karch article Scheithauer.2023 The SARS-CoV\hbox-2 pandemic has shown a~deficit of essential epidemiological infrastructure, especially with regard to genomic pathogen surveillance in Germany. In order to prepare for future pandemics, the authors consider it urgently necessary to remedy this existing deficit by establishing an efficient infrastructure for genomic pathogen surveillance. Such a network can build on structures, processes, and interactions that have already been initiated regionally and further optimize them. It will be able to respond to current and future challenges with a~high degree of adaptability.The aim of this paper is to address the urgency and to outline proposed measures for establishing an efficient, adaptable, and responsive genomic pathogen surveillance network, taking into account external framework conditions and internal standards. The proposed measures are based on global and country-specific best practices and strategy papers. Specific next steps to achieve an integrated genomic pathogen surveillance include linking epidemiological data with pathogen genomic data; sharing and coordinating existing resources; making surveillance data available to relevant decision-makers, the public health service, and the scientific community; and engaging all stakeholders. The establishment of a~genomic pathogen surveillance network is essential for the continuous, stable, active surveillance of the infection situation in Germany, both during pandemic phases and beyond. Die SARS-CoV-2-Pandemie hat ein Defizit an essentieller infektionsepidemiologischer Infrastruktur, insbesondere in Bezug auf die Genomische Erreger-Surveillance (GES) in Deutschland, gezeigt. Zur Vorbereitung auf zukünftige pandemische Notlagen sehen es die Autor*innen als dringend erforderlich an, dieses bestehende Defizit durch den Aufbau einer leistungsfähigen Infrastruktur für GES zu beheben. Ein derartiges Netzwerk kann auf bereits regional initiierten Strukturen, Prozessen und Interaktionen aufbauen und diese weiter optimieren. Es kann zukünftig mit einer hohen Anpassungsfähigkeit auf aktuelle und kommende Herausforderungen reagieren.Ziele der vorliegenden Arbeit sind die Verdeutlichung der Dringlichkeit und Skizzierung von Vorschlägen zur Etablierung eines effizienten, anpassungsfähigen und reaktionsbereiten GES-Netzwerkes unter Berücksichtigung von externen Rahmenbedingungen und internen Standards. Die erarbeiteten Vorschläge basieren auf der Grundlage globaler und länderspezifischer Best Practices und Strategiepapiere. Zu den konkreten nächsten Schritten zur Realisierung einer integrierten GES zählen die Ermöglichung der Verknüpfung epidemiologischer Daten mit Genomdaten der Erreger, die gemeinsame und koordinierte Nutzung von vorhandenen Ressourcen, die Nutzbarmachung der so gewonnenen Surveillance-Daten für relevante Entscheidungstragende, den Öffentlichen Gesundheitsdienst und die wissenschaftliche Gemeinschaft sowie die Einbindung aller Stakeholder. Der Aufbau eines GES-Netzwerkes ist essentiell für die kontinuierliche, stabile, aktive Überwachung des Infektionsgeschehens in Deutschland sowohl während pandemischer Phasen als auch außerhalb dieser. JA 2023 10.1007/s00103-023-03680-w Bundesgesundheitsblatt, Gesundheitsforschung, Gesundheitsschutz 66 443—449 4 Simone Scheithauer Alexander Dilthey Anna Bludau Sandra Ciesek Victor Corman Tjibbe Donker Tim Eckmanns Richard Egelkamp Hajo Grundmann Georg Häcker Martin Kaase Berit Lange Alexander Mellmann Martin Mielke Mathias Pletz Bernd Salzberger Andrea Thürmer Andreas Widmer Lothar H. Wieler Thorsten Wolff Sören Gatermann Torsten Semmler article Tilch2023-mj With the outbreak of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), global researchers were confronted with major challenges. The German National Pandemic Cohort Network (NAPKON) was launched in fall 2020 to effectively leverage resources and bundle research activities in the fight against the coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic. We analyzed the setup phase of NAPKON as an example for multicenter studies in Germany, highlighting challenges and optimization potential in connecting 59 university and nonuniversity study sites. We examined the ethics application process of 121 ethics submissions considering durations, annotations, and outcomes. Study site activation and recruitment processes were investigated and related to the incidence of SARS-CoV-2 infections. For all initial ethics applications, the median time to a positive ethics vote was less than two weeks and 30 of these study sites (65%) joined NAPKON within less than three weeks each. Electronic instead of postal ethics submission (9.5 days (Q1: 5.75, Q3: 17) vs. 14 days (Q1: 11, Q3: 26), p value = 0.01) and adoption of the primary ethics vote significantly accelerated the ethics application process. Each study center enrolled a median of 37 patients during the 14-month observation period, with large differences depending on the health sector. We found a positive correlation between recruitment performance and COVID-19 incidence as well as hospitalization incidence. Our analysis highlighted the challenges and opportunities of the federated system in Germany. Digital ethics application tools, adoption of a primary ethics vote and standardized formal requirements lead to harmonized and thus faster study initiation processes during a pandemic. 2023 oct en BMC Med. Ethics 24 84 1 COVID-19; Ethical approval; Ethics committee; Multicenter study; Pandemic preparedness; Study initiation Katharina Tilch Sina M Hopff Katharina S. Appel Monika Kraus Bettina Lorenz-Depiereux Lisa Pilgram Gabriele Anton Sarah Berger Ramsia Geisler Kirsten Haas Thomas Illig Dagmar Krefting Roberto Lorbeer Lazar Mitrov Maximilian Muenchhoff Matthias Nauck Christina Pley Jens-Peter Reese Siegbert Rieg Margarete Scherer Melanie Stecher Christoph Stellbrink Heike Valentin Christof Winter Martin Witzenrath Jörg Janne Vehreschild article Cao2023_PMID37373699 Ziel dieser Studie war es, die Leistung der ersten öffentlich verfügbaren automatisierten 3D-Segmentation für spontane intrazerebrale Blutung (ICH) basierend auf einem 3D-Neuralnetzwerk vor und nach der Umschulung zu bewerten. Wir haben eine unabhängige Validierung dieses Modells mit einem multizentrischen retrospektiven Kohort durchgeführt. Performance Metriken wurden mit dem Würfel-Score (DSC), Sensitivität und positiven Vorhersagewerten (PPV) bewertet. Wir haben das Originalmodell (OM) neu trainiert und die Performance über ein externes Validierungsdesign bewertet. Ein multivariate lineares Regressionsmodell wurde verwendet, um unabhängige Variablen zu identifizieren, die mit der Leistung des Modells verbunden sind. Durch Pearsons Korrelationskoeffizienten (r) bzw. Intra-Klasse-Korrelationskoeffizienten (ICC) wurden Vereinbarungen in volumetrischen Messungen und Segmentierungen bewertet. Bei 1040 Patienten hatte das OM einen Median DSC, Sensitivität und PPV von 0,84, 0,79 und 0,93, verglichen mit deneno f 0,83, 0,80 und 0,91 im retrainierten Modell (RM). Der Median DSC für infratentoriale ICH war jedoch relativ gering und nach Umschulung bei p < 0,001 signifikant verbessert. Die Vereinbarung zwischen volumetrischen Messungen (r > 0,90, p > 0,05) und Segmentierungen (ICC ≥ 0,9, p < 0,001) war ausgezeichnet. Das Modell zeigte eine gute Verallgemeinerung in einer externen Validierungskohorte. Ortsspezifische Varianzen verbesserte sich nach dem Rücktraining deutlich. Externe Validierung und Umschulung sind wichtige Schritte, um zu berücksichtigen, bevor Sie tiefe Lernmodelle in neuen klinischen Einstellungen anwenden. JA 2023 Jun 10.3390/jcm12124005 Journal of clinical medicine Cao H Mazzacane F Desser D Schlunk F Güttler C Kniep H Penzkofer T Fiehler J Hanning U Nawabi J article Schulze-Wundling2023-oi BACKGROUND: Early during the SARS-CoV-2 pandemic, national population-based seroprevalence surveys were conducted in some countries; however, this was not done in Germany. In particular, no seroprevalence surveys were planned for the summer of 2022. In the context of the IMMUNEBRIDGE project, the GUIDE study was carried out to estimate seroprevalence on the national and regional levels. METHODS: To obtain an overview of the population-wide immunity against SARS-CoV-2 among adults in Germany that would be as statistically robust as possible, serological tests were carried out using self-sampling dried blood spot cards in conjunction with surveys, one by telephone and one online. Blood samples were analyzed for the presence of antibodies to the S and N antigens of SARS-CoV-2. RESULTS: Among the 15 932 participants, antibodies to the S antigen were detected in 95.7%, and to the N antigen in 44.4%. In the higher-risk age groups of persons aged 65 and above and persons aged 80 and above, anti-S antibodies were found in 97,4% and 98.8%, respectively. Distinct regional differences in the distribution of anti-S and anti-N antibodies emerged. Immunity gaps were found both regionally and in particular subgroups of the population. High anti-N antibody levels were especially common in eastern German states, and high anti-S antibody levels in western German states. CONCLUSION: These findings indicate that a large percentage of the adult German population has formed antibodies against the SARS-CoV-2 virus. This will markedly lower the probability of an overburdening of the health care system by hospitalization and high occupancy of intensive care units due to future SARS-CoV-2 waves, depending on the viral characteristics of then prevailing variants. JA 2023 may en https://doi.org/10.3238/arztebl.m2023.0072 Dtsch. Arztebl. Int. 120 337—344 19 IMMUNEBRIDGE Kai Schulze-Wundling Patrick Frank Ottensmeyer Kristin Maria Meyer-Schlinkmann Marek Deckena Stefan Krüger Simon Schlinkert Axel Budde Dieter Münstermann Nicole Töpfner Astrid Petersmann Matthias Nauck André Karch Berit Lange Sabine Blaschke Carsten Tiemann Hendrik Streeck article Yusuf2023-tr INTRODUCTION: Contradiction is a relevant data quality indicator to evaluate the plausibility of interdependent health data items. However, while contradiction assessment is achieved using domain-established contradictory dependencies, recent studies have shown the necessity for additional requirements to reach conclusive contradiction findings. For example, the oral or rectal methods used in measuring the body temperature will influence the thresholds of fever definition. The availability of this required information as explicit data items must be guaranteed during study design. In this work, we investigate the impact of activities related to study database implementation on contradiction assessment from two perspectives including: 1) additionally required metadata and 2) implementation of checks within electronic case report forms to prevent contradictory data entries. METHODS: Relevant information (timestamps, measurement methods, units, and interdependency rules) required for contradiction checks are identified. Scores are assigned to these parameters and two different studies are evaluated based on the fulfillment of the requirements by two selected interdependent data item sets. RESULTS: None of the studies have fulfilled all requirements. While timestamps and measurement units are found, missing information about measurement methods may impede conclusive contradiction assessment. Implemented checks are only found if data are directly entered. DISCUSSION: Conclusive contradiction assessment typically requires metadata in the context of captured data items. Consideration during study design and implementation of data capture systems may support better data quality in studies and could be further adopted in primary health information systems to enhance clinical anamnestic documentation. JA 2023 sep en 10.3233/SHTI230707 Stud. Health Technol. Inform. 307 152—158 Data quality; contradictions; electronic data capture; metadata definition Khalid O Yusuf Irina Chaplinskaya-Sobol Anne Schoneberg Sabine Hanß Heike Valentin Bettina Lorenz-Depiereux Stefan Hansch Karin Fiedler Margarete Scherer Shimita Sikdar Olga Miljukov Jens-Peter Reese Patricia Wagner Isabel Bröhl Ramsia Geisler Jörg Janne Vehreschild Sabine Blaschke Carla Bellinghausen Milena Milovanovic Dagmar Krefting article Pappe2023-ol Introduction: Patients with chronic obstructive pulmonary disease (COPD) have an increased risk of acquiring severe coronavirus disease 2019 (COVID-19), which is why self-isolation was recommended. However, long periods of social isolation, accompanied by limited access to health care systems, might influence the outcome of patients with severe COPD negatively. Methods: Data from COPD and pneumonia patients at Charité-Universit"atsmedizin Berlin and the volume of endoscopic lung volume reduction (ELVR) surgeries from the German Lung Emphysema Registry (Lungenemphysem Register e.V.) were analyzed from pre-pandemic (2012 to 2019) to the pandemic period (2020 and 2021). In addition, 52 patients with COPD Global initiative for chronic Obstructive Lung Disease (GOLD) stage 4 status included in the lung emphysema registry received questionnaires during lockdowns from June 2020 to April 2021. Results: Admissions and ventilation therapies administered to COPD patients significantly decreased during the COVID-19 pandemic. Likewise, there was a reduction in ELVR treatments and follow-ups registered in German emphysema centers. Mortality was slightly higher among patients hospitalized with COPD during the pandemic. Increasing proportions of COPD patients with GOLD stage 3 and GOLD stage 4 status reported behavioral changes and subjective feelings of increasing COPD symptoms the longer the lockdown lasted. However, COPD symptom questionnaires revealed stable COPD symptoms over the pandemic time period. Summary: This study reveals reduced COPD admissions and elective treatment procedures of COPD patients during the pandemic, but a slight increase in mortality among patients hospitalized with COPD, irrespective of COVID-19. Correspondingly, patients with severe COPD reported subjective deterioration of their health status, probably caused by their very strict compliance with lockdown measures. JA 2023 jul en 10.15326/jcopdf.2022.0383 Chronic Obstr. Pulm. Dis. 10 COPD Foundation 211—223 3 COPD; COVID-19; endoscopic lung volume reduction; lockdown measures Eva Pappe Ralf Hammerich Jacopo Saccomanno Thomas Sgarbossa Anne Pohrt Bernd Schmidt Christian Grah Stephan Eisenmann Angelique Holland Stephan Eggeling Franz Stanzel Martin Witzenrath Ralf-Harto Hübner article granai_impact_2023 In critically ill SARS-CoV-2 infected patients, early leukocyte recruitment to the respiratory system was found to be orchestrated by leukocyte trafficking molecules accompanied by massive secretion of pro-inflammatory cytokines and hypercoagulability. Our study aimed to explore the interplay between leukocyte activation and pulmonary endothelium in different disease stages of fatal COVID-19. Our study comprised 10 COVID-19 post-mortem lung specimens and 20 control lung samples (5 ARDS, 2 viral pneumonia, 3 bacterial pneumonia, and 10 normal) which were stained for antigens representing the different steps of leucocyte migration: E-selectin, P-selectin, PSGL-1, ICAM1, VCAM1, and CD11b. Image analysis software QuPath was used for quantification of positive leukocytes (PSGL-1 and CD11b) and endothelium (E-selectin, P-selectin, ICAM1, VCAM1). Expression of IL-6 and IL-1ß was quantified by qRT-PCR. Expression of P-selectin and PSGL-1 was strongly increased in the COVID-19 cohort compared to all control groups (ratio =17,23, p\textless0,0001; ratio=2,75, p\textless0,0001 respectively). Importantly, P-selectin was found in endothelial cells and associated with aggregates of activated platelets adherent to the endothelial surface in COVID-19 cases. In addition, PSGL-1 staining disclosed positive perivascular leucocyte cuffs, reflecting capillaritis. Moreover, CD11b showed a strongly increased positivity in COVID-19 compared to all controls (ratio=2,89; p=0,0002), indicating a proinflammatory immune microenvironment. Of note, CD11b exhibited distinct staining patterns at different stages of COVID-19 disease. Only in cases with very short disease course, high levels of IL-1ß and IL-6 mRNA were observed in lung tissue. The striking upregulation of PSGL-1 and P-selectin reflects the activation of this receptor-ligand pair in COVID-19, increasing the efficiency of initial leucocyte recruitment, thus promoting tissue damage and immunothrombosis. Our results show that endothelial activation and unbalanced leukocyte migration play a central role in COVID-19 involving the P-selectin-PSGL-1 axis. 2023 may 0023-6837 10.1016/j.labinv.2023.100179 Laboratory Investigation; a Journal of Technical Methods and Pathology 100179 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10202465/ Massimo Granai Verena Warm Antonio Vogelsberg Jakob Milla Karen Greif Ulrich Vogel Tamam Bakchoul Peter Rosenberger Leticia Quintanilla-Martinez Christian Schürch Karin Klingel Falko Fend Hans Bösmüller article Liu2023-nn Myalgic Encephalomyelitis/ Chronic Fatigue syndrome (ME/CFS) is a complex, debilitating, long-term illness without a diagnostic biomarker. ME/CFS patients share overlapping symptoms with long COVID patients, an observation which has strengthened the infectious origin hypothesis of ME/CFS. However, the exact sequence of events leading to disease development is largely unknown for both clinical conditions. Here we show antibody response to herpesvirus dUTPases, particularly to that of Epstein-Barr virus (EBV) and HSV-1, increased circulating fibronectin (FN1) levels in serum and depletion of natural IgM against fibronectin ((n)IgM-FN1) are common factors for both severe ME/CFS and long COVID. We provide evidence for herpesvirus dUTPases-mediated alterations in host cell cytoskeleton, mitochondrial dysfunction and OXPHOS. Our data show altered active immune complexes, immunoglobulin-mediated mitochondrial fragmentation as well as adaptive IgM production in ME/CFS patients. Our findings provide mechanistic insight into both ME/CFS and long COVID development. Finding of increased circulating FN1 and depletion of (n)IgM-FN1 as a biomarker for the severity of both ME/CFS and long COVID has an immediate implication in diagnostics and development of treatment modalities. JA 2023 jun en 10.1101/2023.06.23.23291827 37425897 medRxiv Online ahead of print (n)IgM; EBV; Fibronectin; HHV-6; HSV-1; ME/CFS; dUTPase; long COVID Zheng Liu Claudia Hollmann Sharada Kalanidhi Arnhild Grothey Sam Keating Irene Mena-Palomo Stephanie Lamer Andreas Schlosser Agnes Kaiping Carsten Scheller Franzeska Sotzny Anna Horn Carolin Nürnberger Vladimir Cejka Thomas Bahmer Stefan Schreiber Jörg Janne Vehreschild Olga Miljukov Christian Schäfer Luzie Kretzler Thomas Keil Jens-Peter Reese Felizitas A Eichner Lena Schmidbauer Peter U Heuschmann Stefan Störk Caroline Morbach Gabriela Riemekasten Niklas Beyersdorf Carmen Scheibenbogen Robert K Naviaux Marshall Williams Maria E Ariza Bhupesh K Prusty article Kolck2023_PMID37421448 SARS-CoV-2 Virusinfektion kann zu akutem Atemnotsyndrom (ARDS) führen, das durch schwere Muskelverschwendung kompliziert sein kann. Bisher sind Daten über den Muskelverlust von kritisch kranken COVID-19-Patienten begrenzt, während berechnete Tomographie (CT)-Scans für klinische Nachfolge verfügbar sind. Wir wollten die Parameter der Muskelverschwendung bei diesen Patienten untersuchen, indem wir als erstes die klinische Anwendung der Körperzusammensetzungsanalyse (BCA) als intermittierendes Monitoring-Tool testen. BCA wurde an 54 Patienten durchgeführt, mit mindestens drei Messungen während der Hospitalisierung, insgesamt 239 Bewertungen. Veränderungen der psoas- (PMA) und der gesamten Bauchmuskelfläche (TAMA) wurden durch lineare Mischmodellanalyse bewertet. PMA wurde als relativer Muskelverlust pro Tag für die gesamte Überwachungsperiode sowie für das Intervall zwischen jedem aufeinanderfolgenden Scan berechnet. Cox-Regression wurde angewendet, um Assoziationen mit Überleben zu analysieren. Die Receiver-Betriebskennlinie (ROC)-Analyse und Youden-Index wurden verwendet, um einen Abkling-Ausschnitt zu definieren. Intermittent BCA ergab deutlich höhere langfristige PMA-Verlustraten von 2,62% (vs. 1.16%, p < 0.001) und maximale Muskelverfall von 5.48% (vs. 3.66%, p = 0.039) pro Tag in Nicht-Überlebenden. Die erste verfügbare Abklingrate unterscheidet sich nicht wesentlich zwischen Überlebensgruppen, zeigte jedoch signifikante Überlebensvereinigungen in der Cox-Regression (p = 0,011). In der ROC-Analyse hatte PMA-Verlust im Durchschnitt über den Aufenthalt die größte diskriminierende Macht (AUC = 0,777) für das Überleben. Ein langfristiger PMA-Abfall pro Tag von 1,84% wurde als Schwelle definiert; Muskelverlust jenseits dieser Absenkung erwies sich als ein signifikanter BCA-abgeleiteter Prädiktor der Sterblichkeit. Muskelverschwendung bei kritisch kranken COVID-19-Patienten ist schwer und korreliert mit Überleben. Intermittierende BCA aus klinisch angezeigten CT-Scans erwies sich als wertvolles Monitoring-Tool, das die Identifizierung von Personen mit Risiko für negative Ergebnisse ermöglicht und großes Potenzial hat, kritische Pflegeentscheidungen zu unterstützen. JA 2023 Jul 10.1186/s13613-023-01162-5 Annals of intensive care Kolck J Rako ZA Beetz NL Auer TA Segger LK Pille C Penzkofer T Fehrenbach U Geisel D article Lichtner2023-eg Background: The COVID-19 pandemic has spurred large-scale, interinstitutional research efforts. To enable these efforts, researchers must agree on data set definitions that not only cover all elements relevant to the respective medical specialty but also are syntactically and semantically interoperable. Therefore, the German Corona Consensus (GECCO) data set was developed as a harmonized, interoperable collection of the most relevant data elements for COVID-19-related patient research. As the GECCO data set is a compact core data set comprising data across all medical fields, the focused research within particular medical domains demands the definition of extension modules that include data elements that are the most relevant to the research performed in those individual medical specialties. Objective: We aimed to (1) specify a workflow for the development of interoperable data set definitions that involves close collaboration between medical experts and information scientists and (2) apply the workflow to develop data set definitions that include data elements that are the most relevant to COVID-19-related patient research regarding immunization, pediatrics, and cardiology. Methods: We developed a workflow to create data set definitions that were (1) content-wise as relevant as possible to a specific field of study and (2) universally usable across computer systems, institutions, and countries (ie, interoperable). We then gathered medical experts from 3 specialties-infectious diseases (with a focus on immunization), pediatrics, and cardiology-to select data elements that were the most relevant to COVID-19-related patient research in the respective specialty. We mapped the data elements to international standardized vocabularies and created data exchange specifications, using Health Level Seven International (HL7) Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR). All steps were performed in close interdisciplinary collaboration with medical domain experts and medical information specialists. Profiles and vocabulary mappings were syntactically and semantically validated in a 2-stage process. Results: We created GECCO extension modules for the immunization, pediatrics, and cardiology domains according to pandemic-related requests. The data elements included in each module were selected, according to the developed consensus-based workflow, by medical experts from these specialties to ensure that the contents aligned with their research needs. We defined data set specifications for 48 immunization, 150 pediatrics, and 52 cardiology data elements that complement the GECCO core data set. We created and published implementation guides, example implementations, and data set annotations for each extension module. Conclusions: The GECCO extension modules, which contain data elements that are the most relevant to COVID-19-related patient research on infectious diseases (with a focus on immunization), pediatrics, and cardiology, were defined in an interdisciplinary, iterative, consensus-based workflow that may serve as a blueprint for developing further data set definitions. The GECCO extension modules provide standardized and harmonized definitions of specialty-related data sets that can help enable interinstitutional and cross-country COVID-19 research in these specialties. JA 2023 jul en 10.2196/45496 37490312 JMIR Med. Inform. 11 e45496 COVID-19; FAIR principle; FHIR; Fast Healthcare Interoperability Resources; SARS-CoV-2; cardiology; immunization; interoperability; interoperable; pediatric; research data set; standard Gregor Lichtner Thomas Haese Sally Brose Larissa Röhrig Liudmila Lysyakova Stefanie Rudolph Maria Uebe Julian Sass Alexander Bartschke David Hillus Florian Kurth Leif Erik Sander Falk Eckart Nicole Toepfner Reinhard Berner Anna Frey Marcus Dörr Jörg Janne Vehreschild Christof Kalle Sylvia Thun article JA 2023 Poster KIT Kongress 2023, Leipzig Shimita Sikdar article Dadras2023_PMID38247898 Lung Lobe Segmentierung in der Brust CT ist für eine breite Palette von klinischen Anwendungen relevant. Jedoch weisen bestehende Segmentierungspipelines bei Verwendung von externen Datensätzen oft Schwachstellen und Performance-Degradationen auf. Dies wird in der Regel auf die Größe des verfügbaren Datensatzes oder Modells zurückgeführt. Wir zeigen, dass es möglich ist, die Verallgemeinerbarkeit ohne große Ressourcen zu verbessern, indem wir den Datensatz sorgfältig kurieren und maschinelles Lernen mit medizinischer Expertise kombinieren. Mehrere maschinelle Lerntechniken (SSL), Aufmerksamkeit (A) und Daten-Augmentation (DA)) werden verwendet, um ein schnelles und vollautomatisiertes Lungen-Lobe-Segmentationsmodell basierend auf 2D U-Net zu trainieren. Unsere Studie untersuchte diese Techniken auf einem vielfältigen Datensatz, der unter dem RACOON-Projekt gesammelt wurde, und umfasste 100 CT-Brustscans von Patienten mit bakteriellen, viralen oder SARS-CoV2-Infektionen. Wir vergleichen unser Modell mit einem auf demselben Datensatz ausgebildeten Basis-U-Net. Unser Ansatz hat die Segmentierungsgenauigkeit deutlich verbessert (Score von 92,8% gegenüber 82,3%, p>/i> < 0,001). Darüber hinaus erreichte unser Modell eine hochmoderne Performance (Dice-Score von 92,8% gegenüber 90,8% für die hochmoderne Literatur, p = 0,102) mit reduzierten Trainingsbeispielen (69 vs. 231 CT Scans). Unter den Techniken zeigten die Datenvergrößerung mit Expertenwissen die signifikantesten Auswirkungen, was die Dice-Score um +0.056 steigerte. Insbesondere sind diese Verbesserungen nicht auf die Lobe-Segmentierung beschränkt, sondern können nahtlos in verschiedene medizinische Bildgebungssegmentierungsaufgaben integriert werden, was ihre Vielseitigkeit und ihr Potenzial für breitere Anwendungen zeigt. JA 2023 Dec 10.3390/bioengineering11010021 Bioengineering (Basel, Switzerland) Frodl E Vogl TJ Dietz J article Khader2023_PMID37393383 Bei der Beurteilung der Prognose von Patienten in der Intensivpflege berücksichtigen sie bildgebende und nicht bildgebende Daten. Im Gegensatz dazu verlassen sich viele traditionelle maschinelle Lernmodelle nur auf eine dieser Modalitäten und begrenzen ihr Potenzial in medizinischen Anwendungen. Diese Arbeit schlägt vor und wertet ein transformatorbasiertes neuronales Netzwerk als neuartige AI-Architektur aus, die multimodale Patientendaten, d.h. Abbildungsdaten (chest radiographs) und nicht-imaging-Daten (klinische Daten) integriert. Wir bewerten die Leistung unseres Modells in einer retrospektiven Studie mit 6,125 Patienten in intensiver Pflege. Wir zeigen, dass das kombinierte Modell (Fläche unter der Empfänger-Betriebskennlinie [AUROC] von 0,863) dem Radiographen-only-Modell (AUROC = 0,811, p < 0,001) und dem klinischen Daten-only-Modell (AUROC = 0,785, p < 0,001) überlegen ist, wenn es mit der Vorhersage von In-hospital-Überleben pro Patient betraut wird. Darüber hinaus zeigen wir, dass unser vorgeschlagenes Modell robust ist, wenn nicht alle (klinischen) Datenpunkte zur Verfügung stehen. JA 2023 Jul 10.1038/s41598-023-37835-1 Scientific reports Khader F Kather JN Müller-Franzes G Wang T Han T Tayebi Arasteh S Hamesch K Bressem K Haarburger C Stegmaier J Kuhl C Nebelung S Truhn D article Baumgärtner2023_PMID37453274 Das zunehmende Volumen an medizinischen Bildgebungsdaten und das Interesse an Big Data Forschung bringt Herausforderungen an die Datenorganisation, Kategorisierung und Retrieval. Obwohl die radiologische Wertschöpfungskette fast vollständig digital ist, wurde die Datenstrukturierung pragmatisch weit verbreitet, aber mit unzureichenden Namens- und Metadatenstandards für die strengen Bedürfnisse der Bildanalyse. Um das automatisierte Datenmanagement unabhängig von der Benennung und Metadaten zu ermöglichen, konzentrierte sich diese Studie auf die Entwicklung eines konvolutionalen neuronalen Netzwerks (CNN), das medizinische Bilder auf Basis von Voxel-Daten klassifiziert. Ein 3D CNN (3D-ResNet18) wurde mit einem Datensatz von 31,602 Prostata-MRT-Volumen mit 10 verschiedenen Sequenztypen von 1243 Patienten trainiert. Für Schulungen und Tests wurde ein fünffacher Cross-Validation-Ansatz mit patientenbasierten Splits gewählt. Die Ausbildung wurde wiederholt mit einer allmählichen Verringerung der Ausbildungsdaten, die Klassifizierungsgenauigkeiten bewerten, um die für eine ausreichende Leistung erforderlichen Mindestausbildungsdaten zu ermitteln. Das ausgebildete Modell und entwickelte Verfahren wurden an drei externen Datensätzen getestet. Das Modell erreichte eine Gesamtgenauigkeit von 99,88 % ± 0,13 % bei der Klassifizierung typischer Prostata-MRT-Sequenzentypen. Bei der Ausbildung mit etwa 10 % der ursprünglichen Kohorte (112 Patienten) erreichte die CNN noch eine Genauigkeit von 97,43 % ± 2,10 %. Bei externen Tests erreichte das Modell Empfindlichkeiten von > 90 % für 10/15 getestete Sequenztypen. Die hier entwickelte CNN ermöglichte eine automatische und zuverlässige Sequenzidentifikation in der Prostata MRI. Letztendlich könnten solche CNN-Modelle zur voxelbasierten Sequenzidentifizierung das Management von medizinischen Bildgebungsdaten wesentlich verbessern, die Workflow-Effizienz und Datenqualität verbessern und robuste klinische AI-Workflows ermöglichen. JA 2023 Sep 10.1016/j.ejrad.2023.110964 European journal of radiology Baumgärtner GL Hamm CA Schulze-Weddige S Ruppel R Beetz NL Rudolph M Dräger F Froböse KP Posch H Lenk J Biessmann F Penzkofer T article azeke_minimally_2023 In the past years the number of hospital autopsies have declined steadily, becoming almost excluded from medical training. Medicolegal (forensic) autopsies account for almost all autopsies, whereas hospital autopsies are becoming increasingly rare. Minimally invasive tissue sampling (MITS) using post mortem ultrasound offers the opportunity to increase the number of post mortem examinations in a clinical and even forensic context. MITS is a needle-based post mortem procedure that uses (radiological) imaging techniques to examine major organs of the body, acquire tissue samples and aspirate fluid from the body cavities or hollow organs. In this study, MITS was used to determine the presence of other co-existing diseases in a deceased infected 97-year-old woman with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2. The examination of her body was carried out using ultrasound as an imaging tool and to gather ultrasound-guided biopsies as conventional autopsy was rejected by the next of kin. Ultrasound and histology identified an intravesical mass leading to an obstruction of the urinary outlet resulting in bilateral hydronephrosis and purulent pyelonephritis, which was unknown during her lifetime. Histopathological examination revealed the tumor mass to be a squamous cell carcinoma. This study has shown that MITS can be used to determine the cause of death and the presence of concomitant diseases in the infectious deceased. JA 2023 aug eng 2075-4418 10.3390/diagnostics13162643 Diagnostics (Basel, Switzerland) 13 2643 16 COVID-19, conventional autopsy, forensic pathology, histopathology, minimal invasive tissue sampling (MITS), post mortem, ultrasound https://doi.org/10.3390%2Fdiagnostics13162643 Akhator Terence Azeke Julia Schädler Benjamin Ondruschka Stefan Steurer Dustin Möbius Antonia Fitzek article Kottlors2023_PMID36819239 Die Diagnose einer Coronavirus-Krankheit 2019 (COVID-19)-Infektion mit hoher Spezifität in der Brust-Computertomographie (CT)-Bildgebung wird aufgrund von markanten Abbildungsmerkmalen der COVID-19-Pneumonie als möglich angesehen. Da andere virale nicht-COVID-Pneumonie meist ein anderes Verteilungsmuster zeigen, ist es sinnvoll, davon auszugehen, dass die durch das neuartige schwere akute Atemsyndrom Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) beobachteten Muster eine Folge ihrer genetisch kodierten molekularen Eigenschaften bei der Interaktion mit dem Atemgewebe sind. Da im Laufe von 2021 mehr Mutationen des anfänglichen SARS-CoV-2 Wildtyps mit unterschiedlicher Aggressivität nachgewiesen wurden, wurde deutlich, dass sein Genom in einem Transformationszustand ist und somit eine mögliche Modifikation des spezifischen morphologischen Erscheinungsbildes in CT auftreten kann. Ziel dieser Studie war es, die morphologischen Unterschiede der SARS-CoV-2-B.1.1.7 Mutation und Wildtypvariante in CT-Scans des Thorax quantitativ zu analysieren. Wir analysierten einen Datensatz von 140 Patienten, der in Pneumonien unterteilt wurde, die durch n=40 Wildtypvarianten, n=40 B.1.1.7 Varianten, n=20 Bakterienpneumonien, n=20 virale (non-COVID) Pneumonien und eine Testgruppe von n=20 unremarkable CT-Untersuchungen des Thorax verursacht wurden. Zur Quantifizierung der Lungenwege wurde eine semiautomatisierte 3D-Segmentierung des Lungengewebes durchgeführt. Das Ausmaß, das Verhältnis und die spezifische Verteilung des entzündlich betroffenen Lungengewebes in jeder Gruppe wurden in einer multivariaten Gruppenanalyse verglichen. Die Lung-Segmentierung ergab einen signifikanten Unterschied zwischen dem Ausmaß der Bodenglasundurchlässigkeiten (GGO) oder dem Konsolidierungsvergleich von SARS-CoV-2 Wildtyp und B.1.1.7 Variante. Wildtyp und B.1.1.7 Variante zeigten sowohl ein symmetrisches Verteilungsmuster stufenabhängiger GGO als auch eine Konsolidierung in aufeinander abgestimmten COVID-19-Stufen. Virale nicht-COVID Pneumonien hatten deutlich weniger Konsolidierungen als die Bakterien, aber auch als die COVID-19 B.1.1.7 Variantengruppen. Die CT-basierte Segmentierung zeigte keinen signifikanten Unterschied zwischen dem morphologischen Erscheinungsbild der COVID-19 Wildtyp-Variante und der SARS-CoV-2 B.1.1.7 Mutation. Unser Ansatz erlaubte jedoch eine halbautomatische Quantifizierung von bakteriellen und viralen Lungenerkrankungen. Quantitative CT-Bildanalysen, wie die vorgestellte, scheinen eine wichtige Komponente der Pandemievorbereitung in Anbetracht eines Organismus mit anhaltender genetischer Veränderung zu sein, um eine potenziell auftretende Veränderung des CT-morphologischen Erscheinungsbildes möglicher neuer ankommender COVID-19-Varianten zu beschreiben. JA 2023 Feb 10.21037/qims-22-718 Quantitative imaging in medicine and surgery Kottlors J Fervers P Geißen S Gertz RJ Bremm J Rinneburger M Weisthoff M Shahzad R Maintz D Persigehl T article heinrich_new_2023 We performed autopsies on persons in Germany who died from COVID-19 and observed higher nasopharyngeal SARS-CoV-2 viral loads for variants of concern (VOC) compared with non-VOC lineages. Pulmonary inflammation and damage appeared higher in non-VOC than VOC lineages until adjusted for vaccination status, suggesting COVID-19 vaccination may mitigate pulmonary damage. 2023 mar eng 1080-6059 10.3201/eid2903.221297 Emerging Infectious Diseases 29 652—656 3 Alpha variant, Autopsy, B.1.1.529, B.1.1.7, B.1.617.2, COVID-19, COVID-19 Vaccines, Delta variant, Germany, Humans, Omicron variant, SARS, SARS-CoV-2, VOC, coronavirus, coronavirus disease, organ tropism, pulmonary damage, respiratory infections, severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, variants of concern, viral load, viruses, zoonoses Fabian Heinrich Tobias Huter Sophie Mertens Philine Lange Jessica Vering Axel Heinemann Dominik Sebastian Nörz Armin Hoffmann Benjamin Ondruschka Susanne Krasemann Marc Lütgehetmann article Nawabi2023_PMID37212845 Nicht kontrastreich berechnete Tomographie (NCCT) Marker sind robuste Prädiktoren der parenchymalen Hämatomenausweitung in der intracerebralen Blutung (ICH). Wir untersuchten, ob NCCT-Funktionen auch ICH-Patienten identifizieren können, die mit dem Risiko eines intraventrikulären Hämorrhage-Wachstums (IVH) rechnen können. Patienten mit akuter spontaner ICH in vier Tertiärzentren in Deutschland und Italien wurden von Januar 2017 bis Juni 2020 rückwirkend aufgenommen. NCCT-Marker wurden von zwei Ermittlern für heterogene Dichte, Hypodensität, schwarzes Lochzeichen, Drallzeichen, Blendzeichen, Flüssigkeitsspiegel, Inselschild, Satellitenzeichen und unregelmäßige Form bewertet. ICH- und IVH-Volumen wurden halbmanuell segmentiert. IVH-Wachstum wurde definiert als IVH-Erweiterung > 1 mL (eIVH) oder jede verzögerte IVH (dIVH) bei der Nachbildung. Predictors von eIVH und dIVH wurden mit multivariabler logistischer Regression erforscht. Hypothesize Moderatoren und Mediatoren wurden in PROCESS-Makromodellen unabhängig bewertet. Insgesamt wurden 731 Patienten aufgenommen, von denen 185 (25,31%) unter IVH-Wachstum litten, 130 (17,78%) eIVH und 55 (7,52%) dIVH. Unregelmäßige Form wurde mit IVH-Wachstum (OR 1.68; 95%CI [1.16-2.44]; p = 0,006) signifikant verbunden. Bei der durch den IVH-Wachstumstyp gestreuten Untergruppenanalyse wurden Hypodensitäten signifikant mit eIVH (OR 2.06; 95%CI [1.48-2.64]; p = 0.015) verbunden, während unregelmäßige Form (OR 2.72; 95%CI [1.91-3.53]; p = 0.016) in dIVH. Der Zusammenhang zwischen NCCT-Markern und IVH-Wachstum wurde nicht durch parenchymale Hämatom-Erweiterung vermittelt. NCCT-Funktionen identifizierten ICH-Patienten mit einem hohen Risiko von IVH-Wachstum. Unsere Ergebnisse schlagen die Möglichkeit vor, das Risiko von IVH-Wachstum mit Basis-NCCT zu verlagern und laufende und zukünftige Studien zu informieren. Nicht kontrastreiche CT-Funktionen identifizierten ICH-Patienten bei einem hohen Risiko des intraventrikulären Hämorrhagewachstums mit subtypspezifischen Unterschieden. Unsere Ergebnisse können bei der Risikoschichtung des intraventrikulären Hämorrhage-Wachstums mit Basis-CT helfen und möglicherweise laufende und zukünftige klinische Studien informieren. • NCCT-Funktionen identifizierten ICH-Patienten mit hohem Risiko des IVH-Wachstums mit subtypspezifischen Unterschieden. • Die Wirkung von NCCT-Features wurde nicht von Zeit und Ort moderiert oder indirekt durch die Hämatom-Erweiterung vermittelt. • Unsere Ergebnisse können bei der Risikoschichtung des IVH-Wachstums mit Basis-NCCT helfen und laufende und zukünftige Studien informieren. JA 2023 Nov 10.1007/s00330-023-09707-9 European radiology Nawabi J Schlunk F Elsayed S Mazzacane F Desser D Vu L Vogt E Cao H Böhmer MFH Akkurt BH Sporns PB Pasi M Jensen-Kondering U Broocks G Penzkofer T Fiehler J Hanning U article JA 2023 Poster NAPKON Vention 2023, Frankfurt Lena Schmidbauer Carolin Nürnberger Cornelia Fiessler Katrin Franzpötter J Haug F Haug A Hermes Steffi Jiru-Hillmann Olga Miljukov Anne-Kathrin Ruß Jörg J Vehreschild Michael Krawczak Martin Witzenrath W. Lieb S Schmidt JP Reese Peter Heuschmann C Bauer article JA 2023 Poster DGEpi 2023, Würzburg L Schmidbauer Carolin Nürnberger Cornelia Fiessler Katrin Franzpötter F Haug J Haug A Hermes Steffi Jiru-Hillmann K Günther Olga Miljukov Anne-Kathrin Ruß Jörg Janne Vehreschild Michael Krawczak Martin Witzenrath W. Lieb M Rose S Schmidt Wolfgang Hoffmann J Schmitt P. Ihle Jens-Peter Reese Peter U Heuschmann article Hoffmann.2023 The SARS-CoV-2 Omicron subvariants BA.1 and BA.2 exhibit reduced lung cell infection relative to previously circulating SARS-CoV-2 variants, which may account for their reduced pathogenicity. However, it is unclear whether lung cell infection by BA.5, which displaced these variants, remains attenuated. Here, we show that the spike (S) protein of BA.5 exhibits increased cleavage at the S1/S2 site and drives cell-cell fusion and lung cell entry with higher efficiency than its counterparts from BA.1 and BA.2. Increased lung cell entry depends on mutation H69\textgreekD/V70\textgreekD and is associated with efficient replication of BA.5 in cultured lung cells. Further, BA.5 replicates in the lungs of female Balb/c mice and the nasal cavity of female ferrets with much higher efficiency than BA.1. These results suggest that BA.5 has acquired the ability to efficiently infect lung cells, a prerequisite for causing severe disease, suggesting that evolution of Omicron subvariants can result in partial loss of attenuation. JA 2023 10.1038/s41467-023-39147-4 Nature communications 14 3500 1 Markus Hoffmann Lok-Yin Roy Wong Prerna Arora Lu Zhang Cheila Rocha Abby Odle Inga Nehlmeier Amy Kempf Anja Richter Nico Joel Halwe Jacob Schön Lorenz Ulrich Donata Hoffmann Martin Beer Christian Drosten Stanley Perlman Stefan Pöhlmann article Shi2023-ge PURPOSE: We aimed to assess symptoms in patients after SARS-CoV-2 infection and to identify factors predicting prolonged time to symptom-free. METHODS: COVIDOM/NAPKON-POP is a population-based prospective cohort of adults whose first on-site visits were scheduled $\geq$ 6 months after a positive SARS-CoV-2 PCR test. Retrospective data including self-reported symptoms and time to symptom-free were collected during the survey before a site visit. In the survival analyses, being symptom-free served as the event and time to be symptom-free as the time variable. Data were visualized with Kaplan-Meier curves, differences were tested with log-rank tests. A stratified Cox proportional hazard model was used to estimate adjusted hazard ratios (aHRs) of predictors, with aHR < 1 indicating a longer time to symptom-free. RESULTS: Of 1175 symptomatic participants included in the present analysis, 636 (54.1%) reported persistent symptoms after 280 days (SD 68) post infection. 25% of participants were free from symptoms after 18 days [quartiles: 14, 21]. Factors associated with prolonged time to symptom-free were age 49-59 years compared to < 49 years (aHR 0.70, 95% CI 0.56-0.87), female sex (aHR 0.78, 95% CI 0.65-0.93), lower educational level (aHR 0.77, 95% CI 0.64-0.93), living with a partner (aHR 0.81, 95% CI 0.66-0.99), low resilience (aHR 0.65, 95% CI 0.47-0.90), steroid treatment (aHR 0.22, 95% CI 0.05-0.90) and no medication (aHR 0.74, 95% CI 0.62-0.89) during acute infection. CONCLUSION: In the studied population, COVID-19 symptoms had resolved in one-quarter of participants within 18 days, and in 34.5% within 28 days. Over half of the participants reported COVID-19-related symptoms 9 months after infection. Symptom persistence was predominantly determined by participant's characteristics that are difficult to modify. JA 2023 may en 10.1007/s15010-023-02043-6 37231313 Infection 51 1679–1694 6 COVID-19; Long COVID; Post-COVID syndrome; Risk factors; Time to symptom-free Yanyan Shi Ralf Strobl Christian Apfelbacher Thomas Bahmer Ramsia Geisler Peter Heuschmann Anna Horn Hanno Hoven Thomas Keil Michael Krawczak Lilian Krist Christina Lemhöfer Wolfgang Lieb Bettina Lorenz-Depiereux Rafael Mikolajczyk Felipe A Montellano Jens Peter Reese Stefan Schreiber Nicole Skoetz Stefan Störk Jörg Janne Vehreschild Martin Witzenrath Eva Grill NAPKON Study Group article Winkelmann2023-nj BACKGROUND: Chemosensory dysfunction (CD) has been reported as a common symptom of SARS-CoV-2 infection, but it is not well understood whether and for how long changes of smell, taste and chemesthesis persist in infected individuals. METHODOLOGY: Unselected adult residents of the German federal state of Schleswig-Holstein with Polymerase Chain Reaction (PCR)-test-confirmed SARS-CoV-2 infection were invited to participate in this large cross-sectional study. Data on the medical history and subjective chemosensory function of participants were obtained through questionnaires and visual analogue scales (VAS). Olfactory function (OF) was objectified with the Sniffin Sticks test (SST), including threshold (T), discrimination (D) and identification (I) test as well as summarized TDI score, and compared to that in healthy controls. Gustatory function (GF) was evaluated with the suprathreshold taste strips (TS) test, and trigeminal function was tested with an ampoule containing ammonia. RESULTS: Between November 2020 and June 2021, 667 infected individuals (mean age: 48.2 years) were examined 9.1 months, on average, after positive PCR testing. Of these, 45.6% had persisting subjective olfactory dysfunction (OD), 36.2% had subjective gustatory dysfunction (GD). Tested OD, tested GD and impaired trigeminal function were observed in 34.6%, 7.3% and 1.8% of participants, respectively. The mean TDI score of participants was significantly lower compared to healthy subjects. Significant associations were observed between subjective OD and GD, and between tested OD and GD. CONCLUSION: Nine months after SARS-CoV-2 infection, OD prevalence is significantly increased among infected members of the general population. Therefore, OD should be included in the list of symptoms collectively defining Long-COVID. JA 2023 feb en 10.4193/Rhin22.176 Rhinology 61 Stichting Nase 12—23 1 S Winkelmann A Korth B Voss M A Nasr N Behrend A Pudszuhn V M Hofmann P Schendzielorz C Maetzler A Hermes C Borzikowsky T Bahmer W Lieb S Schreiber S Störk F A Montellano M Witzenrath T Keil M Krawczak M Laudien On Behalf Of The Napkon Study Group article Fervers2023_PMID37274340 Die Jodaufnahme des Knochenmarks im dualen energetischen CT (DECT) ist bei maligner Krankheit erhöht. Wir wollten nach intravenöser Kontrastanwendung den physiologischen Bereich der Knochenmark-Iodaufnahme untersuchen und die Abhängigkeit von vBMD, Jod-Blutpool, Patientenalter und Sex untersuchen. Retrospektive Analyse von onkologischen Patienten ohne Nachweis der metastasierenden Erkrankung. DECT-Untersuchungen wurden an einem Spektraldetektor CT-Scanner in Portal venöser Kontrastphase durchgeführt. Die Thorax- und Lendenwirbelsäule wurden durch ein vortrainiertes neuronales Netz segmentiert, wobei volumetrische Jodkonzentrationsdaten erhalten wurden [mg/ml]. vBMD wurde mit einer phantomlosen, CE-zertifizierten Software [mg/cm3] bewertet. Der Jod-Blutpool wurde durch ROI-basierte Messungen in den großen Bauchgefäßen geschätzt. Ein multivariates Regressionsmodell passte zur abhängigen Variablen "medianen Knochenmark-Iodaufnahme". Zur Beurteilung der Auswirkungen jedes Kovariats wurden standardisierte Regressionskoeffizienten (β) berechnet. 678 aufeinanderfolgende DECT-Prüfungen von 189 Personen (93 weiblich, Alter 61.4 ± 16.0 Jahre) wurden bewertet. KI-basierte Segmentierung lieferte Volumendaten von 97,9 % der eingeschlossenen Wirbel (n=11,286). Die 95^th-prozentile Knochenmark-Iodaufnahme, als Surrogat für den oberen Rand der physiologischen Verteilung, lag zwischen 4,7-6,4 mg/ml vBMD (p <0.001, mittlere β=0,50) und Portalven-Iod-Blutpool (p <0.001, mittlere β=0,43) vermittelte den stärksten Einfluss. Darauf aufbauend wurden angepasste Referenzwerte berechnet. Die Knochenmark-Iodaufnahme zeigt ein deutliches Profil je nach vBMD, Jod-Blutpool, Patientenalter und Sex. Diese Studie ist die erste, die die angepassten Referenzwerte liefert. JA 2023 10.3389/fendo.2023.1098898 Frontiers in endocrinology Fervers P Fervers F Rinneburger M Weisthoff M Kottlors J Reimer R Zopfs D Celik E Maintz D Große-Hokamp N Persigehl T article Surov2023_PMID35667979 Um die Auswirkungen der niedrigen Skelettmuskelmasse bei Patienten mit COVID-19 auf relevante Ergebnisse wie 30-Tage-Sterblichkeit zu bewerten, müssen Intubation und intensiver Pflegeeinheit Zulassung erforderlich sein. Für diese Studie wurden Daten aus sechs Zentren erworben. Die gewonnene Probe umfasst 1138 Patienten. Es gab 547 Frauen (48,1%) und 591 Männer (51.9%) mit einem mittleren Alter von 54.5 ± 18,8 Jahre; mittleres Alter, 55 Jahre; Reichweite, 18-84 Jahre). In jedem Fall wurde thoracic CT ohne intravenöse Applikation von Kontrastmittel durchgeführt. Die folgenden Parameter der Pectoralis-Muskeln wurden geschätzt: Muskelfläche als Summe der bilateralen Bereiche der pectoralis großen und kleineren Muskeln, Muskeldichte, Muskelindex (PMI) (Pectoralis-Muskelbereich geteilt durch den Körperhöhenwinkel des Patienten) als Verhältnis pectoralis großen und kleinen Muskeln geteilt durch die Körperhöhe des Patienten ≥2, und Muskelmaß als PMI x Muskeldichte. Insgesamt wurden 220 Patienten (19,33%) in die Intensivstation zugelassen. Bei 171 Patienten (15,03%) wurde eine mechanische Lungenentlüftung durchgeführt. Schließlich starben 154 Patienten (13,53%) innerhalb der Beobachtungszeit von 30-Tag. Alle untersuchten Parameter des Pectoralis-Muskels waren bei den Patienten mit ungünstigen Kursen von Covid-19 niedriger. Alle pectoralis Muskelparameter wurden mit 30-Tage-Sterblichkeit in multivariate Analysen eingestellt für Alter und Geschlecht: pectoralis Muskelfläche, HR = 0.93 CI 95% (0.91-0.95) p < 0.001; pectoralis Muskeldichte, HR = 0.94 CI 95% (0.93-0.96) p < 0.001; pectoralis Muskelindex, HR = 0.79 CI 95% (0.75-0.85) p < 0.001, pectoralis Die analysierten Muskelparameter können jedoch nicht zur Vorhersage von Krankheitskursen verwendet werden. JA 2023 Jan 10.1016/j.acra.2022.05.003 Academic radiology Kardas H Besutti G Pellegrini M Ottone M Onur MR Atak F Hocaoglu E Yıldız Ö Inci E Cingöz E Cingöz M Dursun M Korkmaz İ Orhan Ç Pech M article lutter_pulmonale_2023 Es gibt keine größeren Vergleichsstudien zu der Anwendbarkeit etablierter klinisch-diagnostischer Computertomographie (CT)-Kriterien für „Coronavirus Disease 2019“ (COVID-19)-Infektionen auf die postmortale Computertomographie (PMCT). 2023 dec de 1434-5196 10.1007/s00194-023-00667-4 Rechtsmedizin 34 17—23 Bildgebung, Coronavirus, Imaging, Lunge, Lungs, Pandemic, Pandemie, Pneumonia, Pneumonie https://doi.org/10.1007/s00194-023-00667-4 M. Lutter I. Kniep B. Ondruschka A. Heinemann article Ebong2023_PMID37371024 PURPOSE: Um die technische Durchführbarkeit eines KI-basierten Software-Prototyps zu implementieren, der für den Nachweis von COVID-19-Pneumonie in CT-Datensätzen der Lunge und die Differenzierung zwischen anderen Pneumonie-Etiologien optimiert ist. METHODEN: Diese einzentige retrospektive Fall-Kontroll-Studie ergab nacheinander 144 Patienten (58 weiblich, mittleres Alter 57,72 ± 18,25 y) mit CT-Datensätzen der Lunge. Untergruppen einschließlich bestätigter Bakterien (>i>n/i> = 24, 16,6%), virale (n = 52, 36,1%) oder Pilze (n = 25, 16,6%) Pneumonie und (n>/i> = 43, 30.7%) Patienten ohne nachgewiesene Pneumonie (Compison group) wurden mit Hilfe der AI-basierten RESULTS: Die Software erreichte eine optimale Empfindlichkeit von 80,8% mit einer Spezifität von 50% für den Nachweis von COVID-19; der menschliche Radiologe erreichte jedoch eine optimale Empfindlichkeit von 80,8% und eine Spezifität von 97,2%. Die mittlere Nachbearbeitungszeit betrug 7,61 ± 4,2 min. Die Verwendung eines Kontrastmittels hat die Ergebnisse der Software nicht beeinflusst (p = 0,81). Die mittlere bewertete COVID-19-Wahrscheinlichkeit liegt bei COVID-19-Patienten bei 0,80 ± 0,36 deutlich höher als bei Patienten mit pilzlicher Lungenentzündung (p>/i>/i> < 0,001). Der mittlere Anteil an Opazität (PO) und Anteil an hoher Opazität (PHO ≥ -200 HU) lag bei COVID-19 Patienten deutlich höher als bei gesunden Patienten. Der Gesamtmittelwert HU bei COVID-19-Patienten betrug -679.57 ± 112.72, was deutlich höher ist als bei der gesunden Kontrollgruppe (p < 0,001). CONCLUSION: Die Detektion und Quantifizierung von Lungenentzündungen über die primär geschulten COVID-19-Datensätze ist möglich und zeigt vergleichbare Ergebnisse für COVID-19-Pneumonie zu einem erfahrenen Leser. Die Vorteile sind die schnelle, automatisierte Segmentierung und Quantifizierung der Lungenentzündung. JA 2023 Jun 10.3390/diagnostics13122129 Diagnostics (Basel, Switzerland) Ebong U Büttner SM Schmidt SA Flack F Korf P Peters L Grüner B Stenger S Stamminger T Kestler H Beer M Kloth C article Lisson2023_PMID38067334 Eine genaue Vorhersage der Lymphknotenmetastase (LNM) bei Patienten mit Hodenkrebs ist für die Therapieentscheidungsfindung und prognostische Auswertung sehr relevant. Unsere Studie zielte darauf ab, klinische Radiomikromodelle für individuelle präoperative Vorhersage von LNM bei Patienten mit Hodenkrebs zu entwickeln und zu validieren. Wir haben 91 Patienten mit klinikopathologisch bestätigten frühen Stadium der Hodenkrebs, mit Krankheit beschränkt auf die Tests. Wir umfassten fünf signifikante klinische Risikofaktoren (Alter, präoperative Serum Tumormarker AFP und B-HCG, Histotyp und BMI) zur Erstellung des klinischen Modells. Nach der Segmentierung von 273 retroperitonealen Lymphknoten haben wir dann die klinischen Risikofaktoren und Lymphknoten-Radiomics-Funktionen kombiniert, um kombinierte Vorhersagemodelle mit Random Forest (RF), Light Gradient Boosting Machine (LGBM), Support Vector Machine Classifier (SVC) und K-Nearest Neighbours (KNN). Die Modellleistung wurde durch den Bereich unter der Empfängerbetriebskennlinie (ROC) (AUC) bewertet. Schließlich wurde mit der Entscheidungskurvenanalyse (DCA) die klinische Nützlichkeit bewertet. Das Random Forest kombinierte klinische Lymphknoten-Radiomics-Modell mit dem höchsten AUC von 0.95 (±0.03 SD; 95% CI) wurde als Kandidatenmodell mit Entscheidungskurvenanalyse betrachtet, was seine Nützlichkeit für präoperative Vorhersage in der klinischen Einstellung zeigt. Unsere Studie hat zuverlässige und vorausschauende maschinelle Lerntechniken für die Vorhersage von Lymphknotenmetastasen im frühen Stadium des Hodenkrebses identifiziert. Die Identifizierung der effektivsten maschinellen Lernansätze für die prädiktive Analyse auf Basis von Radiomik, die klinische Risikofaktoren integrieren, kann die Anwendbarkeit von Radiomik in der Präzisions-Onkologie und Krebsbehandlung erweitern. JA 2023 Nov 10.3390/cancers15235630 Cancers Lisson CS Manoj S Wolf D Lisson CG Schmidt SA Beer M Thaiss W Bolenz C Zengerling F Goetz M article Engels2023_PMID37280412 Die Studie bewertet die Auswirkungen auf die Sero-Immunität, den Gesundheitsstatus und die Lebensqualität von Kindern und Jugendlichen nach dem Aufstand der Omicron-Variante in Deutschland. Diese multizentrische Querschnittsstudie (IMMUNEBRIDGE Kids) wurde von Juli bis Oktober 2022 in der Deutschen Netzwerk-Universitätsmedizin (NUM) durchgeführt. Die SARS-CoV-2-Antikörper wurden gemessen und die Daten zu SARS-CoV-2 Infektionen, Impfungen, gesundheitlichen und sozioökonomischen Faktoren sowie der sorggiver-reported Bewertung über die Gesundheit und den psychologischen Status ihrer Kinder bewertet. 497 Kinder im Alter von 2 bis 17 Jahren wurden einbezogen. Drei Gruppen wurden analysiert: 183 Vorschulkinder im Alter von 2-4 Jahren, 176 Schulkinder im Alter von 5-11 Jahren und 138 Jugendliche im Alter von 12-18 Jahren. Positive Antikörper gegen das S- oder N-Antigen von SARS-CoV-2 wurden in 86,5% aller Teilnehmer (70,0% [128/183] der Vorschulkinder, 94,3% der Schulkinder [166/176] und 98,6% der Jugendlichen [136/138]) nachgewiesen. Unter allen Kindern wurden 40,4% (201/497) gegen COVID-19 geimpft (Vorschulkinder 4,4% [8/183], Schüler 44,3% [78/176] und Jugendliche 83,3% [115/138]). Die Seroprevalenz von SARS-CoV-2 war in der Vorschule am niedrigsten. Gesundheitsstatus und Lebensqualität der Eltern waren zum Zeitpunkt der Erhebung sehr positiv (Sommer 2022). Altersbedingte Unterschiede bei SARS-CoV-2 Sero-Immunität könnten vor allem durch Unterschiede bei Impfungen anhand der offiziellen deutschen Impfungsempfehlungen sowie Unterschiede bei SARS-CoV-2 Infektionsraten in den verschiedenen Altersgruppen erklärt werden. Gesundheitsstatus und Lebensqualität von fast allen Kindern waren sehr gut unabhängig von der Infektion und/oder Impfung von SARS-CoV-2. Deutsches Register für klinische Studien Identifier Würzburg: DRKS00025546 (Registrierung: 11.09.2021), Bochum: DRKS00022434 (Registrierung:07.08.2020), Dresden: DRKS 00022455 (Registrierung: 23.07.2020). JA 2023 Oct 10.1007/s15010-023-02052-5 Infection Engels G Maier C Holzwarth S Lange B Streeck H Blaschke-Steinbrecher S Härtel C Schroten H R Berner R Liese J Brinkmann F Toepfner N article Wolf2023_PMID37985685 Deep Learning in der medizinischen Bildgebung hat das Potenzial, das Risiko von diagnostischen Fehlern zu minimieren, die radiologische Arbeitsbelastung zu reduzieren und die Diagnose zu beschleunigen. Die Ausbildung solcher Deep Learning-Modelle erfordert große und genaue Datensätze, mit Anmerkungen für alle Trainingsproben. Allerdings sind in der medizinischen Bildgebungsdomäne annotierte Datensätze für bestimmte Aufgaben aufgrund der hohen Komplexität von Anmerkungen, eingeschränktem Zugriff oder der Seltenheit von Krankheiten oft klein. Um diese Herausforderung anzugehen, können tiefe Lernmodelle auf großen Bilddatensätzen vortrainiert werden, ohne dass mit Methoden aus dem Bereich des selbsterweiterten Lernens Anmerkungen gemacht werden. Nach dem Vortraining reichen kleine annotierte Datensätze aus, um die Modelle für eine bestimmte Aufgabe zu verfeinern. Die populärsten selbstbeaufsichtigten Vorschulansätze in der medizinischen Bildgebung basieren auf kontrastierendem Lernen. Neue Studien in der natürlichen Bildverarbeitung zeigen jedoch ein starkes Potenzial für maskierte Autoencoder-Ansätze. Unsere Arbeit vergleicht hochmoderne kontrastive Lernmethoden mit dem kürzlich eingeführten maskierten Autoencoder-Ansatz "SparK" für konvolutionale neuronale Netzwerke (CNNs) auf medizinischen Bildern. Daher trainieren wir auf einem großen, unbemerkten CT-Bilddatensatz und Feinabstimmung auf mehreren CT-Klassifikationsaufgaben. Aufgrund der Herausforderung, ausreichende annotierte Trainingsdaten in der medizinischen Bildgebung zu erhalten, ist es von besonderem Interesse, zu bewerten, wie die selbstübertroffenen Vortrainingsmethoden bei der Feinabstimmung auf kleinen Datensätzen durchgeführt werden. Durch Experimente mit einer allmählichen Verringerung der Trainingsdatensatzgröße für Feinabstimmung finden wir, dass die Reduktion je nach Art der gewählten Vorausbildung unterschiedliche Auswirkungen hat. Die SparK-Vortrainingsmethode ist robuster als die kontrastierenden Methoden. Basierend auf unseren Ergebnissen schlagen wir die SparK-Vorschulung für medizinische Bildgebungsaufgaben mit nur kleinen annotierten Datensätzen vor. JA 2023 Nov 10.1038/s41598-023-46433-0 Scientific reports Wolf D Payer T Lisson CS Lisson CG Beer M Götz M Ropinski T article Thibeault2023-jm BACKGROUNDAfter its introduction as standard-of-care for severe COVID-19, dexamethasone has been administered to a large number of patients globally. Detailed knowledge of its impact on the cellular and humoral immune response to SARS-CoV-2 remains scarce.METHODSWe included immunocompetent individuals with (a) mild COVID-19, (b) severe COVID-19 before introduction of dexamethasone treatment, and (c) severe COVID-19 infection treated with dexamethasone from prospective observational cohort studies at Charité-Universit"atsmedizin Berlin, Germany. We analyzed SARS-CoV-2 spike-reactive T cells, spike-specific IgG titers, and serum neutralizing activity against B.1.1.7 and B.1.617.2 in samples ranging from 2 weeks to 6 months after infection. We also analyzed BA.2 neutralization in sera after booster immunization.RESULTSPatients with severe COVID-19 and dexamethasone treatment had lower T cell and antibody responses to SARS-CoV-2 compared with patients without dexamethasone treatment in the early phase of disease, which converged in both groups before 6 months after infection and also after immunization. Patients with mild COVID-19 had comparatively lower T cell and antibody responses than patients with severe disease, including a lower response to booster immunization during convalescence.CONCLUSIONDexamethasone treatment was associated with a short-term reduction in T cell and antibody responses in severe COVID-19 when compared with the nontreated group, but this difference evened out 6 months after infection. We confirm higher cellular and humoral immune responses in patients after severe versus mild COVID-19 and the concept of improved hybrid immunity upon immunization.FUNDINGBerlin Institute of Health, German Federal Ministry of Education, and German Federal Institute for Drugs and Medical Devices. JA 2023 apr en 10.1172/jci.insight.166711 36881474 JCI Insight 8 8 Adaptive immunity; Immunology; Immunotherapy; Infectious disease; T cells Charlotte Thibeault Lara Bardtke Kanika Vanshylla Veronica Cristanziano Kirsten A Eberhardt Paula Stubbemann David Hillus Pinkus Tober-Lau Parnika Mukherjee Friederike Münn Lena J Lippert Elisa T Helbig Tilman Lingscheid Fridolin Steinbeis Mirja Mittermaier Martin Witzenrath Thomas Zoller Pa-COVID Group Florian Klein Leif E Sander Florian Kurth article Li2023_PMID37981641 Traditionelle konvolutionale neuronale Netzwerk-Methoden (CNN) stützen sich auf dichte Tensors, die sie suboptimal für räumlich sparsame Daten macht. In diesem Papier schlagen wir ein CNN-Modell auf Basis von Sparse Tensors für eine effiziente Verarbeitung von hochauflösenden Formen vor, die als binäre Voxel-Belegungsgitter dargestellt sind. Im Gegensatz zu einem dichten CNN, der das gesamte Voxel-Gitter als Eingabe nimmt, verarbeitet ein spärlicher CNN nur auf den nicht leeren Voxeln, wodurch der Speicher- und Rechenkopf aufgrund der spärlichen Eingabedaten reduziert wird. Wir bewerten unsere Methode auf zwei klinisch relevanten Schädelrekonstruktionsaufgaben: (1) bei einem defekten Schädel, rekonstruieren den kompletten Schädel (d.h. Schädelformvervollständigung), und (2) bei einem groben Schädel, rekonstruieren einen hochauflösenden Schädel mit feinen geometrischen Details (Form Super-Resolution). Unsere Methode übertrifft ihre dichten CNN-basierten Gegenstücke in der Schädelrekonstruktionsaufgabe quantitativ und qualitativ, erfordert jedoch wesentlich weniger Gedächtnis für Training und Inferenz. Wir stellten fest, dass bei den 3D-Schädeldaten der Gesamtspeicherverbrauch des spärlichen CNN bei der Inferenz zu den Bildauflösungen etwa linear wächst. Während des Trainings bleibt die Speichernutzung deutlich unter den Erhöhungen der Bildauflösung-an [Formel: siehe Text] Erhöhung der Voxelzahl führt zu weniger als [Formel: siehe Text] Erhöhung der Speicheranforderungen. Unsere Studie zeigt die Wirksamkeit der Verwendung eines spärlichen CNN für Schädelrekonstruktionsaufgaben, und unsere Ergebnisse können auf andere räumlich spärliche Probleme angewendet werden. Wir beweisen dies durch zusätzliche experimentelle Ergebnisse auf anderen sparsamen medizinischen Datensätzen, wie die Aorta und das Herz. Projektseite unter https://github.com/Jianningli/SparseCNN . JA 2023 Nov 10.1038/s41598-023-47437-6 Scientific reports Li J Gsaxner C Schmalstieg D Kleesiek J Egger J article JA 2023 01 10.1007/s00103-022-03649-1 Bundesgesundheitsblatt Gesundheitsforschung Gesundheitsschutz Ralf Heyder NUM Coordination Office NUKLEUS Study Group NUM-RDP Coordination RACOON Coordination AKTIN Coordination GenSurv Study Group article Miederer2023-da Digitization in the healthcare sector and the support of clinical workflows with artificial intelligence (AI), including AI-supported image analysis, represent a great challenge and equally a promising perspective for preclinical and clinical nuclear medicine. In Germany, the Medical Informatics Initiative (MII) and the Network University Medicine (NUM) are of central importance for this transformation. This review article outlines these structures and highlights their future role in enabling privacy-preserving federated multi-center analyses with interoperable data structures harmonized between site-specific IT infrastructures. The newly founded working group "Digitization and AI" in the German Society of Nuclear Medicine (DGN) as well as the Fach- und Organspezifische Arbeitsgruppe (FOSA, specialty- and organ-specific working group) founded for the field of nuclear medicine (FOSA Nuklearmedizin) within the NUM aim to initiate and coordinate measures in the context of digital medicine and (image-)data-driven analyses for the DGN. JA 2023 en 10.1055/a-2067-7642 Nuklearmedizin 62 Georg Thieme Verlag KG

Stuttgart

276—283 5 Digitalization Data integration Harmonization Federated learning Multi-centric analysis NUM-DIZ http://dx.doi.org/10.1055/a-2067-7642 1 Isabelle Miederer Julian Manuel Michael Rogasch Regina Fischer Timo Fuchs Constantin Lapa Philipp Lohmann Kuangyu Shi Johannes Tran-Gia Thomas Wendler Dirk Hellwig article Gierend2023_PMID37938878 Im Rahmen der Medical Informatics Initiative haben medizinische Datenintegrationszentren (DICs) komplexe Datenflüsse implementiert, um routinemäßige Gesundheitsdaten in Forschungsdaten-Repositorien für die sekundäre Nutzung zu übertragen. Die Methoden der Datenverwaltung sind während dieser Prozesse von Bedeutung, und besondere Aufmerksamkeit sollte auf Provenienzaspekte gegeben werden. Unzureichendes Wissen kann zu Gültigkeitsrisiken führen und das Vertrauen und die Qualität der verarbeiteten Daten reduzieren. Die Notwendigkeit, pflegefähige Datenmanagement-Praktiken zu implementieren, ist unbestritten, aber es gibt einen großen Mangel an Klarheit über den Status. Unsere Studie untersucht die aktuellen Methoden des Datenmanagements während des gesamten Datenlebenszyklus innerhalb des Konsortiums Medical Informatics in Research and Care in University Medicine (MIRACUM). Wir stellen einen Rahmen für den Reifestatus von Datenmanagement-Praktiken dar und geben Empfehlungen vor, um eine vertrauensvolle Verbreitung und Wiederverwendung von routinemäßigen Gesundheitsdaten zu ermöglichen. In dieser gemischten Methodenstudie führten wir zwischen Juli und September 2021 halbstrukturierte Interviews mit Interessenvertretern aus 10 DICs durch. Wir nutzten einen selbst gestalteten Fragebogen, den wir auf die MIRACUM DICs zugeschnitten haben, um qualitative und quantitative Daten zu sammeln. Unsere Studienmethode entspricht der Good Reporting einer Mixed Methods Study (GRAMMS) Checkliste. Unsere Studie liefert Einblicke in die Datenmanagementpraxis der MIRACUM DICs. Wir identifizieren mehrere Rückverfolgbarkeitsfragen, die teilweise mit fehlenden kontextbezogenen Informationen innerhalb nicht harmonisierter Arbeitsabläufe, unklarer Verantwortlichkeiten, fehlender oder unvollständiger Datenelemente und unvollständiger Informationen über die rechnergestützten Umgebungsinformationen erläutert werden können. Basierend auf den identifizierten Mängeln schlagen wir einen Rahmen für die Reife des Datenmanagements vor, um mehr Klarheit zu erreichen und verbesserte Strategien für das Datenmanagement zu definieren. Der Rahmen für die Datenverwaltung unterstützt die Erstellung und Verbreitung von genauen und nachweislich bereicherten Daten für die sekundäre Nutzung. Unsere Arbeit dient als Katalysator für die Ableitung einer übergeordneten Datenmanagementstrategie, die die Datenintegrität und Provenienzeigenschaften als Schlüsselfaktoren bewahrt. Wir stellen fest, dass diese Arbeit zur Erzeugung fairer und aufrechterhaltener Gesundheitsforschungsdaten von hoher Qualität führen wird. JA 2023 Nov 10.2196/48809 Journal of medical Internet research Gierend K Freiesleben S Kadioglu D Siegel F Ganslandt T Waltemath D article lucke_tnf_2023 Coronavirus disease 2019 (COVID-19) is caused by the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). This virus does not only lead to pulmonary infection but can also infect other organs such as the gut, the kidney, or the liver. Recent studies confirmed that severe cases of COVID-19 are often associated with liver damage and liver failure, as well as the systemic upregulation of pro-inflammatory cytokines such as tumor necrosis factor-alpha (TNFα). However, the impact these immune mediators in the liver have on patient survival during SARS-CoV-2 infection is currently unknown. Here, by performing a post-mortem analysis of 45 patients that died from a SARS-CoV-2 infection, we find that an increased expression of TNFA in the liver is associated with elevated mortality. Using publicly available single-cell sequencing datasets, we determined that Kupffer cells and monocytes are the main sources of this TNFα production. Further analysis revealed that TNFα signaling led to the upregulation of pro-inflammatory genes that are associated with an unfavorable outcome. Moreover, high levels of TNFA in the liver were associated with lower levels of interferon alpha and interferon beta. Thus, TNFα signaling in the infected SARS-CoV-2 liver correlates with reduced interferon levels and overall survival time. 2023 eng 1664-3224 10.3389/fimmu.2023.1151937 Frontiers in Immunology 14 1151937 COVID-19, Cxcl3, Cxcl8, Cytokines, Humans, Icam1, Liver, SARS-CoV-2, TNFa, Tumor Necrosis Factor-alpha, liver, post-mortem Jöran Lücke Mikolaj Nawrocki Josa Schnell Nicholas Meins Fabian Heinrich Tao Zhang Franziska Bertram Morsal Sabihi Marius Böttcher Tom Blankenburg Marie Pfaff Sara Notz Jan Kempski Matthias Reeh Stefan Wolter Oliver Mann Jakob R. Izbicki Marc Lütgehetmann Anna Duprée Anastasios D. Giannou Benjamin Ondruschka Samuel Huber article Thiam2023_PMID36844424 In den letzten Jahren wurden mehrere tiefgreifende Lernansätze im Bereich der medizinischen Bildanalyse erfolgreich angewandt. Speziell wurden verschiedene tiefe neuronale Netzwerkarchitekturen für die Detektion verschiedener Pathologien auf der Grundlage von Brust-Röntgenbildern vorgeschlagen und bewertet. Während die durchgeführten Bewertungen sehr vielversprechende Ergebnisse gezeigt haben, bestehen die meisten von ihnen in der Ausbildung und Bewertung der Leistung der vorgeschlagenen Ansätze auf einem einzigen Datensatz. Die Verallgemeinerung solcher Modelle ist jedoch in einer Kreuzdomaineinstellung recht begrenzt, da bei der Auswertung dieser Modelle auf Datensätzen, die aus verschiedenen medizinischen Zentren stammen oder unter verschiedenen Protokollen aufgezeichnet werden, ein signifikanter Leistungsabbau beobachtet werden kann. Der Leistungsabbau wird meist durch die Domänenverschiebung zwischen dem Trainingssatz und dem Bewertungssatz verursacht. Um dieses Problem zu lindern, werden in der aktuellen Arbeit unterschiedliche ununterbrochene Domänenanpassungsansätze vorgeschlagen und ausgewertet, um Kardiomegalie basierend auf Brust-Röntgenbildern in einer Kreuzdomäneneinstellung zu erkennen. Die vorgeschlagenen Ansätze erzeugen Domäneninvariante Merkmalsdarstellungen durch Anpassung der Parameter eines auf einer großen Menge markierter Proben optimierten Modells an eine Reihe von unmarkierten Bildern, die aus einem anderen Datensatz stammen. Die durchgeführte Auswertung weist auf die Wirksamkeit der vorgeschlagenen Ansätze hin, da die angepassten Modelle optimierte Modelle ausprägen, die ohne jede Form der Domänenanpassung direkt auf die Auswertesätze angewendet werden. JA 2023 10.3389/frai.2023.1056422 Frontiers in artificial intelligence Thiam P Lausser L Kloth C Blaich D Beer M Kestler HA article woo_vagus_2023 Dysautonomia has substantially impacted acute COVID-19 severity as well as symptom burden after recovery from COVID-19 (long COVID), yet the underlying causes remain unknown. Here, we hypothesized that vagus nerves are affected in COVID-19 which might contribute to autonomic dysfunction. We performed a histopathological characterization of postmortem vagus nerves from COVID-19 patients and controls, and detected SARS-CoV-2 RNA together with inflammatory cell infiltration composed primarily of monocytes. Furthermore, we performed RNA sequencing which revealed a strong inflammatory response of neurons, endothelial cells, and Schwann cells which correlated with SARS-CoV-2 RNA load. Lastly, we screened a clinical cohort of 323 patients to detect a clinical phenotype of vagus nerve affection and found a decreased respiratory rate in non-survivors of critical COVID-19. Our data suggest that SARS-CoV-2 induces vagus nerve inflammation followed by autonomic dysfunction which contributes to critical disease courses and might contribute to dysautonomia observed in long COVID. 2023 sep en 1432-0533 10.1007/s00401-023-02612-x Acta Neuropathologica 146 387—394 3 COVID-19, Dysautonomia, Neuroinflammation, Vagus nerve https://doi.org/10.1007/s00401-023-02612-x Marcel S. Woo Mohsin Shafiq Antonia Fitzek Matthias Dottermusch Behnam Mohammadi Christina Mayer Lukas C. Bal Lukas Raich Jakob Matschke Susanne Krasemann Susanne Pfefferle Thomas Theo Brehm Marc Lütgehetmann Julia Schädler Julian Wiesch Benjamin Ondruschka Manuel A. Friese Markus Glatzel article Surov2023_PMID37543614 Akute Lungenembolie (APE) ist eine gefährliche Erkrankung mit hoher Sterblichkeit. Die Kombination von klinischen, radiologischen und serologischen Parametern kann die Risikoschichtung von APE verbessern. Die meisten der vorgeschlagenen kombinierten Punkte wurden in unabhängigen Kohorten nicht validiert. Unser Ziel war es, die vorgeschlagenen klinisch-radiologischen Ergebnisse zur Prognose von 7- und 30-tägiger Sterblichkeit in APE zu validieren. Unsere Probe umfasste 531 Patienten mit APE, mittleres Alter 64,8 ± 15,6 Jahre, 221 (41.6%) Frauen und 310 (58,4%) Männer. Die folgenden Parameter wurden gesammelt: Alter und Geschlecht der Patienten, Mortalität innerhalb der Beobachtungszeit von 30 Tagen, vereinfachter Lungenprägegrad (sPESI), pH-Poponinspiegel (pg/ml), minimaler systolischer und diastolischer Blutdruck (mmHg), Herzfrequenz, O_{2>/sub> Sättigung, Synkopsequenzen und Notwendigkeit für Vasokpressoren. Bei CT-Pulmonalangiographie (CTPA) wurden kurzes Achsverhältnis rechts Ventrikel/linkes Ventrikel (RV/LV) und Rückfluss von Kontrastmittel in die minderwertige Venenkava erhalten. Die folgenden klinisch-radiologischen Punkte wurden berechnet: BOVA-Score, Lungenembolismus-Mortalitäts-Score (PEMS), European Society of Cardiology (ESC)-Score, Kumamaru-Score und Calgary akuter Lungenembolismus (CAPE). Insgesamt starben 31 Patienten (5,8%) innerhalb von sieben und 64 Patienten (12%) innerhalb von 30 Tagen. Alle Punkte zeigten hohe negative Prognosewerte von 89,0 bis 99,0%. PEMS und CAPE haben die höchste Spezifität für die 7-Tage-Sterblichkeit gezeigt (93,4% und 85,0%), PEMS und BOVA für 30-Tage-Sterblichkeit (94,2% und 90,4%). Die höchste Empfindlichkeit wurde für das ESC 2019 (96,8% und 95,3%) beobachtet. Kumamaru und CAPE erzielten eine geringe Empfindlichkeit. Alle Punkte hatten niedrige positive und hohe negative Vorhersagewerte. Zur Prognose der 7- und 30-tägigen Sterblichkeit in APE hat PEMS die höchste Spezifität. ESC 2019 zeigt die höchste Empfindlichkeit. Alle Punkte hatten niedrige positive und hohe negative Vorhersagewerte.} JA 2023 Aug 10.1186/s12931-023-02489-0 Respiratory research Thormann M Bär C Borggrefe J article JA 2023 Vortrag KIT Kongress 2023, Leipzig Sina Marie Hopff article Surov2023_PMID36744766 Um die Assoziierung von Körperzusammensetzungsparametern mit Ergebnissen in Covid-19 zu bewerten, wurden 173 Patienten, die für die Covid-19-Infektion in 6 europäischen Zentren stationiert waren, in diese retrospektive Studie aufgenommen. Die Messungen wurden auf L3-Ebene durchgeführt und umfassten Skelettmuskelindex (SMI), Muskeldichte (MD) und Adipose Gewebemessungen [visceral adipose Gewebe (VAT), subkutanes Fettgewebe (SAT), intramuskuläres Fettgewebe (IMAT), visceral-to-subcutane-adipose-tissue-area-ratio (VSR)]. Die Zuordnung zur Sterblichkeit, die Notwendigkeit der Intubation (MV) und die Notwendigkeit der Zulassung zur ICU innerhalb von 30 Tagen wurden bewertet. Höhere SAT-Dichte wurde mit einem höheren Risiko von MV (OR = 1.071, 95%CI=(1.034;1.110), p < 0,001) verbunden. Höhere MwSt.-Dichte wurde mit der Zulassung zu ICU (OR = 1.068, 95%CI=(1.029;1.109), p < 0.001) verbunden. Höhere MD war ein Schutzfaktor für MV und ICU-Zulassung (OR = 0.914, 95%CI=(0.870;0.960), p < 0.001; OR = 0.882, 95%CI=(0.832;0.934), p>/i> = 0.028). Höhere VSR war mit der Sterblichkeit verbunden (OR = 2.147, 95%CI=(1.022;4.512), p = 0,044). Der männliche Sex zeigte den stärksten Einfluss auf das Risiko von ICU-Zulassungen und MV. SMI wurde weder mit einem Parameter verknüpft. Bei Patienten, die für die Covid-19-Infektion stationiert sind, scheint die höhere VSR ein starker prognostizierter Faktor der kurzfristigen Sterblichkeit zu sein. Schwache Assoziationen mit klinischem Kurs wurden für MD- und Fettgewebemessungen gefunden. Männlicher Sex war der stärkste prognostische Faktor des negativen klinischen Kurses. VSR ist ein prognostizierter Biomarker für 30-tägige Mortalität bei Patienten, die für die Kovid-19-Krankheit ins Krankenhaus gebracht werden. JA 2023 Mar 10.1259/bjr.20220869 The British journal of radiology Thormann M Kardas H Hinnerichs M Omari J Cingöz E Cingöz M Dursun M Kormaz İ Orhan Ç Yıldız Ö Hocaoglu E Inci E Önder H Erk H Chousein O Sasani H Gönen KA Pech M inproceedings mieling_collaborative_2023 The diagnostic value of biopsies is highly dependent on the placement of needles. Robotic trajectory guidance has been shown to improve needle positioning, but feedback for real-time navigation is limited. Haptic display of needle tip forces can provide rich feedback for needle navigation by enabling localization of tissue structures along the insertion path. We present a collaborative robotic biopsy system that combines trajectory guidance with kinesthetic feedback to assist the physician in needle placement. The robot aligns the needle while the insertion is performed in collaboration with a medical expert who controls the needle position on site. We present a needle design that senses forces at the needle tip based on optical coherence tomography and machine learning for real-time data processing. Our robotic setup allows operators to sense deep tissue interfaces independent of frictional forces to improve needle placement relative to a desired target structure. We first evaluate needle tip force sensing in ex-vivo tissue in a phantom study. We characterize the tip forces during insertions with constant velocity and demonstrate the ability to detect tissue interfaces in a collaborative user study. Participants are able to detect 91 percent of ex-vivo tissue interfaces based on needle tip force feedback alone. Finally, we demonstrate that even smaller, deep target structures can be accurately sampled by performing post-mortem in situ biopsies of the pancreas. JA 2023 may 10.1109/ICRA48891.2023.10161377 2023 IEEE International Conference on Robotics and Automation (ICRA) 6893—6900 Collaboration, Force feedback, Navigation, Needles, Phantoms, Real-time systems, Robot sensing systems Robin Mieling Maximilian Neidhardt Sarah Latus Carolin Stapper Stefan Gerlach Inga Kniep Axel Heinemann Benjamin Ondruschka Alexander Schlaefer article JA 2022 09 17 10.1016/j.eclinm.2022.101651 EClinicalMedicine Tim J Hartung Christian Neumann T Bahmer Irina Chaplinskaya-Sobol Matthias Endres Johanna Geritz Karl Georg Haeusler Peter Heuschmann Hanna Hildesheim Andreas Hinz SM Hopff Anna Horn Michael Krawczak L Krist Jennifer Kudelka W. Lieb C Maetzler Anja Mehnert-Theuerkauf FA Montellano C Morbach S Schmidt S Schreiber Flo Steigerwald Stefan Störk Walter Maetzler Carsten Finke article JA 2022 09 Vortrag Deutscher Kongress für Physikalische und Rehabilitative Medizin Nora Hettich article JA 2022 09 Vortrag Deutscher Kongress für Physikalische und Rehabilitative Medizin Martin Weigl Christina Lemhöfer article JA 2022 09 ortrag Deutscher Kongress für Physikalische und Rehabilitative Medizin SM Hopff article JA 2022 09 Vortrag Deutscher Kongress für Physikalische und Rehabilitative Medizin Martin Weigl article JA 2022 07 10.1055/a-2006-1086 Methods Inf Med Khalid O Yusuf Olga Miljukov Anne Schoneberg Sabine Hanß article JA 2022 07 10.1016/j.eclinm.2022.101549 T Bahmer article JA 2022 07 10.1007/s10654-022-00896-z European Journal of Epidemiology 37(8) Maximilian Schons Lisa Pilgram JP Reese article JA 2022 05 12 16. DVMD-Fachtagung Lizon Fiedler-Lacombe Ekatherina Heim Heike Valentin Henriette Rau Arne Blumentritt Dana Stahl M Kraus Bettina Lorenz-Depiereux article JA 2022 05 12 Henriette Rau Arne Blumentritt Dana Stahl article JA 2022 05 12 16. DVMD-Fachtagung Henriette Rau Arne Blumentritt Dana Stahl article JA 2022 05 12 16. DVMD-Fachtagung Ekatherina Heim Heike Valentin Henriette Rau Arne Blumentritt Dana Stahl Melanie Stecher M Kraus Bettina Lorenz-Depiereux article JA 2022 04 Oral presentation Kongress ECCMID 04/2022 SM Hopff K Tilch M Kraus Bettina Lorenz-Depiereux G. Anton K Appel T Bahmer A Bartschke C Bellinghausen I Bernemann Markus Brechtel Clara Brünn Cornelia Fiessler Ramsia Geisler Stefan Hansch Frank Hanses Sabine Hanß R Heyder Andreas Hoffmann A Horn Carolin Jakob Steffi Jiru-Hillmann T. Keil Yascha Khodamoradi M Kohls Dagmar Krefting S Kunze Florian Kurth W. Lieb Lena J Lippert Roberto Lorbeer Liudmila Lysyakova C Maetzler Olga Miljukov Matthias Nauck Lisa Pilgram Valentina Püntmann JP Reese L Reinke S Rudolph J Sass Christian Schäfer Jens Schaller Mario Schattschneider Christian Scheer Margarete Scherer J Schmidt S Schmidt Maximilian Schons Kristina Seibel Dana Stahl Melanie Stecher F Steinbeis Stefan Störk M Tauchert C Thibeault Nicole Töpfner Kathrin Ungethüm Heike Valentin Silke Wiedmann T Zoller Reinhard Berner Michael Krawczak Eike Nagel T. Illig Stefan Schreiber Martin Witzenrath Peter Heuschmann Jörg Janne Vehreschild article JA 2022 02 28 https://www.christophlohfert-stiftung.de/panorama/ausschreibung-fuer-den-lohfert-preis-2022-beendet/ Dana Stahl article triefenbach2022establishing ja 2022 May 25 https://doi.org/10.3233/shti220439 35612058 Stud Health Technol Inform. 294 209-213 25 Lucas Triefenbach Robert Otto Jonas Bienzeisler Alexander Kombeiz Saskia Ehrentreich Rainer Röhrig Raphael W Majeed article JA 2022 November 12 https://doi.org/10.1007/s10456-022-09860-7 Angiogenesis 26 233-248 C. Werlein Helge Stark Alexandar Tzankov Jasmine Dinonne Haslbauer et al article JA 2022 Juli 12 https://doi.org/10.1016/j.immuni.2022.06.013 Immunity 55 1159-1172 7 T. Aschman Ronja Mothes FL. Heppner H. Radbruch article JA 2022 Februar 03 https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.12.040 Cell 185 493-512 3 P. Georg R. Astaburuaga-García L. Bonaguro S Brumhard L Michalick LJ Lippert et al article JA 2022 Januar 03 https://doi.org/10.1007/s10875-021-01187-0 Journal of Clinical Immunology 42 441-447 ST. Woon MN. Sheppard Jack Garland B. Ondruschka Christopher X. Wong et al article wang2022multiplex 2022 10.1016/j.eclinm.2022.101495 EClinicalMedicine 49 101495 Z Wang A Cryar O Lemke P Tober-Lau D Ludwig ET Helbig S Hippenstiel LE Sander D Blake CS Lane Dana Stahl article demichev2022proteomic 2022 10.1371/journal.pdig.0000007 PLOS Digital Health 1 e0000007 Vadim Demichev et al article wuerstle2022telemedicine 2022 10.2196/32564 JMIR Formative Research 6 1 https://doi.org/10.2196/32564 S Würstle J Erber M Hanselmann Dana Stahl article wygrecka2022altered 2022 10.1182/bloodadvances.2021004816 Blood Adv 6 1074—1087 3 M Wygrecka A Birnhuber B Seeliger L Michalick O Pak AS Schultz F Schramm M Zacharias G Gorkiewicz S David T Welte JJ Schmidt N Weissmann RT Schermuly G Barreto L Schaefer P Markart MC Brack S Hippenstiel F Kurth LE Sander M Witzenrath WM Kuebler G Kwapiszewska KT Preissner article gagiannis_antemortem_2022 Respiratory failure is the major cause of death in coronavirus disease 2019 (COVID-19). Autopsy-based reports describe diffuse alveolar damage (DAD), organizing pneumonia, and fibrotic change, but data on early pathologic changes and during progression of the disease are rare.We prospectively enrolled three patients with COVID-19 and performed full clinical evaluation, including high-resolution computed tomography. We took transbronchial biopsy (TBB) specimens at different time points and autopsy tissue samples for histopathologic and ultrastructural evaluation after the patients’ death.Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) was confirmed by reverse transcription polymerase chain reaction and/or fluorescence in situ hybridization in all TBBs. Lung histology showed reactive pneumocytes and capillary congestion in one patient who died shortly after hospital admission with detectable virus in one of two lung autopsy samples. SARS-CoV-2 was detected in two of two autopsy samples from another patient with a fulminant course and very short latency between biopsy and autopsy, showing widespread organizing DAD. In a third patient with a prolonged course, autopsy samples showed extensive fibrosis without detectable virus.We report the course of COVID-19 in paired biopsy specimens and autopsies, illustrating vascular, organizing, and fibrotic patterns of COVID-19–induced lung injury. Our results suggest an early spread of SARS-CoV-2 from the upper airways to the lung periphery with diminishing viral load during disease. 2022 jan 0002-9173 10.1093/ajcp/aqab087 American Journal of Clinical Pathology 157 54—63 1 https://doi.org/10.1093/ajcp/aqab087 Daniel Gagiannis Vincent Gottfried Umathum Wilhelm Bloch Conn Rother Marcel Stahl Hanno Maximilian Witte Sonja Djudjaj Peter Boor Konrad Steinestel article krasemann_assessing_2022 BACKGROUND: Autopsy studies have provided valuable insights into the pathophysiology of COVID-19. Controversies remain about whether the clinical presentation is due to direct organ damage by SARS-CoV-2 or secondary effects, such as overshooting immune response. SARS-CoV-2 detection in tissues by RT-qPCR and immunohistochemistry (IHC) or electron microscopy (EM) can help answer these questions, but a comprehensive evaluation of these applications is missing. METHODS: We assessed publications using IHC and EM for SARS-CoV-2 detection in autopsy tissues. We systematically evaluated commercially available antibodies against the SARS-CoV-2 proteins in cultured cell lines and COVID-19 autopsy tissues. In a multicentre study, we evaluated specificity, reproducibility, and inter-observer variability of SARS-CoV-2 IHC. We correlated RT-qPCR viral tissue loads with semiquantitative IHC scoring. We used qualitative and quantitative EM analyses to refine criteria for ultrastructural identification of SARS-CoV-2. FINDINGS: Publications show high variability in detection and interpretation of SARS-CoV-2 abundance in autopsy tissues by IHC or EM. We show that IHC using antibodies against SARS-CoV-2 nucleocapsid yields the highest sensitivity and specificity. We found a positive correlation between presence of viral proteins by IHC and RT-qPCR-determined SARS-CoV-2 viral RNA load (N= 35; r=-0.83, p-value \textless0.0001). For EM, we refined criteria for virus identification and provide recommendations for optimized sampling and analysis. 135 of 144 publications misinterpret cellular structures as virus using EM or show only insufficient data. We provide publicly accessible digitized EM sections as a reference and for training purposes. INTERPRETATION: Since detection of SARS-CoV-2 in human autopsy tissues by IHC and EM is difficult and frequently incorrect, we propose criteria for a re-evaluation of available data and guidance for further investigations of direct organ effects by SARS-CoV-2. FUNDING: German Federal Ministry of Health, German Federal Ministry of Education and Research, Berlin University Alliance, German Research Foundation, German Center for Infectious Research. 2022 sep eng 2352-3964 10.1016/j.ebiom.2022.104193 EBioMedicine 83 104193 Autopsy, COVID-19, Electron microscopy, Humans, Immunohistochemistry, Pathology, RNA, Viral, Reproducibility of Results, SARS-CoV-2, Viral Proteins Susanne Krasemann Carsten Dittmayer Saskia Stillfried Jenny Meinhardt Fabian Heinrich Kristin Hartmann Susanne Pfefferle Edda Thies Regina Manitius Tom Alex David Aschman Josefine Radke Anja Osterloh Simone Schmid Eva Miriam Buhl Jana Ihlow Frank Dubois Viktor Arnhold Sefer Elezkurtaj David Horst Andreas Hocke Sara Timm Sebastian Bachmann Victor Corman Hans-Hilmar Goebel Jakob Matschke Stephanie Stanelle-Bertram Gülsah Gabriel Danielle Seilhean Benjamin Ondruschka Matthias Ochs Werner Stenzel Frank L. Heppner Peter Boor Helena Radbruch Michael Laue Markus Glatzel article Fervers2022_PMID36330188 Das Ausmaß der Lungenbeteiligung an der Coronavirus-Krankheit 2019 (COVID-19)-Pneumonie, quantifiziert auf berechnete Tomographie (CT), ist ein etablierter Biomarker für Prognosen und führt klinische Entscheidungsfindungen. Der klinische Standard ist semi-quantitatives Scoring von Lungeneinbindung durch einen erfahrenen Leser. Wir wollen die Leistung automatisierter Tief- und Schwellenverfahren mit dem manuellen semiquantitativen Lungenscoring vergleichen. Darüber hinaus wollen wir eine optimale Schwelle zur Quantifizierung der beteiligten Lunge in der COVID-Pneumonie-Brust-CT unter Verwendung eines multizentrischen Datensatzes untersuchen. Insgesamt wurden 250 Patienten aufgenommen, 50 aufeinanderfolgende Patienten mit RT-PCR bestätigten COVID-19 aus unserer lokalen institutionellen Datenbank und weitere 200 Patienten aus vier internationalen Datensätzen (n=50 pro). Das Engagement der Lung wurde semi-quantitative von drei erfahrenen Radiologen nach der etablierten Brust CT Punktzahl (CCS) von 0-25 bewertet. Die Interrater-Verlässlichkeit wurde durch den Intra-Klasse-Korrelationskoeffizienten (ICC) gemeldet. Die Deep-learning-basierte Segmentierung von Grundglas und Konsolidierung wurde von CT Pulmo Auto Results Prototyp Plugin auf IntelliSpace Discovery (Philips Healthcare, Niederlande) erhalten. Die Threshold-basierte Segmentierung der betroffenen Lunge wurde mit Hilfe eines Open-Source-Tools für die Ganzlungssegmentierung unter Anwesenheit schwerer Pathologien (R231CovidWeb, Hofmanninger et al., 2020) und fortlaufender quantitativer Bewertung der Lungendämpfung durchgeführt. Die beste Schwelle wurde durch Training und Testen einer linearen Regression von tiefgreifenden und schwellenbasierten Ergebnissen in einer fünffachen Cross-Validationsstrategie untersucht. Median CCS unter 250 bewerteten Patienten betrug 10 [6-15]. Inter-Rater Zuverlässigkeit des CCS war ausgezeichnet [ICC 0.97 (0.97-0.98)]. Die beste Dämpfungsschwelle für die Identifizierung der betroffenen Lunge betrug -522 HU. > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > > Das manuelle semiquantitative CCS unterschätzt das Ausmaß der COVID-Pneumonie in höheren Score-Bereichen, was seine klinische Nützlichkeit bei schweren Erkrankungen begrenzt. Die klinische Umsetzung vollautomatischer Methoden, wie tiefgreifende oder schwellenbasierte Ansätze (beste Schwelle in unserem Multicenter-Datensatz: -522 HU), könnte Zeit des geschulten Personals sparen, Interreader-Variabilität abschaffen und eine wirklich quantitative, lineare Bewertung der COVID-Lungenbeteiligung ermöglichen. JA 2022 Nov 10.21037/qims-22-175 Quantitative imaging in medicine and surgery Fervers P Fervers F Rinneburger M Weisthoff M Pollmann-Schweckhorst P Kottlors J Carolus H Lennartz S Maintz D Shahzad R Persigehl T article buhr2022attitudes 2022 10.2196/31857 JMIR Mhealth Uhealth 10 e31857 1 Lydia Buhr Silke Schicktanz Eva Nordmeyer article schulz2022augmented 2022 10.1002/eji.202249841 European journal of immunology S. R. Schulz et al article schmid2022awake 2022 10.3390/jcm11020391 J Clin Med 11 391 2 Bastian Schmid Merle Griesel Anne-Linda Fischer Carlos S Romero Maria-Inti Metzendorf Stephanie Weibel Fabian Fichtner article demleitner ja 2022 https://doi.org/10.1007/s00702-022-02484-7 J Neural Transm (Vienna) 129 1377-1385 11 A.F. Demleitner A. Wolff J. Erber et al article lingscheid2022characterization 2022 10.1007/s15010-022-01796-w Infection 50 1441—1452 6 T Lingscheid LJ Lippert D Hillus T Kruis C Thibeault ET Helbig P Tober-Lau F Pfäfflin H Müller-Redetzky M Witzenrath T Zoller A Uhrig B Opitz N Suttorp TS Kramer LE Sander MS Stegemann F Kurth article Walker.2022 BACKGROUND Tracing of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) transmission chains is still a major challenge for public health authorities, when incidental contacts are not recalled or are not perceived as potential risk contacts. Viral sequencing can address key questions about SARS-CoV-2 evolution and may support reconstruction of viral transmission networks by integration of molecular epidemiology into classical contact tracing. METHODS In collaboration with local public health authorities, we set up an integrated system of genomic surveillance in an urban setting, combining a) viral surveillance sequencing, b) genetically based identification of infection clusters in the population, c) integration of public health authority contact tracing data, and d) a user-friendly dashboard application as a central data analysis platform. RESULTS Application of the integrated system from August to December 2020 enabled a characterization of viral population structure, analysis of 4 outbreaks at a maximum care hospital, and genetically based identification of 5 putative population infection clusters, all of which were confirmed by contact tracing. The system contributed to the development of improved hospital infection control and prevention measures and enabled the identification of previously unrecognized transmission chains, involving a martial arts gym and establishing a link between the hospital to the local population. CONCLUSIONS Integrated systems of genomic surveillance could contribute to the monitoring and, potentially, improved management of SARS-CoV-2 transmission in the population. JA 2022 10.1093/cid/ciab588 Clinical infectious diseases : an official publication of the Infectious Diseases Society of America 74 1039—1046 6 Andreas Walker Torsten Houwaart Patrick Finzer Lutz Ehlkes Alona Tyshaieva Maximilian Damagnez Daniel Strelow Ashley Duplessis Jessica Nicolai Tobias Wienemann Teresa Tamayo Malte Kohns Vasconcelos Lisanna Hülse Katrin Hoffmann Nadine Lübke Sandra Hauka Martin P. Däumer Alexander Thielen Susanne Kolbe-Busch Klaus Göbels Rainer Zotz Klaus Pfeffer Jörg Timm Alexander T. Dilthey article dulovic2022comparative 2022 10.3389/fimmu.2022.828053 Frontiers in Immunology 13 828053 Andrea Dulovic et al article georg2022complement 2022 Cell 185 493—512.e425 P Georg R Astaburuaga-García L Bonaguro S Brumhard L Michalick et al. Lippert article brandner2022contamination 2022 10.1007/s00428-021-03263-7 Virchows Arch 1-10 JM. Brandner P. Boor L. Borcherding et al article JA 2022 SCIENTIFIC REPORTS. (open access) 2022; 12(1):7249 E Schäfer Christian Scheer K Saljé A Fritz T Kohlmann N Hübner M Napp Lizon Fiedler-Lacombe Dana Stahl B Rauch Matthias Nauck U Völker S Felix G Lucchese A Flöel S Engeli Wolfgang Hoffmann K Hahnenkamp M Tzvetkov article JA 2022 SCIENTIFIC REPORTS. (open access) 2022; 12(1):7249 Christian Scheer Lizon Fiedler-Lacombe Dana Stahl Matthias Nauck Wolfgang Hoffmann E Schäfer K Saljé A Fritz T Kohlmann N Hübner M Napp B Rauch U Völker S Felix G Lucchese A Flöel S Engeli K Hahnenkamp M Tzvetkov article Mardiko.2022 BACKGROUND SARS-CoV-2 vaccination for healthcare workers (HCWs) started in Germany in December 2020. Hospitals had little time to prepare a vaccination strategy. AIM To gather information on the initial vaccination strategy for HCWs from the infection control practitioners in Germany. METHODS A cross-sectional, ethically approved questionnaire was developed, formatted as an online survey and pre-tested. Infection control practitioners responsible for hygiene/infection prevention in 987 randomly selected German hospitals were invited to participate in the survey in March and April 2021. For statistical analysis, the hospitals were categorized into two groups based on bed capacity (\textless500 beds: small; $\geq$500 beds: large). FINDINGS One hundred out of 987 (10%) infection control practitioners completed the survey. In 80% of the participating hospitals, HCW vaccination prioritization was based on recommendations of the German standing committee on vaccination (STIKO). Even so, only 54% prioritized the vaccination of HCWs with contact to vulnerable patients, thus deviating from STIKO recommendations. HCWs with a high personal health risk were prioritized for vaccination in 24% of the hospitals. Transferring unvaccinated HCWs to an area with less infection risk was considered by 2% of large and 12% of small hospitals. CONCLUSION Vaccination prioritization differed across hospitals and deviated from STIKO recommendations. A pandemic preparedness concept should address the potential impact of divergent strategies compared to a common approach. In addition, further studies analysing the reasons why HCWs remain unvaccinated are needed to adopt effective strategies. This is especially important against the background of facility-based compulsory vaccination. JA 2022 10.1016/j.jhin.2022.05.012 The Journal of hospital infection 126 87—92 A. A. Mardiko S. Heinemann A. Bludau H. E. J. Kaba A. Leha N. Maltzahn N. T. Mutters R. Leistner F. Mattner S. Scheithauer article Scheithauer.2022 BACKGROUND AND AIM At the beginning of the COVID-19 vaccination campaign in Germany, employees in medical facilities were prioritised for vaccination against SARS-CoV\hbox-2 due to the high risk of exposure and contact with vulnerable groups. Hospitals were therefore encouraged to organise and implement the vaccination of their employees as soon as possible. The aim of the study was to record the practice regarding the vaccination strategy for employees in German hospitals. METHODS In a~self-developed cross-sectional study, infection control practitioners of all German university hospitals as well as non-university hospitals in Lower Saxony and Bavaria were surveyed in March 2021. The data were stratified according to the characteristics of university hospitals and non-university hospitals. RESULTS Of 416 invitations sent out, 100 questionnaires (university hospitals:~33; non-university hospitals:~67) were completed. University hospitals reported greater vaccination capacity than non-university hospitals, but a~limiting factor was uncertain vaccine supply. Vaccination information campaigns were planned or had already been conducted in 89% of clinics. About two-thirds of the respondents (70%) said they did not plan to conduct antibody tests on vaccinated employees. A~follow-up of vaccinated employees to detect possible SARS-CoV\hbox-2 infections by PCR was planned by 41% of the respondents. In case of detection of SARS-CoV\hbox-2 infection, 72% of the respondents had planned further diagnostic procedures. DISCUSSION All hospitals were able to achieve rapid implementation of COVID-19 vaccination of their employees. At the time of the survey, there was also much uncertainty regarding the management of breakthrough infections as well as the need for booster vaccinations. ZUSAMMENFASSUNG HINTERGRUND UND ZIEL: Zu Beginn der COVID-19-Impfkampagne in Deutschland wurden Beschäftigte in medizinischen Einrichtungen aufgrund des hohen Expositionsrisikos und des Kontakts mit vulnerablen Gruppen priorisiert gegen SARS-CoV\hbox-2 geimpft. Die Krankenhäuser waren angehalten die Impfungen ihrer Beschäftigten möglichst schnell zu organisieren und durchzuführen. Ziel der vorliegenden Arbeit war es, die Impfstrategie für die Mitarbeitenden deutscher Kliniken zu erfassen. METHODEN In einer Querschnittstudie mit selbstentwickeltem Fragebogen wurden die Leitungen der (Krankenhaus\hbox-)Hygiene aller deutschen Universitätskliniken sowie der Nicht-Universitätskliniken in Niedersachsen und Bayern im März 2021 befragt. Die Daten wurden nach den beiden Versorgungsstufen stratifiziert. ERGEBNISSE 100 von 416 versendeten Fragebögen wurden vollständig ausgefüllt (Universitätsklinik:~33, Nicht-Universitätsklinik:~67). Universitätskliniken berichteten von einer größeren Impfkapazität als Nicht-Universitätskliniken, ein begrenzender Faktor waren die ungewissen Impfstofflieferungen. 89 % der Kliniken planten Informationskampagnen zum Thema Impfung oder hatten diese bereits durchgeführt. 70 % gaben an, keine Antikörpertests bei geimpften Beschäftigten durchführen zu wollen. Eine Nachverfolgung geimpfter Beschäftigter zur Detektion möglicher SARS-CoV-2-Infektionen mittels Erregernachweis durch PCR wurde von 41 % geplant. Im Falle des Nachweises einer SARS-CoV-2-Infektion bei geimpften Beschäftigten hatten 72 % weitere Diagnostik geplant. DISKUSSION Alle Krankenhäuser konnten eine schnelle Umsetzung der COVID-19-Vakzinierung ihrer Beschäftigten erreichen. Zum Zeitpunkt der Befragung gab es große Unsicherheit bezüglich des Umgangs mit Durchbruchsinfektionen und der Notwendigkeit von Auffrischimpfungen. JA 2022 10.1007/s00103-022-03607-x Bundesgesundheitsblatt, Gesundheitsforschung, Gesundheitsschutz 65 1299—1306 12 Simone Scheithauer Anna Bludau Stephanie Heinemann Martina Anton Percy Knolle article radbruch2022covid 2022 Rheinisches Ärzteblatt 6 Lukas Radbruch Claudia Bausewein article toberlau2022crossvariant 2022 10.3201/eid2805.220271 Emerging infectious diseases 28 P. Tober-Lau et al article meyerarndt2022serum 2022 10.4049/jimmunol.2100990 Journal of immunology 208 1001–1005 L. Meyer-Arndt et al article chen2022detection 2022 10.15252/emmm.202114182 EMBO Mol Med 14 e14182 Haixia Chen et al article chen2022 2022 10.15252/emmm.202114182 EMBO Mol Med 14 1 https://doi.org/10.15252/emmm.202114182 H. Chen A. Maul‐Pavicic M. Holzer et al article Almubarak2022_PMID36548534 Noncontrast Computed Tomography (NCCT) Funktionen sind vielversprechende Marker für akute Hämatomenausweitung (HE) bei Patienten mit intracerebraler Blutung (ICH). Es bleibt unklar, ob die genaue Identifizierung dieser Marker auch bei Rattern mit unterschiedlichen Erfahrungsstufen zuverlässig ist. Patienten mit akuter spontaner ICH in vier Tertiärzentren in Deutschland und Italien wurden von Januar 2017 bis Juni 2020 rückwirkend aufgenommen. Insgesamt wurden neun NCCT-Marker von einer Radiologie, einem Radiologie-Stipendiaten und einem Neuroradiologie-Stipendiaten mit verschiedenen Ebenen Erfahrung in der ICH-Bildgebung bewertet. Interrater-Relationen des Anwohner- und Radiologiekollegen wurden durch berechnete Cohen's kappa (κ)-Statistiken in Bezug auf den Neuroradiologie-Stipendiaten, der als Goldstandard bezeichnet wurde, ausgewertet. Gold-Standard-Ratings wurden nach berechneten Interrater κ-Statistiken bewertet. Globale Interrater-Relationen wurden durch berechnete Fleiss kappa-Statistiken in allen drei Lesern bewertet. Ein Vergleich der Empfänger-Betriebseigenschaften (ROCs) wurde verwendet, um Unterschiede in der Diagnosegenauigkeit für die Vorhersage der akuten Hämatomen-Expansion (HE) unter den Rattern zu bewerten. Für den Bewohner mit Interrater Cohen's kappa von 0,70 (95% CI 0.65-0.81) bis 0,96 (95% CI 0.94-0.98) wurde eine substantiell-zu-fast-perfect interrater concordance gefunden. Der Interrater Cohens Kappa für den Radiologie-Stipendiat war moderat bis fast perfekt und reichte von 0,58 (95% CI 0.52-0.65) bis 94 (95% CI 92-0.97). Der Intrarater Gold-Standard Cohen's kappa war fast perfekt und reichte von 0,79 (95% CI 0.78-0.90) bis 0,98 (95% CI 0.78-0.90). Der globale Interrater Fleiss kappa reichte von 0,62 (95%CI 0.57-0.66) auf 0,93 (95%CI 0.89-0.97). Die Diagnosegenauigkeit für die Vorhersage der akuten Hämatomenausdehnung (HE) war für das Inselzeichen und das Flüssigkeitszeichen unterschiedlich, mit p-Werten < 0,05. Die NCCT-Marker hatten eine weitgehend durchgängige Interrater-Vereinbarung unter den Raten mit unterschiedlichen Erfahrungsstufen. Unterschiede in der Diagnosegenauigkeit für die Vorhersage von akutem HE wurden in zwei von neun NCCT-Markern gefunden. Die Studie unterstreicht das vielversprechende Nutzen von NCCT-Markern für eine akute HE-Prädiktion. JA 2022 Dec 10.3390/tomography8060242 Tomography (Ann Arbor, Mich.) Almubarak H Elsayed S Mazzacane F Schlunk F Cao H Vu LH Vogt E Desser D Böhmer MFH Akkurt BH Sporns PB Penzkofer T Hanning U Nawabi J article JA 2022 Nationales Biobanken Symposium Abstract 11 M Tauchert I Bernemann A Kühn-Steven V Kopfnagel S Kunze T. Illig G. Anton article tauchert2022digital 2022 Not available M Tauchert I Bernemann A Kühn-Steven V Kopfnagel S Kunze T Illig G Anton article González2022_PMID36084564 Automatische Segmentierung von Bodenglas-Optik und Konsolidierungen in der Brustcomputertomographie (CT) Scans können die Belastung von Radiologen während der Zeiten der hohen Ressourcenauslastung möglicherweise erleichtern. Allerdings werden Deep Learning-Modelle nicht in der klinischen Routine vertraut, da sie auf Nicht-Verteilungsdaten (OOD) stillschweigend scheitern. Wir schlagen eine leichte OOD-Detektionsmethode vor, die die Mahalanobis-Distanz im Funktionsraum nutzt und nahtlos in hochmoderne Segmentierungspipelines integriert. Der einfache Ansatz kann sogar vortrainierte Modelle mit klinisch relevanten Unsicherheitsquantifizierung erweitern. Wir validieren unsere Methode über vier Brust-CT-Verteilungsverschiebungen und zwei Magnetresonanz-Bildgebungsanwendungen, nämlich Segmentierung des Hippocampus und der Prostata. Unsere Ergebnisse zeigen, dass die vorgeschlagene Methode in allen erforschten Szenarien effektiv weit- und nah-gute Proben erkennt. JA 2022 Nov 10.1016/j.media.2022.102596 Medical image analysis González C Gotkowski K Fuchs M Bucher A Fischbach R Kaltenborn IJ article vanshylla2022durability 2022 10.1016/S1473-3099(22)00135-9 The Lancet Infectious Diseases 22 445–446 K. Vanshylla et al article heinrich_dying_2022 The current pandemic with Severe acute respiratory syndrome-coronavirus-2 has been taking on new dynamics since the emergence of new variants last fall, some of them spreading more rapidly. Many countries currently find themselves in a race to ramp up vaccination strategies that have been initiated and a possible third wave of the pandemic from new variants, such as the Variant of Concern-202012/01 from the B.1.1.7 lineage. Until today, many investigations in death cases of Coronavirus-disease-19 have been conducted, revealing pulmonary damage to be the predominant feature of the disease. Thereby, different degrees of macroscopic and microscopic lung damage have been reported, most of them resembling an Acute Respiratory Distress Syndrome. Far more, systemic complications of the disease such as pulmonary embolisms have been described. However, neither morphologic nor virologic findings of patients dying of the new variants have yet been reported. Here, we report on a comprehensive analysis of radiologic, morphologic, and virologic findings in a fatal case of this variant. 2022 jan en 1437-1596 10.1007/s00414-021-02618-8 International Journal of Legal Medicine 136 193—202 1 501Y.V1, B.1.1.7, Coronavirus-disease-19, Postmortem, Respiratory infections, SARS-CoV-2, Variant of Concern-202012/01 https://doi.org/10.1007/s00414-021-02618-8 Fabian Heinrich Carina Romich Tamara Zimmermann Inga Kniep Antonia Fitzek Stefan Steurer Markus Glatzel Dominik Nörz Thomas Günther Manja Czech-Sioli Nicole Fischer Adam Grundhoff Marc Lütgehetmann Benjamin Ondruschka article koerber2022 2022 10.1038/s41467-021-27649-y Nat Commun 13 1 N. Koerber A. Priller S. Yazici et al article akbil2022early 2022 10.1007/s10875-022-01252-2 Journal of Clinical Immunology Online ahead of print et al article Akbil2022-zk PURPOSE: Six to 19% of critically ill COVID-19 patients display circulating auto-antibodies against type I interferons (IFN-AABs). Here, we establish a clinically applicable strategy for early identification of IFN-AAB-positive patients for potential subsequent clinical interventions. METHODS: We analyzed sera of 430 COVID-19 patients from four hospitals for presence of IFN-AABs by ELISA. Binding specificity and neutralizing activity were evaluated via competition assay and virus-infection-based neutralization assay. We defined clinical parameters associated with IFN-AAB positivity. In a subgroup of critically ill patients, we analyzed effects of therapeutic plasma exchange (TPE) on the levels of IFN-AABs, SARS-CoV-2 antibodies and clinical outcome. RESULTS: The prevalence of neutralizing AABs to IFN-$\alpha$ and IFN-$ømega$ in COVID-19 patients from all cohorts was 4.2% (18/430), while being undetectable in an uninfected control cohort. Neutralizing IFN-AABs were detectable exclusively in critically affected (max. WHO score 6-8), predominantly male (83%) patients (7.6%, 18/237 for IFN-$\alpha$-AABs and 4.6%, 11/237 for IFN-$ømega$-AABs in 237 patients with critical COVID-19). IFN-AABs were present early post-symptom onset and at the peak of disease. Fever and oxygen requirement at hospital admission co-presented with neutralizing IFN-AAB positivity. IFN-AABs were associated with lower probability of survival (7.7% versus 80.9% in patients without IFN-AABs). TPE reduced levels of IFN-AABs in three of five patients and may increase survival of IFN-AAB-positive patients compared to those not undergoing TPE. CONCLUSION: IFN-AABs may serve as early biomarker for the development of severe COVID-19. We propose to implement routine screening of hospitalized COVID-19 patients for rapid identification of patients with IFN-AABs who most likely benefit from specific therapies. JA 2022 aug en 10.1007/s10875-022-01252-2 35511314 J. Clin. Immunol. 42 Springer Science and Business Media LLC 1111—1129 6 Autoantibodies; COVID-19; SARS-CoV-2; Type I interferon Tim Meyer Paula Stubbemann Charlotte Thibeault Olga Staudacher Daniela Niemeyer Jenny Jansen Barbara Mühlemann Jan Doehn Christoph Tabeling Christian Nusshag Cédric Hirzel David Sökler Sanchez Alexandra Nieters Achim Lother Daniel Duerschmied Nils Schallner Jan Nikolaus Lieberum Dietrich August Siegbert Rieg Valeria Falcone Hartmut Hengel Uwe Kölsch Nadine Unterwalder Ralf-Harto Hübner Terry C Jones Norbert Suttorp Christian Drosten Klaus Warnatz Thibaud Spinetti Joerg C Schefold Thomas Dörner Leif Erik Sander Victor M Corman Uta Merle Pa-COVID Group Florian Kurth Horst Bernuth Christian Meisel Christine Goffinet article pietzner2022elf5 2022 10.1101/2022.01.17.22269283 medRxiv Preprint Maik Pietzner Robert L Chua Eleanor Wheeler Kevin Jechow Helena Radbruch et al. Trump article hopff2022ethical JA 2022 Abstract ECCMID 2022 SM Hopff K Tilch M Kraus L Lorenz-Depiereux G Anton K Appel T Bahmer A Bartschke C Bellinghausen I Bernemann Dana Stahl article antoniou2022european 2022 10.1183/13993003.02174-2021 Eur Respir J 60 2102174 2 KM Antoniou E Vasarmidi AM Russell B Crestani M Delcroix AT Dinh-Xuan V Poletti N Sverzellati M Vitacca M Witzenrath T Tonia A Spanevello article kruger2022lumiradx 2022 10.1007/s15010-021-01681-y Infection 50 https://doi.org/10.1007/s15010-021-01681-y LJ Krüger JAF Klein F Tobian Dana Stahl article hoffmann2022ace2independent 2022 10.1128/mbio.00364-22 mBio e0036422 M. Hoffmann et al article Hartung2022-mu Background: Reliable estimates of frequency, severity and associated factors of both fatigue and cognitive impairment after COVID-19 are needed. Also, it is not clear whether the two are distinct sequelae of COVID-19 or part of the same syndrome." Methods: In this prospective multicentre study, frequency of post-COVID fatigue and cognitive impairment were assessed in n = 969 patients (535 [55%] female) $\geq$6 months after SARS-CoV-2 infection with the FACIT-Fatigue scale (cut-off $łeq$30) and Montreal Cognitive Assessment ($łeq$25 mild, $łeq$17 moderate impairment) between November 15, 2020 and September 29, 2021 at University Medical Center Schleswig-Holstein, Campus Kiel and University Hospital W"urzburg in Germany. 969 matched non-COVID controls were drawn from a pre-pandemic, randomised, Germany-wide population survey which also included the FACIT-Fatigue scale. Associated sociodemographic, comorbid, clinical, psychosocial factors and laboratory markers were identified with univariate and multivariable linear regression models. Findings: On average 9 months after infection, 19% of patients had clinically relevant fatigue, compared to 8% of matched non-COVID controls (p < 0.001). Factors associated with fatigue were female gender, younger age, history of depression and the number of acute COVID symptoms. Among acute COVID symptoms, altered consciousness, dizziness and myalgia were most strongly associated with long-term fatigue. Moreover, 26% of patients had mild and 1% had moderate cognitive impairment. Factors associated with cognitive impairment were older age, male gender, shorter education and a history of neuropsychiatric disease. There was no significant correlation between fatigue and cognitive impairment and only 5% of patients suffered from both conditions. Interpretation: Fatigue and cognitive impairment are two common, but distinct sequelae of COVID-19 with potentially separate pathophysiological pathways. Funding: German Federal Ministry of Education and Research (BMBF). JA 2022 nov en 10.1016/j.eclinm.2022.101651 36133318 EClinicalMedicine 53 Elsevier BV 101651 101651 CI, confidence interval; COVID-19; COVID-19, Coronavirus Disease 2019; CRP, C-reactive protein; CSF, cerebrospinal fluid; Cognitive dysfunction; Fatigue; GAD-7, 7-item anxiety screening questionnaire; MoCA, Montreal Cognitive Assessment; NAPKON, National Pandemic Cohort Network; PCR, polymerase chain reaction; PHQ-8, 8-item depression module of the Patient Health Questionnaire; PSQI, Pittsburgh Sleep Quality Index; Post-acute COVID-19 syndrome; SARS-CoV-2; SARS-CoV-2, Severe Acute Respiratory Distress Syndrome caused by Corona Virus 2; VIF, variance inflation factor Tim J Hartung Christian Neumann Thomas Bahmer Irina Chaplinskaya-Sobol Matthias Endres Johanna Geritz Karl Georg Haeusler Peter U Heuschmann Hanna Hildesheim Andreas Hinz Sina Hopff Anna Horn Michael Krawczak Lilian Krist Jennifer Kudelka Wolfgang Lieb Corina Maetzler Anja Mehnert-Theuerkauf Felipe A Montellano Caroline Morbach Sein Schmidt Stefan Schreiber Flo Steigerwald Stefan Störk Walter Maetzler Carsten Finke article ameratunga2022first 2022 10.1007/s10875-021-01187-0 J Clin Immunol ST. Woon MN. Sheppard et al article vonstillfried2022first 2022 10.1016/j.lanepe.2022.100330 The Lancet Regional Health - Europe 100330 S. Von Stillfried RD. Bülow R. Röhrig P. Boor DeRegCOVID Collaborators article von_stillfried_first_2022 BACKGROUND: Autopsies are an important tool in medicine, dissecting disease pathophysiology and causes of death. In COVID-19, autopsies revealed e.g., the effects on pulmonary (micro)vasculature or the nervous system, systemic viral spread, or the interplay with the immune system. To facilitate multicentre autopsy-based studies and provide a central hub supporting autopsy centres, researchers, and data analyses and reporting, in April 2020 the German COVID-19 Autopsy Registry (DeRegCOVID) was launched. METHODS: The electronic registry uses a web-based electronic case report form. Participation is voluntary and biomaterial remains at the respective site (decentralized biobanking). As of October 2021, the registry included N=1129 autopsy cases, with 69271 single data points including information on 18674 available biospecimens gathered from 29 German sites. FINDINGS: In the N=1095 eligible records, the male-to-female ratio was 1·8:1, with peaks at 65-69 and 80-84 years in males and \textgreater85 years in females. The analysis of the chain of events directly leading to death revealed COVID-19 as the underlying cause of death in 86% of the autopsy cases, whereas in 14% COVID-19 was a concomitant disease. The most common immediate cause of death was diffuse alveolar damage, followed by multi-organ failure. The registry supports several scientific projects, public outreach and provides reports to the federal health authorities, leading to legislative adaptation of the German Infection Protection Act, facilitating the performance of autopsies during pandemics. INTERPRETATION: A national autopsy registry can provide multicentre quantitative information on COVID-19 deaths on a national level, supporting medical research, political decision-making and public discussion. FUNDING: German Federal Ministries of Education and Research and Health.Hintergrund: Obduktionen sind ein wichtiges Instrument in der Medizin, um die Pathophysiologie von Krankheiten und Todesursachen zu untersuchen. Im Rahmen von COVID-19 wurden durch Obduktionen z.B. die Auswirkungen auf die pulmonale Mikrovaskulatur, das Nervensystem, die systemische Virusausbreitung, und das Zusammenspiel mit dem Immunsystem untersucht. Um multizentrische, auf Obduktionen basierende Studien zu erleichtern und eine zentrale Anlaufstelle zu schaffen, die Obduktionszentren, Forscher sowie Datenanalysen und -berichte unterstützt, wurde im April 2020 das deutsche COVID-19-Autopsieregister (DeRegCOVID) ins Leben gerufen.Methoden: Das elektronische Register verwendet ein webbasiertes elektronisches Fallberichtsformular. Die Teilnahme ist freiwillig und das Biomaterial verbleibt am jeweiligen Standort (dezentrales Biobanking). Im Oktober 2021 umfasste das Register N=1129 Obduktionsfälle mit 69271 einzelnen Datenpunkten, die Informationen über 18674 verfügbare Bioproben enthielten, die von 29 deutschen Standorten gesammelt wurden.Ergebnisse: In den N=1095 ausgewerteten Datensätzen betrug das Verhältnis von Männern zu Frauen 1,8:1 mit Spitzenwerten bei 65-69 und 80-84 Jahren bei Männern und \textgreater85 Jahren bei Frauen. Die Analyse der Sequenz der unmittelbar zum Tod führenden Ereignisse ergab, dass in 86 % der Obduktionsfälle COVID-19 die zugrunde liegende Todesursache war, während in 14 % der Fälle COVID-19 eine Begleiterkrankung war. Die häufigste unmittelbare Todesursache war der diffuse Alveolarschaden, gefolgt von Multiorganversagen. Das Register unterstützt mehrere wissenschaftliche Projekte, die Öffentlichkeitsarbeit und liefert Berichte an die Bundesgesundheitsbehörden, was zu einer Anpassung des deutschen Infektionsschutzgesetzes führte und die Durchführung von Obduktionen in Pandemien erleichtert.Interpretation: Ein nationales Obduktionsregister kann multizentrische quantitative Informationen über COVID-19-Todesfälle auf nationaler Ebene liefern und damit die medizinische Forschung, die politische Entscheidungsfindung und die öffentliche Diskussion unterstützen.Finanzierung: Bundesministerien für Bildung und Forschung und für Gesundheit. 2022 apr eng 2666-7762 10.1016/j.lanepe.2022.100330 The Lancet Regional Health. Europe 15 100330 Autopsy, COVID-19, Cause of Death, Registry, SARS-CoV-2 Saskia Stillfried Roman David Bülow Rainer Röhrig Peter Boor DeRegCOVID Collaborators COVID-19 Autopsies (DeRegCOVID) article steinbeis2022functional 2022 10.1016/j.rmed.2022.106968 Respir Med 202 106968 F Steinbeis P Knape M Mittermaier ET Helbig P Tober-Lau C Thibeault LJ Lippert W Xiang M Müller-Plathe S Steinbrecher Dana Stahl article rosenau2022generation 2022 April https://doi.org/10.2196/35789 JMIR Med Inform 10 e35789 4 Lorenz Rosenau Raphael W Majeed Josef Ingenerf Alexander Kiel Björn Kroll Thomas Köhler Hans-Ulrich Prokosch Julian Gruendner article kuhnapfel2022genetic 2022 10.3390/genes13010111 Genes (Basel) 13 111 1 A Kühnapfel K Horn U Klotz M Kiehntopf M Rosolowski M Loeffler N Suttorp M Witzenrath M Scholz article JA 2022 A Kühnapfel K Horn U Klotz M Kiehntopf M Rosolowski M Loeffler Norbert Suttorp Martin Witzenrath M Scholz article hirschbuhl_high_2022 The rate of SARS-CoV-2 infections in vaccinees has become a relevant serious issue. This study aimed to determine the causes of death, histological organ alteration, and viral spread in relation to demographic, clinical-pathological, viral variants, and vaccine types for deceased individuals with proven SARS-CoV-2 infection after vaccination who died between January and November 2021. Twenty-nine consecutively collected cases were analyzed and compared to 141 nonvaccinated control cases. Autopsies were performed on 16 partially and 13 fully vaccinated individuals. Most patients were elderly and suffered from several relevant comorbidities. Real-time RT-PCR (RT-qPCR) identified a significantly increased rate of generalized viral dissemination within organ systems in vaccinated cases versus nonvaccinated cases (45% vs. 16%, respectively; P = 0.008) mainly with Ct-values of higher than 25 in non-respiratory samples. However, vaccinated cases also showed high viral loads, reaching Ct-values below 10, especially in the upper airways and lungs. This was accompanied by high rates of pulmonal bacterial or mycotic superinfections and the occurrence of immunocompromising factors, such as malignancies, immunosuppressive drug intake, or decreased immunoglobulin levels. All these findings were particularly accentuated in partially vaccinated patients compared to fully vaccinated individuals. The virus dissemination observed in our case study may indicate that patients with an impaired immune system have a decreased ability to eliminate the virus. However, the potential role of antibody-dependent enhancement must also be ruled out in future studies. Fatal cases of COVID-19 in vaccinees were rare and often associated with severe comorbidities or other immunosuppressive conditions. 2022 aug en 1530-0285 10.1038/s41379-022-01069-9 Modern Pathology 35 1013—1021 8 Respiratory tract diseases, Viral infection https://www.nature.com/articles/s41379-022-01069-9 Number: 8 Publisher: Nature Publishing Group Klaus Hirschbühl Tina Schaller Bruno Märkl Rainer Claus Eva Sipos Lukas Rentschler Andrea Maccagno Bianca Grosser Elisabeth Kling Michael Neidig Thomas Kröncke Oliver Spring Georg Braun Hans Bösmüller Maximilian Seidl Irene Esposito Jessica Pablik Julia Hilsenbeck Peter Boor Martin Beer Sebastian Dintner Claudia Wylezich article dannebaum2022highly 2022 10.1016/j.eclinm.2022.101438 EClinicalMedicine 48 101438 R Dannebaum P Suwalski H Asgharian Zhipei G Du H Lin J Weiner M Holtgrewe C Thibeault M Müller X Wang Dana Stahl article JA 2022 EClinicalMedicine.2022;48:101438 R Dannebaum P Suwalski H Asgharian Zhipei G Du J Weiner M Holtgrewe C. Thibeault M Müller X Wang Joe Saccomanno Jan-Moritz Doehn Ralf-Harto Hübner Norbert Suttorp Martin Witzenrath S Hippenstiel Leif E Sander Florian Kurth Pa-COVID Group H Lin Z Karadeniz B Hinzmann A Blüher S Siemann D Telman C Skurk W Poller D Beule T Guettouche U Landmesser J Berka K Luong F Rubelt B Heidecker article honzke2022human 2022 10.1183/13993003.02725-2021 Eur Respir J 60 2102725 6 K Hönzke B Obermayer C Mache D Fathykova M Kessler S Dökel E Wyler M Baumgardt A Löwa K Hoffmann Dana Stahl article honzke2022human 2022 10.1183/13993003.02725-2021 Eur Respir J 60 2102725 6 K Hönzke B Obermayer C Mache D Fathykova M Kessler et al. Dökel article Wolff2022-to The COVID-19 pandemic has posed challenges to maintaining medical care for patients with Parkinson's disease (PD). The Parkinson's Disease during the COVID-19 Pandemic (ParCoPa) survey was conducted as an online, nationwide, cross-sectional survey from December 2020 to March 2021 and aimed to assess the impact of the pandemic on the medical care of PD patients from the physicians' perspective. Invitations containing a randomly generated registration code were mailed to healthcare professionals from sixty-seven specialty centers in Germany. Confounders for the worsening of subjective treatment quality, perceived health risk due to the profession, and adequate protective measures against SARS-CoV-2 were assessed using logistic regression analysis. Of all forty physicians who responded, 87.5% reported a worsening of motor and nonmotor symptoms in their patients, 97.5% experienced cancellation of appointments, and difficulties in organizing advanced and supplementary therapies were reported by over 95%. Participants offered alternative consultation options, mostly in the form of telephone (77.5%) or online (64.1%) consultations, but telephone consultations were the most accepted by patients ("broadly accepted", 40.0%). We identified pandemic-related deficits in providing care for patients with PD and areas of improvement to ensure continued care for this vulnerable patient population. 2022 mar en Brain Sci. 12 MDPI AG 353 3 COVID-19; Parkinson's disease; provision of care; telemedicine; B-FAST Andreas Wolfgang Wolff Bernhard Haller Antonia Franziska Demleitner Erica Westenberg Paul Lingor article sedlmayr2022improving 2022 10.1055/s-0042-1744549 Appl Clin Inform 13 400—409 Benjamin Sedlmayr Martin Sedlmayr Christian Schüttler et al article wratil2022 2022 10.1007/s15010-021-01672-z Infection 50 P.R. Wratil N.A. Schmacke A. Osterman et al article dragano2022increase 2022 10.3238/arztebl.m2022.0133 Deutsches Ärzteblatt International 119 179–187 DOI: 10.3238/arztebl.m2022.0133 N. Dragano M. Reuter A. Peters M. Engels B. Schmidt KH. Greiser B. Bohn S. Riedel-Heller A. Karch R. Mikolajczyk G. Krause O. Lang L. Panreck M. Rietschel H. Brenner B. Fischer CW. Franzke S. Gastell B. Holleczek KH. Jöckel R. Kaaks T. Keil A. Kluttig O. Kuß N. Legath M. Leitzmann W. Lieb C. Meinke-Franze KB. Michels N. Obi T. Pischon I. Feinkohl S. Rospleszcz T. Schikowski MB. Schulze A. Stang H. Völzke SN. Willlich K. Wirkner H. Zeeb K. Berger article Bludau.2022 BACKGROUND Patients are at risk of nosocomial COVID-19 infection. The role of accompanying persons/visitors as potential infection donors is not yet well researched, but the risk will be influenced by prevention measures recommended by infection control practitioners. AIM To collect information about COVID-19 infection control strategies for patients and accompanying persons from infection control practitioners in German hospitals. METHODS A cross-sectional questionnaire was developed, ethically approved, pre-tested and formatted as an online tool. Infection control practitioners in 987 randomly selected German hospitals were invited to participate in March and April 2021. For statistical analysis, the hospitals were categorized as small (0-499 beds) or large ($\geq$500 beds). FINDINGS One hundred surveys were completed (response rate: 10%). A higher proportion of large (71%) than small (49%) hospitals let patients decide freely whether to wear medical or FFP2 masks. Most hospitals reported spatial separation for COVID-19 patients and non-COVID-19 cases (38%) or additionally for suspected COVID-19 cases (53%). A separation of healthcare teams for these areas existed in 54% of the hospitals. Accompaniment bans were more prevalent in large (52%) than in small hospitals (29%), but large hospitals granted more exemptions. CONCLUSION The decision as to whether to separate areas and teams seemed to depend on the hospital's structural conditions, therefore impairing the implementation of recommendations. Accompaniment regulations differ between hospital sizes and may depend on patient numbers, case type/severity and patients' requirements. In the dynamic situation of a pandemic, it can be difficult to stay up to date with findings and recommendations on infection control. JA 2022 10.1016/j.jhin.2022.03.014 The Journal of hospital infection 125 28—36 A. Bludau S. Heinemann A. A. Mardiko H. E. J. Kaba A. Leha N. Maltzahn N. T. Mutters R. Leistner F. Mattner S. Scheithauer article Houwaart.2022 BackgroundTracking person-to-person SARS-CoV-2 transmission in the population is important to understand the epidemiology of community transmission and may contribute to the containment of SARS-CoV-2. Neither contact tracing nor genomic surveillance alone, however, are typically sufficient to achieve this objective.AimWe demonstrate the successful application of the integrated genomic surveillance (IGS) system of the German city of Düsseldorf for tracing SARS-CoV-2 transmission chains in the population as well as detecting and investigating travel-associated SARS-CoV-2 infection clusters.MethodsGenomic surveillance, phylogenetic analysis, and structured case interviews were integrated to elucidate two genetically defined clusters of SARS-CoV-2 isolates detected by IGS in Düsseldorf in July 2021.ResultsCluster 1 (n = 67 Düsseldorf cases) and Cluster 2 (n = 36) were detected in a surveillance dataset of 518 high-quality SARS-CoV-2 genomes from Düsseldorf (53% of total cases, sampled mid-June to July 2021). Cluster 1 could be traced back to a complex pattern of transmission in nightlife venues following a putative importation by a SARS-CoV-2-infected return traveller (IP) in late June; 28 SARS-CoV-2 cases could be epidemiologically directly linked to IP. Supported by viral genome data from Spain, Cluster 2 was shown to represent multiple independent introduction events of a viral strain circulating in Catalonia and other European countries, followed by diffuse community transmission in Düsseldorf.ConclusionIGS enabled high-resolution tracing of SARS-CoV-2 transmission in an internationally connected city during community transmission and provided infection chain-level evidence of the downstream propagation of travel-imported SARS-CoV-2 cases. JA 2022 10.2807/1560-7917.ES.2022.27.43.2101089 Euro surveillance : bulletin Europeen sur les maladies transmissibles = European communicable disease bulletin 27 43 Torsten Houwaart Samir Belhaj Emran Tawalbeh Dirk Nagels Yara Fröhlich Patrick Finzer Pilar Ciruela Aurora Sabrià Mercè Herrero Cristina Andrés Andrés Antón Assia Benmoumene Dounia Asskali Hussein Haidar Janina Dahlen Jessica Nicolai Mygg Stiller Jacqueline Blum Christian Lange Britta Schroer Ute Osmers Christiane Grice Phillipp P. Kirfel Hassan Jomaa Daniel Strelow Lisanna Hülse Moritz Pigulla Pascal Kreuzer Alona Tyshaieva Jonas Weber Tobias Wienemann Malte Kohns Vasconcelos Katrin Hoffmann Nadine Lübke Sandra Hauka Claus Jürgen Scholz Nathalie Jazmati Klaus Göbels Rainer Zotz Klaus Pfeffer Jörg Timm Lutz Ehlkes Andreas Walker Alexander T. Dilthey article muller2022integration 2022 10.1007/s10389-021-01655-2 Journal of Public Health 30 93—97 1 A Müller H Haneke V Kirchberger G Mastella M Dommasch U Merle O Heinze A Siegmann C Spinner A Buiatti K-L Laugwitz G Schmidt E Martens article kantauskaite2022mycophenolate 2022 10.1111/ajt.16851 American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons 22 634–639 M. Kantauskaite et al article oorschot2022pallpan2 2022 Schmerz, Nervenarzt, Forum DKG, Urologe, Onkologe Oorschot Dana Stahl article donges2022interplay 2022 10.3389/fphy.2022.842180 Frontiers in Physics 10 842180 P Dönges J Wagner S Contreras E N Iftekhar S Bauer S B Mohr J Dehning A C Valdez M Kretzschmar M Mäs K Nagel V Priesemann article von_stillfried_intracranial_2022 BACKGROUND: In severe cases, SARS-CoV-2 infection leads to acute respiratory distress syndrome (ARDS), often treated by extracorporeal membrane oxygenation (ECMO). During ECMO therapy, anticoagulation is crucial to prevent device-associated thrombosis and device failure, however, it is associated with bleeding complications. In COVID-19, additional pathologies, such as endotheliitis, may further increase the risk of bleeding complications. To assess the frequency of bleeding events, we analyzed data from the German COVID-19 autopsy registry (DeRegCOVID). METHODS: The electronic registry uses a web-based electronic case report form. In November 2021, the registry included N = 1129 confirmed COVID-19 autopsy cases, with data on 63 ECMO autopsy cases and 1066 non-ECMO autopsy cases, contributed from 29 German sites. FINDINGS: The registry data showed that ECMO was used in younger male patients and bleeding events occurred much more frequently in ECMO cases compared to non-ECMO cases (56% and 9%, respectively). Similarly, intracranial bleeding (ICB) was documented in 21% of ECMO cases and 3% of non-ECMO cases and was classified as the immediate or underlying cause of death in 78% of ECMO cases and 37% of non-ECMO cases. In ECMO cases, the three most common immediate causes of death were multi-organ failure, ARDS and ICB, and in non-ECMO cases ARDS, multi-organ failure and pulmonary bacterial ± fungal superinfection, ordered by descending frequency. INTERPRETATION: Our study suggests the potential value of autopsies and a joint interdisciplinary multicenter (national) approach in addressing fatal complications in COVID-19. 2022 mar eng 1466-609X 10.1186/s13054-022-03945-x Critical Care (London, England) 26 83 1 Autopsy, Bleeding events, COVID-19, ECMO, Extracorporeal Membrane Oxygenation, Humans, Intracranial Hemorrhages, Intracranial bleeding, Male, Registry, Respiratory Distress Syndrome, Respiratory Insufficiency, SARS-CoV-2 Saskia Stillfried Roman David Bülow Rainer Röhrig Patrick Meybohm Peter Boor DeRegCOVID Collaborators# COVID-19 Autopsies (DeRegCOVID) article vonstillfried2022intracranial 2022 10.1186/s13054-022-03945-x Critical care (London, England) 26 83 S. Stillfried RD. Bülow R. Röhrig P. Meybohm P. Boor article pauli2022like 2022 10.1177/02692163221076355 Palliative Medicine Benjamin Pauli Julia Strupp Kathrin Schloesser Dana Stahl article Wyler2022-rm For coronavirus disease 2019 (COVID-19), effective and well-understood treatment options are still scarce. Since vaccine efficacy is challenged by novel variants, short-lasting immunity, and vaccine hesitancy, understanding and optimizing therapeutic options remains essential. We aimed at better understanding the effects of two standard-of-care drugs, dexamethasone and anti-severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) antibodies, on infection and host responses. By using two COVID-19 hamster models, pulmonary immune responses were analyzed to characterize effects of single or combinatorial treatments. Pulmonary viral burden was reduced by anti-SARS-CoV-2 antibody treatment and unaltered or increased by dexamethasone alone. Dexamethasone exhibited strong anti-inflammatory effects and prevented fulminant disease in a severe disease model. Combination therapy showed additive benefits with both anti-viral and anti-inflammatory potency. Bulk and single-cell transcriptomic analyses confirmed dampened inflammatory cell recruitment into lungs upon dexamethasone treatment and identified a specifically responsive subpopulation of neutrophils, thereby indicating a potential mechanism of action. Our analyses confirm the anti-inflammatory properties of dexamethasone and suggest possible mechanisms, validate anti-viral effects of anti-SARS-CoV-2 antibody treatment, and reveal synergistic effects of a combination therapy, thus informing more effective COVID-19 therapies. JA 2022 may en 10.1016/j.ymthe.2022.03.014 35339689 Mol. Ther. 30 Elsevier BV 1952—1965 5 COVID-19 treatment; SARS-CoV-2; antibody; dexamethasone; hamster; monoclonal antibody therapy; scRNA-seq; transcriptomics Emanuel Wyler Kathrin Eschke G Teixeira Alves Stefan Peidli Fabian Pott Julia Kazmierski Laura Michalick Olivia Kershaw Judith Bushe Peter Pennitz Dylan Postmus Christine Goffinet Jakob Kreye S Momsen Reincke Harald Prüss Nils Blüthgen Achim D Gruber Wolfgang M Kuebler Martin Witzenrath Markus Landthaler Geraldine Nouailles Jakob Trimpert article Fervers2022_PMID35687921 Vaccin-induzierte immunthrombotische Thrombozytopenie (VITT) mit cerebraler venöser Thrombose (CVST) ist eine unwahrscheinliche (0.0005%), aber möglicherweise tödliche Komplikation nach ChAdOx1 Impfung. Andererseits gehört Kopfschmerzen zu den häufigsten Nebenwirkungen von ChAdOx1 (29,3%). Im September 2021 schlug die American Heart Association (AHA) einen diagnostischen Workflow vor, um die risikoadaptierte Verwendung von bildgebenden Ressourcen für Patienten mit neurologischen Symptomen nach ChAdOx1 zu erleichtern. Wir wollten den AHA-Workflow in einem retrospektiven Patientenkohort bewerten, der nach ChAdOx1 an vier primären Pflegekrankenhäusern in Deutschland präsentiert. Wissenschaftliche Literatur wurde für Fallberichte von VITT mit CVST nach ChAdOx1, veröffentlicht bis 1. September 2021. Einhundertdreizehn aufeinanderfolgende Patienten (77 weiblich, mittleres Alter 38,7 +/- 11,9 Jahre) wurden an unseren Instituten bewertet, darunter ein Fall von VITT mit CVST. Weitere 228 Fallberichte von VITT mit CVST werden in jüngster Literatur veröffentlicht, die Thrombozyten-Thema (225/227 berichtet) und erhöhte d-Dimer-Spiegel (100/101 berichtet) teilen. Der AHA-Workflow hätte alle VITT-Fälle mit CVST (100% Empfindlichkeit) erkannt, die für die Diagnose (NND) benötigte Anzahl betrug 1:113. Die anfängliche Auswertung von Thrombocytopenie oder erhöhten d-Dimer-Spiegeln hätte den NND auf 1:68 reduziert, ohne dass die Empfindlichkeit gekostet wäre. Daher schlagen wir vor, dass bei normalen Thrombozyten- und d-Dimerenspiegeln der Zugang zu weiteren Diagnostiken durch die etablierten klinischen Überlegungen unabhängig von der Impfungsgeschichte begrenzt werden sollte. JA 2022 Aug 10.1016/j.jocn.2022.05.031 Journal of clinical neuroscience : official journal of the Neurosurgical Society of Australasia Fervers P Kottlors J Persigehl T Lennartz S Maus V Fischer S Styczen H Deuschl C Schlamann M Zubel S Schroeter M Maintz D Fink GR Abdullayev N article krishnaratne2022measures 2022 10.1002/14651858.CD015029 Cochrane Database of Systematic Reviews 2022 CD015029 Shari Krishnaratne Hannah Littlecott Katie Sell Jacob Burns Jeanne E Rabe Jan M Stratil Tomasz Litwin Clemens Kreutz Michaela Coenen Katharina Geffert Anne H Boger Ani Movsisyan Stefanie Kratzer Christoph Klinger Karl Wabnitz Birte Strahwald Bianca Verboom Eva Rehfuess Robert L Biallas Claire Jung-Sievers Susanne Voss Lisa M Pfadenhauer article JA 2022 Januar https://doi.org/10.1016/j.ajog.2021.06.098 American Journal of Obstetrics & Gynecology 226 135-136 DD. Jonigk article schwartz2022modelle 2022 Praxis Palliative Care 54 29-36 Aktualisierte Version der Publikation von Schwartz et al., 2021 in Der Onkologe Julika Schwartz Marco C. Reuters Marco Schallenburger Stefanie Meier Constanze Roch Lea Werner Birgit Oorschot Michael Neukirchen article wanner2022molecular 2022 10.1038/s42255-022-00552-6 Nat Metab 4 310-319 N. Wanner G. Andrieux P. Badia-i-Mompel et al article gruell2022mRNA 2022 10.1038/s41591-021-01676-0 Nature Medicine Henning Gruell et al article liu2022multiomics 2022 10.3389/fimmu.2022.838132 Frontiers in immunology 13 838132 Z. Liu et al article JA 2022 Plenarvortrag, Nationales Biobanken Symposium T. Illig article bausewein2022national 2022 10.1186/s12904-021-00898-w BMC palliative care 21 10 1 Claudia Bausewein Farina Hodiamont Nina Berges Antje Ullrich Christina Gerlach Karin Oechsle Bernhard Pauli Julia Weber Stephanie Stiel Nils Schneider Dana Stahl article heinrich_new_2022 Critically ill COVID-19 patients are at high risk for venous thromboembolism (VTE), namely deep vein thrombosis (DVT) and/or pulmonary embolism (PE), and death. The optimal anticoagulation strategy in critically ill patients with COVID-19 remains unknown. This study investigated the ante mortem incidence as well as postmortem prevalence of VTE, the factors predictive of VTE, and the impact of changed anticoagulation practice on patient survival. We conducted a consecutive retrospective analysis of postmortem COVID-19 (n = 64) and non-COVID-19 (n = 67) patients, as well as ante mortem COVID-19 (n = 170) patients admitted to the University Medical Center Hamburg-Eppendorf (Hamburg, Germany). Baseline patient characteristics, parameters related to the intensive care unit (ICU) stay, and the clinical and autoptic presence of VTE were evaluated and statistically compared between groups. The occurrence of VTE in critically ill COVID-19 patients is confirmed in both ante mortem (17%) and postmortem (38%) cohorts. Accordingly, comparing the postmortem prevalence of VTE between age- and sex-matched COVID-19 (43%) and non-COVID-19 (0%) cohorts, we found the statistically significant increased prevalence of VTE in critically ill COVID-19 cohorts (p = 0.001). A change in anticoagulation practice was associated with the statistically significant prolongation of survival time (HR: 2.55, [95% CI 1.41-4.61], p = 0.01) and a reduction in VTE occurrence (54% vs. 25%; p = 0.02). In summary, in the autopsy as well as clinical cohort of critically ill patients with COVID-19, we found that VTE was a frequent finding. A change in anticoagulation practice was associated with a statistically significantly prolonged survival time. 2022 apr eng 1999-4915 10.3390/v14040811 Viruses 14 811 4 Anticoagulants, Autopsy, COVID-19, Critical Illness, Humans, Retrospective Studies, Risk Factors, SARS-CoV-2, Venous Thromboembolism, deep vein thrombosis, pulmonary embolism, respiratory infections, venous thromboembolism Fabian Heinrich Kevin Roedl Dominik Jarczak Hanna-Lisa Goebels Axel Heinemann Ulrich Schäfer Frank Ludwig Martin Bachmann Berthold Bein Christian Friedrich Weber Karsten Sydow Marc Bota Hans-Richard Paschen Andreas Weerth Carsten Veit Oliver Detsch Philipp-Alexander Brand Stefan Kluge Benjamin Ondruschka Dominic Wichmann article heinrich2022new 2022 10.3390/v14040811 Viruses 14 811 F. Heinrich K. Roedl D. Jarczak et al article arora2022noevidence 2022 10.1038/s41423-021-00811-8 Cellular & Molecular Immunology Pragya Arora et al article ercanoglu2022nosubstantial 2022 10.1016/j.isci.2022.103951 iScience 25 103951 Mustafa S. Ercanoglu et al article zellmer2022 2022 10.3390/ijerph19010175 Int J Environ Res Public Health 19 1 S. Zellmer E. Bachmann A. Muzalyova et al article jonigk2022organ 2022 10.1007/s00428-022-03319-2 Virchows Arch D. Jonigk C. Werlein et al article jonigk_organ_2022 The use of autopsies in medicine has been declining. The COVID-19 pandemic has documented and rejuvenated the importance of autopsies as a tool of modern medicine. In this review, we discuss the various autopsy techniques, the applicability of modern analytical methods to understand the pathophysiology of COVID-19, the major pathological organ findings, limitations or current studies, and open questions. This article summarizes published literature and the consented experience of the nationwide network of clinical, neuro-, and forensic pathologists from 27 German autopsy centers with more than 1200 COVID-19 autopsies. The autopsy tissues revealed that SARS-CoV-2 can be found in virtually all human organs and tissues, and the majority of cells. Autopsies have revealed the organ and tissue tropism of SARS-CoV-2, and the morphological features of COVID-19. This is characterized by diffuse alveolar damage, combined with angiocentric disease, which in turn is characterized by endothelial dysfunction, vascular inflammation, (micro-) thrombosis, vasoconstriction, and intussusceptive angiogenesis. These findings explained the increased pulmonary resistance in COVID-19 and supported the recommendations for antithrombotic treatment in COVID-19. In contrast, in extra-respiratory organs, pathological changes are often nonspecific and unclear to which extent these changes are due to direct infection vs. indirect/secondary mechanisms of organ injury, or a combination thereof. Ongoing research using autopsies aims at answering questions on disease mechanisms, e.g., focusing on variants of concern, and future challenges, such as post-COVID conditions. Autopsies are an invaluable tool in medicine and national and international interdisciplinary collaborative autopsy-based research initiatives are essential. 2022 aug eng 1432-2307 10.1007/s00428-022-03319-2 Virchows Archiv: An International Journal of Pathology 481 139—159 2 Acute kidney damage, Autopsy, COVID-19, Diffuse alveolar damage, Humans, Immune response, Lung, Pandemics, SARS-CoV-2 Danny Jonigk Christopher Werlein Gustavo Baretton Peter Barth Rainer M. Bohle Andreas Büttner Reinhard Büttner Reinhard Dettmeyer Philip Eichhorn Sefer Elezkurtaj Irene Esposito Katja Evert Matthias Evert Falko Fend Nikolaus Gaßler Stefan Gattenlöhner Markus Glatzel Heike Göbel Elise Gradhand Torsten Hansen Arndt Hartmann Axel Heinemann Frank L. Heppner Julia Hilsenbeck David Horst Jan C. Kamp Gita Mall Bruno Märkl Benjamin Ondruschka Jessica Pablik Susanne Pfefferle Alexander Quaas Helena Radbruch Christoph Röcken Andreas Rosenwald Wilfried Roth Martina Rudelius Peter Schirmacher Julia Slotta-Huspenina Kevin Smith Linna Sommer Konrad Stock Philipp Ströbel Stephanie Strobl Ulf Titze Gregor Weirich Joachim Weis Martin Werner Claudia Wickenhauser Thorsten Wiech Peter Wild Tobias Welte Saskia Stillfried Peter Boor article oorschot2022pallpan1 2022 Der Ophthalmologe Oorschot Dana Stahl article Ebler.2022 Typical genotyping workflows map reads to a reference genome before identifying genetic variants. Generating such alignments introduces reference biases and comes with substantial computational burden. Furthermore, short-read lengths limit the ability to characterize repetitive genomic regions, which are particularly challenging for fast k-mer-based genotypers. In the present study, we propose a new algorithm, PanGenie, that leverages a haplotype-resolved pangenome reference together with k-mer counts from short-read sequencing data to genotype a wide spectrum of genetic variation-a process we refer to as genome inference. Compared with mapping-based approaches, PanGenie is more than 4 times faster at 30-fold coverage and achieves better genotype concordances for almost all variant types and coverages tested. Improvements are especially pronounced for large insertions ($\geq$50 bp) and variants in repetitive regions, enabling the inclusion of these classes of variants in genome-wide association studies. PanGenie efficiently leverages the increasing amount of haplotype-resolved assemblies to unravel the functional impact of previously inaccessible variants while being faster compared with alignment-based workflows. 2022 10.1038/s41588-022-01043-w Nature genetics 54 518—525 4 Jana Ebler Peter Ebert Wayne E. Clarke Tobias Rausch Peter A. Audano Torsten Houwaart Yafei Mao Jan O. Korbel Evan E. Eichler Michael C. Zody Alexander T. Dilthey Tobias Marschall article Lemhofer2022-fq Die Pr"avalenz des Post-COVID-Syndroms (PCS) ist noch nicht abschließend gekl"art. Die bisherigen Definitionen bilden vorrangig zeitliche Aspekte ab, lassen jedoch funktionelle Defizite sowie die Objektivierung von Symptomen außer Acht. Dies f"uhrt zu diagnostischen sowie therapeutischen Unklarheiten. In Pubmed wurde daher nach systematischen Reviews gesucht, die sich mit den Folgen einer SARS-CoV-2-Infektion befassten. Die zugrunde liegenden Definitionen sowie zeitlichen Einschlusskriterien wurden extrahiert. 16 systematische Reviews wurden eingeschlossen, davon 11 mit einer Definition des PCS. In 58 % der analysierten Einzelstudien wurden Patienten mit einer Symptomatik > 12 Wochen und damit entsprechend der Definition des PCS inkludiert. Fazit: Eine weitere Pr"azisierung der Definition des PCS ist notwendig, um Diagnostik und eine multimodale Behandlung zu erleichtern und die knappen therapeutischen Ressourcen entsprechend zu nutzen. 2022 oct Dtsch Med Wochenschr 147 Georg Thieme Verlag KG 1391—1397 21 Post-COVID-Syndrom; Long-COVID; Pr"avalenz; multimodale Therapie Christina Lemhöfer Katharina S. Appel Winfried Häuser Nora Hettich Mirjam Kohls Maria Cristina Polidori article heinrich2022postmortem 2022 10.3201/eid2801.211749 Emerg Infect Dis 28 244-247 F. Heinrich AS. Schröder AL. Gerberding et al article schwarz2022preserved 2022 10.1101/2021.10.11.21264694 Multiple Sclerosis Journal T. Schwarz et al article gorji2022 2022 10.1101/2022.01.24.22269676 MedRxiv Preprint H. Gorji N. Stauffer I. Lunati et al article daechert2022 2022 10.1007/s00430-022-00728-7 Med Microbiol Immunol 211 1 https://doi.org/10.1007/s00430-022-00728-7 C. Dächert M. Muenchhoff A. Graf et al article zickler2022replication 2022 10.1016/j.cmet.2021.12.002 Cell Metab 34 1-2 M. Zickler S. Stanelle-Bertram S. Ehret et al article neidhardt2022robotic 2022 10.1109/TMRB.2022.3146440 IEEE Trans. Med. Robot. Bionics 4 94-105 M. Neidhardt S. Gerlach R. Mieling et al article hammerschmidt2022 2022 10.1002/eji.202149645 Eur J Immunol 52 2 S.I. Hammerschmidt C. Thurm B. Bošnjak et al article reincke2022sarscov2beta 2022 10.1126/science.abm5835 Science (New York, N.Y.) S. Momsen Reincke et al article jansen_sars-cov-2_2022 Kidney failure is frequently observed during and after COVID-19, but it remains elusive whether this is a direct effect of the virus. Here, we report that SARS-CoV-2 directly infects kidney cells and is associated with increased tubule-interstitial kidney fibrosis in patient autopsy samples. To study direct effects of the virus on the kidney independent of systemic effects of COVID-19, we infected human-induced pluripotent stem-cell-derived kidney organoids with SARS-CoV-2. Single-cell RNA sequencing indicated injury and dedifferentiation of infected cells with activation of profibrotic signaling pathways. Importantly, SARS-CoV-2 infection also led to increased collagen 1 protein expression in organoids. A SARS-CoV-2 protease inhibitor was able to ameliorate the infection of kidney cells by SARS-CoV-2. Our results suggest that SARS-CoV-2 can directly infect kidney cells and induce cell injury with subsequent fibrosis. These data could explain both acute kidney injury in COVID-19 patients and the development of chronic kidney disease in long COVID. 2022 feb eng 1875-9777 10.1016/j.stem.2021.12.010 Cell Stem Cell 29 217—231.e8 2 COVID-19, Fibrosis, Humans, Kidney, Organoids, Post-Acute COVID-19 Syndrome, SARS-CoV-2, chronic kidney disease, fibrosis, human iPSC kidney organoids, kidney injury, protease blocker Jitske Jansen Katharina C. Reimer James S. Nagai Finny S. Varghese Gijs J. Overheul Marit Beer Rona Roverts Deniz Daviran Liline A. S. Fermin Brigith Willemsen Marcel Beukenboom Sonja Djudjaj Saskia Stillfried Larissa E. Eijk Mirjam Mastik Marian Bulthuis Wilfred den Dunnen Harry Goor Jan-Luuk Hillebrands Sergio H. Triana Marie-Cherelle Timm Bartholomeus T. Berge Martijn Broek Quincy Nlandu Joelle Heijnert Eric M. J. Bindels Remco M. Hoogenboezem Fieke Mooren Christoph Kuppe Pascal Miesen Katrien Grünberg Ties Ijzermans Eric J. Steenbergen Jan Czogalla Michiel F. Schreuder Nico Sommerdijk Peter Boor Victor G. Puelles Jürgen Floege Tobias B. Huber COVID Moonshot consortium Ronald P. Rij Ivan G. Costa Rebekka K. Schneider Bart Smeets Rafael Kramann article layer2022sarscov2 2022 10.1016/j.ijid.2022.02.045 International Journal of Infectious Diseases 118 126—131 E Layer S Hoehl M Widera D Bojkova T Westphal R Gottschalk B Boeddinghaus J Schork S Ciesek U Goetsch article backhaus2022sars 2022 https://doi.org/10.1016/j.puhe.2022.03.009 Public Health DOI: https://doi.org/10.1016/j.puhe.2022.03.009 (mit NUM-Förderung) I. Backhaus D. Hermsen J. Timm F. Boege N. Lübke T. Degode K. Göbels N. Dragano article arora2022sarscov2variants 2022 10.1016/j.celrep.2022.110754 Cell Reports 39 110754 Pragya Arora et al article Steinbeis2022_PMID34871947 Prospektive und longitudinale Daten zur Lungenverletzung über ein Jahr nach akuter Coronavirus-Krankheit 2019 (COVID-19) sind spärlich. Die Patienten mit akutem COVID-19 wurden in ein laufendes, prospektives Beobachtungsstudium eingeschrieben und 6 Wochen, 3, 6 und 12 Monate nach Beginn der Symptome von COVID-19 untersucht. Chest CT-Scans, Lungenfunktion und Symptome, die von St. Georges Respiratory Questionnaire bewertet wurden, wurden verwendet, um Atembeschränkungen zu bewerten. Die Patienten wurden nach Schwere der akuten COVID-19 gestreut. Das mittlere Alter aller Patienten betrug 57 Jahre, 37,8% waren weiblich. Höheres Alter, männliches Geschlecht und höheres BMI wurden mit akuter COVID-19 Schwere verbunden (p < 0,0001, 0,001 bzw. 0,004). Auch die Lungenbeschränkung und die verringerte Kohlenmonoxiddiffusionskapazität war mit der Krankheitsschwere verbunden. Bei Patienten mit eingeschränkter und beeinträchtigter Diffusionskapazität verbesserte sich FVC über 12 Monate von 61,32 bis 71,82, DC von 68,92 bis 76,95, D_LCO von 60,18 bis 68,98 und K_CO von 81,28 bis 87,80 (prozentige prognostizierte Werte; p = 0,002, 0,045, 0,0002 und 0,0005). Der CT-Score der Lungenbeteiligung in der akuten Phase war mit einer Restriktion und Verringerung der Diffusionskapazität im Anschluss verbunden. Atemwegserkrankungen verbesserten sich bei Patienten in höheren Schweregruppen während der Folge, nicht aber bei Patienten mit zunächst milder Erkrankung. Schwere des Atemversagens während der COVID-19 korreliert mit dem Grad der Lungenfunktion Beeinträchtigung und Atmungsqualität des Lebens im Jahr nach akuter Infektion. JA 2022 Jan 10.1016/j.rmed.2021.106709 Respiratory medicine Steinbeis F Thibeault C Doellinger F Ring RM Mittermaier M Ruwwe-Glösenkamp C Alius F Knape P Meyer HJ Lippert LJ Helbig ET Grund D Temmesfeld-Wollbrück B Suttorp N Sander LE Kurth F Penzkofer T Witzenrath M Zoller T article JA 2022 Respir Med. 2022;191:106709. F Steinbeis C. Thibeault F Doellinger RM Ring M Mittermaier Caroline Ruwwe-Glösenkamp P Knape HJ Meyer LJ Lippert ET Helbig Bettina Temmesfeld N Suttorp Leif E Sander Florian Kurth T Penzkofer Martin Witzenrath T Zoller D Grund article Bahmer2022-lo Background: Post-COVID syndrome (PCS) is an important sequela of COVID-19, characterised by symptom persistence for >3 months, post-acute symptom development, and worsening of pre-existing comorbidities. The causes and public health impact of PCS are still unclear, not least for the lack of efficient means to assess the presence and severity of PCS. Methods: COVIDOM is a population-based cohort study of polymerase chain reaction (PCR) confirmed cases of SARS-CoV-2 infection, recruited through public health authorities in three German regions (Kiel, Berlin, W"urzburg) between November 15, 2020 and September 29, 2021. Main inclusion criteria were (i) a PCR confirmed SARS-CoV-2 infection and (ii) a period of at least 6 months between the infection and the visit to the COVIDOM study site. Other inclusion criteria were written informed consent and age $\geq$18 years. Key exclusion criterion was an acute reinfection with SARS-CoV-2. Study site visits included standardised interviews, in-depth examination, and biomaterial procurement. In sub-cohort Kiel-I, a PCS (severity) score was developed based upon 12 long-term symptom complexes. Two validation sub-cohorts (W"urzburg/Berlin, Kiel-II) were used for PCS score replication and identification of clinically meaningful predictors. This study is registered at clinicaltrials.gov (NCT04679584) and at the German Registry for Clinical Studies (DRKS, DRKS00023742). Findings: In Kiel-I (n = 667, 57% women), 90% of participants had received outpatient treatment for acute COVID-19. Neurological ailments (61·5%), fatigue (57·1%), and sleep disturbance (57·0%) were the most frequent persisting symptoms at 6-12 months after infection. Across sub-cohorts (W"urzburg/Berlin, n = 316, 52% women; Kiel-II, n = 459, 56% women), higher PCS scores were associated with lower health-related quality of life (EQ-5D-5L-VAS/-index: r = -0·54/ -0·56, all p < 0·0001). Severe, moderate, and mild/no PCS according to the individual participant's PCS score occurred in 18·8%, 48·2%, and 32·9%, respectively, of the Kiel-I sub-cohort. In both validation sub-cohorts, statistically significant predictors of the PCS score included the intensity of acute phase symptoms and the level of personal resilience. Interpretation: PCS severity can be quantified by an easy-to-use symptom-based score reflecting acute phase disease burden and general psychological predisposition. The PCS score thus holds promise to facilitate the clinical diagnosis of PCS, scientific studies of its natural course, and the development of therapeutic interventions. Funding: The COVIDOM study is funded by the Network University Medicine (NUM) as part of the National Pandemic Cohort Network (NAPKON). JA 2022 sep en 10.1016/j.eclinm.2022.101549 35875815 EClinicalMedicine 51 Elsevier BV 101549 101549 COVID-19; Fatigue; LongCOVID, Post-acute sequelae of SARS-CoV-2 infection (PASC); Post-COVID-Syndrome (PCS); Resilience; SARS-CoV-2 infection Thomas Bahmer Christoph Borzikowsky Wolfgang Lieb Anna Horn Lilian Krist Julia Fricke Carmen Scheibenbogen Klaus F Rabe Walter Maetzler Corina Maetzler Martin Laudien Derk Frank Sabrina Ballhausen Anne Hermes Olga Miljukov Karl Georg Haeusler Nour Eddine El Mokhtari Martin Witzenrath Jörg Janne Vehreschild Dagmar Krefting Daniel Pape Felipe A Montellano Mirjam Kohls Caroline Morbach Stefan Störk Jens-Peter Reese Thomas Keil Peter Heuschmann Michael Krawczak Stefan Schreiber NAPKON group article medenwald2022shift 2022 10.1007/s00066-021-01883-1 Strahlenther Onkol 198 334—345 4 Daniel Medenwald Thomas Brunner Hans Christiansen et al article schug2022sick 2022 Feb 10.3390/ijerph19041947 International Journal of Environmental Research and Public Health 19 1947 4 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8872054/pdf/ijerph-19-01947.pdf C. Schug F. Geiser N. Hiebel P. Beschoner L. Jerg-Bretzke K. Weidner E. Morawa Y. Erim article koll2022statistical 2022 10.1038/s41597-022-01669-9 Sci Data 9 776 1 CEM Koll SM Hopff T Meurers CH Lee M Kohls C Stellbrink C Thibeault L Reinke S Steinbrecher S Schreiber Dana Stahl article JA 2022 10.1038/s41597-022-01669-9 Sci Data 9, 776 CEM Koll SM Hopff T Meurers article mayer2022 2022 10.1007/s00405-021-06992-2 Eur Arch Otorhinolaryngol 279 2 M. Mayer S. Zellmer J. Zenk et al article hoven2022striving 2022 10.3389/ijph.2022.1604542 International Journal of Public Health 67 1604542 DOI: 10.3389/ijph.2022.1604542 H. Hoven N. Dragano P. Angerer C. Apfelbacher I. Backhaus B. Hoffmann A. Icks S. Wilm F. Fangerau F. Söhner article peter2022tacrolimusresistant 2022 10.1016/j.omtm.2022.02.012 Molecular therapy. Methods & clinical development 25 52–73 L. Peter et al article gruendner2022architecture 2022 Mai https://doi.org/10.2196/36709 35486893 JMIR Medical Informatics 10 e36709 5 Forthcoming/In press, DOI: 10.2196/preprints.36709 Julian Gruendner Noemi Deppenwiese Michael Folz Thomas Köhler Björn Kroll Hans-Ulrich Prokosch Lorenz Rosenau Mathias Rühle Marc-Anton Scheidl Christina Schüttler Brita Sedlmayr Alexander Twrdik Alexander Kiel Raphael W Majeed article czypionka2022benefits 2022 10.1016/j.lanepe.2021.100294 The Lancet Regional Health-Europe 13 100294 T Czypionka E N Iftekhar B Prainsack V Priesemann S Bauer A C Valdez S Cuschieri E Glaab E Grill J Krutzinna C Lionis H Machado C Martins G N Pavlakis M Perc E Petelos M Pickersgill A Skupin E Schernhammer E Szczurek S Tsiodras P Willeit P Wilmes article krasemann2022bloodbrain 2022 10.1016/j.stemcr.2021.12.011 Stem Cell Reports 17 307-320 S. Krasemann U. Haferkamp S. Pfefferle et al article ackermann2022bronchial 2022 10.1164/rccm.202103-0594IM Am J Respir Crit Care Med 205 121-125 P. Tafforeau WL. Wagner et al article JA 2022 Januar 1 10.1164/rccm.202103-0594IM American Journal of Respiratory and Critical Care 205 121-125 P. Tafforeau WL. Wagner CL. Walsh C. Werlein MP. Kühnel et al article Prokosch2022-pq COVID-19 has challenged the healthcare systems worldwide. To quickly identify successful diagnostic and therapeutic approaches large data sharing approaches are inevitable. Though organizational clinical data are abundant, many of them are available only in isolated silos and largely inaccessible to external researchers. To overcome and tackle this challenge the university medicine network (comprising all 36 German university hospitals) has been founded in April 2020 to coordinate COVID-19 action plans, diagnostic and therapeutic strategies and collaborative research activities. 13 projects were initiated from which the CODEX project, aiming at the development of a Germany-wide Covid-19 Data Exchange Platform, is presented in this publication. We illustrate the conceptual design, the stepwise development and deployment, first results and the current status. 2022 may en Stud. Health Technol. Inform. 294 674—678 Covid-19; Real world data; data sharing network; pandemic preparedness Hans-Ulrich Prokosch Thomas Bahls Martin Bialke Jürgen Eils Christian Fegeler Julian Gruendner Birger Haarbrandt Christopher Hampf Wolfgang Hoffmann Hauke Hund Marvin Kampf Lorenz A Kapsner Piotr Kasprzak Oliver Kohlbacher Dagmar Krefting Jonathan M Mang Michael Marschollek Sebastian Mate Armin Müller Fabian Prasser Julian Sass Sebastian Semler Holger Stenzhorn Sylvia Thun Sven Zenker Roland Eils article Schons2022-qt The German government initiated the Network University Medicine (NUM) in early 2020 to improve national research activities on the Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) pandemic. To this end, 36 German Academic Medical Centers started to collaborate on 13 projects, with the largest being the National Pandemic Cohort Network (NAPKON). The NAPKON's goal is creating the most comprehensive Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) cohort in Germany. Within NAPKON, adult and pediatric patients are observed in three complementary cohort platforms (Cross-Sectoral, High-Resolution and Population-Based) from the initial infection until up to three years of follow-up. Study procedures comprise comprehensive clinical and imaging diagnostics, quality-of-life assessment, patient-reported outcomes and biosampling. The three cohort platforms build on four infrastructure core units (Interaction, Biosampling, Epidemiology, and Integration) and collaborations with NUM projects. Key components of the data capture, regulatory, and data privacy are based on the German Centre for Cardiovascular Research. By April 01, 2022, 34 university and 40 non-university hospitals have enrolled 5298 patients with local data quality reviews performed on 4727 (89%). 47% were female, the median age was 52 (IQR 36-62-) and 50 pediatric cases were included. 44% of patients were hospitalized, 15% admitted to an intensive care unit, and 12% of patients deceased while enrolled. 8845 visits with biosampling in 4349 patients were conducted by April 03, 2022. In this overview article, we summarize NAPKON's design, relevant milestones including first study population characteristics, and outline the potential of NAPKON for German and international research activities.Trial registration https://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT04768998 . https://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT04747366 . https://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT04679584. JA 2022 aug en 10.1007/s10654-022-00896-z 35904671 Eur. J. Epidemiol. 37 Springer Science and Business Media LLC 849—870 8 COVID-19; Cross-sectoral; Epidemiology; Longitudinal study; Population-based; Prospective national cohort; SARS-CoV-2 Maximilian Schons Lisa Pilgram Jens-Peter Reese Melanie Stecher Gabriele Anton Katharina S Appel Thomas Bahmer Alexander Bartschke Carla Bellinghausen Inga Bernemann Markus Brechtel Folke Brinkmann Clara Brünn Christine Dhillon Cornelia Fiessler Ramsia Geisler Eckard Hamelmann Stefan Hansch Frank Hanses Sabine Hanß Susanne Herold Ralf Heyder Anna-Lena Hofmann Sina Marie Hopff Anna Horn Carolin Jakob Steffi Jiru-Hillmann Thomas Keil Yascha Khodamoradi Mirjam Kohls Monika Kraus Dagmar Krefting Sonja Kunze Florian Kurth Wolfgang Lieb Lena Johanna Lippert Roberto Lorbeer Bettina Lorenz-Depiereux Corina Maetzler Olga Miljukov Matthias Nauck Daniel Pape Valentina Püntmann Lennart Reinke Christoph Römmele Stefanie Rudolph Julian Sass Christian Schäfer Jens Schaller Mario Schattschneider Christian Scheer Margarete Scherer Sein Schmidt Julia Schmidt Kristina Seibel Dana Stahl Fridolin Steinbeis Stefan Störk Maike Tauchert Johannes Josef Tebbe Charlotte Thibeault Nicole Toepfner Kathrin Ungethüm Istvan Vadasz Heike Valentin Silke Wiedmann Thomas Zoller Eike Nagel Michael Krawczak Christof Kalle Thomas Illig Stefan Schreiber Martin Witzenrath Peter Heuschmann Jörg Janne Vehreschild NAPKON Research Group article borusiak2022impact 2022 Arch Public Health 80 113 1 Online verfügbar unter: \urlhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8990278/pdf/13690_2022_Article_876.pdf P Borusiak Y Mazheika S Bauer E Haberlandt I Krois C Fricke L Simon P Beschoner L Jerg-Bretzke F Geiser N Hiebel K Weidner E Morawa Y Erim article hannemann2022impact 2022 10.1371/journal.pone.0264290 PLoS One 17 e0264290 2 J Hannemann Y Erim E Morawa L Jerg-Bretzke P Beschoner F Geiser N Hiebel K Weidner S Steudte-Schmiedgen article schreiber2022mek1 2022 10.1007/s00018-021-03917-x Cell Mol Life Sci 79 65 Andre Schreiber Dorothee Viemann Janine Schöning Sebastian Schloer Andres Mecate Zambrano et al. Brunotte article wratil2022 2022 10.1038/s41591-022-01715-4 Nat Med Advance online publication P.R. Wratil M. Stern A. Priller et al article voigtlaender_thromboembolic_2022 Unlabelled Image 2022 oct 0049-3848 10.1016/j.thromres.2022.08.021 Thrombosis Research 218 171—176 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9420077/ Minna Voigtlaender Carolin Edler Moritz Gerling Julia Schädler Benjamin Ondruschka Ann Sophie Schröder Jan Sperhake Stephan Ehrhardt Lin Wang Munif Haddad Verena Kiencke Thomas Renné Kevin Roedl Stefan Kluge Dominic Wichmann Florian Länger article kamp_time-dependent_2022 (1) Background: In COVID-19 survivors there is an increased prevalence of pulmonary fibrosis of which the underlying molecular mechanisms are poorly understood; (2) Methods: In this multicentric study, n = 12 patients who succumbed to COVID-19 due to progressive respiratory failure were assigned to an early and late group (death within ≤7 and \textgreater7 days of hospitalization, respectively) and compared to n = 11 healthy controls; mRNA and protein expression as well as biological pathway analysis were performed to gain insights into the evolution of pulmonary fibrogenesis in COVID-19; (3) Results: Median duration of hospitalization until death was 3 (IQR25-75, 3-3.75) and 14 (12.5-14) days in the early and late group, respectively. Fifty-eight out of 770 analyzed genes showed a significantly altered expression signature in COVID-19 compared to controls in a time-dependent manner. The entire study group showed an increased expression of BST2 and IL1R1, independent of hospitalization time. In the early group there was increased activity of inflammation-related genes and pathways, while fibrosis-related genes (particularly PDGFRB) and pathways dominated in the late group; (4) Conclusions: After the first week of hospitalization, there is a shift from pro-inflammatory to fibrogenic activity in severe COVID-19. IL1R1 and PDGFRB may serve as potential therapeutic targets in future studies. 2022 jan eng 1422-0067 10.3390/ijms23031583 International Journal of Molecular Sciences 23 1583 3 Aged, COVID-19, Female, Hospital Mortality, Hospitalization, Humans, Lung, Male, Middle Aged, Pulmonary Fibrosis, Respiratory Insufficiency, SARS-CoV-2, inflammation, pulmonary fibrosis Jan C. Kamp Lavinia Neubert Helge Stark Christopher Werlein Jan Fuge Axel Haverich Alexandar Tzankov Konrad Steinestel Johannes Friemann Peter Boor Klaus Junker Marius M. Hoeper Tobias Welte Florian Laenger Mark P. Kuehnel Danny D. Jonigk article kamp2022time 2022 10.3390/ijms23031583 Int J Mol Sci 23 JC. Kamp L. Neubert et al article Wulff.2022 Early anticipation of COVID-19 infection chains within hospitals is of high importance for initiating suitable measures at the right time. Infection control specialists can be supported by application systems able of consolidating and analyzing heterogeneous, up-to-now non-standardized and distributed data needed for tracking COVID-19 infections and infected patients' hospital contacts. We developed a system, Co-Surv-SmICS, assisting in infection chain detection, in an open and standards-based way to ensure reusability of the system across institutions. Data is modelled in alignment to various national modelling initiatives and consensus data definitions, queried in a standardized way by the use of OpenEHR as information modelling standard and its associated model-based query language, analyzed and interactively visualized in the application. A first version has been published and will be enhanced with further features and evaluated in detail with regard to its potentials to support specialists during their work against SARS-CoV-2. JA 2022 10.3233/SHTI220168 Studies in health technology and informatics 290 699—703 Antje Wulff Pascal Biermann Tatiana Landesberger Tom Baumgartl Christoph Schmidt Kristina Schick Paul Waldstein Yufei Zhu Dagmar Krefting Simone Scheithauer Michael Marschollek article von_stillfried_update_2022 Hintergrund Obduktionen sind ein wichtiges Instrument zum Verständnis von Krankheiten, einschließlich COVID-19. Material und Methoden Das im April 2020 eingerichtete und gestartete Deutsche Register für COVID-19-Obduktionen (DeRegCOVID) dient als elektronisches Rückgrat des Nationalen Obduktionsnetzwerks (NATON), das Anfang 2022 im Anschluss an DEFEAT PANDEMIcs gestartet worden ist. Ergebnisse Die vernetzte, kollaborative Obduktionsforschung des NATON-Konsortiums wird durch eine beispiellose Zusammenarbeit von 138 Personen an mehr als 35 universitären und nichtuniversitären Obduktionszentren ermöglicht, durch die Daten, einschließlich Daten zu Biomaterialien aus Pathologie, Neuropathologie und Rechtsmedizin, im DeRegCOVID gesammelt sowie gewebebasierte Forschung und Methodenentwicklung betrieben werden. Aus den teilnehmenden Obduktionszentren sind inzwischen mehr als 145 Publikationen hervorgegangen, die verschiedene grundlagenwissenschaftliche und klinische Aspekte von COVID-19 beleuchten, z. B. thromboembolische Ereignisse, Organtropismus, Nachweismethoden von SARS-CoV‑2 oder die Infektiosität von SARS-CoV‑2 bei der Obduktion. Schlussfolgerungen Die teilnehmenden Zentren haben den hohen Wert der Autopsie und der aus der Autopsie gewonnenen Daten und Biomaterialien für die moderne Medizin unter Beweis gestellt. Die geplante langfristige Fortführung und Weiterentwicklung des Registers und Netzwerks und die offene und partizipative Gestaltung ermöglichen es, alle interessierten Partner miteinzubeziehen. 2022 2731-7188 10.1007/s00292-022-01117-w Pathologie (Heidelberg, Germany) 43 101—105 Suppl 1 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9483541/ Saskia Stillfried Benita Freeborn Svenja Windeck Peter Boor article schug2022vaccination 2022 Jan 10.1007/s00103-021-03418-6 Bundesgesundheitsblatt, Gesundheitsforschung, Gesundheitsschutz 65 74—85 1 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8458789/pdf/103_2021_Article_3418.pdf C. Schug Y. Erim F. Geiser N. Hiebel P. Beschoner L. Jerg-Bretzke K. Weidner S. Steudte-Schmiedgen A. Borho M. Lieb E. Morawa article stroehlein2022dtscharztebl 2022 10.3238/arztebl.m2022.0006 Dtsch Arztebl Int 119 23-30 Claudia Struwe Martin Golinski Clemens Grimm Steffen Dickel Kathrin Grummich Monika Nothacker Sebastian Voigt-Radloff Jörg Meerpohl Onnen Moerer incollection mayer2022pandemic 2022 In the Realm of Corona Normativities II Verlag Vitorrio Klostermann Gephart, W K Mayer article dickel2021nationwide 2021 Jul 29 10.3390/jcm10153363 J Clin Med 10 3363 15 S. Dickel C. Grimm M. Popp C. Struwe A. Sachkova M. Golinski C. Seeber F. Fichtner D. Heise P. Kranke W. Meissner S. Laudi S. Voigt-Radloff J. Meerpohl O. Moerer Group On Behalf Of The German CEOsys Study article JA 2021 Januar 20 https://doi.org/10.1007/s00428-020-03014-0 Virchows Arch 479 97-108 Katja Evert Torsten Dienemann Christoph Brochhausen Dirk Lunz Matthias Lubnow Markus Ritzka et al article grimm2021targeted 2021 Jun 19 10.7759/cureus.15755 Cureus 13 e15755 6 C. Grimm S. Dickel A. Sachkova M. Popp M. Golinksi F. Fichtner P. Kranke C. Seeber S. Laudi S. Voigt-Radloff O. Moerer article holzmann2021covid 2021 Jul 12 10.3390/vaccines9070777 Vaccines (Basel) 9 777 7 C. Holzmann-Littig M. C. Braunisch P. Kranke M. Popp C. Seeber F. Fichtner B. Littig J. Carbajo-Lozoya T. Frank J. J. Meerpohl B. Haller C. Schmaderer article JA 2021 Februar 09 https://doi.org/10.1007/s00292-021-00918-9 Pathologe 42 164-171 C. Werlein Florian Länger MP. Kühnel DD. Jonigk article jansky2021it 2021 10.1371/journal.pone.0260767 PLOS ONE 16 e0260767 12 Maximilian Jansky Frank Schade Nina Rieder Daniel Lohrmann Christoph Gebel Dana Stahl article schloesser2021saying 2021 10.1186/s12913-021-06987-z BMC Health Serv Res 21 998 Kathrin Schloesser Steffen T. Simon Benjamin Pauli Dana Stahl article gebel2021auswirkungen 2021 10.1055/a-1714-8336 Gesundheitswesen EFirst Christoph Gebel Loredana Kloppenburg Maximilian K. Jansky Friedemann Nauck Frank Schade Ulrich Weddin article reichardt_3d_2021 For the first time, we have used phase-contrast X-ray tomography to characterize the three-dimensional (3d) structure of cardiac tissue from patients who succumbed to Covid-19. By extending conventional histopathological examination by a third dimension, the delicate pathological changes of the vascular system of severe Covid-19 progressions can be analyzed, fully quantified and compared to other types of viral myocarditis and controls. To this end, cardiac samples with a cross-section of 3.5mm were scanned at a laboratory setup as well as at a parallel beam setup at a synchrotron radiation facility the synchrotron in a parallel beam configuration. The vascular network was segmented by a deep learning architecture suitable for 3d datasets (V-net), trained by sparse manual annotations. Pathological alterations of vessels, concerning the variation of diameters and the amount of small holes, were observed, indicative of elevated occurrence of intussusceptive angiogenesis, also confirmed by high-resolution cone beam X-ray tomography and scanning electron microscopy. Furthermore, we implemented a fully automated analysis of the tissue structure in the form of shape measures based on the structure tensor. The corresponding distributions show that the histopathology of Covid-19 differs from both influenza and typical coxsackie virus myocarditis. 2021 2050-084X 10.7554/eLife.71359 eLife 10 e71359 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8747495/ Marius Reichardt Patrick Moller Jensen Anders Bjorholm Dahl Harshit Shah Florian Länger Christopher Werlein Mark P Kuehnel Danny Jonigk Tim Salditt article reichardt2021virtual 2021 10.7554/eLife.71359 Elife 10 e71359 M. Reichardt P. Moller Jensen et al article vesper2021barcoded 2021 10.3389/fimmu.2021.730766 Frontiers in immunology 12 N. Vesper et al article iftekhar2021look 2021 10.1016/j.lanepe.2021.100185 The Lancet Regional Health-Europe 8 100185 E N Iftekhar V Priesemann R Balling S Bauer P Beutels A C Valdez S Cuschieri T Czypionla U Dumpis E Glaab E Grill C Hanson P Hotulainen P Klimek M Kretzschmar T Krüger J Krutzinna N Low H Machado C Martins M McKee S B Mohr A Nassehi M Perc E Petelos M Pickersgrill B Prainsack J Rocklöv E Schernhammer A Staines E Szczurek S Tsiodras S Van Gucht P Willeit article wang2021multiplex 2021 10.1101/2021.12.03.21267253 medRxiv Zhiyong Wang Adam Cryar Oliver Lemke David Ludwig Pinkus Tober-Lau et al. Helbig article mahoney2021novelclass 2021 10.1073/pnas.2108728118 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 118 M. Mahoney et al article peter2021pair 2021 10.1002/eji.202149374 European journal of immunology A. S. Peter et al article peter2021 2021 10.1002/eji.202149374 Eur J Immunol https://doi.org/10.1002/eji.202149374 A. S. Peter E. Roth S. R. Schulz et al article schuh2021surrogate 2021 10.1002/eji.202149302 European journal of immunology W. Schuh et al article demichev2021time 2021 10.1016/j.cels.2021.05.005 Cell Syst 12 780—794.e7 8 V Demichev P Tober-Lau O Lemke T Nazarenko C Thibeault H Whitwell A Röhl A Freiwald L Szyrwiel D Ludwig Dana Stahl article demichev2021time-resolved 2021 Cell Syst 12 780—+ V Demichev P Tober-Lau O Lemke T Nazarenko C Thibeault et al. Whitwell article JA 2021 Cell Syst. 2021;12(8):780-794.e7 Vadim Demichev P. Tober-Lau O Lemke T Nazarenko C. Thibeault H Whitwell A Röhl A Freiwald L Szyrwiel D Ludwig ET Helbig P Stubbemann LJ Lippert S. Klein M Mittermaier F Machleidt Clara Vázquez García Caroline Ruwwe-Glösenkamp T Lingscheid Miriam S Stegemann Philipp Enghard Anne Uhrig Holger C Müller-Redetzky S Hippenstiel Martin Witzenrath Norbert Suttorp Michael Mülleder Leif E Sander Pa-COVID-19 group Markus Ralser Florian Kurth C Correia-Melo SK Aulakh NM Grüning O Blyuss S Vernardis M White CB Messner M Joannidis T Sonnweber A Pizzini Y Wohlfarter S Sahanic R Hilbe B Schaefer S Wagner L Bosquillon de Jarcy M Pfeiffer L Jürgens S Denker D Zickler A Zelezniak A Campbell C Hayward DJ Porteous RE Marioni H Zoller J Löffler-Ragg MA Keller I Tancevski JF Timms A Zaikin M Ramharter K Lilley article demichev2021timeresolved 2021 10.1016/j.cels.2021.05.005 Cell Systems Vadim Demichev et al article brummer2021accuracy 2021 10.1371/journal.pmed.1003735 PLOS Medicine 18 8 https://doi.org/10.1371/journal.pmed.1003735 LE Brümmer S Katzenschlager M Gaeddert Dana Stahl article stanifer2021adapting 2021 10.3791/62857 JoVE e62857 166 Megan L Stanifer Steeve Boulant article murbe2021b 2021 10.1038/s41598-021-93281-x Sci Rep 11 D. Mürbe M. Kriegel J. Lange et al article murbe2021a 2021 10.1371/journal.pone.0246819 PLoS ONE 16 2 D. Mürbe M. Kriegel J. Lange et al article schwartz2021allgemeine 2021 10.1007/s00761-021-00970-3 Onkologe 27 686-690 Julika Schwartz Marco C. Reuters Marco Schallenburger Dana Stahl article weber2021ambulante 2021 10.1007/s00761-021-00974-z Onkologe 27 783-789 Jana P. Weber Juliane M. Tielker Nasra Kamandi et al article priesemann2021action 2021 10.1016/S0140-6736(21)00150-1 The Lancet 397 469—470 10273 V. Priesemann R. Balling M.M. Brinkmann S. Ciesek T. Czypionka I. Eckerle G. Giordano C. Hanson Z. Hel P. Hotulainen P. Klimek A. Nassehi A. Peichl M. Perc E. Petelos B. Prainsack E. Szczurek article bagheri2021a 2021 10.1073/pnas.2110117118 PNAS 118 49 G. Bagheri B. Thiede B. Hejazi et al article schulze2021analysis 2021 10.1093/infdis/jiab489 J Infect Dis Julia Schulze Christoph Mache Alexander Balazs David Frey Daniela Niemeyer et al. 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Thibeault S Schreiber T Bahmer Lizon Fiedler-Lacombe Arne Blumentritt Michael Stahl Wolfgang Hoffmann Sabine Hanß Dagmar Krefting Christian Schäfer Matthias Nauck Jens Schaller M. Hoffmann M Kraus On Behalf Of The Napkon Study Group article walker2021 2021 10.1101/2021.02.13.21251678 Epidemiology https://doi.org/10.1101/2021.02.13.21251678 preprint A. Walker T. Houwaart P. Finzer et al article walker2021a 2021 10.1093/cid/ciab588 Clin Infect Dis 74 6 A. Walker T. Houwaart P. Finzer et al article ankerhold2021 2021 10.1101/2021.06.25.449893 Immunology Preprint J. Ankerhold S. Giese P. Kolb et al article thibeault2021clinical 2021 10.1007/s15010-021-01594-w Infection 49 703—714 4 C Thibeault B Mühlemann ET Helbig M Mittermaier T Lingscheid P Tober-Lau LA Meyer-Arndt L Meiners P Stubbemann SS Haenel Dana Stahl article thibeault2021clinical 2021 10.1007/s15010-021-01594-w Infection C. 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Osterman M. Iglhaut A. Lehner et al article Osterman.2021 A versatile portfolio of diagnostic tests is essential for the containment of the severe acute respiratory syndrome coronavirus type 2 (SARS-CoV-2) pandemic. Besides nucleic acid-based test systems and point-of-care (POCT) antigen (Ag) tests, quantitative, laboratory-based nucleocapsid Ag tests for SARS-CoV-2 have recently been launched. Here, we evaluated four commercial Ag tests on automated platforms and one POCT to detect SARS-CoV-2. We evaluated PCR-positive (n = 107) and PCR-negative (n = 303) respiratory swabs from asymptomatic and symptomatic patients at the end of the second pandemic wave in Germany (February-March 2021) as well as clinical isolates EU1 (B.1.117), variant of concern (VOC) Alpha (B.1.1.7) or Beta (B.1.351), which had been expanded in a biosafety level 3 laboratory. The specificities of automated SARS-CoV-2 Ag tests ranged between 97.0 and 99.7% (Lumipulse G SARS-CoV-2 Ag (Fujirebio): 97.03%, Elecsys SARS-CoV-2 Ag (Roche Diagnostics): 97.69%; LIAISONćircledR SARS-CoV-2 Ag (Diasorin) and SARS-CoV-2 Ag ELISA (Euroimmun): 99.67%). In this study cohort of hospitalized patients, the clinical sensitivities of tests were low, ranging from 17.76 to 52.34%, and analytical sensitivities ranged from 420,000 to 25,000,000 Geq/ml. In comparison, the detection limit of the Roche Rapid Ag Test (RAT) was 9,300,000 Geq/ml, detecting 23.58% of respiratory samples. Receiver-operating-characteristics (ROCs) and Youden's index analyses were performed to further characterize the assays' overall performance and determine optimal assay cutoffs for sensitivity and specificity. VOCs carrying up to four amino acid mutations in nucleocapsid were detected by all five assays with characteristics comparable to non-VOCs. In summary, automated, quantitative SARS-CoV-2 Ag tests show variable performance and are not necessarily superior to a standard POCT. The efficacy of any alternative testing strategies to complement nucleic acid-based assays must be carefully evaluated by independent laboratories prior to widespread implementation. JA 2021 10.1007/s00430-021-00719-0 Medical microbiology and immunology 210 263—275 5-6 Andreas Osterman Maximilian Iglhaut Andreas Lehner Patricia Späth Marcel Stern Hanna Autenrieth Maximilian Muenchhoff Alexander Graf Stefan Krebs Helmut Blum Armin Baiker Natascha Grzimek-Koschewa Ulrike Protzer Lars Kaderali Hanna-Mari Baldauf Oliver T. Keppler article georg2021complement 2021 10.1016/j.cell.2021.12.040 Cell Philipp Georg et al article georg2021complement 2021 10.1016/j.cell.2021.12.040 Cell P. Georg R. Astaburuaga-García L. Bonaguro et al article foh2021 2021 10.1183/13993003.04004-2020 Eur Respir J Advance online publication B. Föh M. Borsche A. 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Bartenschlager et al article baumann2021covid 2021 10.1007/s44192-021-00002-x Discov Ment Health 1 2 1 Michael Baumann article ritschel2021covid 2021 10.1007/s00292-021-00923-w Pathologe 42 172—182 Nadine Ritschel Helena Radbruch Christian Herden Nico Schneider Carsten Dittmayer et al. Franz article adhikary2021covid 2021 Nat Rev Mater 1—3 Q Ul Ain AC Hocke S Hedtrich article roth2021covid 2021 Pathologe 42 147-148 2 German, doi: 10.1007/s00292-021-00916-x Wolfram Roth Peter Boor article gaitzsch2021covid19 2021 10.1097/HS9.0000000000000603 HemaSphere 5 e603 Eva Gaitzsch et al article gaitzsch2021 2021 10.1097/HS9.000000000000060 Hemasphere 5 7 E. Gaitzsch V. Passerini E. Khatamzas et al article heinemann2021b 2021 DGHM https://www.egms.de/static/de/journals/dgkh/2021-16/dgkh000402.shtml Manuscript submitted S. Heinemann A. Bludau H. Kaba et al article bludau2021 2021 DGHM https://www.dghm-kongress.de/fileadmin/congress/media/dghm2021/pdf/DGHM_2021_digital_Programme_booklet.pdf Manuscript submitted A. Bludau M. Anton S. 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Radbruch Christian Herden Nils Schneider et al article ackermann2021covid 2021 Pathologe 42 164-171 2 German, doi: 10.1007/s00292-021-00918-9 Christopher Werlein Florian Länger Michael P. Kühnel Danny D. Jonigk article loyal2021cross-reactive 2021 Science L Loyal J Braun L Henze B Kruse M Dingeldey et al. Reimer article loyal2021crossreactive 2021 10.1126/science.abh1823 Science (New York, N.Y.) L. Loyal et al article metzendorf2021cochrane_covid19_studienregister 2021 September 10.3205/mbi000498 GMS Med Bibl Inf 21 Doc09 1-2 Maria-Inti Metzendorf article edler2021deaths 2021 Jul 10.1016/j.legalmed.2021.101895 Leg Med (Tokyo) 51 101895 C. Edler A. Klein AS. Schröder JP. Sperhake B. Ondruschka article trimpert2021deciphering 2021 10.3390/v13112290 Viruses 13 J. Trimpert et al article schwabenland2021deep 2021 10.1016/j.immuni.2021.06.002 Immunity 54 1594-1610.e11 7 M. Schwabenland H. Salié J. Tanevski S. Killmer MS. Lago AE. Schlaak L. Mayer J. Matschke K. Püschel A. Fitzek B. 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Ebigbo et al article Jensen.2021 BACKGROUND Monoclonal antibodies (mAb) have been introduced as a promising new therapeutic approach against SARS-CoV-2. At present, there is little experience regarding their clinical effects in patient populations underrepresented in clinical trials, e.g. immunocompromised patients. Additionally, it is not well known to what extent SARS-CoV-2 treatment with monoclonal antibodies could trigger the selection of immune escape viral variants. METHODS After identifying immunocompromised patients with viral rebound under treatment with bamlanivimab, we characterized the SARS-CoV-2-isolates by whole genome sequencing. Viral load measurements and sequence analysis were performed consecutively before and after bamlanivimab administration. FINDINGS After initial decrease of viral load, viral clearance was not achieved in five of six immunocompromised patients treated with bamlanivimab. Instead, viral replication increased again over the course of the following one to two weeks. In these five patients, the E484K substitution - known to confer immune escape - was detected at the time of viral rebound but not before bamlanivimab treatment. INTERPRETATION Treatment of SARS-CoV-2 with bamlanivimab in immunocompromised patients results in the rapid development of immune escape variants in a significant proportion of cases. Given that the E484K mutation can hamper natural immunity, the effectiveness of vaccination as well as antibody-based therapies, these findings may have important implications not only for individual treatment decisions but may also pose a risk to general prevention and treatment strategies. FUNDING All authors are employed and all expenses covered by governmental, federal state, or other publicly funded institutions. 2021 10.1016/j.lanepe.2021.100164 The Lancet regional health. Europe 8 100164 Bjoern Jensen Nadine Luebke Torsten Feldt Verena Keitel Timo Brandenburger Detlef Kindgen-Milles Matthias Lutterbeck Noemi F. Freise David Schoeler Rainer Haas Alexander Dilthey Andreas Walker Joerg Timm Tom Luedde article jensen2021 2021 10.1016/j.lanepe.2021.100164 Lancet Reg Health Eur 8 B. Jensen N. Luebke T. Feldt et al article ruhl2021endothelial 2021 10.1038/s41392-021-00819-6 Signal transduction and targeted therapy 6 418 L. Ruhl et al article vonstillfried2021entwicklung 2021 German 10.1007/s00292-021-01004-w Pathologe 1-5 S. Stillfried P. Boor DeRegCOVID PANDEMIcs article zack2021erste 2021 Ärztebl Meckl-Vorpom 31 125-128 Florian Zack Sarah Nigbur Julia Manhart Hiba Derani Daniel Boy Verena Kolbe Andreas Büttner article revet2021escap 2021 10.1007/s00787-020-01699-x European Child & Adolescent Psychiatry Online ahead of print A. Revet J. Hebebrand LA Kehoe COVID-19 Child S Bender P. Klauser article wagner2021 2021 10.3390/v13061118 Viruses 13 6 https://doi.org/10.3390/v13061118 R. Wagner D. Peterhoff S. Beileke et al article jones2021estimating 2021 10.1126/science.abi5273 Science (New York, N.Y.) T. C. Jones et al article eberhardt2021evaluation 2021 10.3390/microorganisms9040733 Microorganisms 9 Kirsten A. Eberhardt et al article korenkov2021 2021 10.1128/JCM.00896-21 J Clin Microbiol 59 9 M. Korenkov N. Poopalasingam M. Madler et al article toptana2021 2021 10.1016/j.jcv.2020.104713 J Clin Virol 135 T. Toptana L. Eckermann A.E. Pfeiffer et al article metzendorf2021evaluation 2021 Jun 5 10.1002/jrsm.1501 Res Synth Methods Online ahead of print Maria-Inti Metzendorf Robin M Featherstone article hildebrandt2021evaluierung 2021 10.3205/mibe000226 GMS Med Inform Biom Epidemiol 17 Doc12 3 urn:nbn:de:0183-mibe0002267 J. Hildebrandt M. I. Metzendorf T. Jakob article popp2021evidence 2021 10.1136/bmjebm-2021-111791 BMJ Evid Based Med 2021 bmjebm-2021-111791 Epub ahead of print, PMID: 34417268 Michael Popp Peter Kranke Patrick Meybohm Maria-Inti Metzendorf Nicole Skoetz Matthias S Stegemann Stephanie Weibel article wachinger2021b 2021 10.1136/bmjpo-2021-001262 BMJ Paediatr Open 5 1 https://doi.org/10.1136/bmjpo-2021-001262 J. Wachinger M. Schirmer N. Täuber et al article tielker2021experiences 2021 10.1371/journal.pone.0254056 PLoS ONE 16 e0254056 7 Juliane M. Tielker Jana P. Weber Steffen T. Simon Claudia Bausewein Stephanie Stiel Nils Schneider article tielker_experiences_2021 Background The SARS-CoV-2 (COVID-19) pandemic is posing major challenges for health care systems. In Germany, one such challenge has been that adequate palliative care for the severely ill and dying (with and without COVID-19), as well as their loved ones, has not been available at all times and in all settings., the pandemic has underlined the significance of the contribution of general practitioners (GPs) to the care of severely ill and dying patients. Objectives To describe GPs’ experiences, challenges and perspectives with respect to end-of-life care during the first peak of the pandemic (spring 2020) in Germany. Materials and methods In November and December 2020, a link to an Unipark online survey was sent to GPs registered on nationwide distribution lists. Results In total, 410 GPs responded; 61.5% indicated that the quality of their patients’ end-of-life care was maintained throughout the pandemic, 36.8% reported a decrease in quality compared to pre-pandemic times. Of the GPs who made home visits to severely ill and dying patients, 61.4% reported a stable number of visits, 28.5% reported fewer visits. 62.7% of the GPs reported increased telephone contact and reduced personal contact with patients; 36.1% offered video consultations in lieu of face-to-face contact. The GPs reported that relatives were restricted (48.5%) or prohibited from visiting (33.4%) patients in nursing homes. They observed a fear of loneliness among patients in nursing homes (91.9%), private homes (87.3%) and hospitals (86.1%). Conclusions The present work provides insights into the pandemic management of GPs and supports the development of a national strategy for palliative care during a pandemic. To effectively address end-of-life care, GPs and palliative care specialists should be involved in COVID-19 task forces on micro, meso and macro levels of health care. 2021 jul en 1932-6203 10.1371/journal.pone.0254056 PLOS ONE 16 e0254056 7 COVID 19, Pandemics, Germany, General practitioners, Health care providers, Nursing homes, Palliative care, Physicians https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0254056 Publisher: Public Library of Science Jannik M. Tielker Jan P. Weber Steffen T. Simon Claudia Bausewein Stephanie Stiel Nils Schneider article muenchhoff2021 2021 10.2807/1560-7917.ES.2021.26.43.2002066 Euro Surveill 26 43 https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2021.26.43.2002066 M. Muenchhoff A. Graf S. Krebs et al article thun2021german 2021 10.1055/s-0041-1731187 kma - Klinik Management aktuell 26 55—56 06 S Thun J Sass A Bartschke article gruber2021hamster 2021 Vet Pathol AD Gruber TC Firsching J Trimpert K Dietert article schmidt2021handlungsfahigkeit 2021 10.3205/21degam086 DocV-15-05 Preprint: https://doi.org/10.3205/21degam086 M. Schmidt S. Kugai B. Weltermann article klein2021a 2021 10.1007/s00430-021-00710-9 Med Microbiol Immunol 210 4 https://doi.org/10.1007/s00430-021-00710-9 J. A. F. Klein L. J. Krüger F. Tobian et al article hadzibegovic2021heart 2021 10.1002/ejhf.2210 Eur J Heart Fail 23 1891—1902 11 S Hadzibegovic A Lena TW Churchill JE Ho S Potthoff C Denecke L Rösnick KM Heim M Kleinschmidt LE Sander Dana Stahl article gross2021heterologous 2021 10.1016/j.ebiom.2021.103761 EBioMedicine 75 103761 Rainer Groß et al article tenbusch2021 2021 10.1016/S1473-3099(21)00420-5 Lancet Infect Dis 21 9 M. Tenbusch S. Schumacher E. Vogel et al article roessler2021hierarchisierung 2021 10.25646/8405.2 Preprint: https://doi.org/10.25646/8405.2 M. Rössler J. Jacob L. Risch F. Tesch D. Enders D. Wende R. Jucknewitz O. Weidinger M. Batram P. Ballesteros S. Baßler D. Hertle U. Repschläger N. Richter C. Schulte A. Schramm F. Sobik M. Treskova-Schwarzbach S. Scholz J. Walker Dana Stahl article lehmann2021human 2021 Mucosal Immunol 14 1381—1392 M Lehmann C Heldt J Meinhardt F Schmidt et al. Rodriguez-Sillke article lehmann2021human 2021 10.1038/s41385-021-00437-z Mucosal Immunol 1-12 M. Lehmann C. Heldt et al article barrosmartins2021 2021 10.1101/2021.06.01.21258172 MedRxiv https://doi.org/10.1101/2021.06.01.21258172 preprint J. Barros-Martins S. I. Hammerschmidt A. Cossmann article trump2021hypertension 2021 10.1038/s41587-021-00937-2 Nat Biotechnol 39 705—716 Simon Trump Soeren Lukassen Stefan M Anker Robert L Chua Jonathan Liebig et al. Thurmann article walsh2021imaging 2021 10.1038/s41592-021-01317-x Nat Methods 18 1532-1541 12 CL. Walsh P. Tafforeau WL. Wagner et al article barrosmartins2021immune 2021 10.1038/s41591-021-01449-9 Nature Medicine 27 1525—1529 João Barros-Martins et al article burnett2021immunizations 2021 10.1016/j.immuni.2021.10.019 Immunity 54 2908—2921.e6 David L. Burnett et al article schrezenmeier2021immunogenicity 2021 10.3389/fimmu.2021.690698 Frontiers in immunology 12 690698 E. Schrezenmeier et al article ahrens2021impact 2021 10.1038/s41398-021-01508-2 Translational Psychiatry 11 1—10 1 Robert J Neumann Björn Kollmann Jan Brokelmann Nils M Werthern Andrei Malsyhau Dominik Weichert Beatrice Lutz Christian J Fiebach Michèle Wessa Dana Stahl article muehlemann2021impact 2021 10.1016/j.cmi.2021.06.008 Clinical microbiology and infection: the official publication of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases B. Mühlemann et al article muhlemann2021impact 2021 10.1016/j.cmi.2021.06.008 Clin Microbiol Infect B Mühlemann C Thibeault D Hillus ET Helbig LJ Lippert P Tober-Lau T Schwarz MA Müller Pa-COVID-19 group M Witzenrath Dana Stahl article JA 2021 1520.e7-1520.e10 B. Mühlemann C. Thibeault D. Hillus ET Helbig LJ Lippert P. Tober-Lau T. Schwarz Marcel A. Müller Pa-COVID-19 group Martin Witzenrath Norbert Suttorp Leif E Sander Christian Drosten T. C. Jones Victor M Corman Florian Kurth article ricke2021impaired 2021 Aug 10.1371/journal.pone.0255335 PLoS One 16 e0255335 8 M. Ricke-Hoch E. Stelling L. Lasswitz AP. Gunesch M. Kasten FJ. Zapatero-Belinchón G. Brogden G. Gerold T. Pietschmann V. Montiel JL. Balligand F. Facciotti E. Hirsch T. Gausepohl H. Elbahesh GF. Rimmelzwaan A. Höfer MP. Kühnel D. Jonigk J. Eigendorf U. Tegtbur L. Mink M. Scherr T. Illig A. Schambach TJ. Pfeffer A. Hilfiker A. Haverich D. Hilfiker-Kleiner article dauletbaev2021implementation 2021 10.1136/bmjopen-2021-053819 BMJ Open 11 e053819 9 N Dauletbaev S Kuhn S Holtz S Waldmann L Niekrenz B S Müller C Bellinghausen M Dreher G G U Rohde C Vogelmeier article muller2021implementation 2021 10.3390/ijerph18115710 International Journal of Environmental Research and Public Health 18 5710 11 A Müller F S Melzow G Göstemeyer S Paris F Schwendicke article hennig2021increased 2021 10.1186/s13023-021-02011-z Orphanet Journal of Rare Diseases 16 373 V. Hennig et al article JA 2021 04:01. EClinicalMedicine.2021;40:101099 J Weiner P Suwalski M Holtgrewe A Rakitko C. Thibeault MA Müller D Patriki C Quedenau U Krüger V Ilinsky ET Helbig LJ Lippert P Stubbemann X Wang Z Karadeniz Joe Saccomanno Jan-Moritz Doehn Ralf-Harto Hübner B Hinzmann S Siemann Victor M Corman B. Mühlemann Christian Drosten T. C. Jones Norbert Suttorp Martin Witzenrath S Hippenstiel C Skurk Pa-COVID Group Leif E Sander D Beule U Landmesser T Guettouche Florian Kurth B Heidecker I Popov J Balnis A Jaitovich LM Real J Macías JA Pineda M Fernandez-Fuertes M Salvo A Blueher S Jurisic JH Beer J Rutishauser B Wiggli H Schmid K Danninger R Binder R Arjun Arkal GK Fragiadakis E Mick C Comet CS Calfee DJ Erle CM Hendrickson KN Kangelaris MF Krummel PG Woodruff CR Langelier U Venkataramani F García J Zyla T Zemojtel P Wolfgang T Borodina S Ripke article weiner2021increased 2021 10.1016/j.eclinm.2021.101099 EClinicalMedicine J Weiner P Suwalski M Holtgrewe A Rakitko C Thibeault M Müller D Patriki C Quedenau U Krüger V Ilinsky Dana Stahl article dickel2021infection 2021 10.3205/dgkh000392 GMS Hyg Infect Control 16 Doc21 S Dickel C Grimm M Popp C Struwe A Sachkova M Golinski C Seeber F Fichtner D Heise P Kranke W Meissner S Laudi S Voigt-Radloff JJ Meerpohl J Jabs NT Mutters O Moerer Group On Behalf Of The German CEOsys Study article koster2021 2021 10.3205/dgkh000398 GMS Hyg Infect Control 16 A. Köster A. Bludau S. Devcic et al article Koster.2021 Introduction: To address the question as to which infection surveillance measures are used during the ongoing COVID-19 pandemic in Germany and how they differ from pre-existing approaches. Methods: In accordance with the systematic approach of a scoping review, a literature search was conducted in national and international medical literature databases using a search string. The search in the databases was limited to the period from 01.01.2000 to 15.11.2020 and has been subsequently completed by hand search until 08.03.2021. A hand search, even beyond 15.11.2020, seemed necessary and reasonable, since due to the dynamics of the ongoing COVID-19 pandemic, a large number of articles and regulations are being published very quickly at short notice. Results: The literature search resulted in the following number of hits in the databases listed below: PubMed: 165 articlesCochrane: 1 review and 35 studiesWeb of Science: 217 articlesRobert Koch Institute: 49 articles Thus, a total of 467 hits were identified, with a total of 124 hits being duplicates. From these, 138 articles were considered relevant to the COVID-19 infection surveillance situation in Germany based on established criteria. After reading the full texts, 92 articles and websites were ultimately included in the scoping review. Discussion: Many of the lessons learned from previous outbreaks seem to have been implemented in the infection surveillance measures during the ongoing COVID-19 pandemic in Germany. Most of the changes compared with previous measures were based on technological streamlining of existing procedures and changes and more inclusion of the population in different infection surveillance measures. Einleitung: Es wird der Frage nachgegangen, welche Maßnahmen zur Infektionsüberwachung während der aktuellen COVID-19-Pandemie in Deutschland eingesetzt werden und wie sie sich von bereits bestehenden Ansätzen unterscheiden.Methoden: Entsprechend der systematischen Vorgehensweise eines Scoping Reviews wird eine Literaturrecherche in nationalen und internationalen medizinischen Literaturdatenbanken mittels Suchstring durchgeführt. Die Suche in den Datenbanken ist auf den Zeitraum vom 01.01.2000 bis zum 15.11.2020 begrenzt und anschließend per Handsuche bis zum 08.03.2021 ergänzt. Eine Handsuche, auch über den 15.11.2020 hinaus, erscheint notwendig und sinnvoll, da aufgrund der Dynamik der laufenden COVID-19-Pandemie sehr kurzfristig eine große Anzahl von Artikeln und Verordnungen veröffentlicht werden.Ergebnisse: Die Literaturrecherche hat die folgende Anzahl von Treffern in den unten aufgeführten Datenbanken ergeben: PubMed: 165 ArtikelCochrane: 1 Review und 35 StudienWeb of Science: 217 ArtikelRobert Koch-Institut: 49 Artikel Somit sind insgesamt 467 Treffer identifiziert worden, wobei insgesamt 124 Treffer Duplikate sind. Anhand festgelegter Kriterien werden 138 Artikel als relevant für die COVID-19-Infektionssurveillance in Deutschland eingestuft, und nach dem Lesen der Volltexte schließlich 92 Artikel und Webseiten in den Scoping Review aufgenommen.Diskussion: Viele der Maßnahmen, die aufgrund früherer Ausbruchsgeschehen bekannt sind, scheinen auch bei der jetzigen Infektionsüberwachung während der laufenden COVID-19-Pandemie in Deutschland umgesetzt worden zu sein. Die meisten Änderungen im Vergleich zu früheren Maßnahmen betreffen technologische Neuerungen sowie eine stärkere Einbeziehung der Bevölkerung in die verschiedenen Maßnahmen zur Infektionsüberwachung. JA 2021 2196-5226 10.3205/dgkh000398 GMS hygiene and infection control 16 Doc27 Antonia Milena Köster Anna Bludau Sanja Katharina Devcic Simone Scheithauer Amelia Aquareta Mardiko Reiner Schaumann article wyler2021insights 2021 10.1101/2021.12.17.473180 bioRxiv Emanuel Wyler Kathleen Eschke Stefanie Peidli et al. Pott article houwaart2021 2021 10.1101/2021.10.18.21264530 MedRxiv T. Houwaart S. Belhaj E. Tawalbeh et al article schroeder2021interferon 2021 10.1016/S2666-5247(21)00069-0 Lancet Microbe 2 e210—e218 Susanne Schroeder Franziska Pott Daniela Niemeyer Tobias Veith Antje Richter et al. Muth article burns2021international 2021 10.1002/14651858.CD013717.pub2 Cochrane Database of Systematic Reviews 3 J Burns A Movsisyan JM Stratil RL Biallis M Coenen KMF Emmert-Fees K Geffert S Hoffmann O Horstick M Laxy C Klinger S Kratzer T Litwin S Norris LM Pfadenhauer P Philipsborn K Sell B Stadelmaier S Voss K Wabnitz EA Rehfuess article strobl2021internationale 2021 Pathologe 42 224-230 2 German, doi: 10.1007/s00292-020-00892-8 Sebastian Strobl Wolfram Roth article andreas2021interventions 2021 10.1002/14651858.CD015061 Cochrane Database of Systematic Reviews 2021 CD015061 8 V Piechotta N Skoetz K Grummich M Becker L Joos G Becker W Meissner C Boehlke article andreas2021interventions 2021 10.1002/14651858.CD015061.pub2 Cochrane Database of Systematic Reviews CD015061 Vanessa Piechotta Nicole Skoetz Katharina Grummich Mona Becker Stefanie Joos Gerd Becker Winfried Meissner Christoph Boehlke article halwe2021intranasal 2021 10.3390/v13081498 Viruses 13 Svenja Halwe et al article halwe2021 2021 10.3390/v13081498 Viruses 13 8 https://doi.org/10.3390/v13081498 S. Halwe A. Kupke K. Vanshylla et al article bosnjak2021a 2021 10.3389/fimmu.2021.772240 Front Immunol 12 https://doi.org/10.3389/fimmu.2021.772240 B. Bošnjak I. Odak J. Barros-Martins et al article bosnjak2021intranasal 2021 10.3389/fimmu.2021.772240 Frontiers in Immunology 12 772240 Berislav Bošnjak et al article popp2021ivermectin 2021 10.1002/14651858.CD015017.pub2 Cochrane Database of Systematic Reviews 2021 CD015017 Michael Popp Matthias Stegemann Maria-Inti Metzendorf Shane Gould Peter Kranke Patrick Meybohm Nicole Skoetz Stephanie Weibel article malin2021key 2021 10.1007/s15010-021-01645-2 Infection Epub ahead of print, PMID: 34228347 Johannes J Malin Christoph D Spinner Udo Janssens Tobias Welte Steffen Weber-Carstens Gereon Schälte Petra Gastmeier Frank Langer Martin Wepler Mike Westhoff Michael Pfeifer Klaus F Rabe Falk Hoffmann Bernd W Böttiger Julia Weinmann-Menke Alexander Kersten Peter Berlit Marek Krawczyk Wolfgang Nehls Frank Fichtner Stefan Laudi Matthias Stegemann Nicole Skoetz Monika Nothacker Gernot Marx Christian Karagiannidis Stefan Kluge article vanshylla2021kinetics 2021 10.1016/j.chom.2021.04.015 Cell host & microbe K. Vanshylla et al article schmidt2021kommunikations 2021 10.3205/21degam120 DocV-22-02 Preprint: https://doi.org/10.3205/21degam120 M. Schmidt C. Löwe S. Kugai A. Thielmann B. Weltermann article vonstillfried2021kooperatives 2021 Pathologe 42 216-223 2 German, doi: 10.1007/s00292-020-00891-9 Saskia Stillfried Gustavo Baretton Roland D. Bülow Karin F. Bürrig Uwe H. Holtherm Danny Jonigk Ruth Knüchel Ramin W. Majeed Rainer Röhrig Jonas Wienströer Peter Boor article ludwig2021 2021 10.1038/s41587-021-00966-9 Nat Biotechnol 39 12 https://doi.org/10.1038/s41587-021-00966-9 K. U. Ludwig R. M. Schmithausen D. Li et al article englisch2021lesions 2021 10.1016/j.aanat.2020.151657 Ann Anat 234 151657 Cornelius N. Englisch Thomas Tschernig Friedrich Flockerzi Carola Meier Rainer M. Bohle article theobald2021longlived 2021 10.15252/emmm.202114150 EMBO Mol Med S. J. Theobald et al article knolle2021 2021 10.21203/rs.3.rs-677167/v1 Research Square Preprint P. Knolle N. Körber A. 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Willlich F Kurth F Steinbeis Martin Witzenrath T Bahmer A Hermes Michael Krawczak L Reinke C Maetzler J Franzenburg Jörg J Vehreschild Maximilian Schons T. Illig G. Anton Kathrin Ungethüm Peter Heuschmann T. Keil S Schreiber S Schmidt S N Willich J Enderle A Flinspach B C Finkenberg M T Gehrig N Savaskan article toberlau2021longterm 2021 10.1016/S2213-2600(21)00456-2 The Lancet Respiratory Medicine 9 e104-e105 P. Tober-Lau et al article janikova2021loop 2021 10.1111/1751-7915.13737 Microb Biotechnol 14 307-316 1 Mária Jan\'ıková Ján Hodosy Peter Boor Boris Klempa Peter Celec article contreras2021low 2021 10.1126/sciadv.abg2243 Science advances 7 eabg2243 41 Sergio Contreras Jonas Dehning Sebastian B Mohr Stefan Bauer Fabian P Spitzner Viola Priesemann article kuhlmann2021 2021 10.1093/eurpub/ckab165.441 Eur J Public Health 31 Supplement 3 E. Kuhlmann S. Heinemann A. 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Walsh P. Tafforeau WL. Wagner et al article wong2021multisystemic 2021 10.3390/cells10081900 Cells 10 1900 8 Dominic WL Wong Bernhard M. Klinkhammer Sonja Djudjaj Sandra Villwock Maria C. Timm Eva Maria Buhl Stefan Wucherpfennig Clara Cacchi Till Braunschweig Ruth Knüchel-Clarke Danny Jonigk Christopher Werlein Robin D. Bülow Edgar Dahl Saskia Stillfried Peter Boor article arora2021mutation 2021 10.1038/s41392-021-00502-w Signal Transduction and Targeted Therapy 6 101 Pragya Arora Stefan Pöhlmann Markus Hoffmann article vonstillfried2021nachweismethoden 2021 Pathologe 42 208-215 2 German, doi: 10.1007/s00292-021-00919-8 Saskia Stillfried Peter Boor article gesell2021national 2021 10.1017/S1478951521001772 Palliative and Supportive Care 1-13 David Gesell Elena Lehmann Sabine Gauder Moritz Wallner Steffen T. Simon Claudia Bausewein article gerlach2021needle 2021 10.1515/cdbme-2021-2199 Current Directions in Biomedical Engineering 7 779-782 2 S. Gerlach M. Neidhardt T. Weiß MH. Laves C. Stapper M. Gromniak I. Kniep D. Möbius A. Heinemann B. Ondruschka A. Schlaefer article laise2021network-based 2021 10.1101/2021.07.03.451001 bioRxiv Preprint P Laise ML Stanifer G Bosker X Sun S Triana et al. Doldan article glatzel2021neuropathology 2021 Lancet 397 276 10271 doi: 10.1016/S0140-6736(21)00098-2 Markus Glatzel Christian Hagel Jakob Matschke Jan Sperhake Nikolaus Deigendesch Alexandar Tzankov Stephan Frank article hammerschmidt2021a 2021 10.1038/s41423-021-00755-z Cell Mol Immunol 18 10 S.I. Hammerschmidt B. Bošnjak G. 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Simon Claudia Bausewein Nils Schneider article buhr2021pandemieapps 2021 Dtsch Arztebl International 118 A-1362 / B-1128 27–28 Dtsch Arztebl Int. 2021; 118: A-1362 / B-1128 Lydia Buhr Eva Nordmeyer Silke Schicktanz article revet2021perceived 2021 10.1007/s00787-021-01851-1 European Child & Adolescent Psychiatry Online ahead of print A. Revet J. Hebebrand LA Kehoe COVID-19 Child S Bender P. Klauser article weber2021 2021 10.21203/rs.3.rs-776085/v1 BMC Public Health Currently under review M. Weber M. Plew C. Neumann Weber et al article kahn2021 2021 10.1186/s12879-021-06524-7 BMC Infect Dis 21 1 M. Kahn L. Schuierer C. Bartenschlager et al article lee2021 2021 10.1128/JCM.02881-20 J Clin Microbiol 59 5 https://doi.org/10.1128/JCM.02881-20 R. A. Lee J. C. Herigon A. Benedetti et al article kreuzberger2021igm 2021 10.1002/14651858.CD014946 Cochrane Database of Systematic Reviews N. 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Hocke Volker Thiel Klaus Osterrieder Thorsten Wolff Ulrich Martin Victor M. Corman Marcel A. Müller Christine Goffinet Christian Drosten article niemeyer2021post 2021 10.1101/2021.10.20.465121 bioRxiv Preprint Daniela Niemeyer Susanne Schroeder Klaus Friedmann Florian Weege Jakob Trimpert et al. Richter article heinrich2021postmortem 2021 10.3201/eid2701.203112 Emerg Infect Dis 27 329-331 1 Fabian Heinrich Katja Meißner Felix Langenwalder Klaus Püschel Dominic Nörz Andreas Hoffmann Marc Lütgehetmann Elias Bibiza-Freiwald Susanne Pfefferle Axel Heinemann article boor2021praktische 2021 Pathologe 42 197-207 2 German, doi: 10.1007/s00292-021-00925-w Peter Boor Philipp Eichhorn Arndt Hartmann Sören F. Lax Bruno Märkl Thomas Menter Kristina Skok Julia Slotta-Huspenina Saskia Stillfried Alexandar Tzankov Gregor Weirich article casagrande2021presence 2021 10.1001/jamaophthalmol.2020.6339 JAMA Ophthalmol Maristella Casagrande Antonia Fitzek Martin S. Spitzer Klaus Püschel Markus Glatzel Susanne Krasemann Dominic Nörz Marc Lütgehetmann Susanne Pfefferle Michael Schultheiss article oestreich2021privacy 2021 10.17179/excli2021-4002 EXCLI journal 20 1243–1260 M. Oestreich D. Chen J. L. Schultze M. Fritz M. Becker article weinberger2021 2021 10.1093/cid/ciaa1935 Clin Infect Dis 73 9 T. Weinberger J. Steffen A. Osterman et al article fitzek2021prospective 2021 Sep 10.1038/s41598-021-98499-3 Sci Rep 11 19342 1 A. Fitzek J. Schädler E. Dietz A. Ron M. Gerling AL. Kammal L. Lohner C. Falck D. Möbius H. Goebels AL. Gerberding AS. Schröder JP. Sperhake A. Klein D. Fröb H. Mushumba S. Wilmes I. Kniep F. Heinrich F. Langenwalder K. Meißner P. Lange A. Zapf K. Püschel A. Heinemann M. Glatzel J. Matschke M. Lütgehetmann S. Steurer C. Thorns C. Edler B. Ondruschka article lapuente2021 2021 10.1038/s41467-021-27063-4 Nat Commun 12 1 https://doi.org/10.1038/s41467-021-27063-4 D. Lapuente J. Fuchs J. 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Bobko Dana Stahl article morawa2021psychosocial 2021 10.1016/j.jpsychores.2021.110415 Journal of Psychosomatic Research 144 110415 E Morawa C Schug F Geiser P Beschoner L Jerg-Bretzke K Weidner N Hiebel A Borho Y Erim article jergbretzke2021psychosocial 2021 10.3390/ijerph181910531 International Journal of Environmental Research and Public Health 18 10531 19 L Jerg-Bretzke M Kempf M N Jarczok K Weimer C Hirning H Gündel Y Erim E Morawa F Geiser N Hiebel K Weidner P Beschoner article JA 2021 European Biobank Week 2021 G. Anton A. Kuehn-Steven M.K. Taucher I Bernemann T. Illig article denzler2021 2021 10.1101/2021.07.29.21261314 MedRxiv https://doi.org/10.1101/2021.07.29.21261314 preprint A. Denzler M. L. Jacobs V. Witte et al article kluge2021recommendations 2021 10.3238/arztebl.m2021.0374 Dtsch Arztebl Int Forthcoming, arztebl.m2021.0374, Epub ahead of print, PMID: 34789365 Stefan Kluge Johannes J Malin Fabian Fichtner Oliver J Müller Nicole Skoetz Christian Karagiannidis article wagner2021recruitment 2021 10.1016/j.celrep.2021.110214 Cell reports 35 110214 K. I. Wagner et al article bauer2021relaxing 2021 10.1371/journal.pcbi.1009288 PLOS Computational Biology 17 e1009288 9 Stefan Bauer Samuel Contreras Jonas Dehning Maximilian Linden Enayetur Iftekhar Sebastian B Mohr Alvaro Olivera-Nappa Viola Priesemann article thole2021relevant 2021 10.3233/SHTI210580 Stud Health Technol Inform 283 186—193 Dominik Thole Tim Ole Diesterhöft Sebastian Vogel Moritz Greve Eva Bauer Simon Strathmann Christoph Elsner Niklas Kolbe Dagmar Krefting article ansems2021remdesivir 2021 10.1002/14651858.CD014962 Cochrane Database of Systematic Reviews 2021 CD014962 8 K Ansems F Grundeis K Dahms A Mikolajewska V Thieme V Piechotta M-I Metzendorf M Stegemann C Benstoem F Fichtner article wurzer2021remote 2021 10.1371/journal.pone.0257095 PLOS ONE 16 e0257095 9 https://doi.org/10.1371/journal.pone.0257095 D. Wurzer P. Spielhagen A. Siegmann A. Gercekcioglu J. Gorgass S. Henze Y. Kolar F. Koneberg S. Kukkonen H. McGowan S. Schmid-Eisinger A. Steger M. Dommasch H. U. 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Corman M.S. Stegemann et al article deinhardt-emmer2021sars-cov-2 2021 J Virol S Deinhardt-Emmer S Bottcher C Haring L Giebeler A Henke et al. Zell article wendisch2021sarscov2 2021 10.1016/j.cell.2021.11.033 Cell 184 6243—6261.e27 26 D Wendisch O Dietrich T Mari S Stillfried IL Ibarra M Mittermaier C Mache RL Chua R Knoll S Timm Dana Stahl article wendisch2021sarscov2 2021 10.1016/j.cell.2021.11.033 Cell 184 6243—6261.e6227 Daniel Wendisch Olaf Dietrich Tizian Mari Saskia Stillfried Ingrid L Ibarra et al. Mittermaier article wendisch2021sars-cov-2 2021 10.1016/j.cell.2021.11.033 Cell 184 6243-6261.e27 D. Wendisch et al article wendisch2021profibrotic 2021 10.1016/j.cell.2021.11.033 Cell D. Wendisch O. Dietrich T. Mari et al article JA 2021 Cell. 2021;184(26):6243-6261.e27. D. Wendisch O. Dietrich T. Mari S. Von Stillfried IL Ibarra M Mittermaier C Mache RL Chua R Knoll S Timm S Brumhard T. Kramer Ronja Mothes RD. Bülow Julia Schulze Sonja Djudjaj F Pott J Kazmierski J. Radke S. Baßler BCG Conrad M Landthaler Emanuel Wyler David Horst S Hippenstiel AC Hocke FL. Heppner Anne Uhrig Clara Vázquez García Susanne Herold S. Elezkurtaj C. Thibeault Martin Witzenrath Norbert Suttorp Christian Drosten C Goffinet Florian Kurth J. L. Schultze H. Radbruch Matthias Ochs Roland Eils Holger C Müller-Redetzky Anja E Hauser Christian Conrad Thorsten Wolff P. Boor Leif E Sander H Zauber AL Hiller A Pascual-Reguant AM Leipold F Erhard R Geffers P Pergantis AC Aschenbrenner B Sawitzki C Cochain MD Luecken FJ Theis M Selbach AE Saliba F Machleidt article jansen2021sarscov2 2021 10.1016/j.stem.2021.12.010 Cell Stem Cell J. Jansen KC. Reimer JS. Nagai et al article hoffmann2021minkmutations 2021 10.1016/j.celrep.2021.109017 Cell Reports 35 109017 M. Hoffmann et al article malin2021neutralizingantibody 2021 10.1182/bloodadvances.2021006655 Blood advances J. J. Malin et al article schwarz2021sarscov2 2021 10.3389/fimmu.2021.629185 Frontiers in immunology 12 629185 T. Schwarz et al article vonstillfried2021sarscov2 2021 Jul 10.1111/1751-7915.13828 Microb Biotechnol 14 1627-1641 4 Epub 2021 May 16 Saskia Stillfried Sandra Villwock Robin D. Bülow Sonja Djudjaj Eva Maria Buhl Andrea Maurer Nadine Ortiz-Brüchle Peter Celec Bernhard M. Klinkhammer Dominic WL Wong Clara Cacchi Till Braunschweig Ruth Knüchel-Clarke Edgar Dahl Peter Boor article heinemann2021a 2021 10.3205/dgkh000402 GMS Hyg Infect Control 16 S. Heinemann A. Bludau H. Kaba et al article Heinemann.2021 Background: The B-FAST project of the National University Network (NUM) examines and records applied surveillance strategies implemented in hospitals i.a., to protect patients and employees from SARS-CoV-2 infection. Methods: Infection control physicians in German university hospitals (UK), as well as non-university hospitals (NUK; Bavaria, Lower Saxony) were surveyed in March 2021 regarding SARS-CoV-2 testing/surveillance strategies in a cross-sectional study using a standardized online questionnaire. The focus was on screening strategies taking into account the \textquotedbltest\textquotedbl methods used (case history, PCR, antigen, antibody test). Results: The response rate was 91.7% (33/36) in UK and 11.3%-32.2% in NUK. Almost all hospitals (95.0%) performed a symptom and exposure check and/or testing upon inpatient admission. Non-cause-related testing (screening) of health care workers in COVID wards was preferably done by PCR in UK (69.7% PCR; 12.1% antigen), while NUK (29.9% PCR; 49.3% antigen) used antigen testing more frequently. Regardless of the type of facility, about half of the respondents rated the benefit of screening higher than the effort (patients: 49%; employees: 45%). Conclusion: Testing/surveillance strategies find a high level of acceptance at German hospitals and are generally carried out in accordance with the national testing strategy with differences depending on the level of care. Hintergrund: Im „Bundesweiten Forschungsnetzwerk zur Angewandten Surveillance und Testung“ (B-FAST) werden anwendungsbezogene Strategien geprüft und erfasst, die u.a. in Krankenhäusern zum Schutz von Patient*innen und Beschäftigten vor SARS-CoV-2 implementiert wurden.Methoden: Im März 2021 wurden in einer Querschnittstudie mit einem standardisierten Online-Fragebogen die leitenden (Krankenhaus-)Hygieniker*innen in deutschen Universitätskliniken (UK), sowie Nicht-Universitätskliniken (NUK) in Bayern und Niedersachsen zu SARS-CoV-2 Test- und Surveillance-Strategien befragt. Im Fokus standen Screening-Strategien unter Berücksichtigung der eingesetzten „Test“-Methoden (Anamnese, PCR-, Antigen-, Antikörpertest).Ergebnisse: Der Rücklauf liegt bei 91,7% (33 von 36) aus den UK, bei 32,2% (37 von 115) aus den niedersächsischen NUK und bei 11,3% (30 von 265) aus den bayrischen NUK. Nahezu alle Kliniken (95,0%) führen bei der Aufnahme stationärer Patient*innen einen Symptom/Expositionscheck und/oder eine Testung durch. Das nicht-anlassbezogene Testen (Screening) von Beschäftigten im COVID-Bereich erfolgte in UK (69,7% PCR; 12,1% Antigen) bevorzugt durch PCR, während NUK (29,9% PCR; 49,3% Antigen) häufiger Antigentests einsetzten. Unabhängig von der Einrichtungsart bewerten etwa die Hälfte der Befragten den Nutzen von Screening höher als den Aufwand (bei Patient*innen 49,0%; bei Beschäftigten 45,0%).Fazit: Test- und Surveillance-Strategien finden an deutschen Kliniken hohe Akzeptanz und werden grundsätzlich in Anlehnung an die nationale Teststrategie — mit Unterschieden je nach Versorgungsstufe — durchgeführt. JA 2021 2196-5226 10.3205/dgkh000402 GMS hygiene and infection control 16 Doc31 Stephanie Heinemann Anna Bludau Hani Kaba Percy Knolle Hajo Grundmann Simone Scheithauer article hoffmann2021sarscov2variantb1617 2021 10.1016/j.celrep.2021.109415 Cell Reports 36 109415 M. Hoffmann et al article hoffmann2021sarscov2escape 2021 10.1016/j.cell.2021.03.036 Cell 184 2384-2393.e12 M. Hoffmann et al article lohner2021sarscov2 2021 Rechtsmedizin (Berl) 1-9 German, doi: 10.1007/s00194-021-00483-8 Luisa Lohner Dominik Fröb Carolin Edler Alexander S. Schröder Eva Dietz Benjamin Ondruschka article gassen2021sars-cov-2-mediated 2021 Nat Commun 12 3818 NC Gassen J Papies T Bajaj J Emanuel F Dethloff et al. Chua article kreuzberger2021sarscov2antibodies 2021 10.1002/14651858.CD013825.pub2 Cochrane Database of Systematic Reviews 9 CD013825 N. Kreuzberger et al article kreuzberger2021sars 2021 10.1002/14651858.CD013825.pub2 Cochrane Database Syst Rev 9 CD013825 9 Nina Kreuzberger Christopher Hirsch Khai Li Chai Emily Tomlinson Zohreh Khosravi Maximilian Popp Maximilian Neidhardt Vanessa Piechotta Sandrine Salomon Sarah J Valk Ina Monsef Christoph Schmaderer Erica M Wood Cynthia So-Osman Derek J Roberts Zoe McQuilten Lise J Estcourt Nicole Skoetz article hirsch2021sarscov2neutralising 2021 10.1002/14651858.CD014945 Cochrane Database of Systematic Reviews C. Hirsch et al article schmidt2021sarscov2seronegative 2021 10.3389/fimmu.2021.627568 Frontiers in immunology 12 627568 K. G. 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We started in March 2020 to set up a once-a-week qualified spot sampling protocol in six different locations in Munich carefully chosen to contain primarily wastewater of permanent residential areas, rather than industry or hospitals. We used RT-PCR and sequencing to track the spread of SARS-CoV-2 in the Munich population with temporo-spatial resolution. The study became fully operational in mid-April 2020 and has been tracking SARS-CoV-2 RNA load weekly for one year. Sequencing of the isolated viral RNA was performed to obtain information about the presence and abundance of variants of concern in the Munich area over time. We demonstrate that the evolution of SARS-CoV-2 RNA loads (between \textless7.5 and 3874/ml) in these different areas within Munich correlates well with official seven day incidence notification data (between 0.0 and 327 per 100,000) obtained from the authorities within the respective region. Wastewater viral loads predicted the dynamic of SARS-CoV-2 local incidence about 3 weeks in advance of data based on respiratory swab analyses. Aligning with multiple different point-mutations characteristic for certain variants of concern, we could demonstrate the gradual increase of variant of concern B.1.1.7 in the Munich population beginning in January 2021, weeks before it became apparent in sequencing results of swabs samples taken from patients living in Munich. Overall, the study highlights the potential of WBE to monitor the SARS-CoV-2 pandemic, including the introduction of variants of concern in a local population. JA 2021 10.1016/j.scitotenv.2021.149031 The Science of the total environment 797 149031 Raquel Rubio-Acero Jessica Beyerl Maximilian Muenchhoff Marc Sancho Roth Noemi Castelletti Ivana Paunovic Katja Radon Bernd Springer Christian Nagel Bernhard Boehm Merle M. Böhmer Alexander Graf Helmut Blum Stefan Krebs Oliver T. Keppler Andreas Osterman Zohaib Nisar Khan Michael Hoelscher Andreas Wieser article rubioacero2021 2021 10.1016/j.scitotenv.2021.149031 Sci Total Environ 797 R. Rubio-Acero J. Beyerl M. Muenchhoff et al article einhauser2021 2021 10.3390/diagnostics11101843 Diagnostics 11 10 https://doi.org/10.3390/diagnostics11101843 S. Einhauser D. Peterhoff H. H. Niller et al article alvarezfischer2021 2021 10.2139/ssrn.3889435 Lancet Preprint M. Borsche Alexander Balck et al article geraedts2021stationare 2021 Dtsch Arztebl International 118 A-991 19—20 M Geraedts M Eberlein-Gonska R Hecker K Schneider I Schroeder-Printzen M Zeuner article torresreyes2021 2021 10.3390/covid1010029 COVID 1 1 C.R. Torres Reyes E. Steinmann N. Timmesfeld et al article warnat-herresthal2021swarm 2021 10.1038/s41586-021-03583-3 Nature S. Warnat-Herresthal et al article hempel2021synergistic 2021 10.1039/D1SC01494C Chemical Science 12 12600–12609 T. 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Trimpert Martin Witzenrath SM Wienhold T Hoefler article nouailles2021temporal 2021 10.1038/s41467-021-25030-7 Nat Commun 12 4869 Guy Nouailles Emanuel Wyler Philip Pennitz Douwe Postmus Daria Vladimirova et al. Kazmierski article nouailles2021temporal 2021 10.1038/s41467-021-25030-7 Nat Commun 12 4869 1 G Nouailles E Wyler P Pennitz D Postmus D Vladimirova J Kazmierski F Pott K Dietert M Muelleder V Farztdinov Dana Stahl article kruger2021abbott 2021 10.1371/journal.pone.0247918 PLOS ONE 16 5 https://doi.org/10.1371/journal.pone.0247918 LJ Krüger M Gaeddert F Tobian Dana Stahl article witzenrath2021cypa 2021 10.1164/rccm.202104-0919ED Am J Respir Crit Care Med 204 385—387 4 M Witzenrath WM Kuebler article JA 2021 204(4):385-387 Martin Witzenrath WM Kuebler article ramirez2021endogenous 2021 10.1371/journal.ppat.1009687 PLOS Pathogens 17 e1009687 5 Carlos Ramirez Alvarez Cheong Kee Arun K Sharma Laura Thomas Florian I Schmidt et al. 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